【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】生命・健康・医療情報学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】木立 尚孝 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)

【キーワード】バイオインフォマティクス / RNA / RNA二次構造 / アルゴリズム / RNA結合タンパク質 (他15件)

【概要】細胞内のRNA分子は、遺伝子に書き込まれた情報がタンパク質になり生理的な機能を発揮する上で非常に重要な役割を持つ。RNA分子の立体構造は、ステムと呼ばれる局所的二重らせん構造（二次構造）の３次元的な配置としてよく理解されることが知られており、二次構造の性質を解明することは、RNAの機能を理解する上で重要である。本研究において、我々は、メッセンジャーRNAや長鎖非コードRNAと呼ばれる長大なRNA分...

【研究テーマ】生命・健康・医療情報学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】木立 尚孝 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)

【キーワード】バイオインフォマティクス / RNA / RNA二次構造 / アルゴリズム / RNA結合タンパク質 (他15件)

【概要】細胞内のRNA分子は、遺伝子に書き込まれた情報がタンパク質になり生理的な機能を発揮する上で非常に重要な役割を持つ。RNA分子の立体構造は、ステムと呼ばれる局所的二重らせん構造（二次構造）の３次元的な配置としてよく理解されることが知られており、二次構造の性質を解明することは、RNAの機能を理解する上で重要である。本研究において、我々は、メッセンジャーRNAや長鎖非コードRNAと呼ばれる長大なRNA分...

【研究テーマ】生命・健康・医療情報学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】木立 尚孝 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)

【キーワード】バイオインフォマティクス / RNA / RNA二次構造 / アルゴリズム / RNA結合タンパク質 (他15件)

【概要】細胞内のRNA分子は、遺伝子に書き込まれた情報がタンパク質になり生理的な機能を発揮する上で非常に重要な役割を持つ。RNA分子の立体構造は、ステムと呼ばれる局所的二重らせん構造（二次構造）の３次元的な配置としてよく理解されることが知られており、二次構造の性質を解明することは、RNAの機能を理解する上で重要である。本研究において、我々は、メッセンジャーRNAや長鎖非コードRNAと呼ばれる長大なRNA分...

【研究テーマ】生命・健康・医療情報学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】木立 尚孝 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)

【キーワード】バイオインフォマティクス / RNA / RNA二次構造 / アルゴリズム / RNA結合タンパク質 (他15件)

【概要】細胞内のRNA分子は、遺伝子に書き込まれた情報がタンパク質になり生理的な機能を発揮する上で非常に重要な役割を持つ。RNA分子の立体構造は、ステムと呼ばれる局所的二重らせん構造（二次構造）の３次元的な配置としてよく理解されることが知られており、二次構造の性質を解明することは、RNAの機能を理解する上で重要である。本研究において、我々は、メッセンジャーRNAや長鎖非コードRNAと呼ばれる長大なRNA分...

【研究テーマ】生命・健康・医療情報学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】木立 尚孝 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)

【キーワード】バイオインフォマティクス / RNA / RNA二次構造 / アルゴリズム / RNA結合タンパク質 (他15件)

【概要】細胞内のRNA分子は、遺伝子に書き込まれた情報がタンパク質になり生理的な機能を発揮する上で非常に重要な役割を持つ。RNA分子の立体構造は、ステムと呼ばれる局所的二重らせん構造（二次構造）の３次元的な配置としてよく理解されることが知られており、二次構造の性質を解明することは、RNAの機能を理解する上で重要である。本研究において、我々は、メッセンジャーRNAや長鎖非コードRNAと呼ばれる長大なRNA分...

【研究テーマ】生命・健康・医療情報学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】木立 尚孝 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)

【キーワード】バイオインフォマティクス / RNA / RNA二次構造 / アルゴリズム / RNA結合タンパク質 (他15件)

【概要】細胞内のRNA分子は、遺伝子に書き込まれた情報がタンパク質になり生理的な機能を発揮する上で非常に重要な役割を持つ。RNA分子の立体構造は、ステムと呼ばれる局所的二重らせん構造（二次構造）の３次元的な配置としてよく理解されることが知られており、二次構造の性質を解明することは、RNAの機能を理解する上で重要である。本研究において、我々は、メッセンジャーRNAや長鎖非コードRNAと呼ばれる長大なRNA分...

【研究テーマ】生命・健康・医療情報学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】木立 尚孝 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)

【キーワード】バイオインフォマティクス / RNA / RNA二次構造 / アルゴリズム / RNA結合タンパク質 (他15件)

【概要】細胞内のRNA分子は、遺伝子に書き込まれた情報がタンパク質になり生理的な機能を発揮する上で非常に重要な役割を持つ。RNA分子の立体構造は、ステムと呼ばれる局所的二重らせん構造（二次構造）の３次元的な配置としてよく理解されることが知られており、二次構造の性質を解明することは、RNAの機能を理解する上で重要である。本研究において、我々は、メッセンジャーRNAや長鎖非コードRNAと呼ばれる長大なRNA分...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】岡根 泉 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (60260171)

【キーワード】サビキン / ベトナム / 熱帯植物 / 東南アジア / インベントリー (他15件)

【概要】すでに収集・保存しているベトナム北部、中部、南部のコーヒープランテーション産のコーヒーさび病菌の標本を供試し、コーヒーノキ（Coffea）とその近縁植物を宿主とするサビキンであるHemileia属サビキンの種の特定を行うとともに、遺伝子解析によるコーヒーさび病菌の種内変異について調査を行った。 その結果、ベトナムの主要コーヒー栽培地域では、広くさび病が発生していること、さび病の原因サビキン種はHe...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】竹内 一将 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (50622304)

【キーワード】生物物理学 / アクティブマター / バクテリア / 微小流体デバイス / 集団遺伝学 (他8件)

【概要】本研究では、微小流体デバイスを用いて二つの細菌集団を培養し、競合させるモデル生態系実験を実現して、その結果を統計力学的な見地から解析した。まず、高密度の細菌集団を均一な環境で培養し、長時間計測できる灌流型の微小流体デバイスを開発した。それを用いて、蛍光タンパク質で標識した二つの大腸菌株を培養したところ、二集団の占有領域にフラクタル状のパターン形成を見出した。我々は、パターンの統計的特徴や菌の配向秩...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】竹内 一将 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (50622304)

【キーワード】生物物理学 / アクティブマター / バクテリア / 微小流体デバイス / 集団遺伝学 (他8件)

【概要】本研究では、微小流体デバイスを用いて二つの細菌集団を培養し、競合させるモデル生態系実験を実現して、その結果を統計力学的な見地から解析した。まず、高密度の細菌集団を均一な環境で培養し、長時間計測できる灌流型の微小流体デバイスを開発した。それを用いて、蛍光タンパク質で標識した二つの大腸菌株を培養したところ、二集団の占有領域にフラクタル状のパターン形成を見出した。我々は、パターンの統計的特徴や菌の配向秩...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】竹内 一将 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (50622304)

【キーワード】生物物理学 / アクティブマター / バクテリア / 微小流体デバイス / 集団遺伝学 (他8件)

【概要】本研究では、微小流体デバイスを用いて二つの細菌集団を培養し、競合させるモデル生態系実験を実現して、その結果を統計力学的な見地から解析した。まず、高密度の細菌集団を均一な環境で培養し、長時間計測できる灌流型の微小流体デバイスを開発した。それを用いて、蛍光タンパク質で標識した二つの大腸菌株を培養したところ、二集団の占有領域にフラクタル状のパターン形成を見出した。我々は、パターンの統計的特徴や菌の配向秩...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】竹内 一将 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (50622304)

【キーワード】生物物理学 / アクティブマター / バクテリア / 微小流体デバイス / 集団遺伝学 (他8件)

【概要】本研究では、微小流体デバイスを用いて二つの細菌集団を培養し、競合させるモデル生態系実験を実現して、その結果を統計力学的な見地から解析した。まず、高密度の細菌集団を均一な環境で培養し、長時間計測できる灌流型の微小流体デバイスを開発した。それを用いて、蛍光タンパク質で標識した二つの大腸菌株を培養したところ、二集団の占有領域にフラクタル状のパターン形成を見出した。我々は、パターンの統計的特徴や菌の配向秩...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】岡根 泉 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (60260171)

【キーワード】サビキン / ベトナム / 熱帯植物 / 東南アジア / インベントリー (他15件)

【概要】すでに収集・保存しているベトナム北部、中部、南部のコーヒープランテーション産のコーヒーさび病菌の標本を供試し、コーヒーノキ（Coffea）とその近縁植物を宿主とするサビキンであるHemileia属サビキンの種の特定を行うとともに、遺伝子解析によるコーヒーさび病菌の種内変異について調査を行った。 その結果、ベトナムの主要コーヒー栽培地域では、広くさび病が発生していること、さび病の原因サビキン種はHe...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2019-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】矢萩 拓也 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (50808029)

【キーワード】深海 / 熱水噴出孔 / 腹足動物 / 浮遊幼生 / 分析化学 (他13件)

【概要】本研究では、海底から表層圏を範囲に、深海熱水噴出域固有動物の浮遊幼生における生態、行動、鉛直・水平分布の包括的な調査を行うことで、分散機構を体系的に明らかにし、幼生分散が熱水域生物群集の成立、生態系の機能および物質循環に果たす役割を評価する。 付加成長する殻体をもつ貝類は、殻の形態観察や化学分析により個体の成長履歴を追うことができる点で、幼生分散研究において優れた分類群である。本研究では、深海熱水...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2019-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】矢萩 拓也 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (50808029)

【キーワード】深海 / 熱水噴出孔 / 腹足動物 / 浮遊幼生 / 分析化学 (他13件)

【概要】本研究では、海底から表層圏を範囲に、深海熱水噴出域固有動物の浮遊幼生における生態、行動、鉛直・水平分布の包括的な調査を行うことで、分散機構を体系的に明らかにし、幼生分散が熱水域生物群集の成立、生態系の機能および物質循環に果たす役割を評価する。 付加成長する殻体をもつ貝類は、殻の形態観察や化学分析により個体の成長履歴を追うことができる点で、幼生分散研究において優れた分類群である。本研究では、深海熱水...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】生命・健康・医療情報学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】木立 尚孝 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)

【キーワード】バイオインフォマティクス / RNA / RNA二次構造 / アルゴリズム / RNA結合タンパク質 (他15件)

【概要】細胞内のRNA分子は、遺伝子に書き込まれた情報がタンパク質になり生理的な機能を発揮する上で非常に重要な役割を持つ。RNA分子の立体構造は、ステムと呼ばれる局所的二重らせん構造（二次構造）の３次元的な配置としてよく理解されることが知られており、二次構造の性質を解明することは、RNAの機能を理解する上で重要である。本研究において、我々は、メッセンジャーRNAや長鎖非コードRNAと呼ばれる長大なRNA分...

【研究テーマ】水産学一般

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】菊池 潔 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教 (20292790)

【キーワード】遺伝 / 育種 / トラフグ / メダカ / 棘鰭上目魚類 (他11件)

【概要】魚類に分子育種法を適用するためには、全ゲノムを覆うマーカー座が必須あるが、マーカー座の種特異性は著しく高い。多くの魚種に利用可能なマーカー座を得るため、まず、トラフグのゲノム地図を作製した。次に、これを既報のメダカのゲノム地図と比較して、魚類において保存されたゲノム構造の特徴を明らかとした。この情報をもとに、モデル魚類間で保存されたマーカー座を同定した。これらの座を用いることで、非モデル魚であるマ...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2024-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産資源研究所(横浜), グループ長 (90371799)

【キーワード】自然選択 / 一塩基多型 / 集団ゲノミクス / 集団遺伝学 / 分子生態学

【概要】本年度、静岡県浜名湖産のニホンウナギ（降河中の銀ウナギが中心）の新規標本を得た（N = 26)。これらの標本についてゲノムDNAを抽出した。一方、愛媛産のニホンウナギについてはCOVID19の影響でサンプリングが出来なかったため、研究分担者（横内一樹）が凍結保存していた標本（2016-2017年度採集。N = 56）で代用することにした。これらの標本からもDNAを抽出済みである。なお、愛媛産の標本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】竹内 一将 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (50622304)

【キーワード】生物物理学 / アクティブマター / バクテリア / 微小流体デバイス / 集団遺伝学 (他8件)

【概要】本研究では、微小流体デバイスを用いて二つの細菌集団を培養し、競合させるモデル生態系実験を実現して、その結果を統計力学的な見地から解析した。まず、高密度の細菌集団を均一な環境で培養し、長時間計測できる灌流型の微小流体デバイスを開発した。それを用いて、蛍光タンパク質で標識した二つの大腸菌株を培養したところ、二集団の占有領域にフラクタル状のパターン形成を見出した。我々は、パターンの統計的特徴や菌の配向秩...

【研究テーマ】生命・健康・医療情報学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】木立 尚孝 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)

【キーワード】バイオインフォマティクス / RNA / RNA二次構造 / アルゴリズム / RNA結合タンパク質 (他15件)

【概要】細胞内のRNA分子は、遺伝子に書き込まれた情報がタンパク質になり生理的な機能を発揮する上で非常に重要な役割を持つ。RNA分子の立体構造は、ステムと呼ばれる局所的二重らせん構造（二次構造）の３次元的な配置としてよく理解されることが知られており、二次構造の性質を解明することは、RNAの機能を理解する上で重要である。本研究において、我々は、メッセンジャーRNAや長鎖非コードRNAと呼ばれる長大なRNA分...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】岡根 泉 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (60260171)

【キーワード】サビキン / ベトナム / 熱帯植物 / 東南アジア / インベントリー (他15件)

【概要】すでに収集・保存しているベトナム北部、中部、南部のコーヒープランテーション産のコーヒーさび病菌の標本を供試し、コーヒーノキ（Coffea）とその近縁植物を宿主とするサビキンであるHemileia属サビキンの種の特定を行うとともに、遺伝子解析によるコーヒーさび病菌の種内変異について調査を行った。 その結果、ベトナムの主要コーヒー栽培地域では、広くさび病が発生していること、さび病の原因サビキン種はHe...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2019-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】矢萩 拓也 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (50808029)

【キーワード】深海 / 熱水噴出孔 / 腹足動物 / 浮遊幼生 / 分析化学 (他13件)

【概要】本研究では、海底から表層圏を範囲に、深海熱水噴出域固有動物の浮遊幼生における生態、行動、鉛直・水平分布の包括的な調査を行うことで、分散機構を体系的に明らかにし、幼生分散が熱水域生物群集の成立、生態系の機能および物質循環に果たす役割を評価する。 付加成長する殻体をもつ貝類は、殻の形態観察や化学分析により個体の成長履歴を追うことができる点で、幼生分散研究において優れた分類群である。本研究では、深海熱水...

【研究テーマ】生命・健康・医療情報学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】木立 尚孝 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)

【キーワード】バイオインフォマティクス / RNA / RNA二次構造 / アルゴリズム / RNA結合タンパク質 (他15件)

【概要】細胞内のRNA分子は、遺伝子に書き込まれた情報がタンパク質になり生理的な機能を発揮する上で非常に重要な役割を持つ。RNA分子の立体構造は、ステムと呼ばれる局所的二重らせん構造（二次構造）の３次元的な配置としてよく理解されることが知られており、二次構造の性質を解明することは、RNAの機能を理解する上で重要である。本研究において、我々は、メッセンジャーRNAや長鎖非コードRNAと呼ばれる長大なRNA分...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】竹内 一将 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (50622304)

【キーワード】生物物理学 / アクティブマター / バクテリア / 微小流体デバイス / 集団遺伝学 (他8件)

【概要】本研究では、微小流体デバイスを用いて二つの細菌集団を培養し、競合させるモデル生態系実験を実現して、その結果を統計力学的な見地から解析した。まず、高密度の細菌集団を均一な環境で培養し、長時間計測できる灌流型の微小流体デバイスを開発した。それを用いて、蛍光タンパク質で標識した二つの大腸菌株を培養したところ、二集団の占有領域にフラクタル状のパターン形成を見出した。我々は、パターンの統計的特徴や菌の配向秩...

【研究テーマ】林学・森林工学

【研究種目】萌芽研究

【研究期間】2006 - 2007

【研究代表者】練 春蘭 東京大学, アジア生物資源環境研究センター, 准教授 (40376695)

【キーワード】マイクロサテライトマーカー / 複合SSRアンカーマーカー / 作製法 / 共優性多型マーカー / 複合SSRプライマー (他8件)

【概要】平成19年度は主に以下のような結果が得られた。 1)引き続き、以下の生物種を用いて作製法の汎用性を検討した。 樹木:カワクルミ 動物:クワノザイセイチュウ、カシノナガキクイムシ 草本:レンゲショウマ、フジアザミ クワノザイセイチュウを除き、他の全ての種から共優性で多型性の高い複合SSRマーカーが得られた。このことから、考案した共優性SSRマーカー作製法は極めて汎用性が高いことが示された。現在、他の...

【研究テーマ】林学・森林工学

【研究種目】萌芽研究

【研究期間】2006 - 2007

【研究代表者】練 春蘭 東京大学, アジア生物資源環境研究センター, 准教授 (40376695)

【キーワード】マイクロサテライトマーカー / 複合SSRアンカーマーカー / 作製法 / 共優性多型マーカー / 複合SSRプライマー (他8件)

【概要】平成19年度は主に以下のような結果が得られた。 1)引き続き、以下の生物種を用いて作製法の汎用性を検討した。 樹木:カワクルミ 動物:クワノザイセイチュウ、カシノナガキクイムシ 草本:レンゲショウマ、フジアザミ クワノザイセイチュウを除き、他の全ての種から共優性で多型性の高い複合SSRマーカーが得られた。このことから、考案した共優性SSRマーカー作製法は極めて汎用性が高いことが示された。現在、他の...

【研究テーマ】林学・森林工学

【研究種目】萌芽研究

【研究期間】2006 - 2007

【研究代表者】練 春蘭 東京大学, アジア生物資源環境研究センター, 准教授 (40376695)

【キーワード】マイクロサテライトマーカー / 複合SSRアンカーマーカー / 作製法 / 共優性多型マーカー / 複合SSRプライマー (他8件)

【概要】平成19年度は主に以下のような結果が得られた。 1)引き続き、以下の生物種を用いて作製法の汎用性を検討した。 樹木:カワクルミ 動物:クワノザイセイチュウ、カシノナガキクイムシ 草本:レンゲショウマ、フジアザミ クワノザイセイチュウを除き、他の全ての種から共優性で多型性の高い複合SSRマーカーが得られた。このことから、考案した共優性SSRマーカー作製法は極めて汎用性が高いことが示された。現在、他の...

【研究テーマ】林学・森林工学

【研究種目】萌芽研究

【研究期間】2006 - 2007

【研究代表者】練 春蘭 東京大学, アジア生物資源環境研究センター, 准教授 (40376695)

【キーワード】マイクロサテライトマーカー / 複合SSRアンカーマーカー / 作製法 / 共優性多型マーカー / 複合SSRプライマー (他8件)

【概要】平成19年度は主に以下のような結果が得られた。 1)引き続き、以下の生物種を用いて作製法の汎用性を検討した。 樹木:カワクルミ 動物:クワノザイセイチュウ、カシノナガキクイムシ 草本:レンゲショウマ、フジアザミ クワノザイセイチュウを除き、他の全ての種から共優性で多型性の高い複合SSRマーカーが得られた。このことから、考案した共優性SSRマーカー作製法は極めて汎用性が高いことが示された。現在、他の...

【研究テーマ】水産学一般

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】菊池 潔 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教 (20292790)

【キーワード】遺伝 / 育種 / トラフグ / メダカ / 棘鰭上目魚類 (他11件)

【概要】魚類に分子育種法を適用するためには、全ゲノムを覆うマーカー座が必須あるが、マーカー座の種特異性は著しく高い。多くの魚種に利用可能なマーカー座を得るため、まず、トラフグのゲノム地図を作製した。次に、これを既報のメダカのゲノム地図と比較して、魚類において保存されたゲノム構造の特徴を明らかとした。この情報をもとに、モデル魚類間で保存されたマーカー座を同定した。これらの座を用いることで、非モデル魚であるマ...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】岡根 泉 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (60260171)

【キーワード】サビキン / ベトナム / 熱帯植物 / 東南アジア / インベントリー (他15件)

【概要】すでに収集・保存しているベトナム北部、中部、南部のコーヒープランテーション産のコーヒーさび病菌の標本を供試し、コーヒーノキ（Coffea）とその近縁植物を宿主とするサビキンであるHemileia属サビキンの種の特定を行うとともに、遺伝子解析によるコーヒーさび病菌の種内変異について調査を行った。 その結果、ベトナムの主要コーヒー栽培地域では、広くさび病が発生していること、さび病の原因サビキン種はHe...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】岡根 泉 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (60260171)

【キーワード】サビキン / ベトナム / 熱帯植物 / 東南アジア / インベントリー (他15件)

【概要】すでに収集・保存しているベトナム北部、中部、南部のコーヒープランテーション産のコーヒーさび病菌の標本を供試し、コーヒーノキ（Coffea）とその近縁植物を宿主とするサビキンであるHemileia属サビキンの種の特定を行うとともに、遺伝子解析によるコーヒーさび病菌の種内変異について調査を行った。 その結果、ベトナムの主要コーヒー栽培地域では、広くさび病が発生していること、さび病の原因サビキン種はHe...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】岡根 泉 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (60260171)

【キーワード】サビキン / ベトナム / 熱帯植物 / 東南アジア / インベントリー (他15件)

【概要】すでに収集・保存しているベトナム北部、中部、南部のコーヒープランテーション産のコーヒーさび病菌の標本を供試し、コーヒーノキ（Coffea）とその近縁植物を宿主とするサビキンであるHemileia属サビキンの種の特定を行うとともに、遺伝子解析によるコーヒーさび病菌の種内変異について調査を行った。 その結果、ベトナムの主要コーヒー栽培地域では、広くさび病が発生していること、さび病の原因サビキン種はHe...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】岡根 泉 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (60260171)

【キーワード】サビキン / ベトナム / 熱帯植物 / 東南アジア / インベントリー (他15件)

【概要】すでに収集・保存しているベトナム北部、中部、南部のコーヒープランテーション産のコーヒーさび病菌の標本を供試し、コーヒーノキ（Coffea）とその近縁植物を宿主とするサビキンであるHemileia属サビキンの種の特定を行うとともに、遺伝子解析によるコーヒーさび病菌の種内変異について調査を行った。 その結果、ベトナムの主要コーヒー栽培地域では、広くさび病が発生していること、さび病の原因サビキン種はHe...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】岡根 泉 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (60260171)

【キーワード】サビキン / ベトナム / 熱帯植物 / 東南アジア / インベントリー (他15件)

【概要】すでに収集・保存しているベトナム北部、中部、南部のコーヒープランテーション産のコーヒーさび病菌の標本を供試し、コーヒーノキ（Coffea）とその近縁植物を宿主とするサビキンであるHemileia属サビキンの種の特定を行うとともに、遺伝子解析によるコーヒーさび病菌の種内変異について調査を行った。 その結果、ベトナムの主要コーヒー栽培地域では、広くさび病が発生していること、さび病の原因サビキン種はHe...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】岡根 泉 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (60260171)

【キーワード】サビキン / ベトナム / 熱帯植物 / 東南アジア / インベントリー (他15件)

【概要】すでに収集・保存しているベトナム北部、中部、南部のコーヒープランテーション産のコーヒーさび病菌の標本を供試し、コーヒーノキ（Coffea）とその近縁植物を宿主とするサビキンであるHemileia属サビキンの種の特定を行うとともに、遺伝子解析によるコーヒーさび病菌の種内変異について調査を行った。 その結果、ベトナムの主要コーヒー栽培地域では、広くさび病が発生していること、さび病の原因サビキン種はHe...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】岡根 泉 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (60260171)

【キーワード】サビキン / ベトナム / 熱帯植物 / 東南アジア / インベントリー (他15件)

【概要】すでに収集・保存しているベトナム北部、中部、南部のコーヒープランテーション産のコーヒーさび病菌の標本を供試し、コーヒーノキ（Coffea）とその近縁植物を宿主とするサビキンであるHemileia属サビキンの種の特定を行うとともに、遺伝子解析によるコーヒーさび病菌の種内変異について調査を行った。 その結果、ベトナムの主要コーヒー栽培地域では、広くさび病が発生していること、さび病の原因サビキン種はHe...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】環境農学(含ランドスケープ科学)

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2014-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】武山 智博 岡山理科大学, 生物地球学部, 准教授 (70452266)

【キーワード】景観生態学 / 景観遺伝学 / 集団遺伝学 / 水田生態系 / トンボ群集 (他6件)

【概要】統計モデルの構築によって、水田内の局所環境および水田周辺の景観の異質性が、3種のトンボ（ハラビロトンボ、シオヤトンボ、アキアカネ）の出現個体数に与える効果を検討した結果、個体数を説明する環境要因とそのスケールは種間で異なっていた。全般的な傾向としては、種間の飛翔能力の高低に対応したスケールにおける複数の環境要因が出現個体数に影響を与えており、これらのトンボの分布にとって水田と森林が入り混じるモザイ...

【研究テーマ】環境農学(含ランドスケープ科学)

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2014-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】武山 智博 岡山理科大学, 生物地球学部, 准教授 (70452266)

【キーワード】景観生態学 / 景観遺伝学 / 集団遺伝学 / 水田生態系 / トンボ群集 (他6件)

【概要】統計モデルの構築によって、水田内の局所環境および水田周辺の景観の異質性が、3種のトンボ（ハラビロトンボ、シオヤトンボ、アキアカネ）の出現個体数に与える効果を検討した結果、個体数を説明する環境要因とそのスケールは種間で異なっていた。全般的な傾向としては、種間の飛翔能力の高低に対応したスケールにおける複数の環境要因が出現個体数に影響を与えており、これらのトンボの分布にとって水田と森林が入り混じるモザイ...

【研究テーマ】林学・森林工学

【研究種目】萌芽研究

【研究期間】2006 - 2007

【研究代表者】練 春蘭 東京大学, アジア生物資源環境研究センター, 准教授 (40376695)

【キーワード】マイクロサテライトマーカー / 複合SSRアンカーマーカー / 作製法 / 共優性多型マーカー / 複合SSRプライマー (他8件)

【概要】平成19年度は主に以下のような結果が得られた。 1)引き続き、以下の生物種を用いて作製法の汎用性を検討した。 樹木:カワクルミ 動物:クワノザイセイチュウ、カシノナガキクイムシ 草本:レンゲショウマ、フジアザミ クワノザイセイチュウを除き、他の全ての種から共優性で多型性の高い複合SSRマーカーが得られた。このことから、考案した共優性SSRマーカー作製法は極めて汎用性が高いことが示された。現在、他の...

【研究テーマ】環境農学(含ランドスケープ科学)

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2014-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】武山 智博 岡山理科大学, 生物地球学部, 准教授 (70452266)

【キーワード】景観生態学 / 景観遺伝学 / 集団遺伝学 / 水田生態系 / トンボ群集 (他6件)

【概要】統計モデルの構築によって、水田内の局所環境および水田周辺の景観の異質性が、3種のトンボ（ハラビロトンボ、シオヤトンボ、アキアカネ）の出現個体数に与える効果を検討した結果、個体数を説明する環境要因とそのスケールは種間で異なっていた。全般的な傾向としては、種間の飛翔能力の高低に対応したスケールにおける複数の環境要因が出現個体数に影響を与えており、これらのトンボの分布にとって水田と森林が入り混じるモザイ...

【研究テーマ】環境農学(含ランドスケープ科学)

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2014-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】武山 智博 岡山理科大学, 生物地球学部, 准教授 (70452266)

【キーワード】景観生態学 / 景観遺伝学 / 集団遺伝学 / 水田生態系 / トンボ群集 (他6件)

【概要】統計モデルの構築によって、水田内の局所環境および水田周辺の景観の異質性が、3種のトンボ（ハラビロトンボ、シオヤトンボ、アキアカネ）の出現個体数に与える効果を検討した結果、個体数を説明する環境要因とそのスケールは種間で異なっていた。全般的な傾向としては、種間の飛翔能力の高低に対応したスケールにおける複数の環境要因が出現個体数に影響を与えており、これらのトンボの分布にとって水田と森林が入り混じるモザイ...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】岡根 泉 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (60260171)

【キーワード】サビキン / ベトナム / 熱帯植物 / 東南アジア / インベントリー (他15件)

【概要】すでに収集・保存しているベトナム北部、中部、南部のコーヒープランテーション産のコーヒーさび病菌の標本を供試し、コーヒーノキ（Coffea）とその近縁植物を宿主とするサビキンであるHemileia属サビキンの種の特定を行うとともに、遺伝子解析によるコーヒーさび病菌の種内変異について調査を行った。 その結果、ベトナムの主要コーヒー栽培地域では、広くさび病が発生していること、さび病の原因サビキン種はHe...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】竹内 一将 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (50622304)

【キーワード】生物物理学 / アクティブマター / バクテリア / 微小流体デバイス / 集団遺伝学 (他8件)

【概要】本研究では、微小流体デバイスを用いて二つの細菌集団を培養し、競合させるモデル生態系実験を実現して、その結果を統計力学的な見地から解析した。まず、高密度の細菌集団を均一な環境で培養し、長時間計測できる灌流型の微小流体デバイスを開発した。それを用いて、蛍光タンパク質で標識した二つの大腸菌株を培養したところ、二集団の占有領域にフラクタル状のパターン形成を見出した。我々は、パターンの統計的特徴や菌の配向秩...

【研究テーマ】環境農学(含ランドスケープ科学)

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2014-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】武山 智博 岡山理科大学, 生物地球学部, 准教授 (70452266)

【キーワード】景観生態学 / 景観遺伝学 / 集団遺伝学 / 水田生態系 / トンボ群集 (他6件)

【概要】統計モデルの構築によって、水田内の局所環境および水田周辺の景観の異質性が、3種のトンボ（ハラビロトンボ、シオヤトンボ、アキアカネ）の出現個体数に与える効果を検討した結果、個体数を説明する環境要因とそのスケールは種間で異なっていた。全般的な傾向としては、種間の飛翔能力の高低に対応したスケールにおける複数の環境要因が出現個体数に影響を与えており、これらのトンボの分布にとって水田と森林が入り混じるモザイ...

【研究テーマ】林学・森林工学

【研究種目】萌芽研究

【研究期間】2006 - 2007

【研究代表者】練 春蘭 東京大学, アジア生物資源環境研究センター, 准教授 (40376695)

【キーワード】マイクロサテライトマーカー / 複合SSRアンカーマーカー / 作製法 / 共優性多型マーカー / 複合SSRプライマー (他8件)

【概要】平成19年度は主に以下のような結果が得られた。 1)引き続き、以下の生物種を用いて作製法の汎用性を検討した。 樹木:カワクルミ 動物:クワノザイセイチュウ、カシノナガキクイムシ 草本:レンゲショウマ、フジアザミ クワノザイセイチュウを除き、他の全ての種から共優性で多型性の高い複合SSRマーカーが得られた。このことから、考案した共優性SSRマーカー作製法は極めて汎用性が高いことが示された。現在、他の...

【研究テーマ】水産学一般

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】菊池 潔 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教 (20292790)

【キーワード】遺伝 / 育種 / トラフグ / メダカ / 棘鰭上目魚類 (他11件)

【概要】魚類に分子育種法を適用するためには、全ゲノムを覆うマーカー座が必須あるが、マーカー座の種特異性は著しく高い。多くの魚種に利用可能なマーカー座を得るため、まず、トラフグのゲノム地図を作製した。次に、これを既報のメダカのゲノム地図と比較して、魚類において保存されたゲノム構造の特徴を明らかとした。この情報をもとに、モデル魚類間で保存されたマーカー座を同定した。これらの座を用いることで、非モデル魚であるマ...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2019-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】矢萩 拓也 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (50808029)

【キーワード】深海 / 熱水噴出孔 / 腹足動物 / 浮遊幼生 / 分析化学 (他13件)

【概要】本研究では、海底から表層圏を範囲に、深海熱水噴出域固有動物の浮遊幼生における生態、行動、鉛直・水平分布の包括的な調査を行うことで、分散機構を体系的に明らかにし、幼生分散が熱水域生物群集の成立、生態系の機能および物質循環に果たす役割を評価する。 付加成長する殻体をもつ貝類は、殻の形態観察や化学分析により個体の成長履歴を追うことができる点で、幼生分散研究において優れた分類群である。本研究では、深海熱水...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2019-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】矢萩 拓也 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (50808029)

【キーワード】深海 / 熱水噴出孔 / 腹足動物 / 浮遊幼生 / 分析化学 (他13件)

【概要】本研究では、海底から表層圏を範囲に、深海熱水噴出域固有動物の浮遊幼生における生態、行動、鉛直・水平分布の包括的な調査を行うことで、分散機構を体系的に明らかにし、幼生分散が熱水域生物群集の成立、生態系の機能および物質循環に果たす役割を評価する。 付加成長する殻体をもつ貝類は、殻の形態観察や化学分析により個体の成長履歴を追うことができる点で、幼生分散研究において優れた分類群である。本研究では、深海熱水...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2019-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】矢萩 拓也 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (50808029)

【キーワード】深海 / 熱水噴出孔 / 腹足動物 / 浮遊幼生 / 分析化学 (他13件)

【概要】本研究では、海底から表層圏を範囲に、深海熱水噴出域固有動物の浮遊幼生における生態、行動、鉛直・水平分布の包括的な調査を行うことで、分散機構を体系的に明らかにし、幼生分散が熱水域生物群集の成立、生態系の機能および物質循環に果たす役割を評価する。 付加成長する殻体をもつ貝類は、殻の形態観察や化学分析により個体の成長履歴を追うことができる点で、幼生分散研究において優れた分類群である。本研究では、深海熱水...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】岡根 泉 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (60260171)

【キーワード】サビキン / ベトナム / 熱帯植物 / 東南アジア / インベントリー (他15件)

【概要】すでに収集・保存しているベトナム北部、中部、南部のコーヒープランテーション産のコーヒーさび病菌の標本を供試し、コーヒーノキ（Coffea）とその近縁植物を宿主とするサビキンであるHemileia属サビキンの種の特定を行うとともに、遺伝子解析によるコーヒーさび病菌の種内変異について調査を行った。 その結果、ベトナムの主要コーヒー栽培地域では、広くさび病が発生していること、さび病の原因サビキン種はHe...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2024-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産資源研究所(横浜), グループ長 (90371799)

【キーワード】自然選択 / 一塩基多型 / 集団ゲノミクス / 集団遺伝学 / 分子生態学

【概要】本年度、静岡県浜名湖産のニホンウナギ（降河中の銀ウナギが中心）の新規標本を得た（N = 26)。これらの標本についてゲノムDNAを抽出した。一方、愛媛産のニホンウナギについてはCOVID19の影響でサンプリングが出来なかったため、研究分担者（横内一樹）が凍結保存していた標本（2016-2017年度採集。N = 56）で代用することにした。これらの標本からもDNAを抽出済みである。なお、愛媛産の標本...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2019-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】矢萩 拓也 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (50808029)

【キーワード】深海 / 熱水噴出孔 / 腹足動物 / 浮遊幼生 / 分析化学 (他13件)

【概要】本研究では、海底から表層圏を範囲に、深海熱水噴出域固有動物の浮遊幼生における生態、行動、鉛直・水平分布の包括的な調査を行うことで、分散機構を体系的に明らかにし、幼生分散が熱水域生物群集の成立、生態系の機能および物質循環に果たす役割を評価する。 付加成長する殻体をもつ貝類は、殻の形態観察や化学分析により個体の成長履歴を追うことができる点で、幼生分散研究において優れた分類群である。本研究では、深海熱水...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2019-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】矢萩 拓也 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (50808029)

【キーワード】深海 / 熱水噴出孔 / 腹足動物 / 浮遊幼生 / 分析化学 (他13件)

【概要】本研究では、海底から表層圏を範囲に、深海熱水噴出域固有動物の浮遊幼生における生態、行動、鉛直・水平分布の包括的な調査を行うことで、分散機構を体系的に明らかにし、幼生分散が熱水域生物群集の成立、生態系の機能および物質循環に果たす役割を評価する。 付加成長する殻体をもつ貝類は、殻の形態観察や化学分析により個体の成長履歴を追うことができる点で、幼生分散研究において優れた分類群である。本研究では、深海熱水...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2019-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】矢萩 拓也 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (50808029)

【キーワード】深海 / 熱水噴出孔 / 腹足動物 / 浮遊幼生 / 分析化学 (他13件)

【概要】本研究では、海底から表層圏を範囲に、深海熱水噴出域固有動物の浮遊幼生における生態、行動、鉛直・水平分布の包括的な調査を行うことで、分散機構を体系的に明らかにし、幼生分散が熱水域生物群集の成立、生態系の機能および物質循環に果たす役割を評価する。 付加成長する殻体をもつ貝類は、殻の形態観察や化学分析により個体の成長履歴を追うことができる点で、幼生分散研究において優れた分類群である。本研究では、深海熱水...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2024-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産資源研究所(横浜), グループ長 (90371799)

【キーワード】自然選択 / 一塩基多型 / 集団ゲノミクス / 集団遺伝学 / 分子生態学

【概要】本年度、静岡県浜名湖産のニホンウナギ（降河中の銀ウナギが中心）の新規標本を得た（N = 26)。これらの標本についてゲノムDNAを抽出した。一方、愛媛産のニホンウナギについてはCOVID19の影響でサンプリングが出来なかったため、研究分担者（横内一樹）が凍結保存していた標本（2016-2017年度採集。N = 56）で代用することにした。これらの標本からもDNAを抽出済みである。なお、愛媛産の標本...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...

【研究テーマ】林学・森林工学

【研究種目】萌芽研究

【研究期間】2006 - 2007

【研究代表者】練 春蘭 東京大学, アジア生物資源環境研究センター, 准教授 (40376695)

【キーワード】マイクロサテライトマーカー / 複合SSRアンカーマーカー / 作製法 / 共優性多型マーカー / 複合SSRプライマー (他8件)

【概要】平成19年度は主に以下のような結果が得られた。 1)引き続き、以下の生物種を用いて作製法の汎用性を検討した。 樹木:カワクルミ 動物:クワノザイセイチュウ、カシノナガキクイムシ 草本:レンゲショウマ、フジアザミ クワノザイセイチュウを除き、他の全ての種から共優性で多型性の高い複合SSRマーカーが得られた。このことから、考案した共優性SSRマーカー作製法は極めて汎用性が高いことが示された。現在、他の...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】岡根 泉 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (60260171)

【キーワード】サビキン / ベトナム / 熱帯植物 / 東南アジア / インベントリー (他15件)

【概要】すでに収集・保存しているベトナム北部、中部、南部のコーヒープランテーション産のコーヒーさび病菌の標本を供試し、コーヒーノキ（Coffea）とその近縁植物を宿主とするサビキンであるHemileia属サビキンの種の特定を行うとともに、遺伝子解析によるコーヒーさび病菌の種内変異について調査を行った。 その結果、ベトナムの主要コーヒー栽培地域では、広くさび病が発生していること、さび病の原因サビキン種はHe...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2019-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】矢萩 拓也 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (50808029)

【キーワード】深海 / 熱水噴出孔 / 腹足動物 / 浮遊幼生 / 分析化学 (他13件)

【概要】本研究では、海底から表層圏を範囲に、深海熱水噴出域固有動物の浮遊幼生における生態、行動、鉛直・水平分布の包括的な調査を行うことで、分散機構を体系的に明らかにし、幼生分散が熱水域生物群集の成立、生態系の機能および物質循環に果たす役割を評価する。 付加成長する殻体をもつ貝類は、殻の形態観察や化学分析により個体の成長履歴を追うことができる点で、幼生分散研究において優れた分類群である。本研究では、深海熱水...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2019-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】矢萩 拓也 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (50808029)

【キーワード】深海 / 熱水噴出孔 / 腹足動物 / 浮遊幼生 / 分析化学 (他13件)

【概要】本研究では、海底から表層圏を範囲に、深海熱水噴出域固有動物の浮遊幼生における生態、行動、鉛直・水平分布の包括的な調査を行うことで、分散機構を体系的に明らかにし、幼生分散が熱水域生物群集の成立、生態系の機能および物質循環に果たす役割を評価する。 付加成長する殻体をもつ貝類は、殻の形態観察や化学分析により個体の成長履歴を追うことができる点で、幼生分散研究において優れた分類群である。本研究では、深海熱水...

【研究テーマ】水産学一般

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】菊池 潔 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教 (20292790)

【キーワード】遺伝 / 育種 / トラフグ / メダカ / 棘鰭上目魚類 (他11件)

【概要】魚類に分子育種法を適用するためには、全ゲノムを覆うマーカー座が必須あるが、マーカー座の種特異性は著しく高い。多くの魚種に利用可能なマーカー座を得るため、まず、トラフグのゲノム地図を作製した。次に、これを既報のメダカのゲノム地図と比較して、魚類において保存されたゲノム構造の特徴を明らかとした。この情報をもとに、モデル魚類間で保存されたマーカー座を同定した。これらの座を用いることで、非モデル魚であるマ...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...

【研究テーマ】水産学一般

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】菊池 潔 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教 (20292790)

【キーワード】遺伝 / 育種 / トラフグ / メダカ / 棘鰭上目魚類 (他11件)

【概要】魚類に分子育種法を適用するためには、全ゲノムを覆うマーカー座が必須あるが、マーカー座の種特異性は著しく高い。多くの魚種に利用可能なマーカー座を得るため、まず、トラフグのゲノム地図を作製した。次に、これを既報のメダカのゲノム地図と比較して、魚類において保存されたゲノム構造の特徴を明らかとした。この情報をもとに、モデル魚類間で保存されたマーカー座を同定した。これらの座を用いることで、非モデル魚であるマ...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...

【研究テーマ】水産学一般

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】菊池 潔 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教 (20292790)

【キーワード】遺伝 / 育種 / トラフグ / メダカ / 棘鰭上目魚類 (他11件)

【概要】魚類に分子育種法を適用するためには、全ゲノムを覆うマーカー座が必須あるが、マーカー座の種特異性は著しく高い。多くの魚種に利用可能なマーカー座を得るため、まず、トラフグのゲノム地図を作製した。次に、これを既報のメダカのゲノム地図と比較して、魚類において保存されたゲノム構造の特徴を明らかとした。この情報をもとに、モデル魚類間で保存されたマーカー座を同定した。これらの座を用いることで、非モデル魚であるマ...

【研究テーマ】水産学一般

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】菊池 潔 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教 (20292790)

【キーワード】遺伝 / 育種 / トラフグ / メダカ / 棘鰭上目魚類 (他11件)

【概要】魚類に分子育種法を適用するためには、全ゲノムを覆うマーカー座が必須あるが、マーカー座の種特異性は著しく高い。多くの魚種に利用可能なマーカー座を得るため、まず、トラフグのゲノム地図を作製した。次に、これを既報のメダカのゲノム地図と比較して、魚類において保存されたゲノム構造の特徴を明らかとした。この情報をもとに、モデル魚類間で保存されたマーカー座を同定した。これらの座を用いることで、非モデル魚であるマ...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】水産学一般

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】菊池 潔 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教 (20292790)

【キーワード】遺伝 / 育種 / トラフグ / メダカ / 棘鰭上目魚類 (他11件)

【概要】魚類に分子育種法を適用するためには、全ゲノムを覆うマーカー座が必須あるが、マーカー座の種特異性は著しく高い。多くの魚種に利用可能なマーカー座を得るため、まず、トラフグのゲノム地図を作製した。次に、これを既報のメダカのゲノム地図と比較して、魚類において保存されたゲノム構造の特徴を明らかとした。この情報をもとに、モデル魚類間で保存されたマーカー座を同定した。これらの座を用いることで、非モデル魚であるマ...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】岡根 泉 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (60260171)

【キーワード】サビキン / ベトナム / 熱帯植物 / 東南アジア / インベントリー (他15件)

【概要】すでに収集・保存しているベトナム北部、中部、南部のコーヒープランテーション産のコーヒーさび病菌の標本を供試し、コーヒーノキ（Coffea）とその近縁植物を宿主とするサビキンであるHemileia属サビキンの種の特定を行うとともに、遺伝子解析によるコーヒーさび病菌の種内変異について調査を行った。 その結果、ベトナムの主要コーヒー栽培地域では、広くさび病が発生していること、さび病の原因サビキン種はHe...

【研究テーマ】生命・健康・医療情報学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】木立 尚孝 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)

【キーワード】バイオインフォマティクス / RNA / RNA二次構造 / アルゴリズム / RNA結合タンパク質 (他15件)

【概要】細胞内のRNA分子は、遺伝子に書き込まれた情報がタンパク質になり生理的な機能を発揮する上で非常に重要な役割を持つ。RNA分子の立体構造は、ステムと呼ばれる局所的二重らせん構造（二次構造）の３次元的な配置としてよく理解されることが知られており、二次構造の性質を解明することは、RNAの機能を理解する上で重要である。本研究において、我々は、メッセンジャーRNAや長鎖非コードRNAと呼ばれる長大なRNA分...

【研究テーマ】生命・健康・医療情報学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】木立 尚孝 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)

【キーワード】バイオインフォマティクス / RNA / RNA二次構造 / アルゴリズム / RNA結合タンパク質 (他15件)

【概要】細胞内のRNA分子は、遺伝子に書き込まれた情報がタンパク質になり生理的な機能を発揮する上で非常に重要な役割を持つ。RNA分子の立体構造は、ステムと呼ばれる局所的二重らせん構造（二次構造）の３次元的な配置としてよく理解されることが知られており、二次構造の性質を解明することは、RNAの機能を理解する上で重要である。本研究において、我々は、メッセンジャーRNAや長鎖非コードRNAと呼ばれる長大なRNA分...

【研究テーマ】

【研究種目】若手研究

【研究期間】2019-04-01 - 2023-03-31

【研究代表者】矢萩 拓也 東京大学, 大気海洋研究所, 助教 (50808029)

【キーワード】深海 / 熱水噴出孔 / 腹足動物 / 浮遊幼生 / 分析化学 (他13件)

【概要】本研究では、海底から表層圏を範囲に、深海熱水噴出域固有動物の浮遊幼生における生態、行動、鉛直・水平分布の包括的な調査を行うことで、分散機構を体系的に明らかにし、幼生分散が熱水域生物群集の成立、生態系の機能および物質循環に果たす役割を評価する。 付加成長する殻体をもつ貝類は、殻の形態観察や化学分析により個体の成長履歴を追うことができる点で、幼生分散研究において優れた分類群である。本研究では、深海熱水...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】野生メダカ / 水田農耕 / 拡散 / cytochrome P450 / 遺伝的多型 (他17件)

【概要】【背景】近年ヒト集団において膨大な遺伝的多型が報告されてきているが、対立遺伝子(アレル)間の機能的差違や進化的意義は不明な場合がほとんどである。 【目的】メダカを用いた多型の機能差を計る実験系を構築する。 【平成22年度の成果】(1)野生メダカ地域集団試料の収集:勝村啓史(協力者)は昨年に引き続き野生メダカのサンプリングをおこなった。特に北部九州(弥生時代に水田農耕が伝播したと考えられる地域)4地...

【研究テーマ】生命・健康・医療情報学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】木立 尚孝 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)

【キーワード】バイオインフォマティクス / RNA / RNA二次構造 / アルゴリズム / RNA結合タンパク質 (他15件)

【概要】細胞内のRNA分子は、遺伝子に書き込まれた情報がタンパク質になり生理的な機能を発揮する上で非常に重要な役割を持つ。RNA分子の立体構造は、ステムと呼ばれる局所的二重らせん構造（二次構造）の３次元的な配置としてよく理解されることが知られており、二次構造の性質を解明することは、RNAの機能を理解する上で重要である。本研究において、我々は、メッセンジャーRNAや長鎖非コードRNAと呼ばれる長大なRNA分...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2020-04-01 - 2024-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産資源研究所(横浜), グループ長 (90371799)

【キーワード】自然選択 / 一塩基多型 / 集団ゲノミクス / 集団遺伝学 / 分子生態学

【概要】本年度、静岡県浜名湖産のニホンウナギ（降河中の銀ウナギが中心）の新規標本を得た（N = 26)。これらの標本についてゲノムDNAを抽出した。一方、愛媛産のニホンウナギについてはCOVID19の影響でサンプリングが出来なかったため、研究分担者（横内一樹）が凍結保存していた標本（2016-2017年度採集。N = 56）で代用することにした。これらの標本からもDNAを抽出済みである。なお、愛媛産の標本...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...

【研究テーマ】自然人類学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)

【キーワード】ヒト / 日本列島 / ゲノム / 混血 / 琉球 (他22件)

【概要】本研究は「日本人の起源」を生物学的に検証する目的で詳細なサンプリングとゲノム解析をおこなった。その結果、日本人の集団構造をより高い解像度で明らかにした。【詳細】1.　琉球諸島住民のゲノム解析の結果、①琉球諸島は本土日本とは異なるクラスターを形成し、②石垣島で最近発見された1万7千年前の人骨と現在の先島諸島住民との遺伝的継続性は否定された（Sato et al. 2014）。2.　アイヌ、漢民族、本...

【研究テーマ】水産学一般

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】菊池 潔 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教 (20292790)

【キーワード】遺伝 / 育種 / トラフグ / メダカ / 棘鰭上目魚類 (他11件)

【概要】魚類に分子育種法を適用するためには、全ゲノムを覆うマーカー座が必須あるが、マーカー座の種特異性は著しく高い。多くの魚種に利用可能なマーカー座を得るため、まず、トラフグのゲノム地図を作製した。次に、これを既報のメダカのゲノム地図と比較して、魚類において保存されたゲノム構造の特徴を明らかとした。この情報をもとに、モデル魚類間で保存されたマーカー座を同定した。これらの座を用いることで、非モデル魚であるマ...

【研究テーマ】生命・健康・医療情報学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】木立 尚孝 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)

【キーワード】バイオインフォマティクス / RNA / RNA二次構造 / アルゴリズム / RNA結合タンパク質 (他15件)

【概要】細胞内のRNA分子は、遺伝子に書き込まれた情報がタンパク質になり生理的な機能を発揮する上で非常に重要な役割を持つ。RNA分子の立体構造は、ステムと呼ばれる局所的二重らせん構造（二次構造）の３次元的な配置としてよく理解されることが知られており、二次構造の性質を解明することは、RNAの機能を理解する上で重要である。本研究において、我々は、メッセンジャーRNAや長鎖非コードRNAと呼ばれる長大なRNA分...

【研究テーマ】水産学一般

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】菊池 潔 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教 (20292790)

【キーワード】遺伝 / 育種 / トラフグ / メダカ / 棘鰭上目魚類 (他11件)

【概要】魚類に分子育種法を適用するためには、全ゲノムを覆うマーカー座が必須あるが、マーカー座の種特異性は著しく高い。多くの魚種に利用可能なマーカー座を得るため、まず、トラフグのゲノム地図を作製した。次に、これを既報のメダカのゲノム地図と比較して、魚類において保存されたゲノム構造の特徴を明らかとした。この情報をもとに、モデル魚類間で保存されたマーカー座を同定した。これらの座を用いることで、非モデル魚であるマ...

【研究テーマ】水圏生産科学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】關野 正志 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (90371799)

【キーワード】交雑 / 遺伝子浸透 / 集団遺伝学 / 集団ゲノム学 / 一塩基多型 (他17件)

【概要】大型二枚貝のタイラギは，貝殻表現型に基づき有鱗型と無鱗型に分けられる。しかし両種の同所分布域（瀬戸内海）では、形態が不明瞭な中間型個体が頻繁に観察される。このような個体は、種間交雑と，それに続く遺伝子浸透（雑種F1を介した種間の遺伝子交換）により生じていると考えられるが，十分な検証がなされていない。そこで本研究では，核DNAの一塩基多型解析により、有隣型－無鱗型間の交雑・遺伝子浸透を調べた。その結...