【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1995 - 1997

【研究代表者】太田 博道 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (30152151)

【キーワード】酵素反応 / 不斉脱炭酸反応 / 基質特異性 / ランダム変異 / 部位特異的変異 (他13件)

【概要】我々が発見した二置換マロン酸を不斉脱炭酸する酵素(AMDase)は補因子を全く必要としない非常にユニークな脱炭酸酵素であり、240個のアミノ酸からなる。4個含まれるシステインの内1個が活性部位にあって、反応に重要な役割を担っていることが明らかになっている。部位特異的変異によってこれらのシステインのうち何れか1個だけをセリンに変えた変異酵素4種類を作ってその活性をそれぞれ調べた。その結果、N端から数...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1995 - 1997

【研究代表者】太田 博道 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (30152151)

【キーワード】酵素反応 / 不斉脱炭酸反応 / 基質特異性 / ランダム変異 / 部位特異的変異 (他13件)

【概要】我々が発見した二置換マロン酸を不斉脱炭酸する酵素(AMDase)は補因子を全く必要としない非常にユニークな脱炭酸酵素であり、240個のアミノ酸からなる。4個含まれるシステインの内1個が活性部位にあって、反応に重要な役割を担っていることが明らかになっている。部位特異的変異によってこれらのシステインのうち何れか1個だけをセリンに変えた変異酵素4種類を作ってその活性をそれぞれ調べた。その結果、N端から数...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1995 - 1997

【研究代表者】太田 博道 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (30152151)

【キーワード】酵素反応 / 不斉脱炭酸反応 / 基質特異性 / ランダム変異 / 部位特異的変異 (他13件)

【概要】我々が発見した二置換マロン酸を不斉脱炭酸する酵素(AMDase)は補因子を全く必要としない非常にユニークな脱炭酸酵素であり、240個のアミノ酸からなる。4個含まれるシステインの内1個が活性部位にあって、反応に重要な役割を担っていることが明らかになっている。部位特異的変異によってこれらのシステインのうち何れか1個だけをセリンに変えた変異酵素4種類を作ってその活性をそれぞれ調べた。その結果、N端から数...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1995 - 1997

【研究代表者】太田 博道 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (30152151)

【キーワード】酵素反応 / 不斉脱炭酸反応 / 基質特異性 / ランダム変異 / 部位特異的変異 (他13件)

【概要】我々が発見した二置換マロン酸を不斉脱炭酸する酵素(AMDase)は補因子を全く必要としない非常にユニークな脱炭酸酵素であり、240個のアミノ酸からなる。4個含まれるシステインの内1個が活性部位にあって、反応に重要な役割を担っていることが明らかになっている。部位特異的変異によってこれらのシステインのうち何れか1個だけをセリンに変えた変異酵素4種類を作ってその活性をそれぞれ調べた。その結果、N端から数...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1995 - 1997

【研究代表者】太田 博道 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (30152151)

【キーワード】酵素反応 / 不斉脱炭酸反応 / 基質特異性 / ランダム変異 / 部位特異的変異 (他13件)

【概要】我々が発見した二置換マロン酸を不斉脱炭酸する酵素(AMDase)は補因子を全く必要としない非常にユニークな脱炭酸酵素であり、240個のアミノ酸からなる。4個含まれるシステインの内1個が活性部位にあって、反応に重要な役割を担っていることが明らかになっている。部位特異的変異によってこれらのシステインのうち何れか1個だけをセリンに変えた変異酵素4種類を作ってその活性をそれぞれ調べた。その結果、N端から数...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1995 - 1997

【研究代表者】太田 博道 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (30152151)

【キーワード】酵素反応 / 不斉脱炭酸反応 / 基質特異性 / ランダム変異 / 部位特異的変異 (他13件)

【概要】我々が発見した二置換マロン酸を不斉脱炭酸する酵素(AMDase)は補因子を全く必要としない非常にユニークな脱炭酸酵素であり、240個のアミノ酸からなる。4個含まれるシステインの内1個が活性部位にあって、反応に重要な役割を担っていることが明らかになっている。部位特異的変異によってこれらのシステインのうち何れか1個だけをセリンに変えた変異酵素4種類を作ってその活性をそれぞれ調べた。その結果、N端から数...

【研究テーマ】生物・生体工学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1996

【研究代表者】喜多山 篤 東京大学, 工学系研究科, 助手 (70270882)

【キーワード】カテコール / C230 / 基質特異性

【概要】Pseudomonasaeruginosa JI104の3つのC230のうちの一つXylE_<JI104>はTOLプラスミド上のC230、XylE_<TOL>と一次配列上、非常に相同性が高い。両者の基質特異性の傾向はかなり似ているが、4-chlorocatecholに対する反応性だけが異なっている。先頃、ビフェニル分解において1つ目の芳香環のメタ位開裂を行う酵素BphCの3...

【研究テーマ】生物資源科学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】柘植 丈治 東京工業大学, 大学院・総合理工学研究科, 助手 (70332260)

【キーワード】バイオポリエステル / ポリヒドロキシアルカン酸 / 代謝工学 / 生分解性プラスチック / エノイルCoAヒドラターゼ (他9件)

【概要】本研究は、様々な組成からなるバイオポリエステルを代謝工学的手法を用いて合成し、その基礎的な高分子物性を解析することを目的として行った。これまでに知られているバイオポリエステルの物性は、硬くて脆いか、柔らかすぎるエラストマー状態のどちらかであった。我々が期待する物性は、それらの中間の物性を有し、フイルム状に成型加工が可能なものである。この目的に合う物性を発揮するポリマーとして、炭素鎖数4の3-ヒドロ...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1995 - 1997

【研究代表者】太田 博道 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (30152151)

【キーワード】酵素反応 / 不斉脱炭酸反応 / 基質特異性 / ランダム変異 / 部位特異的変異 (他13件)

【概要】我々が発見した二置換マロン酸を不斉脱炭酸する酵素(AMDase)は補因子を全く必要としない非常にユニークな脱炭酸酵素であり、240個のアミノ酸からなる。4個含まれるシステインの内1個が活性部位にあって、反応に重要な役割を担っていることが明らかになっている。部位特異的変異によってこれらのシステインのうち何れか1個だけをセリンに変えた変異酵素4種類を作ってその活性をそれぞれ調べた。その結果、N端から数...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】生物・生体工学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1996

【研究代表者】喜多山 篤 東京大学, 工学系研究科, 助手 (70270882)

【キーワード】カテコール / C230 / 基質特異性

【概要】Pseudomonasaeruginosa JI104の3つのC230のうちの一つXylE_<JI104>はTOLプラスミド上のC230、XylE_<TOL>と一次配列上、非常に相同性が高い。両者の基質特異性の傾向はかなり似ているが、4-chlorocatecholに対する反応性だけが異なっている。先頃、ビフェニル分解において1つ目の芳香環のメタ位開裂を行う酵素BphCの3...

【研究テーマ】生物機能・バイオプロセス

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2005 - 2007

【研究代表者】田口 精一 北海道大学, 大学院・工学研究科, 教授 (70216828)

【キーワード】生分解性プラスチック / ポリヒドロキシアルカン酸 / 進化分子工学 / 重合酵素 / 基質特異性 (他8件)

【概要】資源循環型バイオプラスチック生合成酵素の進化工学的改変により、バイオポリエステルの生産性・物性を積極的に改善する研究を展開してきた。最終年度は、ポリマーの共重合化におけるモノマー分率制御を精密に行ない、かつ分子量変化がダイナミックに実現する進化酵素を多数創出することを目的として、所期の水準に十分達した成果が得られた。 人工進化システムから得られた複数の優良変異部位4箇所(130,325,477,4...

【研究テーマ】生物資源科学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】柘植 丈治 東京工業大学, 大学院・総合理工学研究科, 助手 (70332260)

【キーワード】バイオポリエステル / ポリヒドロキシアルカン酸 / 代謝工学 / 生分解性プラスチック / エノイルCoAヒドラターゼ (他9件)

【概要】本研究は、様々な組成からなるバイオポリエステルを代謝工学的手法を用いて合成し、その基礎的な高分子物性を解析することを目的として行った。これまでに知られているバイオポリエステルの物性は、硬くて脆いか、柔らかすぎるエラストマー状態のどちらかであった。我々が期待する物性は、それらの中間の物性を有し、フイルム状に成型加工が可能なものである。この目的に合う物性を発揮するポリマーとして、炭素鎖数4の3-ヒドロ...

【研究テーマ】生物機能・バイオプロセス

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2005 - 2007

【研究代表者】田口 精一 北海道大学, 大学院・工学研究科, 教授 (70216828)

【キーワード】生分解性プラスチック / ポリヒドロキシアルカン酸 / 進化分子工学 / 重合酵素 / 基質特異性 (他8件)

【概要】資源循環型バイオプラスチック生合成酵素の進化工学的改変により、バイオポリエステルの生産性・物性を積極的に改善する研究を展開してきた。最終年度は、ポリマーの共重合化におけるモノマー分率制御を精密に行ない、かつ分子量変化がダイナミックに実現する進化酵素を多数創出することを目的として、所期の水準に十分達した成果が得られた。 人工進化システムから得られた複数の優良変異部位4箇所(130,325,477,4...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2011-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】反町 洋之 公益財団法人東京都医学総合研究所, 生体分子先端研究分野, 分野長 (10211327)

【キーワード】カルパイン / プロテオリシス / 質量分析 / 筋ジストロフィー / 胃腸疾患 (他10件)

【概要】カルパイン(CAPN)は、限定分解により基質機能を調節するプロテアーゼである。CAPN1/2は古くから研究されながら、その普遍性のため機能解明が難航している。申請者らは組織特異的分子種を発見し、発現組織機能と関連づけて生理機能を解析してきた。その結果CAPN3、8/9の機能不全は筋ジストロフィー、胃疾患の原因となることを明らかにした。しかし各分子の作用機序は不明な点が多い。そこで組織特異的CAPN...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2011-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】反町 洋之 公益財団法人東京都医学総合研究所, 生体分子先端研究分野, 分野長 (10211327)

【キーワード】カルパイン / プロテオリシス / 質量分析 / 筋ジストロフィー / 胃腸疾患 (他10件)

【概要】カルパイン(CAPN)は、限定分解により基質機能を調節するプロテアーゼである。CAPN1/2は古くから研究されながら、その普遍性のため機能解明が難航している。申請者らは組織特異的分子種を発見し、発現組織機能と関連づけて生理機能を解析してきた。その結果CAPN3、8/9の機能不全は筋ジストロフィー、胃疾患の原因となることを明らかにした。しかし各分子の作用機序は不明な点が多い。そこで組織特異的CAPN...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2011-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】反町 洋之 公益財団法人東京都医学総合研究所, 生体分子先端研究分野, 分野長 (10211327)

【キーワード】カルパイン / プロテオリシス / 質量分析 / 筋ジストロフィー / 胃腸疾患 (他10件)

【概要】カルパイン(CAPN)は、限定分解により基質機能を調節するプロテアーゼである。CAPN1/2は古くから研究されながら、その普遍性のため機能解明が難航している。申請者らは組織特異的分子種を発見し、発現組織機能と関連づけて生理機能を解析してきた。その結果CAPN3、8/9の機能不全は筋ジストロフィー、胃疾患の原因となることを明らかにした。しかし各分子の作用機序は不明な点が多い。そこで組織特異的CAPN...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2011-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】反町 洋之 公益財団法人東京都医学総合研究所, 生体分子先端研究分野, 分野長 (10211327)

【キーワード】カルパイン / プロテオリシス / 質量分析 / 筋ジストロフィー / 胃腸疾患 (他10件)

【概要】カルパイン(CAPN)は、限定分解により基質機能を調節するプロテアーゼである。CAPN1/2は古くから研究されながら、その普遍性のため機能解明が難航している。申請者らは組織特異的分子種を発見し、発現組織機能と関連づけて生理機能を解析してきた。その結果CAPN3、8/9の機能不全は筋ジストロフィー、胃疾患の原因となることを明らかにした。しかし各分子の作用機序は不明な点が多い。そこで組織特異的CAPN...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 教授 (00208240)

【キーワード】Thermus属細菌 / リジン生合成 / 基質特異性 / X線結晶構造解析 / 分子進化工学 (他12件)

【概要】1)Thermus thermophilusにおいて、ホモアコニターゼの酵素学的諸性質を解析し、同酵素が第3番目の反応を触媒出来るものの、第2番目については触媒出来ないことを明らかにした。2)αアミノアジピン酸アミノ基転移酵素(AAA-AT)について、ピリドキサールリン酸(PLP)複合体構造、およびPLP+ロイシン複合体構造などをX線結晶構造解析により決定した。AAA-ATは、リジン生合成の基質で...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 教授 (00208240)

【キーワード】Thermus属細菌 / リジン生合成 / 基質特異性 / X線結晶構造解析 / 分子進化工学 (他12件)

【概要】1)Thermus thermophilusにおいて、ホモアコニターゼの酵素学的諸性質を解析し、同酵素が第3番目の反応を触媒出来るものの、第2番目については触媒出来ないことを明らかにした。2)αアミノアジピン酸アミノ基転移酵素(AAA-AT)について、ピリドキサールリン酸(PLP)複合体構造、およびPLP+ロイシン複合体構造などをX線結晶構造解析により決定した。AAA-ATは、リジン生合成の基質で...

【研究テーマ】応用微生物学・応用生物化学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 助教授 (00208240)

【キーワード】リジン生合成 / Thermus thermophilus / αアミノアジピン酸 / 基質特異性 / アルギニン生合成 (他9件)

【概要】我々は、Thermusでは、リジンがジアミノピメリン酸を介さない経路(αアミノアジピン酸経路)で合成されることを見いだした。しかしながら、その経路がカビ・酵母で見られるものと異なり、経路の後半はアルギニン生合成と似た反応によることを示唆してきた。これまでに行ってきた生合成経路の解析により、リジンは2-オキソグルタル酸から10段階の反応を経て合成されると予想される。まだクローニングができていなかった...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2011-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】反町 洋之 公益財団法人東京都医学総合研究所, 生体分子先端研究分野, 分野長 (10211327)

【キーワード】カルパイン / プロテオリシス / 質量分析 / 筋ジストロフィー / 胃腸疾患 (他10件)

【概要】カルパイン(CAPN)は、限定分解により基質機能を調節するプロテアーゼである。CAPN1/2は古くから研究されながら、その普遍性のため機能解明が難航している。申請者らは組織特異的分子種を発見し、発現組織機能と関連づけて生理機能を解析してきた。その結果CAPN3、8/9の機能不全は筋ジストロフィー、胃疾患の原因となることを明らかにした。しかし各分子の作用機序は不明な点が多い。そこで組織特異的CAPN...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1995 - 1997

【研究代表者】太田 博道 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (30152151)

【キーワード】酵素反応 / 不斉脱炭酸反応 / 基質特異性 / ランダム変異 / 部位特異的変異 (他13件)

【概要】我々が発見した二置換マロン酸を不斉脱炭酸する酵素(AMDase)は補因子を全く必要としない非常にユニークな脱炭酸酵素であり、240個のアミノ酸からなる。4個含まれるシステインの内1個が活性部位にあって、反応に重要な役割を担っていることが明らかになっている。部位特異的変異によってこれらのシステインのうち何れか1個だけをセリンに変えた変異酵素4種類を作ってその活性をそれぞれ調べた。その結果、N端から数...

【研究テーマ】生物機能・バイオプロセス

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2005 - 2007

【研究代表者】田口 精一 北海道大学, 大学院・工学研究科, 教授 (70216828)

【キーワード】生分解性プラスチック / ポリヒドロキシアルカン酸 / 進化分子工学 / 重合酵素 / 基質特異性 (他8件)

【概要】資源循環型バイオプラスチック生合成酵素の進化工学的改変により、バイオポリエステルの生産性・物性を積極的に改善する研究を展開してきた。最終年度は、ポリマーの共重合化におけるモノマー分率制御を精密に行ない、かつ分子量変化がダイナミックに実現する進化酵素を多数創出することを目的として、所期の水準に十分達した成果が得られた。 人工進化システムから得られた複数の優良変異部位4箇所(130,325,477,4...

【研究テーマ】生物機能・バイオプロセス

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2005 - 2007

【研究代表者】田口 精一 北海道大学, 大学院・工学研究科, 教授 (70216828)

【キーワード】生分解性プラスチック / ポリヒドロキシアルカン酸 / 進化分子工学 / 重合酵素 / 基質特異性 (他8件)

【概要】資源循環型バイオプラスチック生合成酵素の進化工学的改変により、バイオポリエステルの生産性・物性を積極的に改善する研究を展開してきた。最終年度は、ポリマーの共重合化におけるモノマー分率制御を精密に行ない、かつ分子量変化がダイナミックに実現する進化酵素を多数創出することを目的として、所期の水準に十分達した成果が得られた。 人工進化システムから得られた複数の優良変異部位4箇所(130,325,477,4...

【研究テーマ】生物資源科学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】柘植 丈治 東京工業大学, 大学院・総合理工学研究科, 助手 (70332260)

【キーワード】バイオポリエステル / ポリヒドロキシアルカン酸 / 代謝工学 / 生分解性プラスチック / エノイルCoAヒドラターゼ (他9件)

【概要】本研究は、様々な組成からなるバイオポリエステルを代謝工学的手法を用いて合成し、その基礎的な高分子物性を解析することを目的として行った。これまでに知られているバイオポリエステルの物性は、硬くて脆いか、柔らかすぎるエラストマー状態のどちらかであった。我々が期待する物性は、それらの中間の物性を有し、フイルム状に成型加工が可能なものである。この目的に合う物性を発揮するポリマーとして、炭素鎖数4の3-ヒドロ...

【研究テーマ】生物資源科学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】柘植 丈治 東京工業大学, 大学院・総合理工学研究科, 助手 (70332260)

【キーワード】バイオポリエステル / ポリヒドロキシアルカン酸 / 代謝工学 / 生分解性プラスチック / エノイルCoAヒドラターゼ (他9件)

【概要】本研究は、様々な組成からなるバイオポリエステルを代謝工学的手法を用いて合成し、その基礎的な高分子物性を解析することを目的として行った。これまでに知られているバイオポリエステルの物性は、硬くて脆いか、柔らかすぎるエラストマー状態のどちらかであった。我々が期待する物性は、それらの中間の物性を有し、フイルム状に成型加工が可能なものである。この目的に合う物性を発揮するポリマーとして、炭素鎖数4の3-ヒドロ...

【研究テーマ】生物分子科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】海老塚 豊 国立医薬品食品衛生研究所, 生薬部, 客員研究員 (90107384)

【キーワード】生合成 / メロテルペノイド / 遺伝子 / 糸状菌 / 遺伝子クラスター (他13件)

【概要】糸状菌ゲノムデータベースを対象に、ポリケタイド合成酵素およびプレニル基転移酵素の共存する遺伝子クラスターを検索することで、2種のメロテルペノイド生合成遺伝子クラスターを見いだし、各酵素遺伝子を異種糸状菌で発現することにより機能同定した。これらの酵素はいずれも既知生合成酵素とは反応性、特異性を異にする新規な酵素であり、天然物の構造多様性拡大への貢献が期待される。また、異種糸状菌での共発現によるメロテ...

【研究テーマ】生物分子科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】海老塚 豊 国立医薬品食品衛生研究所, 生薬部, 客員研究員 (90107384)

【キーワード】生合成 / メロテルペノイド / 遺伝子 / 糸状菌 / 遺伝子クラスター (他13件)

【概要】糸状菌ゲノムデータベースを対象に、ポリケタイド合成酵素およびプレニル基転移酵素の共存する遺伝子クラスターを検索することで、2種のメロテルペノイド生合成遺伝子クラスターを見いだし、各酵素遺伝子を異種糸状菌で発現することにより機能同定した。これらの酵素はいずれも既知生合成酵素とは反応性、特異性を異にする新規な酵素であり、天然物の構造多様性拡大への貢献が期待される。また、異種糸状菌での共発現によるメロテ...

【研究テーマ】生物分子科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】海老塚 豊 国立医薬品食品衛生研究所, 生薬部, 客員研究員 (90107384)

【キーワード】生合成 / メロテルペノイド / 遺伝子 / 糸状菌 / 遺伝子クラスター (他13件)

【概要】糸状菌ゲノムデータベースを対象に、ポリケタイド合成酵素およびプレニル基転移酵素の共存する遺伝子クラスターを検索することで、2種のメロテルペノイド生合成遺伝子クラスターを見いだし、各酵素遺伝子を異種糸状菌で発現することにより機能同定した。これらの酵素はいずれも既知生合成酵素とは反応性、特異性を異にする新規な酵素であり、天然物の構造多様性拡大への貢献が期待される。また、異種糸状菌での共発現によるメロテ...

【研究テーマ】生物分子科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】海老塚 豊 国立医薬品食品衛生研究所, 生薬部, 客員研究員 (90107384)

【キーワード】生合成 / メロテルペノイド / 遺伝子 / 糸状菌 / 遺伝子クラスター (他13件)

【概要】糸状菌ゲノムデータベースを対象に、ポリケタイド合成酵素およびプレニル基転移酵素の共存する遺伝子クラスターを検索することで、2種のメロテルペノイド生合成遺伝子クラスターを見いだし、各酵素遺伝子を異種糸状菌で発現することにより機能同定した。これらの酵素はいずれも既知生合成酵素とは反応性、特異性を異にする新規な酵素であり、天然物の構造多様性拡大への貢献が期待される。また、異種糸状菌での共発現によるメロテ...

【研究テーマ】生物分子科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】海老塚 豊 国立医薬品食品衛生研究所, 生薬部, 客員研究員 (90107384)

【キーワード】生合成 / メロテルペノイド / 遺伝子 / 糸状菌 / 遺伝子クラスター (他13件)

【概要】糸状菌ゲノムデータベースを対象に、ポリケタイド合成酵素およびプレニル基転移酵素の共存する遺伝子クラスターを検索することで、2種のメロテルペノイド生合成遺伝子クラスターを見いだし、各酵素遺伝子を異種糸状菌で発現することにより機能同定した。これらの酵素はいずれも既知生合成酵素とは反応性、特異性を異にする新規な酵素であり、天然物の構造多様性拡大への貢献が期待される。また、異種糸状菌での共発現によるメロテ...

【研究テーマ】生物分子科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】海老塚 豊 国立医薬品食品衛生研究所, 生薬部, 客員研究員 (90107384)

【キーワード】生合成 / メロテルペノイド / 遺伝子 / 糸状菌 / 遺伝子クラスター (他13件)

【概要】糸状菌ゲノムデータベースを対象に、ポリケタイド合成酵素およびプレニル基転移酵素の共存する遺伝子クラスターを検索することで、2種のメロテルペノイド生合成遺伝子クラスターを見いだし、各酵素遺伝子を異種糸状菌で発現することにより機能同定した。これらの酵素はいずれも既知生合成酵素とは反応性、特異性を異にする新規な酵素であり、天然物の構造多様性拡大への貢献が期待される。また、異種糸状菌での共発現によるメロテ...

【研究テーマ】生物分子科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】海老塚 豊 国立医薬品食品衛生研究所, 生薬部, 客員研究員 (90107384)

【キーワード】生合成 / メロテルペノイド / 遺伝子 / 糸状菌 / 遺伝子クラスター (他13件)

【概要】糸状菌ゲノムデータベースを対象に、ポリケタイド合成酵素およびプレニル基転移酵素の共存する遺伝子クラスターを検索することで、2種のメロテルペノイド生合成遺伝子クラスターを見いだし、各酵素遺伝子を異種糸状菌で発現することにより機能同定した。これらの酵素はいずれも既知生合成酵素とは反応性、特異性を異にする新規な酵素であり、天然物の構造多様性拡大への貢献が期待される。また、異種糸状菌での共発現によるメロテ...

【研究テーマ】生物分子科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】海老塚 豊 国立医薬品食品衛生研究所, 生薬部, 客員研究員 (90107384)

【キーワード】生合成 / メロテルペノイド / 遺伝子 / 糸状菌 / 遺伝子クラスター (他13件)

【概要】糸状菌ゲノムデータベースを対象に、ポリケタイド合成酵素およびプレニル基転移酵素の共存する遺伝子クラスターを検索することで、2種のメロテルペノイド生合成遺伝子クラスターを見いだし、各酵素遺伝子を異種糸状菌で発現することにより機能同定した。これらの酵素はいずれも既知生合成酵素とは反応性、特異性を異にする新規な酵素であり、天然物の構造多様性拡大への貢献が期待される。また、異種糸状菌での共発現によるメロテ...

【研究テーマ】応用微生物学・応用生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】梶原 将 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (10272668)

【キーワード】酵母 / 脂肪酸 / 基質特異性 / エタノール耐性

【概要】昨年度の研究では、S.cerevisiaeのOLE1蛋白質で認められるC16:0に対する基質優先性が105番目から257番目のアミノ酸残基の間の領域に依存していることが分かった。そこで、本年度はこの領域を再度細分化したキメラ酵素遺伝子を作製して、基質優先性に関与するアミノ酸残基を特定することを試みた。その結果、105-257領域を細分化したキメラ酵素遺伝子のうち、C末端側の17アミノ酸残基をS.k...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 教授 (00208240)

【キーワード】Thermus属細菌 / リジン生合成 / 基質特異性 / X線結晶構造解析 / 分子進化工学 (他12件)

【概要】1)Thermus thermophilusにおいて、ホモアコニターゼの酵素学的諸性質を解析し、同酵素が第3番目の反応を触媒出来るものの、第2番目については触媒出来ないことを明らかにした。2)αアミノアジピン酸アミノ基転移酵素(AAA-AT)について、ピリドキサールリン酸(PLP)複合体構造、およびPLP+ロイシン複合体構造などをX線結晶構造解析により決定した。AAA-ATは、リジン生合成の基質で...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】生物分子科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】海老塚 豊 国立医薬品食品衛生研究所, 生薬部, 客員研究員 (90107384)

【キーワード】生合成 / メロテルペノイド / 遺伝子 / 糸状菌 / 遺伝子クラスター (他13件)

【概要】糸状菌ゲノムデータベースを対象に、ポリケタイド合成酵素およびプレニル基転移酵素の共存する遺伝子クラスターを検索することで、2種のメロテルペノイド生合成遺伝子クラスターを見いだし、各酵素遺伝子を異種糸状菌で発現することにより機能同定した。これらの酵素はいずれも既知生合成酵素とは反応性、特異性を異にする新規な酵素であり、天然物の構造多様性拡大への貢献が期待される。また、異種糸状菌での共発現によるメロテ...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2011-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】反町 洋之 公益財団法人東京都医学総合研究所, 生体分子先端研究分野, 分野長 (10211327)

【キーワード】カルパイン / プロテオリシス / 質量分析 / 筋ジストロフィー / 胃腸疾患 (他10件)

【概要】カルパイン(CAPN)は、限定分解により基質機能を調節するプロテアーゼである。CAPN1/2は古くから研究されながら、その普遍性のため機能解明が難航している。申請者らは組織特異的分子種を発見し、発現組織機能と関連づけて生理機能を解析してきた。その結果CAPN3、8/9の機能不全は筋ジストロフィー、胃疾患の原因となることを明らかにした。しかし各分子の作用機序は不明な点が多い。そこで組織特異的CAPN...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1995 - 1997

【研究代表者】太田 博道 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (30152151)

【キーワード】酵素反応 / 不斉脱炭酸反応 / 基質特異性 / ランダム変異 / 部位特異的変異 (他13件)

【概要】我々が発見した二置換マロン酸を不斉脱炭酸する酵素(AMDase)は補因子を全く必要としない非常にユニークな脱炭酸酵素であり、240個のアミノ酸からなる。4個含まれるシステインの内1個が活性部位にあって、反応に重要な役割を担っていることが明らかになっている。部位特異的変異によってこれらのシステインのうち何れか1個だけをセリンに変えた変異酵素4種類を作ってその活性をそれぞれ調べた。その結果、N端から数...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 教授 (00208240)

【キーワード】Thermus属細菌 / リジン生合成 / 基質特異性 / X線結晶構造解析 / 分子進化工学 (他12件)

【概要】1)Thermus thermophilusにおいて、ホモアコニターゼの酵素学的諸性質を解析し、同酵素が第3番目の反応を触媒出来るものの、第2番目については触媒出来ないことを明らかにした。2)αアミノアジピン酸アミノ基転移酵素(AAA-AT)について、ピリドキサールリン酸(PLP)複合体構造、およびPLP+ロイシン複合体構造などをX線結晶構造解析により決定した。AAA-ATは、リジン生合成の基質で...

【研究テーマ】応用微生物学・応用生物化学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 助教授 (00208240)

【キーワード】リジン生合成 / Thermus thermophilus / αアミノアジピン酸 / 基質特異性 / アルギニン生合成 (他9件)

【概要】我々は、Thermusでは、リジンがジアミノピメリン酸を介さない経路(αアミノアジピン酸経路)で合成されることを見いだした。しかしながら、その経路がカビ・酵母で見られるものと異なり、経路の後半はアルギニン生合成と似た反応によることを示唆してきた。これまでに行ってきた生合成経路の解析により、リジンは2-オキソグルタル酸から10段階の反応を経て合成されると予想される。まだクローニングができていなかった...

【研究テーマ】応用微生物学・応用生物化学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 助教授 (00208240)

【キーワード】リジン生合成 / Thermus thermophilus / αアミノアジピン酸 / 基質特異性 / アルギニン生合成 (他9件)

【概要】我々は、Thermusでは、リジンがジアミノピメリン酸を介さない経路(αアミノアジピン酸経路)で合成されることを見いだした。しかしながら、その経路がカビ・酵母で見られるものと異なり、経路の後半はアルギニン生合成と似た反応によることを示唆してきた。これまでに行ってきた生合成経路の解析により、リジンは2-オキソグルタル酸から10段階の反応を経て合成されると予想される。まだクローニングができていなかった...

【研究テーマ】応用微生物学・応用生物化学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 助教授 (00208240)

【キーワード】リジン生合成 / Thermus thermophilus / αアミノアジピン酸 / 基質特異性 / アルギニン生合成 (他9件)

【概要】我々は、Thermusでは、リジンがジアミノピメリン酸を介さない経路(αアミノアジピン酸経路)で合成されることを見いだした。しかしながら、その経路がカビ・酵母で見られるものと異なり、経路の後半はアルギニン生合成と似た反応によることを示唆してきた。これまでに行ってきた生合成経路の解析により、リジンは2-オキソグルタル酸から10段階の反応を経て合成されると予想される。まだクローニングができていなかった...

【研究テーマ】応用微生物学・応用生物化学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 助教授 (00208240)

【キーワード】リジン生合成 / Thermus thermophilus / αアミノアジピン酸 / 基質特異性 / アルギニン生合成 (他9件)

【概要】我々は、Thermusでは、リジンがジアミノピメリン酸を介さない経路(αアミノアジピン酸経路)で合成されることを見いだした。しかしながら、その経路がカビ・酵母で見られるものと異なり、経路の後半はアルギニン生合成と似た反応によることを示唆してきた。これまでに行ってきた生合成経路の解析により、リジンは2-オキソグルタル酸から10段階の反応を経て合成されると予想される。まだクローニングができていなかった...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1995 - 1997

【研究代表者】太田 博道 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (30152151)

【キーワード】酵素反応 / 不斉脱炭酸反応 / 基質特異性 / ランダム変異 / 部位特異的変異 (他13件)

【概要】我々が発見した二置換マロン酸を不斉脱炭酸する酵素(AMDase)は補因子を全く必要としない非常にユニークな脱炭酸酵素であり、240個のアミノ酸からなる。4個含まれるシステインの内1個が活性部位にあって、反応に重要な役割を担っていることが明らかになっている。部位特異的変異によってこれらのシステインのうち何れか1個だけをセリンに変えた変異酵素4種類を作ってその活性をそれぞれ調べた。その結果、N端から数...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 教授 (00208240)

【キーワード】Thermus属細菌 / リジン生合成 / 基質特異性 / X線結晶構造解析 / 分子進化工学 (他12件)

【概要】1)Thermus thermophilusにおいて、ホモアコニターゼの酵素学的諸性質を解析し、同酵素が第3番目の反応を触媒出来るものの、第2番目については触媒出来ないことを明らかにした。2)αアミノアジピン酸アミノ基転移酵素(AAA-AT)について、ピリドキサールリン酸(PLP)複合体構造、およびPLP+ロイシン複合体構造などをX線結晶構造解析により決定した。AAA-ATは、リジン生合成の基質で...

【研究テーマ】応用微生物学・応用生物化学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 助教授 (00208240)

【キーワード】リジン生合成 / Thermus thermophilus / αアミノアジピン酸 / 基質特異性 / アルギニン生合成 (他9件)

【概要】我々は、Thermusでは、リジンがジアミノピメリン酸を介さない経路(αアミノアジピン酸経路)で合成されることを見いだした。しかしながら、その経路がカビ・酵母で見られるものと異なり、経路の後半はアルギニン生合成と似た反応によることを示唆してきた。これまでに行ってきた生合成経路の解析により、リジンは2-オキソグルタル酸から10段階の反応を経て合成されると予想される。まだクローニングができていなかった...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 教授 (00208240)

【キーワード】Thermus属細菌 / リジン生合成 / 基質特異性 / X線結晶構造解析 / 分子進化工学 (他12件)

【概要】1)Thermus thermophilusにおいて、ホモアコニターゼの酵素学的諸性質を解析し、同酵素が第3番目の反応を触媒出来るものの、第2番目については触媒出来ないことを明らかにした。2)αアミノアジピン酸アミノ基転移酵素(AAA-AT)について、ピリドキサールリン酸(PLP)複合体構造、およびPLP+ロイシン複合体構造などをX線結晶構造解析により決定した。AAA-ATは、リジン生合成の基質で...

【研究テーマ】応用微生物学・応用生物化学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 助教授 (00208240)

【キーワード】リジン生合成 / Thermus thermophilus / αアミノアジピン酸 / 基質特異性 / アルギニン生合成 (他9件)

【概要】我々は、Thermusでは、リジンがジアミノピメリン酸を介さない経路(αアミノアジピン酸経路)で合成されることを見いだした。しかしながら、その経路がカビ・酵母で見られるものと異なり、経路の後半はアルギニン生合成と似た反応によることを示唆してきた。これまでに行ってきた生合成経路の解析により、リジンは2-オキソグルタル酸から10段階の反応を経て合成されると予想される。まだクローニングができていなかった...

【研究テーマ】応用微生物学・応用生物化学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 助教授 (00208240)

【キーワード】リジン生合成 / Thermus thermophilus / αアミノアジピン酸 / 基質特異性 / アルギニン生合成 (他9件)

【概要】我々は、Thermusでは、リジンがジアミノピメリン酸を介さない経路(αアミノアジピン酸経路)で合成されることを見いだした。しかしながら、その経路がカビ・酵母で見られるものと異なり、経路の後半はアルギニン生合成と似た反応によることを示唆してきた。これまでに行ってきた生合成経路の解析により、リジンは2-オキソグルタル酸から10段階の反応を経て合成されると予想される。まだクローニングができていなかった...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...

【研究テーマ】生物資源科学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】柘植 丈治 東京工業大学, 大学院・総合理工学研究科, 助手 (70332260)

【キーワード】バイオポリエステル / ポリヒドロキシアルカン酸 / 代謝工学 / 生分解性プラスチック / エノイルCoAヒドラターゼ (他9件)

【概要】本研究は、様々な組成からなるバイオポリエステルを代謝工学的手法を用いて合成し、その基礎的な高分子物性を解析することを目的として行った。これまでに知られているバイオポリエステルの物性は、硬くて脆いか、柔らかすぎるエラストマー状態のどちらかであった。我々が期待する物性は、それらの中間の物性を有し、フイルム状に成型加工が可能なものである。この目的に合う物性を発揮するポリマーとして、炭素鎖数4の3-ヒドロ...

【研究テーマ】生物資源科学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】柘植 丈治 東京工業大学, 大学院・総合理工学研究科, 助手 (70332260)

【キーワード】バイオポリエステル / ポリヒドロキシアルカン酸 / 代謝工学 / 生分解性プラスチック / エノイルCoAヒドラターゼ (他9件)

【概要】本研究は、様々な組成からなるバイオポリエステルを代謝工学的手法を用いて合成し、その基礎的な高分子物性を解析することを目的として行った。これまでに知られているバイオポリエステルの物性は、硬くて脆いか、柔らかすぎるエラストマー状態のどちらかであった。我々が期待する物性は、それらの中間の物性を有し、フイルム状に成型加工が可能なものである。この目的に合う物性を発揮するポリマーとして、炭素鎖数4の3-ヒドロ...

【研究テーマ】生物資源科学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】柘植 丈治 東京工業大学, 大学院・総合理工学研究科, 助手 (70332260)

【キーワード】バイオポリエステル / ポリヒドロキシアルカン酸 / 代謝工学 / 生分解性プラスチック / エノイルCoAヒドラターゼ (他9件)

【概要】本研究は、様々な組成からなるバイオポリエステルを代謝工学的手法を用いて合成し、その基礎的な高分子物性を解析することを目的として行った。これまでに知られているバイオポリエステルの物性は、硬くて脆いか、柔らかすぎるエラストマー状態のどちらかであった。我々が期待する物性は、それらの中間の物性を有し、フイルム状に成型加工が可能なものである。この目的に合う物性を発揮するポリマーとして、炭素鎖数4の3-ヒドロ...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1995 - 1997

【研究代表者】太田 博道 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (30152151)

【キーワード】酵素反応 / 不斉脱炭酸反応 / 基質特異性 / ランダム変異 / 部位特異的変異 (他13件)

【概要】我々が発見した二置換マロン酸を不斉脱炭酸する酵素(AMDase)は補因子を全く必要としない非常にユニークな脱炭酸酵素であり、240個のアミノ酸からなる。4個含まれるシステインの内1個が活性部位にあって、反応に重要な役割を担っていることが明らかになっている。部位特異的変異によってこれらのシステインのうち何れか1個だけをセリンに変えた変異酵素4種類を作ってその活性をそれぞれ調べた。その結果、N端から数...

【研究テーマ】生物機能・バイオプロセス

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2005 - 2007

【研究代表者】田口 精一 北海道大学, 大学院・工学研究科, 教授 (70216828)

【キーワード】生分解性プラスチック / ポリヒドロキシアルカン酸 / 進化分子工学 / 重合酵素 / 基質特異性 (他8件)

【概要】資源循環型バイオプラスチック生合成酵素の進化工学的改変により、バイオポリエステルの生産性・物性を積極的に改善する研究を展開してきた。最終年度は、ポリマーの共重合化におけるモノマー分率制御を精密に行ない、かつ分子量変化がダイナミックに実現する進化酵素を多数創出することを目的として、所期の水準に十分達した成果が得られた。 人工進化システムから得られた複数の優良変異部位4箇所(130,325,477,4...

【研究テーマ】生物機能・バイオプロセス

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2005 - 2007

【研究代表者】田口 精一 北海道大学, 大学院・工学研究科, 教授 (70216828)

【キーワード】生分解性プラスチック / ポリヒドロキシアルカン酸 / 進化分子工学 / 重合酵素 / 基質特異性 (他8件)

【概要】資源循環型バイオプラスチック生合成酵素の進化工学的改変により、バイオポリエステルの生産性・物性を積極的に改善する研究を展開してきた。最終年度は、ポリマーの共重合化におけるモノマー分率制御を精密に行ない、かつ分子量変化がダイナミックに実現する進化酵素を多数創出することを目的として、所期の水準に十分達した成果が得られた。 人工進化システムから得られた複数の優良変異部位4箇所(130,325,477,4...

【研究テーマ】生物分子科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】海老塚 豊 国立医薬品食品衛生研究所, 生薬部, 客員研究員 (90107384)

【キーワード】生合成 / メロテルペノイド / 遺伝子 / 糸状菌 / 遺伝子クラスター (他13件)

【概要】糸状菌ゲノムデータベースを対象に、ポリケタイド合成酵素およびプレニル基転移酵素の共存する遺伝子クラスターを検索することで、2種のメロテルペノイド生合成遺伝子クラスターを見いだし、各酵素遺伝子を異種糸状菌で発現することにより機能同定した。これらの酵素はいずれも既知生合成酵素とは反応性、特異性を異にする新規な酵素であり、天然物の構造多様性拡大への貢献が期待される。また、異種糸状菌での共発現によるメロテ...

【研究テーマ】生物機能・バイオプロセス

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2005 - 2007

【研究代表者】田口 精一 北海道大学, 大学院・工学研究科, 教授 (70216828)

【キーワード】生分解性プラスチック / ポリヒドロキシアルカン酸 / 進化分子工学 / 重合酵素 / 基質特異性 (他8件)

【概要】資源循環型バイオプラスチック生合成酵素の進化工学的改変により、バイオポリエステルの生産性・物性を積極的に改善する研究を展開してきた。最終年度は、ポリマーの共重合化におけるモノマー分率制御を精密に行ない、かつ分子量変化がダイナミックに実現する進化酵素を多数創出することを目的として、所期の水準に十分達した成果が得られた。 人工進化システムから得られた複数の優良変異部位4箇所(130,325,477,4...

【研究テーマ】生物資源科学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】柘植 丈治 東京工業大学, 大学院・総合理工学研究科, 助手 (70332260)

【キーワード】バイオポリエステル / ポリヒドロキシアルカン酸 / 代謝工学 / 生分解性プラスチック / エノイルCoAヒドラターゼ (他9件)

【概要】本研究は、様々な組成からなるバイオポリエステルを代謝工学的手法を用いて合成し、その基礎的な高分子物性を解析することを目的として行った。これまでに知られているバイオポリエステルの物性は、硬くて脆いか、柔らかすぎるエラストマー状態のどちらかであった。我々が期待する物性は、それらの中間の物性を有し、フイルム状に成型加工が可能なものである。この目的に合う物性を発揮するポリマーとして、炭素鎖数4の3-ヒドロ...

【研究テーマ】応用微生物学・応用生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】梶原 将 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (10272668)

【キーワード】酵母 / 脂肪酸 / 基質特異性 / エタノール耐性

【概要】昨年度の研究では、S.cerevisiaeのOLE1蛋白質で認められるC16:0に対する基質優先性が105番目から257番目のアミノ酸残基の間の領域に依存していることが分かった。そこで、本年度はこの領域を再度細分化したキメラ酵素遺伝子を作製して、基質優先性に関与するアミノ酸残基を特定することを試みた。その結果、105-257領域を細分化したキメラ酵素遺伝子のうち、C末端側の17アミノ酸残基をS.k...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 教授 (00208240)

【キーワード】Thermus属細菌 / リジン生合成 / 基質特異性 / X線結晶構造解析 / 分子進化工学 (他12件)

【概要】1)Thermus thermophilusにおいて、ホモアコニターゼの酵素学的諸性質を解析し、同酵素が第3番目の反応を触媒出来るものの、第2番目については触媒出来ないことを明らかにした。2)αアミノアジピン酸アミノ基転移酵素(AAA-AT)について、ピリドキサールリン酸(PLP)複合体構造、およびPLP+ロイシン複合体構造などをX線結晶構造解析により決定した。AAA-ATは、リジン生合成の基質で...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】生物分子科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】海老塚 豊 国立医薬品食品衛生研究所, 生薬部, 客員研究員 (90107384)

【キーワード】生合成 / メロテルペノイド / 遺伝子 / 糸状菌 / 遺伝子クラスター (他13件)

【概要】糸状菌ゲノムデータベースを対象に、ポリケタイド合成酵素およびプレニル基転移酵素の共存する遺伝子クラスターを検索することで、2種のメロテルペノイド生合成遺伝子クラスターを見いだし、各酵素遺伝子を異種糸状菌で発現することにより機能同定した。これらの酵素はいずれも既知生合成酵素とは反応性、特異性を異にする新規な酵素であり、天然物の構造多様性拡大への貢献が期待される。また、異種糸状菌での共発現によるメロテ...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 教授 (00208240)

【キーワード】Thermus属細菌 / リジン生合成 / 基質特異性 / X線結晶構造解析 / 分子進化工学 (他12件)

【概要】1)Thermus thermophilusにおいて、ホモアコニターゼの酵素学的諸性質を解析し、同酵素が第3番目の反応を触媒出来るものの、第2番目については触媒出来ないことを明らかにした。2)αアミノアジピン酸アミノ基転移酵素(AAA-AT)について、ピリドキサールリン酸(PLP)複合体構造、およびPLP+ロイシン複合体構造などをX線結晶構造解析により決定した。AAA-ATは、リジン生合成の基質で...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2011-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】反町 洋之 公益財団法人東京都医学総合研究所, 生体分子先端研究分野, 分野長 (10211327)

【キーワード】カルパイン / プロテオリシス / 質量分析 / 筋ジストロフィー / 胃腸疾患 (他10件)

【概要】カルパイン(CAPN)は、限定分解により基質機能を調節するプロテアーゼである。CAPN1/2は古くから研究されながら、その普遍性のため機能解明が難航している。申請者らは組織特異的分子種を発見し、発現組織機能と関連づけて生理機能を解析してきた。その結果CAPN3、8/9の機能不全は筋ジストロフィー、胃疾患の原因となることを明らかにした。しかし各分子の作用機序は不明な点が多い。そこで組織特異的CAPN...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2011-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】反町 洋之 公益財団法人東京都医学総合研究所, 生体分子先端研究分野, 分野長 (10211327)

【キーワード】カルパイン / プロテオリシス / 質量分析 / 筋ジストロフィー / 胃腸疾患 (他10件)

【概要】カルパイン(CAPN)は、限定分解により基質機能を調節するプロテアーゼである。CAPN1/2は古くから研究されながら、その普遍性のため機能解明が難航している。申請者らは組織特異的分子種を発見し、発現組織機能と関連づけて生理機能を解析してきた。その結果CAPN3、8/9の機能不全は筋ジストロフィー、胃疾患の原因となることを明らかにした。しかし各分子の作用機序は不明な点が多い。そこで組織特異的CAPN...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1995 - 1997

【研究代表者】太田 博道 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (30152151)

【キーワード】酵素反応 / 不斉脱炭酸反応 / 基質特異性 / ランダム変異 / 部位特異的変異 (他13件)

【概要】我々が発見した二置換マロン酸を不斉脱炭酸する酵素(AMDase)は補因子を全く必要としない非常にユニークな脱炭酸酵素であり、240個のアミノ酸からなる。4個含まれるシステインの内1個が活性部位にあって、反応に重要な役割を担っていることが明らかになっている。部位特異的変異によってこれらのシステインのうち何れか1個だけをセリンに変えた変異酵素4種類を作ってその活性をそれぞれ調べた。その結果、N端から数...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】進化生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31

【研究代表者】金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部(藤沢), 教授 (60260329)

【キーワード】分子進化 / ポリヌクレオチドリン酸化酵素 / 情報学的解析 / 実験検証 / 巨大タンパク質 (他19件)

【概要】RNAのリン酸化酵素としてClp1が知られている。Clp1の大規模分子進化解析の結果、計3,577件のClp1関連タンパク質を検出した。その多くは真核生物やアーキアに由来し、バクテリアには限られた種にしか存在しなかった。Clp1のキナーゼドメインは、全てのClp1関連タンパク質に共通であり、N 末端やC末端領域には生物種やファミリーに特徴的なドメインが保存されていた。また、1,000アミノ酸残基以...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2011-04-01 - 2015-03-31

【研究代表者】反町 洋之 公益財団法人東京都医学総合研究所, 生体分子先端研究分野, 分野長 (10211327)

【キーワード】カルパイン / プロテオリシス / 質量分析 / 筋ジストロフィー / 胃腸疾患 (他10件)

【概要】カルパイン(CAPN)は、限定分解により基質機能を調節するプロテアーゼである。CAPN1/2は古くから研究されながら、その普遍性のため機能解明が難航している。申請者らは組織特異的分子種を発見し、発現組織機能と関連づけて生理機能を解析してきた。その結果CAPN3、8/9の機能不全は筋ジストロフィー、胃疾患の原因となることを明らかにした。しかし各分子の作用機序は不明な点が多い。そこで組織特異的CAPN...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 教授 (00208240)

【キーワード】Thermus属細菌 / リジン生合成 / 基質特異性 / X線結晶構造解析 / 分子進化工学 (他12件)

【概要】1)Thermus thermophilusにおいて、ホモアコニターゼの酵素学的諸性質を解析し、同酵素が第3番目の反応を触媒出来るものの、第2番目については触媒出来ないことを明らかにした。2)αアミノアジピン酸アミノ基転移酵素(AAA-AT)について、ピリドキサールリン酸(PLP)複合体構造、およびPLP+ロイシン複合体構造などをX線結晶構造解析により決定した。AAA-ATは、リジン生合成の基質で...

【研究テーマ】有機工業化学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1987 - 1988

【研究代表者】松村 秀一 慶応義塾大学, 理工学部応用化学科, 助教授 (30051874)

【キーワード】酵素反応 / ガラクトースオキシダーゼ / グルコースオキシダーゼ / 微生物 / 高選択的分離 (他17件)

【概要】微生物の酵素による高選択的脱水素(酸化)と天然、非天然型糖質のもつ分子構造的特徴と酸化反応における酵素のもつ分子識別能及び選択性との間の相関に対し、基礎的知見を集積するとともに、化学の側から見た酵素反応について一段階反応から多段階反応まで含めて考察を行った。 はじめにグルコースオキシダーゼ及びガラクトースオキシダーゼの基質特異性について検討を行い、生成物の分析を行った。その結果ガラクトース、マンノ...

【研究テーマ】応用微生物学・応用生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】梶原 将 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (10272668)

【キーワード】酵母 / 脂肪酸 / 基質特異性 / エタノール耐性

【概要】昨年度の研究では、S.cerevisiaeのOLE1蛋白質で認められるC16:0に対する基質優先性が105番目から257番目のアミノ酸残基の間の領域に依存していることが分かった。そこで、本年度はこの領域を再度細分化したキメラ酵素遺伝子を作製して、基質優先性に関与するアミノ酸残基を特定することを試みた。その結果、105-257領域を細分化したキメラ酵素遺伝子のうち、C末端側の17アミノ酸残基をS.k...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 教授 (00208240)

【キーワード】Thermus属細菌 / リジン生合成 / 基質特異性 / X線結晶構造解析 / 分子進化工学 (他12件)

【概要】1)Thermus thermophilusにおいて、ホモアコニターゼの酵素学的諸性質を解析し、同酵素が第3番目の反応を触媒出来るものの、第2番目については触媒出来ないことを明らかにした。2)αアミノアジピン酸アミノ基転移酵素(AAA-AT)について、ピリドキサールリン酸(PLP)複合体構造、およびPLP+ロイシン複合体構造などをX線結晶構造解析により決定した。AAA-ATは、リジン生合成の基質で...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】西山 真 東京大学, 生物生産工学研究センター, 教授 (00208240)

【キーワード】Thermus属細菌 / リジン生合成 / 基質特異性 / X線結晶構造解析 / 分子進化工学 (他12件)

【概要】1)Thermus thermophilusにおいて、ホモアコニターゼの酵素学的諸性質を解析し、同酵素が第3番目の反応を触媒出来るものの、第2番目については触媒出来ないことを明らかにした。2)αアミノアジピン酸アミノ基転移酵素(AAA-AT)について、ピリドキサールリン酸(PLP)複合体構造、およびPLP+ロイシン複合体構造などをX線結晶構造解析により決定した。AAA-ATは、リジン生合成の基質で...

【研究テーマ】生物分子科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2008 - 2010

【研究代表者】海老塚 豊 国立医薬品食品衛生研究所, 生薬部, 客員研究員 (90107384)

【キーワード】生合成 / メロテルペノイド / 遺伝子 / 糸状菌 / 遺伝子クラスター (他13件)

【概要】糸状菌ゲノムデータベースを対象に、ポリケタイド合成酵素およびプレニル基転移酵素の共存する遺伝子クラスターを検索することで、2種のメロテルペノイド生合成遺伝子クラスターを見いだし、各酵素遺伝子を異種糸状菌で発現することにより機能同定した。これらの酵素はいずれも既知生合成酵素とは反応性、特異性を異にする新規な酵素であり、天然物の構造多様性拡大への貢献が期待される。また、異種糸状菌での共発現によるメロテ...

【研究テーマ】応用動物科学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2001 - 2004

【研究代表者】酒井 仙吉 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80114487)

【キーワード】アミノ酸オキシダーゼ / 過酸化水素分解酵素 / 抗菌機構 / 乳房炎 / マウス乳 (他19件)

【概要】L-アミノ酸オキシダーゼの同定とその遺伝子の同定について マウスミルクからL-アミノ酸オキシダーゼを精製した。ミルク中では113kDaの分子量であり、変成条件では60KDaであったことから二量体として存在していた。Phe, Met, Tyr, Cys, Leuなどを分解して過酸化水素を発生させた。一方、全く分解できないアミノ酸もあり、これらはミルク中に多量に存在した。遺伝子の検索を行なったところ、...