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研究キーワード：理化学研究所における「微生物」 に関係する研究一覧：24件
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発表日：2025年10月15日
1
遺伝子と腸内細菌の相互作用を日本の研究で確認
－統計的厳密性と手法標準化の重要性を強調－
理化学研究所（理研）生命医科学研究センター ゲノム解析応用研究チームの寺尾 知可史 チームディレクター、デイビッド・オルテガ＝レイエス 大学院生リサーチ・アソシエイト（研究当時、現 粘膜システム研究チーム 特別研究員）、粘膜システム研究チームの大野 博司 チームディレクターらの共同研究グループは、欧州でしか研究されてこなかったヒト遺伝子が腸内細菌叢（さいきんそう）[1]の構成に与える影響について、東京大学医学部附属...
キーワード：統計モデル/ロジスティック回帰/回帰分析/プロトコル/免疫機能/遺伝と環境/微生物群集/ゲノムDNA/ゲノミクス/コドン/生物群集/マイクロ/統計解析/ビフィズス菌/変異体/嗅覚受容体/遺伝的変異/共生微生物/炭水化物/抵抗性/微生物/アミノ酸配列/免疫系/ゲノムワイド/環境要因/強皮症/微生物叢/ヒトゲノム/病理/予後因子/アルコール/ゲノムワイド関連解析/ゲノム解析/メタゲノム/寿命/エンハンサー/統計的手法/病態解明/B細胞/アミノ酸/インスリン/ラット/炎症性サイトカイン/血液/細胞分化/受容体/転写因子/内分泌/白血病/発現制御/免疫細胞/2型糖尿病/GWAS/インスリン抵抗性/ゲノム/サイトカイン/マイクロバイオーム/リスク因子/遺伝子/遺伝子変異/健康寿命/細菌/細菌叢/精神疾患/腸内細菌/腸内細菌叢/糖尿病/標準化/予防医学
他の関係分野：情報学複合領域環境学化学生物学工学農学
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発表日：2025年10月13日
2
細胞増殖法則を80年、180年越しに統一する原理を解明
－複数栄養源の量が変化しても適用可能な代謝理論を構築－
理化学研究所（理研）生命機能科学研究センター 多階層生命動態研究チームの山岸 純平 基礎科学特別研究員と東京科学大学（Science Tokyo）未来社会創成研究院 地球生命研究所（ELSI）の畠山 哲央 特任准教授の共同研究チームは、細胞増殖についてこれまで経験的に知られていた古典的法則の背後にある統一原理を解明しました。これは細胞の増殖・成長が代謝におけるさまざまな資源のやりくりによって制約されるという原理で、一般法則として「大域的制約原理」と名付けました。本研究成果は、生命科学における基礎理論として細胞増殖のメカニズムへのより深い理解をもたらすだけでなく、発酵産業やバイオ燃料生...
キーワード：最適化/化学物質/海洋/微生物群集/統計力学/普遍性/数値計算/グルコース/遺伝情報/生物群集/生産性/モデル生物/発酵/代謝工学/病原菌/資源配分/土壌/バイオ燃料/生態学/微生物/ゲノム情報/ELSI/大腸/がん細胞/システム生物学/バイオテクノロジー/細胞増殖/代謝酵素/大腸菌/ゲノム/細菌/腸内細菌
他の関係分野：情報学環境学数物系科学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年10月2日
3
細菌がつくるナノサイズの遺伝子カプセルが進化を促す
－疾患診断におけるバイオマーカーとしての展開に期待－
理化学研究所（理研）バイオリソース研究センター 統合情報開発室の高野 壮太朗 開発研究員らの共同研究グループは、細菌がつくり出すナノサイズの粒子（細菌膜小胞[1]）に含まれる遺伝子配列を網羅的に解析する技術を開発し、細菌膜小胞がヒトやウイルスとの相互作用に重要な遺伝子を特に多く含んでいること、それらが細菌同士で遺伝子をやり取りする仕組み（遺伝子水平伝...
キーワード：スループット/データ駆動/類似度/ドロップレット/フィルム/高分子/遺伝情報/塩基配列/系統樹/比較ゲノム解析/微小液滴/ACT/ベシクル/固体表面/物質輸送/ナノサイズ/ナノメートル/マイクロ/自動化/ハイスループット/遺伝子クラスター/CRISPR-Cas/マッピング/biosynthesis/ゲノム配列/病原菌/環境ストレス/ゲノム編集技術/感染防御/生態系/環境応答/形質転換/病原性/比較ゲノム/微生物/免疫系/獲得免疫/細胞膜/CRISPR/レドックス/遺伝子解析/染色体/ゲノム解析/ゲノム編集/歯周病/CRISPR-Cas9/PCR/ファージ/リポ多糖/抗生物質/細胞死/創薬/代謝物/ウイルス/ゲノム/ストレス/バイオフィルム/バイオマーカー/マイクロバイオーム/ワクチン/遺伝子/公衆衛生/細菌/細菌叢/腸内細菌/腸内細菌叢
他の関係分野：情報学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年9月30日
4
脂質結合糖鎖の新規分解機構を解明
－アスパラギン結合型糖鎖代謝制御の全容解明に向けた一歩－
理化学研究所（理研）開拓研究所 鈴木糖鎖代謝生化学研究室のシェンタオ・リ研究員、鈴木 匡 主任研究員、岩崎RNAシステム生化学研究室の岩崎 信太郎 主任研究員、環境資源科学研究センター 生物分子解析ユニットの堂前 直 ユニットリーダー、東京大学 大学院農学生命科学研究科 応用生命工学専攻の野田 陽一 特任准教授（同大学 微生物科学イノベーション連携研究機構 酵母発酵学社会連携研究部門（CRIIM）特任准教授）、トロント大学 ドネリーセンターのチャールズ・ブーン教授らの国際共同研究グループは、...
キーワード：品質管理/バクテリア/オリゴ糖/ゴルジ体/塩基配列/出芽酵母/加水分解/前駆体/水分解/遺伝子クラスター/Saccharomyces cerevisiae/イントロン/カルス/遺伝子破壊/古細菌/発酵/リン酸/タンパク質修飾/ゲノム編集技術/フォスファターゼ/哺乳動物/酵素活性/細胞壁/生合成/微生物/分裂酵母/ノックイン/糖鎖修飾/CRISPR/ホメオスタシス/受精/受精卵/糖転移酵素/大腸/分子機構/ゲノム編集/HPLC/RNA/アミノ酸/リガンド/リソソーム/抗生物質/細胞内局在/小胞体/神経変性/神経変性疾患/大腸菌/糖タンパク質/ゲノム/ストレス/遺伝子/細菌/脂質
他の関係分野：複合領域数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年9月24日
5
根本的な治療法のないシェーグレン病、自己抗体の違いで病態が異なることを解明
－患者さんごとの個別化医療（プレシジョン・メディシン）実現に道－
慶應義塾大学 医学部 内科学教室（リウマチ・膠原病）の稲毛 純 助教（現：微生物・免疫学教室 助教）、竹下 勝 専任講師、金子 祐子 准教授（現：教授）、竹内 勤 教授（現：埼玉医科大学 学長）らは、慶應義塾大学 医学部主体の産学連携共同研究組織である免疫炎症性難病創薬コンソーシアムおよび理化学研究所 生命医科学研究センター（IMS）遺伝子制御ゲノミクス研究チームのホン・ヂョン チョウ チームディレクターとの共同研究において、自己免疫疾患であるシェーグレン病において、患者さんが持つ自己抗体の種類によって唾液腺での免疫反応や炎症のメカニズムが異なることを、1細胞レベルの解析で明らかにしました。...
キーワード：産学連携/ゲノミクス/一細胞/さんご/微生物/膠原病/遺伝子制御/自己抗体/リウマチ/自己免疫/自己免疫疾患/創薬/免疫学/遺伝子/疫学/個別化医療/抗体/唾液/難病
他の関係分野：複合領域生物学総合生物農学
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発表日：2025年9月14日
6
補酵素骨格を転移する生合成酵素の触媒機構を解明
－酵素を使った抗生物質のカスタム化へつながる一歩－
理化学研究所（理研）環境資源科学研究センター ケミカルバイオロジー・生合成研究チームの淡川 孝義 チームディレクター、全 智揚 研究員らの共同研究グループは、抗生物質の生合成においてメチル化に関わる補酵素[1]のS-アデノシルメチオニン（SAM）[2]の代謝に関係する新規酵素の触媒機構の解明に成功しました。本研...
キーワード：水分子/分子動力学シミュレーション/X線回折/二量体/アンモニア/求核置換反応/触媒反応/天然物合成/反応機構/RNA修飾/アミン/触媒機能/遷移状態/活性化エネルギー/シミュレーション/酸化物/動力学/分解能/分子動力学/量子力学/酵素工学/天然物化学/物質生産/生物物理学/X線結晶構造/システイン/部位特異的変異/biosynthesis/結晶構造/変異体/細胞壁/病原性/生合成/生合成遺伝子/生合成酵素/微生物/アミノ酸配列/プロトン/ビタミン/アルギニン/エピジェネティクス制御/酵素反応/ポリアミン/生物物理/ATP/RNA/アミノ酸/グルタミン酸/ケミカルバイオロジー/ヘリックス/メチル化/ラジカル/ラット/リガンド/化合物ライブラリー/官能基/抗菌薬/抗生物質/構造変化/合成生物学/生体分子/阻害剤/創薬/低分子化合物/誘導体/立体構造/ゲノム/遺伝子/細菌/疼痛
他の関係分野：数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年9月11日
7
あらゆる新型コロナ感染を阻止できる抗体を開発
－ヒトTMPRSS2抗体の新たな感染阻害薬への進展に期待－
理化学研究所（理研）生命医科学研究センター 創薬抗体基盤ユニット（研究当時）の齊藤 隆 ユニットリーダー（研究当時、現 免疫器官形成研究チーム 客員主管研究員）、原田 通成 研究員（研究当時、現 創薬タンパク質解析基盤ユニット 技師）、創薬タンパク質解析基盤ユニットの松本 武久 研究員、東京大学 医科学研究所の井上 純一郎 特任研究員（研究当時、現 同大学新世代感染症センター 特任教授）、滋賀医科大学 病理学講座の伊藤 靖 教授らの共同研究グループは、...
キーワード：デルタ/生細胞/クローン/遺伝情報/器官形成/霊長類/マイクロ/電子顕微鏡/生体内/カルス/微生物学/セリンプロテアーゼ/リン酸/変異株/消化管/スギ/酵素活性/微生物/アミノ酸配列/クライオ電子顕微鏡/病原体/SARS-CoV-2/エピトープ/オミックス/ノックイン/ノックインマウス/細胞膜/iPS細胞/ウイルス感染症/カニクイザル/細胞株/動物モデル/病理/病理学/臨床応用/mRNA/パンデミック/心臓/新型コロナウイルス/オルガノイド/モノクローナル抗体/骨髄/点変異/B細胞/in vitro/PCR/RNA/アミノ酸/アンジオテンシン/がん細胞/タンパク質分解/プロテアーゼ/マウス/ラット/幹細胞/抗原/抗体医薬/構造生物学/再生医療/受容体/上皮細胞/腎臓/生体分子/阻害剤/創薬/低分子化合物/ウイルス/ワクチン/遺伝子/感染症/血圧/抗体/新型コロナウイルス感染症/新型コロナウイルス感染症/創傷治癒
他の関係分野：複合領域化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年9月7日
8
病原体を見分ける植物のセンサーをデザイン
－免疫受容体を人工設計し新たな病原体の認識を可能に－
理化学研究所（理研）環境資源科学研究センター 植物免疫研究グループの白須 賢 グループディレクター（環境資源科学研究センター 副センター長）、ブルーノ・ポクマン・ゴウ 基礎科学特別研究員、門田 康弘 専任研究員らの国際共同研究グループは、植物が病原体からの"危険サイン"を検知するセンサーの役割を持つ免疫受容体[1]をさまざまな種から網羅的に探索する方法を開発しました。さらに、この手法を用いて、多様な細菌を認識する新...
キーワード：パターン認識/プログラミング/最適化/情報学/人工知能（AI）/レジリエンス/環境変動/バクテリア/分子構造/アブラナ科/タンパク質合成/ロイシン/翻訳開始/ブラシノステロイド/共進化/生命情報/質量分析/持続可能/持続可能な開発/センサー/マイクロ/二酸化炭素/EF-Tu/候補遺伝子/インフォマティクス/構造予測/アポプラスト/酸化酵素/部位特異的変異/哺乳類/アブラナ科植物/リン酸/植物ホルモン/植物免疫/病害抵抗性/シロイヌナズナ/トマト/糸状菌/イネ/キメラ/ゲノム編集技術/形質転換/酵素活性/細胞壁/多糖類/抵抗性/土壌/キチン/耐病性/微生物/アミノ酸配列/ロイシンリッチリピート/病原体/免疫系/オミックス/ゲノム情報/タバコ/機能解析/細胞膜/翻訳制御/酵素反応/ショック/ホルモン/発展途上国/分子機構/ゲノム編集/脱リン酸化/アミノ酸/キナーゼ/グルタミン酸/クローニング/クロマトグラフィー/シグナル伝達機構/スクリーニング/ステロイド
他の関係分野：情報学複合領域環境学数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年8月27日
9
環境保全型養殖への魚体画像診断イノベーション
－抗病性に貢献する好熱菌発酵飼料の機能性を評価－
理化学研究所（理研）環境資源科学研究センター 環境代謝分析研究チームの菊地 淳 チームディレクター、生命医科学研究センター 粘膜システム研究チームの大野 博司 チームディレクター、宮本 浩邦 客員主管研究員、バイオリソース研究センター 統合情報開発室の鈴木 健大 研究員、北里大学 医療衛生学部 血液学研究室の佐藤 隆司 講師らの共同研究グループは、医工学分野で活用される画像診断のための計算手法を応用し、魚体の画像を用いて非侵襲的に健康状態を評価する技術を開発しました。本開発技術の検証では、マダイの感染症発症と...
キーワード：ランダムフォレスト/画像データ/画像情報/ブースティング/学習アルゴリズム/AI/アルゴリズム/フレームワーク/機械学習/品質管理/一酸化二窒素/窒素循環/定量的評価/温室効果ガス/化学物質/海洋/普遍性/エントロピー/ノイズ/温室効果/惑星/植物相/生体触媒/定量評価/バイオリアクター/生物工学/持続可能/社会貢献/持続可能な開発/評価手法/カーボン/AMR/テクスチャ/メタン/リサイクル/環境負荷/自動化/生産性/医工学/園芸学/機能性/好熱菌/発酵/病原菌/共生細菌/環境保全/技術革新/ウシ/生態系/バイオマス/土壌/土壌微生物/病原性/生物多様性/微生物/病原体/細胞膜/微生物叢/HSV/生体防御/白血球/発展途上国/画像診断/血液/抗菌薬/迅速診断/スマートフォン/感染症/細菌/細菌叢/真菌/非侵襲/薬剤耐性
他の関係分野：情報学複合領域環境学数物系科学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年8月26日
10
光合成が強光ストレスに応答して膜脂質転換を行う機構を解明
－光合成生物の膜脂質改変技術の開発へ－
光合成生物は、環境ストレスに応答することで、光合成活性を最適化しています。光合成の場であるチラコイド膜においては、強光や低CO2などの環境変化に応じて膜脂質組成が変化することで光合成活性が制御されていると考えられますが、その分子機構については不明です。本研究では、光合成微生物であるシアノバクテリアを用いて、糖脂質の前駆体であるジアシルグリセロール（DAG）をリン脂質の前駆体であるホスファチジン酸（PA）へ変換するDAGキナーゼ（DGK）の変異株を作出し、強光ストレス応答における膜脂質転換の役割について解明しました。dgkA変異株では、強光ストレス下におけるホスファチジルグ...
キーワード：最適化/環境変化/バクテリア/二量体/光化学/シアノバクテリア/チラコイド膜/光化学系I/光化学系II/光合成/前駆体/二酸化炭素/環境ストレス/変異株/微生物/ジアシルグリセロール/糖脂質/膜脂質/分子機構/キナーゼ/ストレス応答/リン脂質/ストレス/脂質
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学化学生物学工学農学
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発表日：2025年8月9日
11
海洋細菌由来のテルペン合成酵素の機能を解明
－原子レベルでの酵素機能を理解し機能の改変を実現－
理化学研究所（理研）環境資源科学研究センター 天然物生合成研究ユニットの高橋 俊二 ユニットリーダー、藤山 敬介 訪問研究員（研究当時、現 植物化学遺伝学研究チーム 基礎科学特別研究員）、髙木 海 テクニカルスタッフⅠ、ニュー・ノック・クウィン・ヴォ 特別研究員（研究当時、現 植物ゲノム発現研究チーム 研究員）、森田 直子 テクニカルスタッフⅠ、分子構造解析ユニットの野川 俊彦 技師の研究チームは、ユニークなドメイン[1]構成を有する海洋細菌Aquimarina spongiae由来の...
キーワード：最適化/人工知能（AI）/先端技術/海洋/水分子/分子構造/二量体/触媒反応/X線結晶解析/結晶解析/X線結晶構造解析/ブラシノステロイド/結晶構造解析/分子進化/触媒作用/持続可能/持続可能な開発/環境負荷/結晶化/構造最適化/生体内/X線結晶構造/カルス/部位特異的変異/テルペン/リン酸/海洋細菌/結晶構造/変異体/技術革新/ホスファターゼ/二次代謝/生合成/生合成遺伝子/生合成酵素/炭化水素/二次代謝産物/微生物/アミノ酸配列/酵素反応/代謝産物/発展途上国/脱リン酸化/アミノ酸/ステロイド/テルペノイド/ラット/環化反応/抗炎症/抗炎症作用/生体分子/生理活性/創薬/天然化合物/天然有機化合物/立体構造/ウイルス/ゲノム/遺伝学/遺伝子/抗がん剤/細菌/真菌
他の関係分野：情報学複合領域環境学数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年8月2日
12
植物は“危険サイン”により寄生線虫を察知する
－糸状菌や昆虫も同じ仕組みで認識している可能性－
理化学研究所（理研）環境資源科学研究センター 植物免疫研究グループの白須 賢 グループディレクター（環境資源科学研究センター 副センター長）、門田 康弘 専任研究員、飯野 絵里香 研修生（研究当時）、農業・食品産業技術総合研究機構（農研機構）植物防疫研究部門 基盤防除技術研究領域の植原 健人 研究領域長らの国際共同研究グループは、植物が植物寄生線虫[1]のような動物型の病原体を分子レベルで認識する仕組みを初めて明ら...
キーワード：パターン認識/プログラミング/レジリエンス/環境変動/微生物群集/分子構造/アブラナ科/アブラムシ/グルコース/ゲノミクス/個体群/生物群集/転写後制御/ACT/加水分解/水分解/持続可能/持続可能な開発/センサー/マイクロ/EF-Tu/アポプラスト/カルス/酸化酵素/トレハロース/リン酸/植物免疫/病原菌/変異体/シロイヌナズナ/糸状菌/食品産業/農地/イネ/ストレス耐性/形質転換/細胞壁/多糖類/抵抗性/土壌/比較研究/病原性/キチン/遺伝的多様性/生合成/生合成遺伝子/微生物/プロファイリング/病原体/免疫系/オミックス/機能解析/細胞膜/遺伝子解析/発展途上国/分子機構/アミノ酸/キナーゼ/リガンド/リプログラミング/リン酸化酵素/レクチン/自然免疫/受容体/免疫応答/ゲノム/ストレス/遺伝学/遺伝子/細菌/真菌/網羅的解析
他の関係分野：情報学複合領域環境学化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年8月2日
13
日本人集団初の免疫細胞シングルセルアトラスの創生
－多層オミクス情報をシングルセル空間へ投影するフレームワークを開発－
大阪大学 大学院医学系研究科の枝廣 龍哉 助教（遺伝統計学/呼吸器・免疫内科学/理化学研究所 生命医科学研究センター システム遺伝学チーム 客員研究員）、佐藤 豪さん（当時：博士課程、現在：東京大学 大学院医学系研究科 遺伝情報学 助教/理化学研究所 生命医科学研究センター システム遺伝学チーム 客員研究員）、熊ノ郷 淳 教授（呼吸器・免疫内科学）、岡田 随象 教授（遺伝統計学/東京大学 大学院医学系研究科 遺伝情報学 教授/理化学研究所 生命医科学研究センター システム遺伝学チーム チームディレクター）らの研究グループは、日本人集団235名（新型コロナウイルス感染症：COVID-19患者88...
キーワード：フレームワーク/情報学/遺伝情報/生殖/微生物/シークエンス/遺伝統計学/生殖細胞/微生物叢/ウイルス感染症/オミクス/ヒトゲノム/体細胞変異/新型コロナウイルス/トランスクリプトーム/免疫細胞/ウイルス/ゲノム/遺伝学/感染症/新型コロナウイルス感染症/新型コロナウイルス感染症
他の関係分野：情報学生物学農学
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発表日：2025年7月31日
14
腸内細菌は樹状細胞を介して腸から離れたがんの免疫環境に影響する免疫チェックポイント阻害薬の作用に関与する新たな腸内細菌を同定
国立研究開発法人国立がん研究センター（東京都中央区、理事長：間野 博行）研究所 腫瘍免疫研究分野を中心とする研究チームは、免疫チェックポイント阻害薬の治療効果を高める新たな腸内細菌としてルミノコッカス科に属するYB328株を同定し、その培養と作用メカニズムの解明に成功しました。YB328株が腸内で免疫応答の司令塔である樹状細胞を活性化し、その樹状細胞ががん組織まで移動することで免疫効果を発揮するとともに、腸内細菌叢の多様化を通じた樹状細胞のさらなる活性化により、免疫チェックポイント阻害薬の効果を高める可能性が示されました。さらに、YB328株はがん治療薬PD-1阻害薬が効いた患者さん...
キーワード：がん研究/システム制御/腸内フローラ/CD8/微生物/PD-1/がん免疫/がん免疫療法/臨床応用/ゲノム解析/腸内環境/免疫療法/T細胞/がん治療/腫瘍免疫/樹状細胞/免疫チェックポイント/免疫チェックポイント阻害薬/免疫応答/免疫学/免疫細胞/ゲノム/疫学/細菌/細菌叢/腸内細菌/腸内細菌叢
他の関係分野：複合領域工学総合生物農学
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発表日：2025年7月31日
15
マウスの母性養育行動を促進する神経機構
－眼窩前頭皮質による報酬系制御メカニズムの発見－
理化学研究所（理研）生命機能科学研究センター 比較コネクトミクス研究チームの田坂 元一 上級研究員、宮道 和成 チームディレクターの研究チームは、マウスにおける母性養育行動の学習[1]に重要な役割を果たす神経機構を明らかにしました。本研究成果は、哺乳類母子間の愛着形成を支える神経基盤の理解を通じて、母子のウェルビーイング（心身および社会的な幸福）向上に貢献するものです。未熟な新生仔（児）（しんせいし）[2...
キーワード：学習過程/多感覚統合/センサータンパク質/中心核/アニオン/蛍光センサー/オプシン/ファイバー/レンズ/光照射/センサー/マイクロ/屈折率/光センサー/光ファイバー/光プローブ/カルシウムイオン/一細胞/一細胞/神経活動/生体内/線条体/前頭皮質/大脳/大脳辺縁系/実験動物/哺乳類/価値評価/ミオシン/微生物/Ca2+/コネクトミクス/細胞内カルシウムイオン/視床/層構造/カルモジュリン/遺伝子工学/機能解析/視床下部/ミオシン軽鎖/蛍光タンパク質/内視鏡/ドーパミン/可塑性/神経伝達物質/生理機能/前頭前野/前頭葉/光遺伝学/カスパーゼ/カルシウム/キナーゼ/プローブ/マウス/リガンド/蛍光プローブ/細胞核/細胞死/細胞内カルシウム/受容体/神経科学/神経回路/神経細胞/大脳皮質/内分泌/うつ/遺伝学/遺伝子/子育て/妊娠/認知機能
他の関係分野：情報学環境学数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年7月31日
16
新規リベロマイシン誘導体の創出
－マラリア原虫に効果が期待される有用化合物の生産－
理化学研究所（理研）環境資源科学研究センター 天然物生合成研究ユニットの高橋 俊二 ユニットリーダー、ヤフェン・ヨン 国際プログラム・アソシエイト（研究当時）、ソン・リュウ 客員研究員（研究当時）、坂井 克行 研究員、藤山 敬介 訪問研究員（研究当時、現 植物化学遺伝学研究チーム 基礎科学特別研究員）、髙木 海 テクニカルスタッフⅠ、化合物リソース開発研究ユニットの二村 友史 上級研究員（研究当時、現 化合物リソース開発研究ユニット 客員研究員）、長田 裕之 ユニットリーダー（研究当時、現 化合物リソース開発研究ユニット 客員主管研究員）らの...
キーワード：質量分析装置/立体選択的/タンパク質合成/ヘムタンパク質/ロイシン/tRNA/X線結晶構造解析/シトクロム/結晶構造解析/電子伝達/質量分析/クロム/カルボン酸/共結晶/持続可能/持続可能な開発/反応速度/マイクロ/結晶化/動力学/反応動力学/分解能/構造変換/生物活性/ペルオキシダーゼ/遺伝子クラスター/生体内/X線結晶構造/カルス/遺伝子破壊/微生物代謝/部位特異的変異/biosynthesis/P450/Streptomyces/結晶構造/構造決定/生合成経路/変異体/タンパク質工学/糸状菌/ウシ/形質転換/土壌/二次代謝/放線菌/生合成/生合成遺伝子/生物生産/二次代謝産物/微生物/プロトン/増殖抑制/SPECT/細胞膜/転写制御因子/酵素反応/細胞株/細胞毒性/骨転移/代謝産物/大腸/発展途上国/分子標的/骨細胞/骨髄/歯周病/HPLC/RNA/アポトーシス/アミノ酸/クロマトグラフィー/ケミカルバイオロジー/シトクロムP450/ヘモグロビン
他の関係分野：数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年7月31日
17
「AI聖徳太子」が複数情報を聞き分け、開発方針を指示
－多様な要求物性の環境低負荷型プラスチック材開発に貢献－
理化学研究所（理研）環境資源科学研究センター 環境代謝分析研究チームの藤田 凌 研修生（研究当時）、天本 義史 客員研究員、菊地 淳 チームディレクターの研究チームは、人工知能（AI）を用いて環境低負荷型のプラスチックの材料設計サイクルを高速化する手法を開発しました。本研究成果は、単一の計測から複数情報を抽出することで、多様な物性を要求される環境低負荷型のプラスチック材料開発に貢献するものと期待されます。カーボンニュートラル、サーキュラーエコノミー、ネイチャーポジティブ[1]に向...
キーワード：統計モデル/相関係数/特徴抽出/AI/アルゴリズム/ニューラルネットワーク/機械学習/最適化/情報抽出/畳み込みニューラルネットワーク/信号処理/深層学習/人工知能（AI）/医療機器/完新世/沿岸生態系/温室効果ガス/環境分析/低炭素社会/パルス/原子核/磁気共鳴/複雑系/揺らぎ/ノイズ/ヘリウム/温室効果/気候変動/磁場/超伝導/惑星/構造形成/自己組織/分子ダイナミクス/高分子/ケミカルリサイクル/生分解/カーボンニュートラル/持続可能/低炭素/ボトルネック/紫外線/持続可能な開発/評価手法/材料設計/カーボン/シミュレーション/ダイナミクス/ニューラルネット/プラスチック/ポリマー/マルチスケール/メタン/リサイクル/永久磁石/結晶化/高分子材料/資源循環/自動車/二酸化炭素/二酸化炭素/散逸構造/インフォマティクス/生分解性/生態系/水利用/土地利用/土地利用変化/プランクトン/植物プランクトン/生物多様性/微生物/磁気共鳴画像/組織化/超分子
他の関係分野：情報学複合領域環境学数物系科学化学工学総合生物農学
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発表日：2025年7月31日
18
土壌菌により活性化されるとジャガイモの寄生虫を孵化させる鍵物質を発見
－植物・微生物・寄生虫の三者間の相互作用を明らかに－
神戸大学 大学院農学研究科の水谷 正治 教授、理化学研究所（理研）環境資源科学研究センター 代謝システム研究チームの秋山 遼太 基礎科学特別研究員、平井 優美 チームリーダーらと、農研機構北海道農業研究センターの串田 篤彦 博士、北海道大学 大学院理学研究院の谷野 圭持 教授らの研究グループは、ナス科植物が根から分泌する化合物「ソラノエクレピンC」を新たに発見しました。さらに、孵化促進活性を示さない不活性なソラノエクレピンCが土壌中の微生物によって変換されることで、ジャガイモシストセンチュウの孵化を誘導する「孵化促進物質」に変化することが明らかになりました。詳細は...
キーワード：食品産業/土壌/寄生虫/微生物
他の関係分野：農学
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発表日：2025年7月31日
19
海洋性の光合成細菌の窒素固定能力が炭素源の種類で変化
－持続可能な物質生産への貢献を期待－
理化学研究所（理研）環境資源科学研究センター バイオ高分子研究チームの沼田 圭司 チームディレクター（京都大学 大学院工学研究科 教授）、細胞生産研究チームの白井 智量 上級研究員、京都大学 大学院工学研究科の鈴木 美紀 特定研究員らの共同研究グループは、海洋性の紅色非硫黄光合成細菌[1]の窒素固定化効率や固定化された窒素の代謝経路が、環境中の炭素源の種類に応じて変化し、細胞増殖速度に影響することを明らかにしました...
キーワード：金属元素/光エネルギー/海洋/陽子/気候変動/中性子/同位体/遠赤外線/赤外線/太陽/高分子/生分解性プラスチック/窒素固定/オルガネラ/光合成/光合成細菌/電子伝達/太陽光/質量分析/アセチレン/生分解/前駆体/持続可能/持続可能な開発/カーボン/ナノメートル/プラスチック/リサイクル/海洋資源/環境負荷/資源循環/質量分析計/二酸化炭素/廃棄物/有機物/物質生産/生分解性/エチレン/リン酸/クエン酸/酵素活性/カロテノイド/漁業/微生物/ビタミン/ナトリウム/日常生活/発展途上国/アミノ酸/ラット/抗酸化/抗酸化作用/細胞増殖/細菌
他の関係分野：環境学数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年7月31日
20
微生物群と代謝物のデータを統合し分類する新解析法I-SVVSを開発
東京大学 大学院農学生命科学研究科の岩田 洋佳 教授らは、統合確率的変分変数選択（I-SVVS）という新しい手法を開発しました。これは、植物の根圏土壌や動物の腸内など、ホスト生物の近傍に存在する微生物叢（マイクロバイオーム）と代謝物（メタボローム）のデータを統合し、分類（クラスタリング）を行うことで、微生物と代謝物の関係を解明する技術です。詳細は東京大学大学院農学生命科学研究科・農学部のホームページをご覧くださ...
キーワード：変数選択/クラスタリング/マイクロ/土壌/微生物/微生物叢/代謝物/マイクロバイオーム/メタボローム
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発表日：2025年7月31日
21
“難培養”微生物を育てる鍵はオーダーメイド！
－鉄酸化菌の高効率培養に成功、環境浄化へ期待－
愛媛大学 大学院農学研究科 光延 聖 教授、同じく農学研究科の内島 智貴 大学院生（研究当時）は、理化学研究所 加藤 真悟 上級研究員、広島大学 白石 史人 教授、日本原子力研究開発機構 徳永 絋平 研究員、九州大学 濱村 奈津子 教授、東京海洋大学 牧田 寛子 准教授らとの共同研究によって、これまで純粋培養が非常に難しかった鉄酸化細菌の培養効率を大幅に向上する方法を確立しました。詳細は愛媛大学のホームページをご覧く...
キーワード：海洋/環境浄化/原子力/難培養/微生物/細菌
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発表日：2025年7月31日
22
口腔細菌叢の乱れは腸内細菌叢の乱れ
－歯周病に罹患すると腸内細菌叢が乱れて全身に悪影響の恐れ－
理化学研究所（理研）生命医科学研究センター 粘膜システム研究チームの山崎 和久 客員主管研究員（新潟大学 名誉教授）、宮内 栄治 客員研究員（群馬大学 生体調節研究所 粘膜エコシステム制御分野 准教授）、大野 博司 チームディレクターらの国際共同研究グループは、歯周病[1]以外に全身的な疾患のない患者と歯周病を含む全身的な疾患のない健康な対象者の唾液、ならびにふん便中の細菌叢（そう）を網羅的に解析し、歯周病患者では...
キーワード：情報量/類似度/人工知能（AI）/因果関係/フィルム/タンパク質複合体/システム制御/インフォマティクス/rRNA/16S rRNA/有機酸/微生物/脂肪酸合成/dysbiosis/オミクス/オミクス解析/遺伝子解析/炎症性腸疾患/滑膜/肝硬変/肝疾患/関節/血清/疾患モデル動物/病理/アルコール/外傷/寿命/心臓/代謝産物/大腸/短鎖脂肪酸/歯学/歯周病/RNA/アミノ酸/アルツハイマー病/クロマトグラフィー/タンパク質分解/マウス/モデル動物/リウマチ/リポタンパク質/リポ多糖/炎症性サイトカイン/関節リウマチ/血液/抗炎症/抗炎症作用/脂肪酸/上皮細胞/代謝物/大腸がん/2型糖尿病/アレルギー/サイトカイン/ディスバイオーシス/バイオフィルム/メタボローム/メタボローム解析/遺伝子/疫学/疫学研究/健康寿命/細菌/細菌叢/疾患モデル/唾液/腸内細菌/腸内細菌叢/糖尿病/動脈硬化
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発表日：2025年7月31日
23
アジアの多様な集団から世界初の免疫細胞アトラスを作成
理化学研究所（理研）生命医科学研究センター 遺伝子制御回路研究チーム（研究当時）のジェイ・シン チームリーダー（研究当時、現 遺伝子制御ゲノミクス研究チーム 客員研究員）、遺伝子制御ゲノミクス研究チームのヂョン-チョウ・ホン チームディレクター、トランスクリプトーム研究チームのピエロ・カルニンチ チームディレクター、センター長室の安藤 吉成 高度研究支援専門職らの国際共同研究グループはアジア免疫多様性アトラス（AIDA）コンソーシアム...
キーワード：情報学/ゲノミクス/遺伝情報/モニタリング/分解能/一細胞/微生物学/遺伝的変異/遺伝的多様性/微生物/C型肝炎ウイルス/エイズ/プロファイリング/遺伝統計学/病原体/肝炎/全身性エリテマトーデス/C型肝炎/遺伝子解析/遺伝子制御/関節/低酸素応答/AIDS/結核/白血球/B細胞/HIF/HIV/T細胞/トランスクリプトーム/リウマチ/関節リウマチ/血液/抗原/自己免疫/自己免疫疾患/制御性T細胞/低酸素/白血病/免疫応答/免疫学/免疫細胞/アレルギー/ウイルス/ゲノム/コホート/遺伝学/遺伝子/遺伝子発現/遺伝子変異/疫学/感染症
他の関係分野：情報学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年7月31日
24
発現量が進化しやすい遺伝子を細菌で発見
－偏りがある生物進化の予測と制御に期待－
理化学研究所（理研）生命機能科学研究センター 多階層生命動態研究チームの古澤 力 チームリーダー（東京大学 大学院理学系研究科附属生物普遍性研究機構 教授）と東京大学 大学院理学系研究科附属生物普遍性研究機構の津留 三良 特任助教の共同研究チームは、進化実験[1]で得た大腸菌の遺伝子の発現量[2]を網羅的に解析し、遺伝子変異や環境変化で生じる細胞状態の変化に対して、共通して発現量が進化しやすい遺伝子を明ら...
キーワード：相関係数/プロファイル/環境変化/突然変異/化学物質/普遍性/揺らぎ/化学進化/太陽/太陽系/惑星/遺伝情報/環境適応/センサー/モデル生物/進化実験/分子システム/一細胞/一細胞/変異株/細胞壁/微生物/アミノ酸代謝/環境要因/遺伝子発現解析/発現解析/生理機能/大腸/分子機構/DNA複製/RNA/アミノ酸/バイオテクノロジー/抗生物質/大腸菌/転写因子/転写制御/発現制御/ICT/ゲノム/遺伝子/遺伝子発現/遺伝子変異/感染症/細菌
他の関係分野：情報学複合領域環境学数物系科学生物学工学総合生物農学