【研究分野】食品科学

【研究領域課題番号】24658118 (KAKENデータベースで見る）

【研究キーワード】

マイクロRNA / アミノ酸 / タンパク質栄養 / 遺伝子発現 / ロイシン / マイクロアレイ / アミノ酸欠乏 / HepG2 / miRNA / グルコース / DNAマイクロアレイ

【研究成果の概要】

マイクロRNA（miRNA）は、タンパク質に翻訳されない小さなRNAであり、様々なmRNAに作用して遺伝子の発現を制御する。栄養条件の変化により量が変わるmiRNAを探索する目的で、アミノ酸のひとつロイシン欠乏に応答するmiRNAをDNAマイクロアレイにより調べたところ、miR-149*の増加に着目した。また、低タンパク質食に応答するmiR-203の量を培養細胞において人工的に増減させたところ、その標的遺伝子としてNaa50というガンや細胞増殖に関わる因子を見出した。

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2012-04-01 - 2014-03-31

【配分額】4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)

【研究分野】応用健康科学

【研究領域課題番号】23240097 (KAKENデータベースで見る）

【研究キーワード】

バイオマーカー / プロテオミクス / マイクロアレイ / リボソームプロファイリング / 運動 / ストレス / 筋損傷 / 炎症 / ホルモン / サイトカイン / マイクロRNA / 尿 / 老化 / エクソソーム / プロテオーム解析 / 酵素免疫測定法 / ウェスタンブロット / 活性酸素

【研究成果の概要】

運動ストレスに応答するバイオマーカーを検索するため、激運動前後の血液・尿サンプルでプロテオーム解析を行い、運動前後で変動したスポットに関して質量分析装置で同定した。そのうち、尿で顕著な上昇を示した分子についてELISAを構築した。また、血中に存在するマイクロRNAに着目し、マイクロアレイを用いた網羅的解析により一過性レジスタンス運動に応答する複数の血中マイクロRNAを同定し、リアルタイムPCRを用いて発現を定量した。さらに、遺伝子発現の網羅的解析に関しては、特に翻訳動態変化の解析に特化したリボソームプロファイリングの立ち上げに国内で初めて成功し、バイオマーカー開発への応用を開始した。

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2011-04-01 - 2015-03-31

【配分額】49,010千円 (直接経費: 37,700千円、間接経費: 11,310千円)

【研究分野】腫瘍診断学

【研究領域課題番号】23240129 (KAKENデータベースで見る）

【研究キーワード】

胃癌 / 大腸癌 / 肝癌 / エピゲノム / ＤＮＡメチル化 / バイオマーカー / がん / マイクロＲＮＡ / 癌 / ゲノム / トランスレーショナルリサーチ / マイクロアレイ / 臨床 / マクロアレイ

【研究成果の概要】

大腸癌細胞のエピゲノムおよびトランスクリプトームを解析することで、エピジェネティックに不活化されたマイクロRNA遺伝子を同定した。大腸前癌病変および早期癌のエピゲノム・ゲノム解析を行うことで、早期発見マーカー候補となりうるDNAメチル化異常を同定した。さらに大腸癌前癌病変における内視鏡所見、病理所見、DNAメチル化異常の間の新たな相関を明らかにした。また胃癌背景胃粘膜におけるエピゲノム解析から、胃癌リスクマーカー候補となるDNAメチル化異常を同定した。原発性肝癌におけるエピゲノム異常解析から、新たな癌特異的DNAメチル化異常を複数同定した。

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2011-04-01 - 2014-03-31

【配分額】49,400千円 (直接経費: 38,000千円、間接経費: 11,400千円)

【研究分野】食品科学

【研究領域課題番号】21658049 (KAKENデータベースで見る）

【研究キーワード】

マイクロRNA / 栄養 / 絶食 / 低タンパク質食 / DNAマイクロアレイ / 非コードRNA / 選択的スプライシング / マイクロアレイ / 遺伝子発現

【研究成果の概要】

6週齢Wistar系雄ラットを3日間予備飼育後、対照群、絶食群、5%タンパク質食群(各n=6)の3群にわけて14日間飼育した。対照群ラットの食餌はAIN93G、絶食群はAIN93Gで13日間飼育した後に24時間絶食、5%タンパク質食群は5%カゼイン食で14日間飼育した。肝臓より取得したRNAをプールし、GeneChip miRNA Arrays (Affymetrix)にてmiRNAの存在量を解析した。ターゲットの検索にはTarget ScanおよびmicroRNA.orgを用いた。絶食で発現上昇したmRNAとして、rno-miR-151, rno-let-7e, rno-let-7f, rno-miR-103, rno-miR-107, rno-miR-126, rno-miR-143が、低タンパク質食で発現上昇したものとしてrno-miR-376b-3p発現低下したものとしてrno-miR-22が見出された。これらのうち、多くの脂質代謝や細胞外マトリクス関連遺伝子を標的とするlet7fとmiR-107についてリアルタイムPCRも行ったところ、再現性が確認できた。rno-miR-376b-3p発現低下したものとしてrno-miR-22が見出された。これらのうち、多くの脂質代謝や細胞外マトリクス関連遺伝子を標的とするlet7fとmiR-107についてリアルタイムPCRも行ったところ、何れも絶食で発現が増加しており、再現性が確認できた。

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2009 - 2010

【配分額】3,200千円 (直接経費: 3,200千円)

【研究分野】消化器内科学

【研究領域課題番号】21790694 (KAKENデータベースで見る）

【研究キーワード】

胆道学 / 膵臓学 / マイクロRNA / マイクロアレイ / スクリーニング / 膵がん

【研究成果の概要】

難治性固形癌の代表である膵癌の新規治療標的を探索することを目的とし、マイクロRNA発現ウイルスベクターライブラリーならびにDNAマイクロアレイを組み合わせたマイクロRNA機能スクリーニング系を構築した。これを用いて、膵癌細胞株の増殖を制御するマイクロRNAのスクリーニングを行い、とくに増殖を抑制するマイクロRNAを5種同定した。これらマイクロRNAならびにその標的は、膵癌の新規治療標的として有望であると考えられる。

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2009 - 2010

【配分額】4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)

【研究分野】循環器内科学

【研究領域課題番号】21790757 (KAKENデータベースで見る）

【研究キーワード】

ES細胞 / マイクロRNA(miRNA) / 血管内皮細胞 / 血管平滑筋細胞 / 血管前駆細胞 / iPS細胞 / EPC(内皮前駆細胞) / マイクロアレイ

【研究成果の概要】

骨髄由来血管前駆細胞の代替としての、ES細胞由来血管前駆細胞の血管再生細胞ソースとしての有用性に関し検討を行った。我々の方法で誘導されたES細胞由来血管平滑筋細胞はその分化が不充分であり、マイクロRNA(miRNA)-145導入により、より分化した平滑筋細胞となった。また、我々のES細胞由来血管平滑筋細胞は、継代初期は抗老化性を示すものの、比較的早期の継代で細胞老化を起こすことが明らかとなり、ES細胞を用いた血管再生療法の確立には、より至適な血管前駆細胞誘導法の樹立が必要と考えられた。

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2009 - 2010

【配分額】4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)