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研究分野別サイレントキーワード
「バクテリア」サイレントキーワードを含む研究
【環境学】環境解析学:アルベドバクテリアを含む研究件
❏地球規模環境変動が氷河生態系に及ぼす影響評価(26241020)
【研究テーマ】環境影響評価
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2014-04-01 - 2018-03-31
【研究代表者】幸島 司郎 京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60183802)
【キーワード】氷河 / 氷床 / 微生物 / 藻類 / バクテリア (他12件)
【概要】世界各地の氷河で採取した微生物の遺伝子分析と地域間比較により、氷河融解を加速する汚れ物質(クリオコナイト)形成に関係するバクテリアやシアノバクテリアの地理的分布や汚れ物質内での分布、氷河動物と共生するバクテリアの存在が初めて明らかになった。また、生物によるアルベド改変過程を組み込んだ氷河変動モデルを改良するために、クリオコナイトが氷河表面に形成する縦穴(クリオコナイトホール)の発達や崩壊を精度良く...
❏地球規模環境変動に対する氷河生態系の応答予測と影響評価(22241005)
【研究テーマ】環境動態解析
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2010-04-01 - 2014-03-31
【研究代表者】幸島 司郎 京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60183802)
【キーワード】アルベド / バクテリア / リモートセンシング / 微生物 / 極限環境 (他11件)
【概要】氷河生態系の微生物生態、特にその活動が氷河表面のアルベド(反射率)を低下させ氷河融解を促進する課程を理解し、地球規模環境変動による氷河生態系の応答を予測するために、世界各地の様々なタイプの氷河で、氷河の生物相、表面構造、アルベド、気象条件に関する調査を行い、その結果を比較した。その結果、微生物による氷河アルベド改変過程や氷河微生物相の決定要因を理解するのに必要な、微生物相とアルベド、環境条件の関係...
【環境学】環境解析学:氷河バクテリアを含む研究件
❏地球規模環境変動が氷河生態系に及ぼす影響評価(26241020)
【研究テーマ】環境影響評価
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2014-04-01 - 2018-03-31
【研究代表者】幸島 司郎 京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60183802)
【キーワード】氷河 / 氷床 / 微生物 / 藻類 / バクテリア (他12件)
【概要】世界各地の氷河で採取した微生物の遺伝子分析と地域間比較により、氷河融解を加速する汚れ物質(クリオコナイト)形成に関係するバクテリアやシアノバクテリアの地理的分布や汚れ物質内での分布、氷河動物と共生するバクテリアの存在が初めて明らかになった。また、生物によるアルベド改変過程を組み込んだ氷河変動モデルを改良するために、クリオコナイトが氷河表面に形成する縦穴(クリオコナイトホール)の発達や崩壊を精度良く...
❏地球規模環境変動に対する氷河生態系の応答予測と影響評価(22241005)
【研究テーマ】環境動態解析
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2010-04-01 - 2014-03-31
【研究代表者】幸島 司郎 京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60183802)
【キーワード】アルベド / バクテリア / リモートセンシング / 微生物 / 極限環境 (他11件)
【概要】氷河生態系の微生物生態、特にその活動が氷河表面のアルベド(反射率)を低下させ氷河融解を促進する課程を理解し、地球規模環境変動による氷河生態系の応答を予測するために、世界各地の様々なタイプの氷河で、氷河の生物相、表面構造、アルベド、気象条件に関する調査を行い、その結果を比較した。その結果、微生物による氷河アルベド改変過程や氷河微生物相の決定要因を理解するのに必要な、微生物相とアルベド、環境条件の関係...
【数物系科学】物理学:集団運動バクテリアを含む研究件
❏アクティブマターのトポロジカル制御とトポロジカル物性(20K14426)
【研究テーマ】
【研究種目】若手研究
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】西口 大貴 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (20850556)
【キーワード】アクティブマター / 集団運動 / バクテリア乱流 / アクティブ乱流 / トポロジカル物性 (他9件)
【概要】トポロジカル現象が出るとの理論予測がなされている柱格子構造中でアクティブ乱流の観察を引き続きおこない、渦秩序の発生を確認した。柱格子の格子定数を変えることで、渦秩序構造が生じやすいパラメーターの探索を進めた。得られた最適な条件に基づき、格子サイズやエッジの形状などを変えることで、目的の条件が得られると期待できるため、その準備を進めている。 トポロジカル現象の観察のためには、バクテリア濃厚懸濁液の示...
❏細胞集団の応答とトポロジカル欠陥の非平衡ダイナミクス(19K23422)
【研究テーマ】
【研究種目】研究活動スタート支援
【研究期間】2019-08-30 - 2021-03-31
【研究代表者】西口 大貴 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (20850556)
【キーワード】アクティブマター / 集団運動 / 細胞集団 / バクテリア乱流 / アクティブ乱流 (他12件)
【概要】アクティブマター物理学の方法論をより広範な系に適用できるよう拡張するために、本研究では集団運動と他の自由度が結合した場合の挙動を調べた。具体的には、培養細胞集団が外場へ応答するときの様子およびバクテリア濃厚懸濁液のアクティブ乱流が境界条件下で秩序化する原理を、トポロジカル欠陥に着目して解析した。結果、集団運動における新たな境界条件を実験的に推定すること等に成功し、集団運動を理論的に予測する枠組みを...
【数物系科学】物理学:非平衡物理学バクテリアを含む研究件
❏アクティブマターのトポロジカル制御とトポロジカル物性(20K14426)
【研究テーマ】
【研究種目】若手研究
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】西口 大貴 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (20850556)
【キーワード】アクティブマター / 集団運動 / バクテリア乱流 / アクティブ乱流 / トポロジカル物性 (他9件)
【概要】トポロジカル現象が出るとの理論予測がなされている柱格子構造中でアクティブ乱流の観察を引き続きおこない、渦秩序の発生を確認した。柱格子の格子定数を変えることで、渦秩序構造が生じやすいパラメーターの探索を進めた。得られた最適な条件に基づき、格子サイズやエッジの形状などを変えることで、目的の条件が得られると期待できるため、その準備を進めている。 トポロジカル現象の観察のためには、バクテリア濃厚懸濁液の示...
❏細胞集団の応答とトポロジカル欠陥の非平衡ダイナミクス(19K23422)
【研究テーマ】
【研究種目】研究活動スタート支援
【研究期間】2019-08-30 - 2021-03-31
【研究代表者】西口 大貴 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (20850556)
【キーワード】アクティブマター / 集団運動 / 細胞集団 / バクテリア乱流 / アクティブ乱流 (他12件)
【概要】アクティブマター物理学の方法論をより広範な系に適用できるよう拡張するために、本研究では集団運動と他の自由度が結合した場合の挙動を調べた。具体的には、培養細胞集団が外場へ応答するときの様子およびバクテリア濃厚懸濁液のアクティブ乱流が境界条件下で秩序化する原理を、トポロジカル欠陥に着目して解析した。結果、集団運動における新たな境界条件を実験的に推定すること等に成功し、集団運動を理論的に予測する枠組みを...
【数物系科学】物理学:バクテリア乱流バクテリアを含む研究件
❏アクティブマターのトポロジカル制御とトポロジカル物性(20K14426)
【研究テーマ】
【研究種目】若手研究
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】西口 大貴 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (20850556)
【キーワード】アクティブマター / 集団運動 / バクテリア乱流 / アクティブ乱流 / トポロジカル物性 (他9件)
【概要】トポロジカル現象が出るとの理論予測がなされている柱格子構造中でアクティブ乱流の観察を引き続きおこない、渦秩序の発生を確認した。柱格子の格子定数を変えることで、渦秩序構造が生じやすいパラメーターの探索を進めた。得られた最適な条件に基づき、格子サイズやエッジの形状などを変えることで、目的の条件が得られると期待できるため、その準備を進めている。 トポロジカル現象の観察のためには、バクテリア濃厚懸濁液の示...
❏細胞集団の応答とトポロジカル欠陥の非平衡ダイナミクス(19K23422)
【研究テーマ】
【研究種目】研究活動スタート支援
【研究期間】2019-08-30 - 2021-03-31
【研究代表者】西口 大貴 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (20850556)
【キーワード】アクティブマター / 集団運動 / 細胞集団 / バクテリア乱流 / アクティブ乱流 (他12件)
【概要】アクティブマター物理学の方法論をより広範な系に適用できるよう拡張するために、本研究では集団運動と他の自由度が結合した場合の挙動を調べた。具体的には、培養細胞集団が外場へ応答するときの様子およびバクテリア濃厚懸濁液のアクティブ乱流が境界条件下で秩序化する原理を、トポロジカル欠陥に着目して解析した。結果、集団運動における新たな境界条件を実験的に推定すること等に成功し、集団運動を理論的に予測する枠組みを...
【数物系科学】物理学:アクティブマターバクテリアを含む研究件
❏アクティブマターのトポロジカル制御とトポロジカル物性(20K14426)
【研究テーマ】
【研究種目】若手研究
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】西口 大貴 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (20850556)
【キーワード】アクティブマター / 集団運動 / バクテリア乱流 / アクティブ乱流 / トポロジカル物性 (他9件)
【概要】トポロジカル現象が出るとの理論予測がなされている柱格子構造中でアクティブ乱流の観察を引き続きおこない、渦秩序の発生を確認した。柱格子の格子定数を変えることで、渦秩序構造が生じやすいパラメーターの探索を進めた。得られた最適な条件に基づき、格子サイズやエッジの形状などを変えることで、目的の条件が得られると期待できるため、その準備を進めている。 トポロジカル現象の観察のためには、バクテリア濃厚懸濁液の示...
❏細胞集団の応答とトポロジカル欠陥の非平衡ダイナミクス(19K23422)
【研究テーマ】
【研究種目】研究活動スタート支援
【研究期間】2019-08-30 - 2021-03-31
【研究代表者】西口 大貴 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (20850556)
【キーワード】アクティブマター / 集団運動 / 細胞集団 / バクテリア乱流 / アクティブ乱流 (他12件)
【概要】アクティブマター物理学の方法論をより広範な系に適用できるよう拡張するために、本研究では集団運動と他の自由度が結合した場合の挙動を調べた。具体的には、培養細胞集団が外場へ応答するときの様子およびバクテリア濃厚懸濁液のアクティブ乱流が境界条件下で秩序化する原理を、トポロジカル欠陥に着目して解析した。結果、集団運動における新たな境界条件を実験的に推定すること等に成功し、集団運動を理論的に予測する枠組みを...
❏還流系を用いた中立的生態系実験の実現とその統計力学的解析(16H04033)
【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】竹内 一将 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (50622304)
【キーワード】生物物理学 / アクティブマター / バクテリア / 微小流体デバイス / 集団遺伝学 (他8件)
【概要】本研究では、微小流体デバイスを用いて二つの細菌集団を培養し、競合させるモデル生態系実験を実現して、その結果を統計力学的な見地から解析した。まず、高密度の細菌集団を均一な環境で培養し、長時間計測できる灌流型の微小流体デバイスを開発した。それを用いて、蛍光タンパク質で標識した二つの大腸菌株を培養したところ、二集団の占有領域にフラクタル状のパターン形成を見出した。我々は、パターンの統計的特徴や菌の配向秩...
【数物系科学】物理学:アクティブ乱流バクテリアを含む研究件
❏アクティブマターのトポロジカル制御とトポロジカル物性(20K14426)
【研究テーマ】
【研究種目】若手研究
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】西口 大貴 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (20850556)
【キーワード】アクティブマター / 集団運動 / バクテリア乱流 / アクティブ乱流 / トポロジカル物性 (他9件)
【概要】トポロジカル現象が出るとの理論予測がなされている柱格子構造中でアクティブ乱流の観察を引き続きおこない、渦秩序の発生を確認した。柱格子の格子定数を変えることで、渦秩序構造が生じやすいパラメーターの探索を進めた。得られた最適な条件に基づき、格子サイズやエッジの形状などを変えることで、目的の条件が得られると期待できるため、その準備を進めている。 トポロジカル現象の観察のためには、バクテリア濃厚懸濁液の示...
❏細胞集団の応答とトポロジカル欠陥の非平衡ダイナミクス(19K23422)
【研究テーマ】
【研究種目】研究活動スタート支援
【研究期間】2019-08-30 - 2021-03-31
【研究代表者】西口 大貴 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (20850556)
【キーワード】アクティブマター / 集団運動 / 細胞集団 / バクテリア乱流 / アクティブ乱流 (他12件)
【概要】アクティブマター物理学の方法論をより広範な系に適用できるよう拡張するために、本研究では集団運動と他の自由度が結合した場合の挙動を調べた。具体的には、培養細胞集団が外場へ応答するときの様子およびバクテリア濃厚懸濁液のアクティブ乱流が境界条件下で秩序化する原理を、トポロジカル欠陥に着目して解析した。結果、集団運動における新たな境界条件を実験的に推定すること等に成功し、集団運動を理論的に予測する枠組みを...
【数物系科学】物理学:非平衡統計力学バクテリアを含む研究件
❏アクティブマターのトポロジカル制御とトポロジカル物性(20K14426)
【研究テーマ】
【研究種目】若手研究
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】西口 大貴 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (20850556)
【キーワード】アクティブマター / 集団運動 / バクテリア乱流 / アクティブ乱流 / トポロジカル物性 (他9件)
【概要】トポロジカル現象が出るとの理論予測がなされている柱格子構造中でアクティブ乱流の観察を引き続きおこない、渦秩序の発生を確認した。柱格子の格子定数を変えることで、渦秩序構造が生じやすいパラメーターの探索を進めた。得られた最適な条件に基づき、格子サイズやエッジの形状などを変えることで、目的の条件が得られると期待できるため、その準備を進めている。 トポロジカル現象の観察のためには、バクテリア濃厚懸濁液の示...
❏細胞集団の応答とトポロジカル欠陥の非平衡ダイナミクス(19K23422)
【研究テーマ】
【研究種目】研究活動スタート支援
【研究期間】2019-08-30 - 2021-03-31
【研究代表者】西口 大貴 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (20850556)
【キーワード】アクティブマター / 集団運動 / 細胞集団 / バクテリア乱流 / アクティブ乱流 (他12件)
【概要】アクティブマター物理学の方法論をより広範な系に適用できるよう拡張するために、本研究では集団運動と他の自由度が結合した場合の挙動を調べた。具体的には、培養細胞集団が外場へ応答するときの様子およびバクテリア濃厚懸濁液のアクティブ乱流が境界条件下で秩序化する原理を、トポロジカル欠陥に着目して解析した。結果、集団運動における新たな境界条件を実験的に推定すること等に成功し、集団運動を理論的に予測する枠組みを...
❏還流系を用いた中立的生態系実験の実現とその統計力学的解析(16H04033)
【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】竹内 一将 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (50622304)
【キーワード】生物物理学 / アクティブマター / バクテリア / 微小流体デバイス / 集団遺伝学 (他8件)
【概要】本研究では、微小流体デバイスを用いて二つの細菌集団を培養し、競合させるモデル生態系実験を実現して、その結果を統計力学的な見地から解析した。まず、高密度の細菌集団を均一な環境で培養し、長時間計測できる灌流型の微小流体デバイスを開発した。それを用いて、蛍光タンパク質で標識した二つの大腸菌株を培養したところ、二集団の占有領域にフラクタル状のパターン形成を見出した。我々は、パターンの統計的特徴や菌の配向秩...
【数物系科学】地球惑星科学:氷床バクテリアを含む研究件
❏地球規模環境変動が氷河生態系に及ぼす影響評価(26241020)
【研究テーマ】環境影響評価
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2014-04-01 - 2018-03-31
【研究代表者】幸島 司郎 京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60183802)
【キーワード】氷河 / 氷床 / 微生物 / 藻類 / バクテリア (他12件)
【概要】世界各地の氷河で採取した微生物の遺伝子分析と地域間比較により、氷河融解を加速する汚れ物質(クリオコナイト)形成に関係するバクテリアやシアノバクテリアの地理的分布や汚れ物質内での分布、氷河動物と共生するバクテリアの存在が初めて明らかになった。また、生物によるアルベド改変過程を組み込んだ氷河変動モデルを改良するために、クリオコナイトが氷河表面に形成する縦穴(クリオコナイトホール)の発達や崩壊を精度良く...
❏地球規模環境変動に対する氷河生態系の応答予測と影響評価(22241005)
【研究テーマ】環境動態解析
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2010-04-01 - 2014-03-31
【研究代表者】幸島 司郎 京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60183802)
【キーワード】アルベド / バクテリア / リモートセンシング / 微生物 / 極限環境 (他11件)
【概要】氷河生態系の微生物生態、特にその活動が氷河表面のアルベド(反射率)を低下させ氷河融解を促進する課程を理解し、地球規模環境変動による氷河生態系の応答を予測するために、世界各地の様々なタイプの氷河で、氷河の生物相、表面構造、アルベド、気象条件に関する調査を行い、その結果を比較した。その結果、微生物による氷河アルベド改変過程や氷河微生物相の決定要因を理解するのに必要な、微生物相とアルベド、環境条件の関係...
【数物系科学】地球惑星科学:マンガン酸化物バクテリアを含む研究件
❏分子地球化学:原子レベルの状態分析に基づく地球と生命の進化史の精密解析(22224011)
【研究テーマ】地球宇宙化学
【研究種目】基盤研究(S)
【研究期間】2010-04-01 - 2015-03-31
【研究代表者】高橋 嘉夫 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (10304396)
【キーワード】化学種解明 / XAFS / モリブデン / タングステン / セリウム異常 (他24件)
【概要】本研究では、XAFS法などにより固液界面での元素の局所構造を調べる(化学種解析)ことで、海洋での微量元素の固相への吸着反応に伴う元素の固液分配や同位体分別のメカニズム解明を解明し、それに基づいた精密な古海洋の酸化還元状態解析や海洋の酸化還元環境の変化に伴う元素の溶解度の変化などに関する研究を行った。その結果、Mo同位体比とW同位体比の複合的利用、Ce安定同位体比とCe異常の複合的利用、バライト中の...
❏堆積・続成過程における微量元素の化学状態決定と化学的挙動の解明:古環境指標の確立(20540475)
【研究テーマ】地球宇宙化学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2008 - 2010
【研究代表者】清水 洋 広島大学, 大学院・理学研究科, 名誉教授 (60090544)
【キーワード】微量元素 / 希土類元素 / 堆積過程 / 続成過程 / 化学状態 (他21件)
【概要】堆積岩の地球化学的特徴は、地球表層環境の変遷を記録している。本研究では、希土類元素(REE)をはじめとする微量元素について、堆積物への取込みメカニズムと堆積後の反応を原子・分子のミクロな観点から解明した。海洋性堆積物において、堆積時にマンガン酸化物相に取り込まれたREEは続成作用によりリン酸塩相に移動するものの、堆積物全体としてのREEパターンはほぼ変化していないことを初めて明らかにした。この結果...
【数物系科学】地球惑星科学:チャートバクテリアを含む研究件
❏堆積・続成過程における微量元素の化学状態決定と化学的挙動の解明:古環境指標の確立(20540475)
【研究テーマ】地球宇宙化学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2008 - 2010
【研究代表者】清水 洋 広島大学, 大学院・理学研究科, 名誉教授 (60090544)
【キーワード】微量元素 / 希土類元素 / 堆積過程 / 続成過程 / 化学状態 (他21件)
【概要】堆積岩の地球化学的特徴は、地球表層環境の変遷を記録している。本研究では、希土類元素(REE)をはじめとする微量元素について、堆積物への取込みメカニズムと堆積後の反応を原子・分子のミクロな観点から解明した。海洋性堆積物において、堆積時にマンガン酸化物相に取り込まれたREEは続成作用によりリン酸塩相に移動するものの、堆積物全体としてのREEパターンはほぼ変化していないことを初めて明らかにした。この結果...
❏西オーストラリアにおける地球最古生命化石の探索(08041102)
【研究テーマ】地質学
【研究種目】国際学術研究
【研究期間】1996 - 1997
【研究代表者】磯崎 行雄 東京工業大学, 理学部, 助教授 (90144914)
【キーワード】太古代 / 緑色岩帯 / 海嶺 / チャート / 最古化石 (他13件)
【概要】ピルバラ地塊東部に位置する表題地域の太古代前期(約35億年前)の緑色岩帯に関する1997年夏の野外調査の結果、従来の解釈と大きく矛盾する多くの新知見が得られた。特に、かつて太古代の大陸地殻上で形成されたとみなされた緑色岩帯の諸岩石が、実際には海洋中央部の古海嶺でおきた堆積・構造運動の産物であること、また最古生命化石が古海嶺の熱水起源チャートから産することが判明し、初期生命の生息環境について初めて具...
【数物系科学】地球惑星科学:希土類元素バクテリアを含む研究件
❏分子地球化学:原子レベルの状態分析に基づく地球と生命の進化史の精密解析(22224011)
【研究テーマ】地球宇宙化学
【研究種目】基盤研究(S)
【研究期間】2010-04-01 - 2015-03-31
【研究代表者】高橋 嘉夫 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (10304396)
【キーワード】化学種解明 / XAFS / モリブデン / タングステン / セリウム異常 (他24件)
【概要】本研究では、XAFS法などにより固液界面での元素の局所構造を調べる(化学種解析)ことで、海洋での微量元素の固相への吸着反応に伴う元素の固液分配や同位体分別のメカニズム解明を解明し、それに基づいた精密な古海洋の酸化還元状態解析や海洋の酸化還元環境の変化に伴う元素の溶解度の変化などに関する研究を行った。その結果、Mo同位体比とW同位体比の複合的利用、Ce安定同位体比とCe異常の複合的利用、バライト中の...
❏堆積・続成過程における微量元素の化学状態決定と化学的挙動の解明:古環境指標の確立(20540475)
【研究テーマ】地球宇宙化学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2008 - 2010
【研究代表者】清水 洋 広島大学, 大学院・理学研究科, 名誉教授 (60090544)
【キーワード】微量元素 / 希土類元素 / 堆積過程 / 続成過程 / 化学状態 (他21件)
【概要】堆積岩の地球化学的特徴は、地球表層環境の変遷を記録している。本研究では、希土類元素(REE)をはじめとする微量元素について、堆積物への取込みメカニズムと堆積後の反応を原子・分子のミクロな観点から解明した。海洋性堆積物において、堆積時にマンガン酸化物相に取り込まれたREEは続成作用によりリン酸塩相に移動するものの、堆積物全体としてのREEパターンはほぼ変化していないことを初めて明らかにした。この結果...
❏バクテリア活動の指標としての希土類元素パターン:原子レベルから古環境解析まで(19340168)
【研究テーマ】地球宇宙化学
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2007 - 2009
【研究代表者】高橋 嘉夫 広島大学, 大学院・理学研究科, 教授 (10304396)
【キーワード】バクテリア / 希土類元素 / 吸着 / 細胞壁 / バイオフィルム (他11件)
【概要】様々なバクテリア細胞表面への吸着のREE分配パターンには特異な重希土類(HREE)の濃集がみられ、これはEXAFS法によりは多座のリン酸サイトとの錯生成によることが明らかになった。また(リン酸サイト)/(カルボキシル基)比はpHと共に減少し、[REE]/[バクテリア]比の増大と共にカルボキシル基の寄与が増加した。HREEの濃集は天然のバイオフィルムやバクテリア由来の水酸化鉄にも見られると共に、同様...
【数物系科学】地球惑星科学:堆積物バクテリアを含む研究件
❏堆積・続成過程における微量元素の化学状態決定と化学的挙動の解明:古環境指標の確立(20540475)
【研究テーマ】地球宇宙化学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2008 - 2010
【研究代表者】清水 洋 広島大学, 大学院・理学研究科, 名誉教授 (60090544)
【キーワード】微量元素 / 希土類元素 / 堆積過程 / 続成過程 / 化学状態 (他21件)
【概要】堆積岩の地球化学的特徴は、地球表層環境の変遷を記録している。本研究では、希土類元素(REE)をはじめとする微量元素について、堆積物への取込みメカニズムと堆積後の反応を原子・分子のミクロな観点から解明した。海洋性堆積物において、堆積時にマンガン酸化物相に取り込まれたREEは続成作用によりリン酸塩相に移動するものの、堆積物全体としてのREEパターンはほぼ変化していないことを初めて明らかにした。この結果...
❏沿岸海洋生態系における窒素循環研究のための分子トレーサー法の開発と検討(13780413)
【研究テーマ】環境動態解析
【研究種目】若手研究(B)
【研究期間】2001 - 2002
【研究代表者】宮島 利宏 東京大学, 海洋研究所, 助手 (20311631)
【キーワード】窒素循環 / 海洋 / 炭酸塩堆積物 / 同位体トレーサー / 代謝解析 (他15件)
【概要】海洋沿岸堆積物における微生物学的窒素循環過程を定量的に解析するための同位体トレーサー実験技術の考案・改良・検討を行なった。本研究期間中には珊瑚礁礁池の炭酸塩堆積物中の微生物群集をモデルとして、特に窒素循環における有機化/無機化のプロセスの特定と定量化のための実験技術の検討を進めた。 1.珊瑚礁堆積物は底生微細珪藻類と従属栄養性細菌の活性が共存し、ともに窒素有機化過程に深く関与しているため、細菌類に...
【数物系科学】地球惑星科学:水酸化鉄バクテリアを含む研究件
❏分子地球化学:原子レベルの状態分析に基づく地球と生命の進化史の精密解析(22224011)
【研究テーマ】地球宇宙化学
【研究種目】基盤研究(S)
【研究期間】2010-04-01 - 2015-03-31
【研究代表者】高橋 嘉夫 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (10304396)
【キーワード】化学種解明 / XAFS / モリブデン / タングステン / セリウム異常 (他24件)
【概要】本研究では、XAFS法などにより固液界面での元素の局所構造を調べる(化学種解析)ことで、海洋での微量元素の固相への吸着反応に伴う元素の固液分配や同位体分別のメカニズム解明を解明し、それに基づいた精密な古海洋の酸化還元状態解析や海洋の酸化還元環境の変化に伴う元素の溶解度の変化などに関する研究を行った。その結果、Mo同位体比とW同位体比の複合的利用、Ce安定同位体比とCe異常の複合的利用、バライト中の...
❏バクテリア活動の指標としての希土類元素パターン:原子レベルから古環境解析まで(19340168)
【研究テーマ】地球宇宙化学
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2007 - 2009
【研究代表者】高橋 嘉夫 広島大学, 大学院・理学研究科, 教授 (10304396)
【キーワード】バクテリア / 希土類元素 / 吸着 / 細胞壁 / バイオフィルム (他11件)
【概要】様々なバクテリア細胞表面への吸着のREE分配パターンには特異な重希土類(HREE)の濃集がみられ、これはEXAFS法によりは多座のリン酸サイトとの錯生成によることが明らかになった。また(リン酸サイト)/(カルボキシル基)比はpHと共に減少し、[REE]/[バクテリア]比の増大と共にカルボキシル基の寄与が増加した。HREEの濃集は天然のバイオフィルムやバクテリア由来の水酸化鉄にも見られると共に、同様...
【数物系科学】地球惑星科学:ハライドバクテリアを含む研究件
❏分子地球化学:原子レベルの状態分析に基づく地球と生命の進化史の精密解析(22224011)
【研究テーマ】地球宇宙化学
【研究種目】基盤研究(S)
【研究期間】2010-04-01 - 2015-03-31
【研究代表者】高橋 嘉夫 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (10304396)
【キーワード】化学種解明 / XAFS / モリブデン / タングステン / セリウム異常 (他24件)
【概要】本研究では、XAFS法などにより固液界面での元素の局所構造を調べる(化学種解析)ことで、海洋での微量元素の固相への吸着反応に伴う元素の固液分配や同位体分別のメカニズム解明を解明し、それに基づいた精密な古海洋の酸化還元状態解析や海洋の酸化還元環境の変化に伴う元素の溶解度の変化などに関する研究を行った。その結果、Mo同位体比とW同位体比の複合的利用、Ce安定同位体比とCe異常の複合的利用、バライト中の...
❏古テチスにおける前期古生代地圏変動と生命圏進化の相互作用(12573008)
【研究テーマ】地質学
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2000 - 2003
【研究代表者】松本 良 東京大学, 大学院・理学系研究科, 教授 (40011762)
【キーワード】炭素同位体 / ストロンチウム同位体 / ドロマイト / イラン / 中国 (他29件)
【概要】前期古生代を対象として研究を始めたが、地球環境の変遷という視点からは先カンブリア時代後期からの移行も重要と判断し本研究に含めた。研究手法としては、1.イランおよび中国のいわゆる古テチスと呼ばれる地層を対象とした現地調査と分析試料の採取、2.薄片観察を中心とする試料の観察、3.炭酸塩および泥岩試料の化学分析、同位体組成分析による堆積環境の推定と生物の絶滅イベントの抽出、などを含む。調査地域と研究内容...
【生物学】基礎生物学:シアノバクテリアバクテリアを含む研究件
❏シアノバクテリアの持つロドプシンの機能解析:彼らは光をどう使い分けるのか?(15K14601)
【研究テーマ】生態・環境
【研究種目】挑戦的萌芽研究
【研究期間】2015-04-01 - 2018-03-31
【研究代表者】吉澤 晋 東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (00553108)
【キーワード】ロドプシン / シアノバクテリア / バクテリア / 微生物生態 / 光合成 (他10件)
【概要】シアノバクテリア(Synechocystis sp. PCC 7509)から未知ロドプシンを見出しSyHRと命名した。異種発現系を用いた機能解析の結果、SyHRは光でCl-やSO42-を細胞内に輸送することが示された。また分光解析の結果、SyHRは緑色(約540 nm)の光を利用することが分かった。本研究で、シアノバクテリアの持つSyHRがクロロフィルが利用しない緑色の光を利用し、陰イオンを能動的...
❏地球規模環境変動が氷河生態系に及ぼす影響評価(26241020)
【研究テーマ】環境影響評価
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2014-04-01 - 2018-03-31
【研究代表者】幸島 司郎 京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60183802)
【キーワード】氷河 / 氷床 / 微生物 / 藻類 / バクテリア (他12件)
【概要】世界各地の氷河で採取した微生物の遺伝子分析と地域間比較により、氷河融解を加速する汚れ物質(クリオコナイト)形成に関係するバクテリアやシアノバクテリアの地理的分布や汚れ物質内での分布、氷河動物と共生するバクテリアの存在が初めて明らかになった。また、生物によるアルベド改変過程を組み込んだ氷河変動モデルを改良するために、クリオコナイトが氷河表面に形成する縦穴(クリオコナイトホール)の発達や崩壊を精度良く...
【生物学】基礎生物学:藻類バクテリアを含む研究件
❏地球規模環境変動が氷河生態系に及ぼす影響評価(26241020)
【研究テーマ】環境影響評価
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2014-04-01 - 2018-03-31
【研究代表者】幸島 司郎 京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60183802)
【キーワード】氷河 / 氷床 / 微生物 / 藻類 / バクテリア (他12件)
【概要】世界各地の氷河で採取した微生物の遺伝子分析と地域間比較により、氷河融解を加速する汚れ物質(クリオコナイト)形成に関係するバクテリアやシアノバクテリアの地理的分布や汚れ物質内での分布、氷河動物と共生するバクテリアの存在が初めて明らかになった。また、生物によるアルベド改変過程を組み込んだ氷河変動モデルを改良するために、クリオコナイトが氷河表面に形成する縦穴(クリオコナイトホール)の発達や崩壊を精度良く...
❏地球規模環境変動に対する氷河生態系の応答予測と影響評価(22241005)
【研究テーマ】環境動態解析
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2010-04-01 - 2014-03-31
【研究代表者】幸島 司郎 京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60183802)
【キーワード】アルベド / バクテリア / リモートセンシング / 微生物 / 極限環境 (他11件)
【概要】氷河生態系の微生物生態、特にその活動が氷河表面のアルベド(反射率)を低下させ氷河融解を促進する課程を理解し、地球規模環境変動による氷河生態系の応答を予測するために、世界各地の様々なタイプの氷河で、氷河の生物相、表面構造、アルベド、気象条件に関する調査を行い、その結果を比較した。その結果、微生物による氷河アルベド改変過程や氷河微生物相の決定要因を理解するのに必要な、微生物相とアルベド、環境条件の関係...
【生物学】基礎生物学:光合成バクテリアを含む研究件
❏シアノバクテリアの持つロドプシンの機能解析:彼らは光をどう使い分けるのか?(15K14601)
【研究テーマ】生態・環境
【研究種目】挑戦的萌芽研究
【研究期間】2015-04-01 - 2018-03-31
【研究代表者】吉澤 晋 東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (00553108)
【キーワード】ロドプシン / シアノバクテリア / バクテリア / 微生物生態 / 光合成 (他10件)
【概要】シアノバクテリア(Synechocystis sp. PCC 7509)から未知ロドプシンを見出しSyHRと命名した。異種発現系を用いた機能解析の結果、SyHRは光でCl-やSO42-を細胞内に輸送することが示された。また分光解析の結果、SyHRは緑色(約540 nm)の光を利用することが分かった。本研究で、シアノバクテリアの持つSyHRがクロロフィルが利用しない緑色の光を利用し、陰イオンを能動的...
❏電熱線大規模埋設実験による落葉広葉樹林生態系の温暖化に対する応答の解明(19657007)
【研究テーマ】生態・環境
【研究種目】萌芽研究
【研究期間】2007 - 2008
【研究代表者】日浦 勉 北海道大学, 北方生物圏フィールド科学センター, 教授 (70250496)
【キーワード】ミズナラ / 森林生態系 / 窒素含量 / 光合成 / 植食性昆虫 (他13件)
【概要】1、ミズナラの最大光合成速度は温暖化処理によって変化しなかったが、窒素含量は低下したため窒素利用効率は上昇した。イオン交換樹脂法によって土壌中の無機体窒素量がどのように変化したかは現3定量中である。 2、葉中の窒素含量の低下と硬さの指標が上昇したため、植食性昆虫による食害は低下した。 3、ミズナラの堅果生産量は枝の温暖化処理によって3〜5倍に上昇した。そのメカニズムは今のところ不明である。 4、土...
【工学】電気電子工学:電気インピーダンス計測バクテリアを含む研究件
❏ナノ空間の高電界を利用した非線形電気インピーダンス応答による細菌1粒子センシング(20H02160)
【研究テーマ】
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ナノポア / インピーダンス / ウイルス / バクテリア / ナノデバイス (他23件)
【概要】これまでも度々問題になっていた現象であるが,バクテリア計測時はバッファである生理食塩水の塩濃度が高く導電率も高いため,高電界を印加すると電極エッジ部分に電界が集中して電極反応により電極が電気分解する問題が顕著になった。そこで電極の保護のため,デバイス形状の大幅な見直しを行った。具体的には,これまでのデザインとは逆に電極のエッジは使わずに電極面積をなるべく大きく使うように測定セルの形状を変更した。さ...
❏ナノ空間中の電気インピーダンス測定によるウイルスセンシング法の創成(17H03246)
【研究テーマ】電子デバイス・電子機器
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ウイルスセンサー / バクテリアセンサー / 感染予防 / 電気インピーダンス計測 / バイオセンサー (他35件)
【概要】感染症の早期発見に基づく安全・安寧な社会の実現をめざし,高電界非線形電気インピーダンス法を利用したウイルスの電気的測定法の創成を目的として,ナノポア型とナノ流路型のウイルスセンサーの開発を行った。その結果,定量性には課題が残るものの,インピーダンス測定データをウイルスの電気的等価回路モデルを元に解析することによって,ウイルス種の同定が可能となることを示唆する結果が得られた。 ...
【工学】電気電子工学:ナノボアバクテリアを含む研究件
❏ナノ空間の高電界を利用した非線形電気インピーダンス応答による細菌1粒子センシング(20H02160)
【研究テーマ】
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ナノポア / インピーダンス / ウイルス / バクテリア / ナノデバイス (他23件)
【概要】これまでも度々問題になっていた現象であるが,バクテリア計測時はバッファである生理食塩水の塩濃度が高く導電率も高いため,高電界を印加すると電極エッジ部分に電界が集中して電極反応により電極が電気分解する問題が顕著になった。そこで電極の保護のため,デバイス形状の大幅な見直しを行った。具体的には,これまでのデザインとは逆に電極のエッジは使わずに電極面積をなるべく大きく使うように測定セルの形状を変更した。さ...
❏ナノ空間中の電気インピーダンス測定によるウイルスセンシング法の創成(17H03246)
【研究テーマ】電子デバイス・電子機器
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ウイルスセンサー / バクテリアセンサー / 感染予防 / 電気インピーダンス計測 / バイオセンサー (他35件)
【概要】感染症の早期発見に基づく安全・安寧な社会の実現をめざし,高電界非線形電気インピーダンス法を利用したウイルスの電気的測定法の創成を目的として,ナノポア型とナノ流路型のウイルスセンサーの開発を行った。その結果,定量性には課題が残るものの,インピーダンス測定データをウイルスの電気的等価回路モデルを元に解析することによって,ウイルス種の同定が可能となることを示唆する結果が得られた。 ...
【工学】電気電子工学:ナノ流体システムバクテリアを含む研究件
❏ナノ空間の高電界を利用した非線形電気インピーダンス応答による細菌1粒子センシング(20H02160)
【研究テーマ】
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ナノポア / インピーダンス / ウイルス / バクテリア / ナノデバイス (他23件)
【概要】これまでも度々問題になっていた現象であるが,バクテリア計測時はバッファである生理食塩水の塩濃度が高く導電率も高いため,高電界を印加すると電極エッジ部分に電界が集中して電極反応により電極が電気分解する問題が顕著になった。そこで電極の保護のため,デバイス形状の大幅な見直しを行った。具体的には,これまでのデザインとは逆に電極のエッジは使わずに電極面積をなるべく大きく使うように測定セルの形状を変更した。さ...
❏ナノ空間中の電気インピーダンス測定によるウイルスセンシング法の創成(17H03246)
【研究テーマ】電子デバイス・電子機器
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ウイルスセンサー / バクテリアセンサー / 感染予防 / 電気インピーダンス計測 / バイオセンサー (他35件)
【概要】感染症の早期発見に基づく安全・安寧な社会の実現をめざし,高電界非線形電気インピーダンス法を利用したウイルスの電気的測定法の創成を目的として,ナノポア型とナノ流路型のウイルスセンサーの開発を行った。その結果,定量性には課題が残るものの,インピーダンス測定データをウイルスの電気的等価回路モデルを元に解析することによって,ウイルス種の同定が可能となることを示唆する結果が得られた。 ...
【工学】電気電子工学:ナノ流体デバイスバクテリアを含む研究件
❏ナノ空間の高電界を利用した非線形電気インピーダンス応答による細菌1粒子センシング(20H02160)
【研究テーマ】
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ナノポア / インピーダンス / ウイルス / バクテリア / ナノデバイス (他23件)
【概要】これまでも度々問題になっていた現象であるが,バクテリア計測時はバッファである生理食塩水の塩濃度が高く導電率も高いため,高電界を印加すると電極エッジ部分に電界が集中して電極反応により電極が電気分解する問題が顕著になった。そこで電極の保護のため,デバイス形状の大幅な見直しを行った。具体的には,これまでのデザインとは逆に電極のエッジは使わずに電極面積をなるべく大きく使うように測定セルの形状を変更した。さ...
❏ナノ空間中の電気インピーダンス測定によるウイルスセンシング法の創成(17H03246)
【研究テーマ】電子デバイス・電子機器
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ウイルスセンサー / バクテリアセンサー / 感染予防 / 電気インピーダンス計測 / バイオセンサー (他35件)
【概要】感染症の早期発見に基づく安全・安寧な社会の実現をめざし,高電界非線形電気インピーダンス法を利用したウイルスの電気的測定法の創成を目的として,ナノポア型とナノ流路型のウイルスセンサーの開発を行った。その結果,定量性には課題が残るものの,インピーダンス測定データをウイルスの電気的等価回路モデルを元に解析することによって,ウイルス種の同定が可能となることを示唆する結果が得られた。 ...
【工学】総合工学:腐植物質バクテリアを含む研究件
❏堆積・続成過程における微量元素の化学状態決定と化学的挙動の解明:古環境指標の確立(20540475)
【研究テーマ】地球宇宙化学
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2008 - 2010
【研究代表者】清水 洋 広島大学, 大学院・理学研究科, 名誉教授 (60090544)
【キーワード】微量元素 / 希土類元素 / 堆積過程 / 続成過程 / 化学状態 (他21件)
【概要】堆積岩の地球化学的特徴は、地球表層環境の変遷を記録している。本研究では、希土類元素(REE)をはじめとする微量元素について、堆積物への取込みメカニズムと堆積後の反応を原子・分子のミクロな観点から解明した。海洋性堆積物において、堆積時にマンガン酸化物相に取り込まれたREEは続成作用によりリン酸塩相に移動するものの、堆積物全体としてのREEパターンはほぼ変化していないことを初めて明らかにした。この結果...
❏バクテリアおよび腐植物質と希土類元素との相互作用の定量的評価(15740320)
【研究テーマ】地球宇宙化学
【研究種目】若手研究(B)
【研究期間】2003 - 2004
【研究代表者】高橋 嘉夫 広島大学, 大学院・理学研究科, 助教授 (10304396)
【キーワード】希土類元素 / バクテリア / 腐植物質 / 希土類元素パターン / 水圏 (他8件)
【概要】希土類元素の環境中での挙動に影響を与える因子のうち、主にバクテリアや腐植物質との相互作用に関して研究を進めた.主な成果を以下にまとめる. (1)B.subtilisやE.coliなどのバクテリアの細胞表面への希土類元素の吸着を調べた.その結果、相対的に重希土類元素側でバクテリア相への著しい濃縮が見られた.この特異なパターンは、バクテリア細胞表面の希土類元素の吸着サイトとしてリン酸基とカルボキシル基...
【工学】総合工学:微細加工バクテリアを含む研究件
❏ナノ空間中の電気インピーダンス測定によるウイルスセンシング法の創成(17H03246)
【研究テーマ】電子デバイス・電子機器
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ウイルスセンサー / バクテリアセンサー / 感染予防 / 電気インピーダンス計測 / バイオセンサー (他35件)
【概要】感染症の早期発見に基づく安全・安寧な社会の実現をめざし,高電界非線形電気インピーダンス法を利用したウイルスの電気的測定法の創成を目的として,ナノポア型とナノ流路型のウイルスセンサーの開発を行った。その結果,定量性には課題が残るものの,インピーダンス測定データをウイルスの電気的等価回路モデルを元に解析することによって,ウイルス種の同定が可能となることを示唆する結果が得られた。 ...
❏変動環境に適応する大腸菌の一細胞レベルの解析(24710228)
【研究テーマ】システムゲノム科学
【研究種目】若手研究(B)
【研究期間】2012-04-01 - 2014-03-31
【研究代表者】津留 三良 大阪大学, 情報科学研究科, 助教 (80594506)
【キーワード】一細胞観察 / 遺伝子発現の確率性 / マイクロ流路 / 遺伝子発現ノイズ / 微細加工 (他8件)
【概要】本研究は、顕微鏡下でリアルタイムに観測可能で、培地交換が速い微細培養装置を開発することを目的としている。この装置は、細胞の流出を防ぐ小部屋と、培地成分濃度を様々な周波数で供給する発振流路から構成される。培地中の蛍光色素を指標に、小部屋の培地交換速度を計測した。その結果、当初目標の半分以下の10秒程度で培地交換が可能な微細培養装置を完成させた。蛍光タンパク質を合成する大腸菌をこの装置で培養・観察した...
【工学】総合工学:インピーダンスバクテリアを含む研究件
❏ナノ空間の高電界を利用した非線形電気インピーダンス応答による細菌1粒子センシング(20H02160)
【研究テーマ】
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ナノポア / インピーダンス / ウイルス / バクテリア / ナノデバイス (他23件)
【概要】これまでも度々問題になっていた現象であるが,バクテリア計測時はバッファである生理食塩水の塩濃度が高く導電率も高いため,高電界を印加すると電極エッジ部分に電界が集中して電極反応により電極が電気分解する問題が顕著になった。そこで電極の保護のため,デバイス形状の大幅な見直しを行った。具体的には,これまでのデザインとは逆に電極のエッジは使わずに電極面積をなるべく大きく使うように測定セルの形状を変更した。さ...
❏ナノ空間中の電気インピーダンス測定によるウイルスセンシング法の創成(17H03246)
【研究テーマ】電子デバイス・電子機器
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ウイルスセンサー / バクテリアセンサー / 感染予防 / 電気インピーダンス計測 / バイオセンサー (他35件)
【概要】感染症の早期発見に基づく安全・安寧な社会の実現をめざし,高電界非線形電気インピーダンス法を利用したウイルスの電気的測定法の創成を目的として,ナノポア型とナノ流路型のウイルスセンサーの開発を行った。その結果,定量性には課題が残るものの,インピーダンス測定データをウイルスの電気的等価回路モデルを元に解析することによって,ウイルス種の同定が可能となることを示唆する結果が得られた。 ...
【工学】総合工学:バイオセンサーバクテリアを含む研究件
❏ナノ空間の高電界を利用した非線形電気インピーダンス応答による細菌1粒子センシング(20H02160)
【研究テーマ】
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ナノポア / インピーダンス / ウイルス / バクテリア / ナノデバイス (他23件)
【概要】これまでも度々問題になっていた現象であるが,バクテリア計測時はバッファである生理食塩水の塩濃度が高く導電率も高いため,高電界を印加すると電極エッジ部分に電界が集中して電極反応により電極が電気分解する問題が顕著になった。そこで電極の保護のため,デバイス形状の大幅な見直しを行った。具体的には,これまでのデザインとは逆に電極のエッジは使わずに電極面積をなるべく大きく使うように測定セルの形状を変更した。さ...
❏ナノ空間中の電気インピーダンス測定によるウイルスセンシング法の創成(17H03246)
【研究テーマ】電子デバイス・電子機器
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ウイルスセンサー / バクテリアセンサー / 感染予防 / 電気インピーダンス計測 / バイオセンサー (他35件)
【概要】感染症の早期発見に基づく安全・安寧な社会の実現をめざし,高電界非線形電気インピーダンス法を利用したウイルスの電気的測定法の創成を目的として,ナノポア型とナノ流路型のウイルスセンサーの開発を行った。その結果,定量性には課題が残るものの,インピーダンス測定データをウイルスの電気的等価回路モデルを元に解析することによって,ウイルス種の同定が可能となることを示唆する結果が得られた。 ...
【工学】総合工学:吸着バクテリアを含む研究件
❏バクテリア活動の指標としての希土類元素パターン:原子レベルから古環境解析まで(19340168)
【研究テーマ】地球宇宙化学
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2007 - 2009
【研究代表者】高橋 嘉夫 広島大学, 大学院・理学研究科, 教授 (10304396)
【キーワード】バクテリア / 希土類元素 / 吸着 / 細胞壁 / バイオフィルム (他11件)
【概要】様々なバクテリア細胞表面への吸着のREE分配パターンには特異な重希土類(HREE)の濃集がみられ、これはEXAFS法によりは多座のリン酸サイトとの錯生成によることが明らかになった。また(リン酸サイト)/(カルボキシル基)比はpHと共に減少し、[REE]/[バクテリア]比の増大と共にカルボキシル基の寄与が増加した。HREEの濃集は天然のバイオフィルムやバクテリア由来の水酸化鉄にも見られると共に、同様...
❏バクテリアおよび腐植物質と希土類元素との相互作用の定量的評価(15740320)
【研究テーマ】地球宇宙化学
【研究種目】若手研究(B)
【研究期間】2003 - 2004
【研究代表者】高橋 嘉夫 広島大学, 大学院・理学研究科, 助教授 (10304396)
【キーワード】希土類元素 / バクテリア / 腐植物質 / 希土類元素パターン / 水圏 (他8件)
【概要】希土類元素の環境中での挙動に影響を与える因子のうち、主にバクテリアや腐植物質との相互作用に関して研究を進めた.主な成果を以下にまとめる. (1)B.subtilisやE.coliなどのバクテリアの細胞表面への希土類元素の吸着を調べた.その結果、相対的に重希土類元素側でバクテリア相への著しい濃縮が見られた.この特異なパターンは、バクテリア細胞表面の希土類元素の吸着サイトとしてリン酸基とカルボキシル基...
【工学】総合工学:ナノ粒子バクテリアを含む研究件
❏ボロン酸修飾高分子による細菌の簡易迅速識別・分離法の開発(18K14255)
【研究テーマ】
【研究種目】若手研究
【研究期間】2018-04-01 - 2022-03-31
【研究代表者】土戸 優志 早稲田大学, 理工学術院, 講師(任期付) (40737219)
【キーワード】細菌 / 分子認識 / ボロン酸 / デンドリマー / 超分子 (他19件)
【概要】ボロン酸修飾デンドリマーを用いた細菌の検出法を開発した。本手法は、ボロン酸修飾デンドリマーを細菌を含む溶液に添加してボルテックス撹拌するだけの非常に簡易な方法で、細菌凝集を引き起こすことによって検出することができる。その検出感度は、濁度法では約100万 CFU/mL、蛍光法では約1万 CFU/mLである。検出時間は5分~数十分程度であり、従来法に比べて大幅に短い時間での、迅速な細菌検出を達成した。...
❏ナノ地球科学の開拓:微生物酵素により生成するナノ結晶の形成過程の研究(16740300)
【研究テーマ】岩石・鉱物・鉱床学
【研究種目】若手研究(B)
【研究期間】2004 - 2006
【研究代表者】鈴木 庸平 独立行政法人産業技術総合研究所, 深部地質環境研究センター, 研究員 (00359168)
【キーワード】ナノ結晶 / バイオミネラリゼーション / 電子伝達酵素 / 酸化還元 / 嫌気性細菌 (他16件)
【概要】初年度、透過型電子顕微鏡と磁性測定を用いた硫化鉄および酸化鉄のナノ結晶の解析法を確立した。また、生物由来の硫化鉄鉱物を人工的な変質を起こさずに電子顕微鏡用の試料を作成する事に成功した。嫌気性微生物のDesulfovibrio vulgarisが生成する結晶と無機的な反応で生成する結晶とを比較し、粒径が大きく結晶形態の異なる硫化鉄ナノ粒子を生成する事が明らかにした。次年度はDesulfovibrio...
【工学】総合工学:センサーバクテリアを含む研究件
❏ナノ空間の高電界を利用した非線形電気インピーダンス応答による細菌1粒子センシング(20H02160)
【研究テーマ】
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ナノポア / インピーダンス / ウイルス / バクテリア / ナノデバイス (他23件)
【概要】これまでも度々問題になっていた現象であるが,バクテリア計測時はバッファである生理食塩水の塩濃度が高く導電率も高いため,高電界を印加すると電極エッジ部分に電界が集中して電極反応により電極が電気分解する問題が顕著になった。そこで電極の保護のため,デバイス形状の大幅な見直しを行った。具体的には,これまでのデザインとは逆に電極のエッジは使わずに電極面積をなるべく大きく使うように測定セルの形状を変更した。さ...
❏ナノ空間中の電気インピーダンス測定によるウイルスセンシング法の創成(17H03246)
【研究テーマ】電子デバイス・電子機器
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ウイルスセンサー / バクテリアセンサー / 感染予防 / 電気インピーダンス計測 / バイオセンサー (他35件)
【概要】感染症の早期発見に基づく安全・安寧な社会の実現をめざし,高電界非線形電気インピーダンス法を利用したウイルスの電気的測定法の創成を目的として,ナノポア型とナノ流路型のウイルスセンサーの開発を行った。その結果,定量性には課題が残るものの,インピーダンス測定データをウイルスの電気的等価回路モデルを元に解析することによって,ウイルス種の同定が可能となることを示唆する結果が得られた。 ...
【工学】総合工学:マイクロ流路バクテリアを含む研究件
❏ナノ空間中の電気インピーダンス測定によるウイルスセンシング法の創成(17H03246)
【研究テーマ】電子デバイス・電子機器
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ウイルスセンサー / バクテリアセンサー / 感染予防 / 電気インピーダンス計測 / バイオセンサー (他35件)
【概要】感染症の早期発見に基づく安全・安寧な社会の実現をめざし,高電界非線形電気インピーダンス法を利用したウイルスの電気的測定法の創成を目的として,ナノポア型とナノ流路型のウイルスセンサーの開発を行った。その結果,定量性には課題が残るものの,インピーダンス測定データをウイルスの電気的等価回路モデルを元に解析することによって,ウイルス種の同定が可能となることを示唆する結果が得られた。 ...
❏変動環境に適応する大腸菌の一細胞レベルの解析(24710228)
【研究テーマ】システムゲノム科学
【研究種目】若手研究(B)
【研究期間】2012-04-01 - 2014-03-31
【研究代表者】津留 三良 大阪大学, 情報科学研究科, 助教 (80594506)
【キーワード】一細胞観察 / 遺伝子発現の確率性 / マイクロ流路 / 遺伝子発現ノイズ / 微細加工 (他8件)
【概要】本研究は、顕微鏡下でリアルタイムに観測可能で、培地交換が速い微細培養装置を開発することを目的としている。この装置は、細胞の流出を防ぐ小部屋と、培地成分濃度を様々な周波数で供給する発振流路から構成される。培地中の蛍光色素を指標に、小部屋の培地交換速度を計測した。その結果、当初目標の半分以下の10秒程度で培地交換が可能な微細培養装置を完成させた。蛍光タンパク質を合成する大腸菌をこの装置で培養・観察した...
【総合生物】神経科学:生物物理学バクテリアを含む研究件
❏アクティブマターのトポロジカル制御とトポロジカル物性(20K14426)
【研究テーマ】
【研究種目】若手研究
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】西口 大貴 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (20850556)
【キーワード】アクティブマター / 集団運動 / バクテリア乱流 / アクティブ乱流 / トポロジカル物性 (他9件)
【概要】トポロジカル現象が出るとの理論予測がなされている柱格子構造中でアクティブ乱流の観察を引き続きおこない、渦秩序の発生を確認した。柱格子の格子定数を変えることで、渦秩序構造が生じやすいパラメーターの探索を進めた。得られた最適な条件に基づき、格子サイズやエッジの形状などを変えることで、目的の条件が得られると期待できるため、その準備を進めている。 トポロジカル現象の観察のためには、バクテリア濃厚懸濁液の示...
❏細胞集団の応答とトポロジカル欠陥の非平衡ダイナミクス(19K23422)
【研究テーマ】
【研究種目】研究活動スタート支援
【研究期間】2019-08-30 - 2021-03-31
【研究代表者】西口 大貴 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (20850556)
【キーワード】アクティブマター / 集団運動 / 細胞集団 / バクテリア乱流 / アクティブ乱流 (他12件)
【概要】アクティブマター物理学の方法論をより広範な系に適用できるよう拡張するために、本研究では集団運動と他の自由度が結合した場合の挙動を調べた。具体的には、培養細胞集団が外場へ応答するときの様子およびバクテリア濃厚懸濁液のアクティブ乱流が境界条件下で秩序化する原理を、トポロジカル欠陥に着目して解析した。結果、集団運動における新たな境界条件を実験的に推定すること等に成功し、集団運動を理論的に予測する枠組みを...
❏還流系を用いた中立的生態系実験の実現とその統計力学的解析(16H04033)
【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】竹内 一将 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (50622304)
【キーワード】生物物理学 / アクティブマター / バクテリア / 微小流体デバイス / 集団遺伝学 (他8件)
【概要】本研究では、微小流体デバイスを用いて二つの細菌集団を培養し、競合させるモデル生態系実験を実現して、その結果を統計力学的な見地から解析した。まず、高密度の細菌集団を均一な環境で培養し、長時間計測できる灌流型の微小流体デバイスを開発した。それを用いて、蛍光タンパク質で標識した二つの大腸菌株を培養したところ、二集団の占有領域にフラクタル状のパターン形成を見出した。我々は、パターンの統計的特徴や菌の配向秩...
【農学】動物生命科学:生態系バクテリアを含む研究件
❏還流系を用いた中立的生態系実験の実現とその統計力学的解析(16H04033)
【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2016-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】竹内 一将 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (50622304)
【キーワード】生物物理学 / アクティブマター / バクテリア / 微小流体デバイス / 集団遺伝学 (他8件)
【概要】本研究では、微小流体デバイスを用いて二つの細菌集団を培養し、競合させるモデル生態系実験を実現して、その結果を統計力学的な見地から解析した。まず、高密度の細菌集団を均一な環境で培養し、長時間計測できる灌流型の微小流体デバイスを開発した。それを用いて、蛍光タンパク質で標識した二つの大腸菌株を培養したところ、二集団の占有領域にフラクタル状のパターン形成を見出した。我々は、パターンの統計的特徴や菌の配向秩...
❏地球規模環境変動が氷河生態系に及ぼす影響評価(26241020)
【研究テーマ】環境影響評価
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2014-04-01 - 2018-03-31
【研究代表者】幸島 司郎 京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60183802)
【キーワード】氷河 / 氷床 / 微生物 / 藻類 / バクテリア (他12件)
【概要】世界各地の氷河で採取した微生物の遺伝子分析と地域間比較により、氷河融解を加速する汚れ物質(クリオコナイト)形成に関係するバクテリアやシアノバクテリアの地理的分布や汚れ物質内での分布、氷河動物と共生するバクテリアの存在が初めて明らかになった。また、生物によるアルベド改変過程を組み込んだ氷河変動モデルを改良するために、クリオコナイトが氷河表面に形成する縦穴(クリオコナイトホール)の発達や崩壊を精度良く...
【農学】水圏応用科学:微生物バクテリアを含む研究件
❏地球規模環境変動が氷河生態系に及ぼす影響評価(26241020)
【研究テーマ】環境影響評価
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2014-04-01 - 2018-03-31
【研究代表者】幸島 司郎 京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60183802)
【キーワード】氷河 / 氷床 / 微生物 / 藻類 / バクテリア (他12件)
【概要】世界各地の氷河で採取した微生物の遺伝子分析と地域間比較により、氷河融解を加速する汚れ物質(クリオコナイト)形成に関係するバクテリアやシアノバクテリアの地理的分布や汚れ物質内での分布、氷河動物と共生するバクテリアの存在が初めて明らかになった。また、生物によるアルベド改変過程を組み込んだ氷河変動モデルを改良するために、クリオコナイトが氷河表面に形成する縦穴(クリオコナイトホール)の発達や崩壊を精度良く...
❏地球規模環境変動に対する氷河生態系の応答予測と影響評価(22241005)
【研究テーマ】環境動態解析
【研究種目】基盤研究(A)
【研究期間】2010-04-01 - 2014-03-31
【研究代表者】幸島 司郎 京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60183802)
【キーワード】アルベド / バクテリア / リモートセンシング / 微生物 / 極限環境 (他11件)
【概要】氷河生態系の微生物生態、特にその活動が氷河表面のアルベド(反射率)を低下させ氷河融解を促進する課程を理解し、地球規模環境変動による氷河生態系の応答を予測するために、世界各地の様々なタイプの氷河で、氷河の生物相、表面構造、アルベド、気象条件に関する調査を行い、その結果を比較した。その結果、微生物による氷河アルベド改変過程や氷河微生物相の決定要因を理解するのに必要な、微生物相とアルベド、環境条件の関係...
【医歯薬学】薬学:大腸菌バクテリアを含む研究件
❏超効率バイオアッセイシステム開発のためのインクジェット技術の確立(23658138)
【研究テーマ】木質科学
【研究種目】挑戦的萌芽研究
【研究期間】2011 - 2013
【研究代表者】江前 敏晴 筑波大学, 生命環境系, 教授 (40203640)
【キーワード】バイオアッセイ / インクジェット / バクテリア / 細胞 / 寒天培地 (他11件)
【概要】インクジェットプリンタにより培地及び細菌を紙に印刷し、顕微鏡によりコロニー成長を評価することで数時間のうちに最適環境条件を決定できるバイオアッセイシステム開発を目指した。ポリスチレンのトルエン溶液に浸漬し全面疎水化したろ紙に、培地を形成したい区画にだけトルエンを印刷してポしスチレン樹脂を溶かし出し、親疎水性パターンを作製した。印刷中のゲル化を押さえるため、インクカートリッジの加熱と寒天の硫酸加水分...
❏バクテリア・セントロメア様配列migSの染色体分配機構における分子機能の解明(16370082)
【研究テーマ】分子生物学
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2004 - 2006
【研究代表者】仁木 宏典 国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 教授 (70208122)
【キーワード】大腸菌 / 染色体 / 核分裂 / 複製 / セントロメア (他12件)
【概要】大腸菌の複製起点(oriC)領域の染色体分配の様子が解るにつれ、染色体分配の駆動メカニズムの存在が明確になった。oriC領域は、細胞中央から細胞両極へと移動する。このoriCの移動を担うシス配列(migS)を見いだした。さらに、migSと相互作用するタンパク質を分離し、質量分析を基にその遺伝子を明らかにした。これら遺伝子破壊株を調べたところ、2つの遺伝子破壊株で所migS欠失株と同様にoriCの移...
【医歯薬学】薬学:蛍光バクテリアを含む研究件
❏ボロン酸修飾高分子による細菌の簡易迅速識別・分離法の開発(18K14255)
【研究テーマ】
【研究種目】若手研究
【研究期間】2018-04-01 - 2022-03-31
【研究代表者】土戸 優志 早稲田大学, 理工学術院, 講師(任期付) (40737219)
【キーワード】細菌 / 分子認識 / ボロン酸 / デンドリマー / 超分子 (他19件)
【概要】ボロン酸修飾デンドリマーを用いた細菌の検出法を開発した。本手法は、ボロン酸修飾デンドリマーを細菌を含む溶液に添加してボルテックス撹拌するだけの非常に簡易な方法で、細菌凝集を引き起こすことによって検出することができる。その検出感度は、濁度法では約100万 CFU/mL、蛍光法では約1万 CFU/mLである。検出時間は5分~数十分程度であり、従来法に比べて大幅に短い時間での、迅速な細菌検出を達成した。...
❏糖加水分解酵素蛍光プローブ群の開発による新規迅速がんイメージング手法の確立(16F16109)
【研究テーマ】ケミカルバイオロジー
【研究種目】特別研究員奨励費
【研究期間】2016-10-07 - 2019-03-31
【研究代表者】浦野 泰照 東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 教授 (20292956)
【キーワード】sialidase / fluorescence / activation / cancer / self-immolative space (他12件)
【概要】Sialidases are members of a family of exoglycosidases specifically catalyzing the removal of sialic acid residues on the surface of exposed glycoconjugates. A novel fluorescence probe HMRef-S-Neu5Ac h...
❏分解反応の遷移状態構造に立脚した新型核酸医薬を志向した核酸酵素の創製(15KT0057)
【研究テーマ】遷移状態制御
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2015-07-10 - 2018-03-31
【研究代表者】岡本 晃充 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (60314233)
【キーワード】RNA / アプタマー / 核酸構造 / バクテリア / 核酸 (他9件)
【概要】菌の増殖は、食物発酵や環境衛生に関連する分野では、モニターすべき最も基本的な情報である。今までは、採取した菌を培養しそれを顕微鏡で観察しており、さらにより詳しい情報を得るためには菌から核酸を抽出し増幅することによって元の菌の量を定量していた。菌を扱うには、簡便かつ即時的な分析が必要であるが、これまでの方法では困難だった。われわれは、その場で菌の増殖を蛍光で検出できる化学システムを構築した。増殖の元...
【医歯薬学】看護学:ウイルスバクテリアを含む研究件
❏ナノ空間の高電界を利用した非線形電気インピーダンス応答による細菌1粒子センシング(20H02160)
【研究テーマ】
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ナノポア / インピーダンス / ウイルス / バクテリア / ナノデバイス (他23件)
【概要】これまでも度々問題になっていた現象であるが,バクテリア計測時はバッファである生理食塩水の塩濃度が高く導電率も高いため,高電界を印加すると電極エッジ部分に電界が集中して電極反応により電極が電気分解する問題が顕著になった。そこで電極の保護のため,デバイス形状の大幅な見直しを行った。具体的には,これまでのデザインとは逆に電極のエッジは使わずに電極面積をなるべく大きく使うように測定セルの形状を変更した。さ...
❏ナノ空間中の電気インピーダンス測定によるウイルスセンシング法の創成(17H03246)
【研究テーマ】電子デバイス・電子機器
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2017-04-01 - 2020-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ウイルスセンサー / バクテリアセンサー / 感染予防 / 電気インピーダンス計測 / バイオセンサー (他35件)
【概要】感染症の早期発見に基づく安全・安寧な社会の実現をめざし,高電界非線形電気インピーダンス法を利用したウイルスの電気的測定法の創成を目的として,ナノポア型とナノ流路型のウイルスセンサーの開発を行った。その結果,定量性には課題が残るものの,インピーダンス測定データをウイルスの電気的等価回路モデルを元に解析することによって,ウイルス種の同定が可能となることを示唆する結果が得られた。 ...
【医歯薬学】看護学:ゲノムバクテリアを含む研究件
❏地球温暖化に適応するための海藻類の新品種開発手法の確立(19KT0038)
【研究テーマ】次世代の農資源利用
【研究種目】基盤研究(C)
【研究期間】2019-07-17 - 2022-03-31
【研究代表者】西辻 光希 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, スタッフサイエンティスト (60770823)
【キーワード】モズク / 共生バクテリア / モズク類 / 地球温暖化 / オキナワモズク (他12件)
【概要】NBRPバイオリソース藻類から褐藻フトモズク、イシモズクを入手し、次世代シーケンサー(Illumina MiSeqとNovaSeq)でシーケンスを行った。さらに独自手法を開発し、 Oxford Nanopore Technology minIONでのロングリードシーケンスデータの取得にも成功した。 得られたシーケンスデータを解析することにより、ドラフトゲノム配列の取得に成功した。さらに共生バクテリ...
❏シアノバクテリアの持つロドプシンの機能解析:彼らは光をどう使い分けるのか?(15K14601)
【研究テーマ】生態・環境
【研究種目】挑戦的萌芽研究
【研究期間】2015-04-01 - 2018-03-31
【研究代表者】吉澤 晋 東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (00553108)
【キーワード】ロドプシン / シアノバクテリア / バクテリア / 微生物生態 / 光合成 (他10件)
【概要】シアノバクテリア(Synechocystis sp. PCC 7509)から未知ロドプシンを見出しSyHRと命名した。異種発現系を用いた機能解析の結果、SyHRは光でCl-やSO42-を細胞内に輸送することが示された。また分光解析の結果、SyHRは緑色(約540 nm)の光を利用することが分かった。本研究で、シアノバクテリアの持つSyHRがクロロフィルが利用しない緑色の光を利用し、陰イオンを能動的...
❏バクテリア全ゲノム交換法の開発(22657040)
【研究テーマ】生物物理学
【研究種目】挑戦的萌芽研究
【研究期間】2010 - 2012
【研究代表者】田端 和仁 東京大学, 大学院・工学系研究科, 助教 (50403001)
【キーワード】ゲノム / バクテリア / 再構成 / 合成生物学 / 次世代シークエンサー (他6件)
【概要】バクテリアゲノムの交換を目指し、その方法を開発する研究を行った。ゲノム交換を行うためには、宿主バクテリアのゲノムを取り除く必要がある。制限酵素の発現系を利用してゲノム破壊株の作成に成功した。さらに導入するゲノムも切断から守るため、認識部位のメチル化にも成功した。ゲノム入れ替えを試みたところ、いくつかのコロニーを得ることが出来たが、それらの持つゲノムはキメラ状態になっていることが示唆された。 ...
【医歯薬学】看護学:バイオマーカーバクテリアを含む研究件
❏分子地球化学:原子レベルの状態分析に基づく地球と生命の進化史の精密解析(22224011)
【研究テーマ】地球宇宙化学
【研究種目】基盤研究(S)
【研究期間】2010-04-01 - 2015-03-31
【研究代表者】高橋 嘉夫 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (10304396)
【キーワード】化学種解明 / XAFS / モリブデン / タングステン / セリウム異常 (他24件)
【概要】本研究では、XAFS法などにより固液界面での元素の局所構造を調べる(化学種解析)ことで、海洋での微量元素の固相への吸着反応に伴う元素の固液分配や同位体分別のメカニズム解明を解明し、それに基づいた精密な古海洋の酸化還元状態解析や海洋の酸化還元環境の変化に伴う元素の溶解度の変化などに関する研究を行った。その結果、Mo同位体比とW同位体比の複合的利用、Ce安定同位体比とCe異常の複合的利用、バライト中の...
❏分子化石の「ノアの箱舟」:石灰質ノジュールのシェルター効果が守る古環境情報(19654076)
【研究テーマ】層位・古生物学
【研究種目】挑戦的萌芽研究
【研究期間】2007 - 2009
【研究代表者】長谷川 卓 金沢大学, 自然システム学系, 教授 (50272943)
【キーワード】石灰質ノジュール / 炭素同位体比 / 硫酸還元 / 地質野外調査 / 白亜系 (他12件)
【概要】北海道羽幌町の中二股沢および豊沢,同苫前町古丹別川,同小平町幌立沢および小平藥川,そして同夕張市大夕張シューパロ川において,白亜系蝦夷層群の調査を行い,層準を限定して石灰質ノジュール試料を多数採集した.その層準とはInoceramus uwajimensis帯である.羽幌町調査地は入口付近で閉鎖されていたため,往復30Km近い距離を踏破し多量の試料を運搬するという大変な労力を伴った反面,アマチュア...
❏鉄同位体組成分析による地圏/水圏―生物圏相互作用の解明(13440160)
【研究テーマ】岩石・鉱物・鉱床学
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2001 - 2002
【研究代表者】加藤 泰浩 東京大学, 大学院・工学系研究科, 助教授 (40221882)
【キーワード】鉄同位体 / 生体鉱化作用 / 鉄鉱床 / 縞状鉄鉱層 / 同位体分別 (他8件)
【概要】申請者らは,現世や過去の地質試料の鉄同位体組成の大枠を確立し,それにより全地球史を通じての地圏/水圏と生物圏の相互作用を解明することを目的として,本研究を進行させた.次のような成果を得たが,研究の重要な部分については,現在も研究を進展させている. (1)第四紀の陸上温泉活動に伴って,バクテリアなどが関与して生成した堆積性鉄鉱床(群馬鉄山)について,その化学組成が極めて特異であることを見い出し,Re...
【医歯薬学】看護学:細菌バクテリアを含む研究件
❏ナノ空間の高電界を利用した非線形電気インピーダンス応答による細菌1粒子センシング(20H02160)
【研究テーマ】
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2020-04-01 - 2023-03-31
【研究代表者】山本 貴富喜 東京工業大学, 工学院, 准教授 (20322688)
【キーワード】ナノポア / インピーダンス / ウイルス / バクテリア / ナノデバイス (他23件)
【概要】これまでも度々問題になっていた現象であるが,バクテリア計測時はバッファである生理食塩水の塩濃度が高く導電率も高いため,高電界を印加すると電極エッジ部分に電界が集中して電極反応により電極が電気分解する問題が顕著になった。そこで電極の保護のため,デバイス形状の大幅な見直しを行った。具体的には,これまでのデザインとは逆に電極のエッジは使わずに電極面積をなるべく大きく使うように測定セルの形状を変更した。さ...
❏ボロン酸修飾高分子による細菌の簡易迅速識別・分離法の開発(18K14255)
【研究テーマ】
【研究種目】若手研究
【研究期間】2018-04-01 - 2022-03-31
【研究代表者】土戸 優志 早稲田大学, 理工学術院, 講師(任期付) (40737219)
【キーワード】細菌 / 分子認識 / ボロン酸 / デンドリマー / 超分子 (他19件)
【概要】ボロン酸修飾デンドリマーを用いた細菌の検出法を開発した。本手法は、ボロン酸修飾デンドリマーを細菌を含む溶液に添加してボルテックス撹拌するだけの非常に簡易な方法で、細菌凝集を引き起こすことによって検出することができる。その検出感度は、濁度法では約100万 CFU/mL、蛍光法では約1万 CFU/mLである。検出時間は5分~数十分程度であり、従来法に比べて大幅に短い時間での、迅速な細菌検出を達成した。...
❏シアノバクテリアの持つロドプシンの機能解析:彼らは光をどう使い分けるのか?(15K14601)
【研究テーマ】生態・環境
【研究種目】挑戦的萌芽研究
【研究期間】2015-04-01 - 2018-03-31
【研究代表者】吉澤 晋 東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (00553108)
【キーワード】ロドプシン / シアノバクテリア / バクテリア / 微生物生態 / 光合成 (他10件)
【概要】シアノバクテリア(Synechocystis sp. PCC 7509)から未知ロドプシンを見出しSyHRと命名した。異種発現系を用いた機能解析の結果、SyHRは光でCl-やSO42-を細胞内に輸送することが示された。また分光解析の結果、SyHRは緑色(約540 nm)の光を利用することが分かった。本研究で、シアノバクテリアの持つSyHRがクロロフィルが利用しない緑色の光を利用し、陰イオンを能動的...