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理化学研究所 研究シーズDiscovery Saga
研究キーワード:理化学研究所における「生体分子」 に関係する研究一覧:12
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情報学 情報学複合領域 複合領域環境学 環境学数物系科学 数物系科学化学 化学生物学 生物学総合理工 総合理工工学 工学総合生物 総合生物農学 農学医歯薬学 医歯薬学
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発表日:2025年11月20日
1
遺伝子スケールのクロマチンを設計し再構成する
-3次元DNA構造の構築原理に迫る、ゲノム物理の新基盤-
理化学研究所(理研)生命機能科学研究センター 生体非平衡物理学理研白眉研究チーム(研究当時)の深井 洋佑 研究員(研究当時、現 開拓研究所 川口生体非平衡物理学研究室 研究員)、川口 喬吾 理研白眉研究チームリーダー(研究当時、現 開拓研究所 川口生体非平衡物理学研究室 主任研究員、東京大学 大学院理学系研究科附属知の物理学研究センター 准教授)、エピジェネティクス制御研究チーム(研究当時)の若森 昌聡 技師(研究当時)、梅原 崇史 チームリーダー(研究当時、現 立命館大学 薬学部 教授)、東京大学 定量生命科学研究所 先端定量生命科学研究部門 クロマチン構造機能研究分野の鯨井 智也 講師、胡...
キーワード:コンパートメント/先端技術/非平衡/非平衡物理/非平衡物理学/輸送現象/一分子観察/遺伝情報/ACT/ヒストン/単一分子/ドメイン構造/3次元構造/カリウム/ダイナミクス/ナノメートル/ポリマー/原子間力顕微鏡/物理モデル/流体力/流体力学/Hi-C/ヌクレオソーム/遺伝子クラスター/カルス/ゲノム構造/タンパク質修飾/クロマチン構造/細胞運命/ゲノム情報/DNA修復/エピジェネティクス制御/クロマチン/遺伝子制御/染色体/免疫制御/ゆらぎ/エンハンサー/DNAメチル化/in vitro/アセチル化/がん細胞/ヒストン修飾/メチル化/ラット/蛍光色素/蛍光標識/構造変化/細胞核/自然免疫/生体分子/創薬/翻訳後修飾/立体構造/ゲノム/遺伝子/遺伝子発現/網羅的解析
他の関係分野:情報学複合領域数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年11月12日 この記事は2025年11月26日号以降に掲載されます。
2
魚類に特有の卵巣特異的な糖鎖代謝機構を発見
この記事は2025年11月26日号以降に掲載されます。
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発表日:2025年10月26日
3
世代を超えてテロメアDNAを維持する新たな仕組み
-線虫テロメレースRNAによる「イントロン・ヒッチハイク」-
理化学研究所(理研)生命機能科学研究センター 配偶子形成研究チームの澁谷 大輝 チームディレクター、竹田 穣 基礎科学特別研究員、石田 森衛 研究員、梶川 絵理子 テクニカルスタッフⅠ、発生ゲノムシステム研究チームの近藤 武史 チームディレクター、生命医科学研究センター 高機能生体分子開発チームの田上 俊輔 チームディレクター、東京大学 定量生命科学研究所の齊藤 博英 教授、早稲田大学 理工学術院の浜田 道昭 教授らの国際共同研究グループは、線...
キーワード:ゲノムDNA/タンパク質合成/モータータンパク質/生殖系列/snRNA/遺伝情報/塩基配列/個体群/生殖/生存戦略/前駆体/電気泳動/モーター/核小体/遺伝子改変/生体内/トランスポゾン/イントロン/カルス/マッピング/哺乳類/ゲノム配列/リン酸/変異体/ゲノム編集技術/ミオシン/酵素活性/昆虫類/配偶子形成/生殖細胞/プロモーター/アデノシン/ヒトゲノム/酵素反応/染色体/mRNA/テロメア/筋肉/寿命/がん化/ゲノム編集/細胞系譜/ATP/RNA/RNA分解/がん細胞/ショウジョウバエ/スクリーニング/スプライシング/マウス/モデル動物/幹細胞/細胞分裂/神経細胞/生体分子/長鎖非コードRNA/転写制御/発現制御/非コードRNA/ゲノム/遺伝子
他の関係分野:化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年9月14日
4
補酵素骨格を転移する生合成酵素の触媒機構を解明
-酵素を使った抗生物質のカスタム化へつながる一歩-
理化学研究所(理研)環境資源科学研究センター ケミカルバイオロジー・生合成研究チームの淡川 孝義 チームディレクター、全 智揚 研究員らの共同研究グループは、抗生物質の生合成においてメチル化に関わる補酵素[1]のS-アデノシルメチオニン(SAM)[2]の代謝に関係する新規酵素の触媒機構の解明に成功しました。本研...
キーワード:水分子/分子動力学シミュレーション/X線回折/二量体/アンモニア/求核置換反応/触媒反応/天然物合成/反応機構/RNA修飾/アミン/触媒機能/遷移状態/活性化エネルギー/シミュレーション/酸化物/動力学/分解能/分子動力学/量子力学/酵素工学/天然物化学/物質生産/生物物理学/X線結晶構造/システイン/部位特異的変異/biosynthesis/結晶構造/変異体/細胞壁/病原性/生合成/生合成遺伝子/生合成酵素/微生物/アミノ酸配列/プロトン/ビタミン/アルギニン/エピジェネティクス制御/酵素反応/ポリアミン/生物物理/ATP/RNA/アミノ酸/グルタミン酸/ケミカルバイオロジー/ヘリックス/メチル化/ラジカル/ラット/リガンド/化合物ライブラリー/官能基/抗菌薬/抗生物質/構造変化/合成生物学/生体分子/阻害剤/創薬/低分子化合物/誘導体/立体構造/ゲノム/遺伝子/細菌/疼痛
他の関係分野:数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年9月11日
5
あらゆる新型コロナ感染を阻止できる抗体を開発
-ヒトTMPRSS2抗体の新たな感染阻害薬への進展に期待-
理化学研究所(理研)生命医科学研究センター 創薬抗体基盤ユニット(研究当時)の齊藤 隆 ユニットリーダー(研究当時、現 免疫器官形成研究チーム 客員主管研究員)、原田 通成 研究員(研究当時、現 創薬タンパク質解析基盤ユニット 技師)、創薬タンパク質解析基盤ユニットの松本 武久 研究員、東京大学 医科学研究所の井上 純一郎 特任研究員(研究当時、現 同大学新世代感染症センター 特任教授)、滋賀医科大学 病理学講座の伊藤 靖 教授らの共同研究グループは、...
キーワード:デルタ/生細胞/クローン/遺伝情報/器官形成/霊長類/マイクロ/電子顕微鏡/生体内/カルス/微生物学/セリンプロテアーゼ/リン酸/変異株/消化管/スギ/酵素活性/微生物/アミノ酸配列/クライオ電子顕微鏡/病原体/SARS-CoV-2/エピトープ/オミックス/ノックイン/ノックインマウス/細胞膜/iPS細胞/ウイルス感染症/カニクイザル/細胞株/動物モデル/病理/病理学/臨床応用/mRNA/パンデミック/心臓/新型コロナウイルス/オルガノイド/モノクローナル抗体/骨髄/点変異/B細胞/in vitro/PCR/RNA/アミノ酸/アンジオテンシン/がん細胞/タンパク質分解/プロテアーゼ/マウス/ラット/幹細胞/抗原/抗体医薬/構造生物学/再生医療/受容体/上皮細胞/腎臓/生体分子/阻害剤/創薬/低分子化合物/ウイルス/ワクチン/遺伝子/感染症/血圧/抗体/新型コロナウイルス感染症/新型コロナウイルス感染症/創傷治癒
他の関係分野:複合領域化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年9月2日
6
バイオマーカーの1分子デジタルSERS計数法を開発
-認知症検査などリキッドバイオプシーの多項目高感度化に道筋-
理化学研究所(理研)開拓研究所 渡邉分子生理学研究室の安藤 潤 研究員、渡邉 力也 主任研究員、東京都健康長寿医療センターの栗原 正典 脳神経内科医員、齊藤 祐子 研究部長、豊田 雅士 研究副部長らの共同研究チームは、表面増強ラマン散乱(SERS)光[1]を利用し、脳脊髄液などの液性検体に含まれる複数種のバイオマーカー酵素を1分子レベルで高感度に識別し、個数を定量可能な「1分子デジタルSERS計数法」の開発に成功し...
キーワード:ワークフロー/機械学習/空間分布/ラマン散乱/ラマンスペクトル/スペクトル/分子構造/エステル/ラマン/分子識別/加水分解/可視光/金属ナノ構造/銀ナノ粒子/水分解/デジタル化/計測技術/ナノメートル/ナノ構造/ナノ粒子/マイクロ/実証実験/性能評価/微粒子/表面増強ラマン散乱/一分子計測/神経活動/生体組織/同時測定/ラマン分光/ラマン分光法/炎症性疾患/血清/酵素反応/臨床応用/リキッドバイオプシー/健康診断/神経伝達物質/認知障害/臨床検査/アセチルコリン/マイクロチップ/凝集体/蛍光標識/血液/神経変性/神経変性疾患/生体分子/脳脊髄液/バイオマーカー/遺伝子/感染症/軽度認知障害/健康長寿/生理学/低侵襲/認知症
他の関係分野:情報学環境学数物系科学化学総合理工工学総合生物
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発表日:2025年8月30日
7
RNAを見分けてほどく、ヘリカーゼの分子機構
-タンパク質の柔軟な天然変性領域がRNA識別の鍵-
理化学研究所(理研)生命機能科学研究センター 生体分子動的構造研究チーム(研究当時)の嶋田 一夫 チームリーダー(研究当時、現生命医科学研究センター 生体分子動的構造研究チーム チームディレクター、バイオ産業情報化コンソーシアム(JBIC)特別顧問)、外山 侑樹 研究員(研究当時、現生命医科学研究センター 生体分子動的構造研究チーム 客員研究員、東京大学 大学院薬学系研究科 特任助教)、東京大学 大学院薬学系研究科 生命物理化学教室の竹内 恒 教授の共同研究チームは、...
キーワード:環境変化/言語発達/原子核/磁気共鳴/閉じ込め/内部構造/スペクトル/磁場/芳香族/ポリペプチド/構造形成/アミド/らせん構造/蛍光スペクトル/物理化学/X線結晶構造解析/塩基配列/結晶構造解析/アミン/選択性/構造モデル/ドメイン構造/カリウム/電子顕微鏡/電磁波/構造予測/配列解析/神経発達/生体内/X線結晶構造/結晶構造/変異体/生合成/クライオ電子顕微鏡/アルギニン/転写制御因子/翻訳制御/アデノシン/がん遺伝子/悪性黒色腫/悪性脳腫瘍/浸潤/染色体/mRNA/ポリアミン/分子機構/翻訳調節/がん化/ATP/RNA/アミノ酸/がん細胞/グルタミン酸/コンフォメーション/トリプトファン/ヌクレオシド/ヘリックス/メラノーマ/遺伝子発現制御/核磁気共鳴/蛍光標識/高次構造/細胞骨格/細胞増殖/生体分子/創薬/相互作用解析/転写因子/転写制御/動的構造/発現制御/発現調節/分子認識/立体構造/ストレス
他の関係分野:複合領域数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年8月20日
8
生体分子モーターの回転駆動機構を原子レベルで解明
-「歪み」と「押し出し」から成る駆動力-
理化学研究所(理研)開拓研究所 杉田理論分子科学研究室の杉田 有治 主任研究員(計算科学研究センター 粒子系生物物理研究チーム チームプリンシパル)、本橋 昌大 大学院生リサーチ・アソシエイトらの共同研究グループは、生体内でエネルギー変換を担う分子モーター[1]である「F1-ATPase」の回転機構について、計算機シミュレーションを用いて解析し、原子レベルの「歪(ひず)み」と「押し出し」によっ...
キーワード:データ駆動/スーパーコンピュータ/最適化/自由エネルギー/人工知能(AI)/計算量/分子動力学シミュレーション/計算機シミュレーション/分子構造/一分子観察/高分子/ATP合成/静電相互作用/材料科学/生体分子モーター/結合状態/加水分解/遷移状態/水分解/単一分子/TMD/シミュレーション/ナノスケール/ポリマー/マルチスケール/モーター/モデリング/結晶化/大規模計算/電子顕微鏡/電子顕微鏡法/動力学/分解能/分子シミュレーション/分子動力学/並列計算/生体内/エネルギー変換/好熱菌/リン酸/スギ/ATP合成酵素/MDシミュレーション/クライオ電子顕微鏡/分子モーター/高分解能/細胞膜/アデノシン/ナノマシン/生物物理/動態解析/分子機構/ナノテクノロジー/ATP/アミノ酸/ミトコンドリア/構造変化/高次構造/細胞骨格/生体高分子/生体分子/生体膜/分子動力学計算/立体構造/細菌/脂質
他の関係分野:情報学数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日:2025年8月9日
9
海洋細菌由来のテルペン合成酵素の機能を解明
-原子レベルでの酵素機能を理解し機能の改変を実現-
理化学研究所(理研)環境資源科学研究センター 天然物生合成研究ユニットの高橋 俊二 ユニットリーダー、藤山 敬介 訪問研究員(研究当時、現 植物化学遺伝学研究チーム 基礎科学特別研究員)、髙木 海 テクニカルスタッフⅠ、ニュー・ノック・クウィン・ヴォ 特別研究員(研究当時、現 植物ゲノム発現研究チーム 研究員)、森田 直子 テクニカルスタッフⅠ、分子構造解析ユニットの野川 俊彦 技師の研究チームは、ユニークなドメイン[1]構成を有する海洋細菌Aquimarina spongiae由来の...
キーワード:最適化/人工知能(AI)/先端技術/海洋/水分子/分子構造/二量体/触媒反応/X線結晶解析/結晶解析/X線結晶構造解析/ブラシノステロイド/結晶構造解析/分子進化/触媒作用/持続可能/持続可能な開発/環境負荷/結晶化/構造最適化/生体内/X線結晶構造/カルス/部位特異的変異/テルペン/リン酸/海洋細菌/結晶構造/変異体/技術革新/ホスファターゼ/二次代謝/生合成/生合成遺伝子/生合成酵素/炭化水素/二次代謝産物/微生物/アミノ酸配列/酵素反応/代謝産物/発展途上国/脱リン酸化/アミノ酸/ステロイド/テルペノイド/ラット/環化反応/抗炎症/抗炎症作用/生体分子/生理活性/創薬/天然化合物/天然有機化合物/立体構造/ウイルス/ゲノム/遺伝学/遺伝子/抗がん剤/細菌/真菌
他の関係分野:情報学複合領域環境学数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年7月31日
10
神経回路の形成に重要なmRNAのメチル化
-細胞体でのメチル化が成長円錐での翻訳を制御-
理化学研究所(理研)生命機能科学研究センター 脳エピトランスクリプトミクス研究チーム(研究当時)の王 丹 チームリーダー(研究当時)、ロイック・ブロワ JSPS外国人特別研究員(研究当時)、ロヒニ・ロイ テクニカルスタッフⅡ(研究当時)らの国際共同研究グループは、RNA結合タンパク質[1]の一種、APC[2]の...
キーワード:RNA修飾/タンパク質合成/ナノメートル/マイクロ/統合システム/シナプス/神経回路形成/成長円錐/大脳/イントロン/カルス/変異体/アミノ酸配列/環境要因/統合失調症/脳神経科学/APC/アデノシン/mRNA/軸索輸送/胎児/大腸/微小管/解剖学/RNA/RNA結合タンパク質/アクチン/アミノ酸/シナプス形成/チューブリン/トランスクリプトミクス/ヌクレオシド/マウス/メチル化/構造変化/細胞骨格/樹状突起/神経科学/神経回路/神経細胞/生体分子/発現制御/コミュニケーション/遺伝子/遺伝子発現/遺伝子変異/海馬/自閉スペクトラム症/精神疾患
他の関係分野:生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年7月31日
11
テラヘルツ波が細胞膜の相転移を誘起
-非熱効果のメカニズム解明へ-
理化学研究所(理研)光量子工学研究センター テラヘルツイメージング研究チームの保科 宏道 上級研究員はテラヘルツ(THz、1THzは10の12乗ヘルツ)[1]照射が細胞膜の相転移[2]を誘起する現象を発見しました。本研究成果は、今後のTHz周波数利用の安全性評価や、THz波のバイオ・医薬応用に貢献すると期待されます。保科上級研究員は、THz波の生体影響のメカニズムを解明するため、THz...
キーワード:無線通信/ミリ波/外れ値/テラヘルツ光/水分子/高周波/相転移/テラヘルツ/衝撃波/分子ダイナミクス/液晶/生細胞/テラヘルツ波/光照射/紫外線/アモルファス/ダイナミクス/ナノメートル/マイクロ/マイクロ波/レーザー/安全性評価/拡散係数/周波数/相変化/電磁波/半導体/細胞膜/脂質二重膜/Hela細胞/がん細胞/リン脂質/蛍光顕微鏡/蛍光色素/細胞分裂/生体分子/脂質
他の関係分野:情報学数物系科学化学工学
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発表日:2025年7月31日
12
人工イオンチャネルの精密デザインに成功
-膜ペプチドの集まる数を自在に制御して新機能の創出へ-
理化学研究所(理研)生命機能科学研究センター 生体分子動態デザイン研究チームの新津 藍 チームリーダー、開拓研究本部 杉田理論分子科学研究室の杉田 有治 主任研究員、ジョン・ジェウン 専任技師、環境資源科学研究センター 触媒・融合研究グループの袖岡 幹子 グループディレクター、ブリストル大学のデレック・ウルフソン 教授、キングス・カレッジ・ロンドンのマーク・ワレス 教授らの国際共同研究グループは、自然界にはないタンパク質を理論的に設計する独自の手法を用いて、...
キーワード:スーパーコンピュータ/機械学習/人工知能(AI)/システム開発/水分子/水溶液/分子動力学シミュレーション/閉じ込め/バクテリア/α-ヘリックス/自己組織/アルキル化/一分子観察/自己集合/タンパク質合成/ロイシン/細胞内小器官/膜輸送/遺伝情報/抗菌ペプチド/膜輸送体/タンパク質デザイン/メモリ/絶縁体/選択性/構造モデル/動的挙動/二次構造/電気抵抗/HPC/シミュレーション/ナノメートル/モデリング/界面活性剤/生産システム/設計法/動力学/導電性/分子動力学/タンパク質合成系/親水性/人工タンパク質/物質生産/人工細胞/超並列/分子システム/カルシウムイオン/システイン/ペプチド合成/輸送体/二重構造/スギ/Ca2+/アミノ酸配列/全反射蛍光顕微鏡/細胞膜/脂質二重膜/抗菌性/アミノ酸/イオンチャネル/カルシウム/ヘリックス/リン脂質/一分子イメージング/蛍光顕微鏡/蛍光色素/蛍光標識/抗生物質/構造変化/受容体/神経細胞/生体分子/生体膜/分子イメージング/分子動力学計算
他の関係分野:情報学複合領域数物系科学化学生物学工学総合生物農学