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に関するサイレントキーワード
次世代シーケンシング
が含まれる科研費採択研究1件
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次世代シーケンシング
が含まれる科研費採択研究 1件
水環境中の未知ウイルス発見のための選択的メタ
ゲノム
解析技術の開発
【研究分野】土木環境システム
【研究領域課題番号】
15H04065 (KAKENデータベースで見る)
【研究キーワード】
ウイルス / 下水 / メタ
ゲノム
解析 /
ゲノム
解析 / シーケンシング /
ゲノム
/ 遺伝子 /
次世代シーケンシング
/ 土木環境システム / ウィルス
【研究成果の概要】
本研究は効率的な新興病原ウイルスの発見に適した検出手法の開発を目標とした。下水中のウイルス
ゲノム
群から解析対象の
ゲノム
のみを選択的に回収し,
次世代シーケンシング
法によりその塩基配列を決定することで,下水中の存在量が低いウイルスであっても
ゲノム
解析を可能にする手法を開発した。また,下水中のウイルスを対象としたメタ
ゲノム
解析を行い,得たほとんどの配列がデータベースに近縁配列がないことを確認した。メタ
ゲノム
で得た塩基配列で得た塩基配列をもとに,未知のウイルスによると考えられるコンティグを作成し,その配列を持つウイルス
ゲノム
が国内下水に常在する可能性を示した。
【研究代表者】
真砂 佳史 国際連合大学サステイナビリティ高等研究所 サステイナビリティ高等研究所 リサーチフェロー
(Kakenデータベース)
【研究分担者】
原本 英司
山梨大学
大学院総合研究部
准教授
(Kakenデータベース)
久保田 健吾
東北大学
工学研究科
准教授
(Kakenデータベース)
大瀧 雅寛
お茶の水女子大学
基幹研究院
教授
(Kakenデータベース)
【研究連携者】
斉藤 繭子
東北大学
医学系研究科
准教授
(Kakenデータベース)
風間 しのぶ
お茶の水女子大学
シミュレーション科学・生命情報学教育研究センター
特任講師
(Kakenデータベース)
【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2015-04-01 - 2018-03-31
【配分額】18,200千円 (直接経費: 14,000千円、間接経費: 4,200千円)