【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2000 - 2001

【研究代表者】井上 純一郎 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (70176428)

【キーワード】GTP結合タンパク質 / 細胞周期 / アポトーシス / RNP Kホモロジードメイン / RNA結合タンパク質 (他11件)

【概要】アポトーシス及び細胞周期の進行制御の関与すると予想されるGTP結合タンパク質ERAのヒトおよびマウスホモログの完全長cDNAクローニングを行った。ついでヒトERAの生理機能及びその作用機構の解明を目指し以下の結果を得た。 (1)ERAはRNA結合タンパク質である。 ERAのC末端側にはRNA結合能を有すると考えられるhn RNP K homology(KH)ドメインが存在する。リコンビナントERA...

【研究テーマ】応用生物化学

【研究種目】萌芽研究

【研究期間】2004

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (80271542)

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / 超好熱性 (他6件)

【概要】超好熱菌(hyperthermophile)は90℃以上でも生育可能な微生物であるが、生物がなぜこのような高温環境で生育し増殖できるのかという命題は極めて興味深い。これまでにタンパクの高い熱安定性、エーテル脂質・tRNAの特異修飾などが指摘されているが、実際には数多くの要因からなる相加的・相乗的な効果により超好熱性が達成されているものと推測される。本研究では我々が独自にゲノム解析した超好熱始原菌T...

【研究テーマ】応用ゲノム科学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 助教授 (80271542)

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【研究テーマ】基礎ゲノム科学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2009 - 2011

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 准教授 (80271542)

【キーワード】ゲノム発現 / 超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / 遺伝子破壊 (他8件)

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【研究テーマ】基礎ゲノム科学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2009 - 2011

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 准教授 (80271542)

【キーワード】ゲノム発現 / 超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / 遺伝子破壊 (他8件)

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【研究テーマ】応用生物化学

【研究種目】萌芽研究

【研究期間】2004

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (80271542)

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / 超好熱性 (他6件)

【概要】超好熱菌(hyperthermophile)は90℃以上でも生育可能な微生物であるが、生物がなぜこのような高温環境で生育し増殖できるのかという命題は極めて興味深い。これまでにタンパクの高い熱安定性、エーテル脂質・tRNAの特異修飾などが指摘されているが、実際には数多くの要因からなる相加的・相乗的な効果により超好熱性が達成されているものと推測される。本研究では我々が独自にゲノム解析した超好熱始原菌T...

【研究テーマ】応用ゲノム科学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 助教授 (80271542)

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2000 - 2001

【研究代表者】井上 純一郎 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (70176428)

【キーワード】GTP結合タンパク質 / 細胞周期 / アポトーシス / RNP Kホモロジードメイン / RNA結合タンパク質 (他11件)

【概要】アポトーシス及び細胞周期の進行制御の関与すると予想されるGTP結合タンパク質ERAのヒトおよびマウスホモログの完全長cDNAクローニングを行った。ついでヒトERAの生理機能及びその作用機構の解明を目指し以下の結果を得た。 (1)ERAはRNA結合タンパク質である。 ERAのC末端側にはRNA結合能を有すると考えられるhn RNP K homology(KH)ドメインが存在する。リコンビナントERA...

【研究テーマ】基礎ゲノム科学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2009 - 2011

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 准教授 (80271542)

【キーワード】ゲノム発現 / 超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / 遺伝子破壊 (他8件)

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【研究テーマ】応用生物化学

【研究種目】萌芽研究

【研究期間】2004

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (80271542)

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / 超好熱性 (他6件)

【概要】超好熱菌(hyperthermophile)は90℃以上でも生育可能な微生物であるが、生物がなぜこのような高温環境で生育し増殖できるのかという命題は極めて興味深い。これまでにタンパクの高い熱安定性、エーテル脂質・tRNAの特異修飾などが指摘されているが、実際には数多くの要因からなる相加的・相乗的な効果により超好熱性が達成されているものと推測される。本研究では我々が独自にゲノム解析した超好熱始原菌T...

【研究テーマ】応用ゲノム科学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 助教授 (80271542)

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2006 - 2008

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 准教授 (20304066)

【キーワード】レンチウイルス / 遺伝子組換え / 胎盤 / トランスジェニック / ノックアウト (他9件)

【概要】レンチウイルスベクターはHuman Immunodeficiency Virus(HIV)由来のレトロウイルスベクターの1種であるが、特筆すべき利点として、非分裂期にある細胞にも効率良く感染できる特徴や、遺伝子発現が抑制されにくい特徴を併せ持つ。本研究では、動物個体レベルで遺伝子機能を解析するツールとして、レンチウイルスベクターの有用性について検討することを目的としている。これまでにレンチウイルス...

【研究テーマ】基礎ゲノム科学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2009 - 2011

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 准教授 (80271542)

【キーワード】ゲノム発現 / 超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / 遺伝子破壊 (他8件)

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2006 - 2008

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 准教授 (20304066)

【キーワード】レンチウイルス / 遺伝子組換え / 胎盤 / トランスジェニック / ノックアウト (他9件)

【概要】レンチウイルスベクターはHuman Immunodeficiency Virus(HIV)由来のレトロウイルスベクターの1種であるが、特筆すべき利点として、非分裂期にある細胞にも効率良く感染できる特徴や、遺伝子発現が抑制されにくい特徴を併せ持つ。本研究では、動物個体レベルで遺伝子機能を解析するツールとして、レンチウイルスベクターの有用性について検討することを目的としている。これまでにレンチウイルス...

【研究テーマ】応用ゲノム科学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 助教授 (20304066)

【キーワード】レンチウイルスベクター / 遺伝子組換え動物 / 性染色体 / 遺伝子改変動物 / 遺伝子破壊 (他7件)

【概要】レンチウイルスベクターを受精卵に感染させれば、非常に効率良く多数の遺伝子座にGFP発現遺伝子を組み込むことができる。そのことを利用して、GFP遺伝子を性染色体に組み込むと同時に内在性遺伝子を破壊することにより、性染色体の遺伝子機能を解析することを目的として研究を進めてきた。 これまでに、酸性処理による透明帯除去ではなく、ガラスキャピラリーを用いて透明帯と卵の隙間にウイルスを注入するマイクロインジェ...

【研究テーマ】生物・生体工学

【研究種目】基盤研究(S)

【研究期間】2002 - 2006

【研究代表者】今中 忠行 京都大学, 工学研究科, 教授 (30029219)

【キーワード】超好熱菌 / 機能未知遺伝子 / 遺伝子破壊 / 始原菌 / 新規代謝系 (他12件)

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明 炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【研究テーマ】生物・生体工学

【研究種目】基盤研究(S)

【研究期間】2002 - 2006

【研究代表者】今中 忠行 京都大学, 工学研究科, 教授 (30029219)

【キーワード】超好熱菌 / 機能未知遺伝子 / 遺伝子破壊 / 始原菌 / 新規代謝系 (他12件)

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明 炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【研究テーマ】基礎ゲノム科学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2009 - 2011

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 准教授 (80271542)

【キーワード】ゲノム発現 / 超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / 遺伝子破壊 (他8件)

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【研究テーマ】応用生物化学

【研究種目】萌芽研究

【研究期間】2004

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (80271542)

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / 超好熱性 (他6件)

【概要】超好熱菌(hyperthermophile)は90℃以上でも生育可能な微生物であるが、生物がなぜこのような高温環境で生育し増殖できるのかという命題は極めて興味深い。これまでにタンパクの高い熱安定性、エーテル脂質・tRNAの特異修飾などが指摘されているが、実際には数多くの要因からなる相加的・相乗的な効果により超好熱性が達成されているものと推測される。本研究では我々が独自にゲノム解析した超好熱始原菌T...

【研究テーマ】応用ゲノム科学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 助教授 (80271542)

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【研究テーマ】生物・生体工学

【研究種目】基盤研究(S)

【研究期間】2002 - 2006

【研究代表者】今中 忠行 京都大学, 工学研究科, 教授 (30029219)

【キーワード】超好熱菌 / 機能未知遺伝子 / 遺伝子破壊 / 始原菌 / 新規代謝系 (他12件)

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明 炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (20304066)

【キーワード】ゲノム編集 / 生殖不全 / 遺伝子破壊 / 点変異 / ES細胞 (他16件)

【概要】本研究課題では、ZFNやTALENに代わる新しい遺伝子改変技術であるCRISPR/Cas9システムを用いてマウス個体レベルでのゲノム編集技術を確立した。まずpCAG-EGxxFPプラスミドを作製し、EGFP蛍光を指標に培養細胞内でのDNA切断効率を判定する系を確立した。次に、標的配列を認識するgRNAとDNA切断するCAS9酵素を発現するプラスミドを受精卵に注入し、両者を一過性に発現させることで、...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (20304066)

【キーワード】ゲノム編集 / 生殖不全 / 遺伝子破壊 / 点変異 / ES細胞 (他16件)

【概要】本研究課題では、ZFNやTALENに代わる新しい遺伝子改変技術であるCRISPR/Cas9システムを用いてマウス個体レベルでのゲノム編集技術を確立した。まずpCAG-EGxxFPプラスミドを作製し、EGFP蛍光を指標に培養細胞内でのDNA切断効率を判定する系を確立した。次に、標的配列を認識するgRNAとDNA切断するCAS9酵素を発現するプラスミドを受精卵に注入し、両者を一過性に発現させることで、...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】鈴木 徹 岐阜大学, 応用生物科学部, 教授 (20235972)

【キーワード】微生物 / 腸内細菌 / ビフィズス菌 / 腸内フローラ / 遺伝子破壊 (他9件)

【概要】我々が開発したビフィズス菌の遺伝子破壊法を用い、ビフィズス菌の腸内環境に対する適応戦略に関わる可能性のある遺伝子群の系統的遺伝子破壊コレクションの作成を行った。ビフィズス菌の二成分制御系のレスポンスレギュレーター(RR)遺伝子9つの破壊株を取得し、そのトランスクリプトーム解析を行った。結果、一つのRR遺伝子が70個以上の遺伝子の発現調節に関与していることがあきらかになった。これらは、酸素耐性、酸耐...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (20304066)

【キーワード】ゲノム編集 / 生殖不全 / 遺伝子破壊 / 点変異 / ES細胞 (他16件)

【概要】本研究課題では、ZFNやTALENに代わる新しい遺伝子改変技術であるCRISPR/Cas9システムを用いてマウス個体レベルでのゲノム編集技術を確立した。まずpCAG-EGxxFPプラスミドを作製し、EGFP蛍光を指標に培養細胞内でのDNA切断効率を判定する系を確立した。次に、標的配列を認識するgRNAとDNA切断するCAS9酵素を発現するプラスミドを受精卵に注入し、両者を一過性に発現させることで、...

【研究テーマ】応用ゲノム科学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 助教授 (80271542)

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2006 - 2008

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 准教授 (20304066)

【キーワード】レンチウイルス / 遺伝子組換え / 胎盤 / トランスジェニック / ノックアウト (他9件)

【概要】レンチウイルスベクターはHuman Immunodeficiency Virus(HIV)由来のレトロウイルスベクターの1種であるが、特筆すべき利点として、非分裂期にある細胞にも効率良く感染できる特徴や、遺伝子発現が抑制されにくい特徴を併せ持つ。本研究では、動物個体レベルで遺伝子機能を解析するツールとして、レンチウイルスベクターの有用性について検討することを目的としている。これまでにレンチウイルス...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (20304066)

【キーワード】ゲノム編集 / 生殖不全 / 遺伝子破壊 / 点変異 / ES細胞 (他16件)

【概要】本研究課題では、ZFNやTALENに代わる新しい遺伝子改変技術であるCRISPR/Cas9システムを用いてマウス個体レベルでのゲノム編集技術を確立した。まずpCAG-EGxxFPプラスミドを作製し、EGFP蛍光を指標に培養細胞内でのDNA切断効率を判定する系を確立した。次に、標的配列を認識するgRNAとDNA切断するCAS9酵素を発現するプラスミドを受精卵に注入し、両者を一過性に発現させることで、...

【研究テーマ】応用ゲノム科学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 助教授 (80271542)

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【研究テーマ】生物・生体工学

【研究種目】基盤研究(S)

【研究期間】2002 - 2006

【研究代表者】今中 忠行 京都大学, 工学研究科, 教授 (30029219)

【キーワード】超好熱菌 / 機能未知遺伝子 / 遺伝子破壊 / 始原菌 / 新規代謝系 (他12件)

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明 炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【研究テーマ】生物・生体工学

【研究種目】基盤研究(S)

【研究期間】2002 - 2006

【研究代表者】今中 忠行 京都大学, 工学研究科, 教授 (30029219)

【キーワード】超好熱菌 / 機能未知遺伝子 / 遺伝子破壊 / 始原菌 / 新規代謝系 (他12件)

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明 炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】鈴木 徹 岐阜大学, 応用生物科学部, 教授 (20235972)

【キーワード】微生物 / 腸内細菌 / ビフィズス菌 / 腸内フローラ / 遺伝子破壊 (他9件)

【概要】我々が開発したビフィズス菌の遺伝子破壊法を用い、ビフィズス菌の腸内環境に対する適応戦略に関わる可能性のある遺伝子群の系統的遺伝子破壊コレクションの作成を行った。ビフィズス菌の二成分制御系のレスポンスレギュレーター(RR)遺伝子9つの破壊株を取得し、そのトランスクリプトーム解析を行った。結果、一つのRR遺伝子が70個以上の遺伝子の発現調節に関与していることがあきらかになった。これらは、酸素耐性、酸耐...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】鈴木 徹 岐阜大学, 応用生物科学部, 教授 (20235972)

【キーワード】微生物 / 腸内細菌 / ビフィズス菌 / 腸内フローラ / 遺伝子破壊 (他9件)

【概要】我々が開発したビフィズス菌の遺伝子破壊法を用い、ビフィズス菌の腸内環境に対する適応戦略に関わる可能性のある遺伝子群の系統的遺伝子破壊コレクションの作成を行った。ビフィズス菌の二成分制御系のレスポンスレギュレーター(RR)遺伝子9つの破壊株を取得し、そのトランスクリプトーム解析を行った。結果、一つのRR遺伝子が70個以上の遺伝子の発現調節に関与していることがあきらかになった。これらは、酸素耐性、酸耐...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】鈴木 徹 岐阜大学, 応用生物科学部, 教授 (20235972)

【キーワード】微生物 / 腸内細菌 / ビフィズス菌 / 腸内フローラ / 遺伝子破壊 (他9件)

【概要】我々が開発したビフィズス菌の遺伝子破壊法を用い、ビフィズス菌の腸内環境に対する適応戦略に関わる可能性のある遺伝子群の系統的遺伝子破壊コレクションの作成を行った。ビフィズス菌の二成分制御系のレスポンスレギュレーター(RR)遺伝子9つの破壊株を取得し、そのトランスクリプトーム解析を行った。結果、一つのRR遺伝子が70個以上の遺伝子の発現調節に関与していることがあきらかになった。これらは、酸素耐性、酸耐...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (20304066)

【キーワード】ゲノム編集 / 生殖不全 / 遺伝子破壊 / 点変異 / ES細胞 (他16件)

【概要】本研究課題では、ZFNやTALENに代わる新しい遺伝子改変技術であるCRISPR/Cas9システムを用いてマウス個体レベルでのゲノム編集技術を確立した。まずpCAG-EGxxFPプラスミドを作製し、EGFP蛍光を指標に培養細胞内でのDNA切断効率を判定する系を確立した。次に、標的配列を認識するgRNAとDNA切断するCAS9酵素を発現するプラスミドを受精卵に注入し、両者を一過性に発現させることで、...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2006 - 2008

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 准教授 (20304066)

【キーワード】レンチウイルス / 遺伝子組換え / 胎盤 / トランスジェニック / ノックアウト (他9件)

【概要】レンチウイルスベクターはHuman Immunodeficiency Virus(HIV)由来のレトロウイルスベクターの1種であるが、特筆すべき利点として、非分裂期にある細胞にも効率良く感染できる特徴や、遺伝子発現が抑制されにくい特徴を併せ持つ。本研究では、動物個体レベルで遺伝子機能を解析するツールとして、レンチウイルスベクターの有用性について検討することを目的としている。これまでにレンチウイルス...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】鈴木 徹 岐阜大学, 応用生物科学部, 教授 (20235972)

【キーワード】微生物 / 腸内細菌 / ビフィズス菌 / 腸内フローラ / 遺伝子破壊 (他9件)

【概要】我々が開発したビフィズス菌の遺伝子破壊法を用い、ビフィズス菌の腸内環境に対する適応戦略に関わる可能性のある遺伝子群の系統的遺伝子破壊コレクションの作成を行った。ビフィズス菌の二成分制御系のレスポンスレギュレーター(RR)遺伝子9つの破壊株を取得し、そのトランスクリプトーム解析を行った。結果、一つのRR遺伝子が70個以上の遺伝子の発現調節に関与していることがあきらかになった。これらは、酸素耐性、酸耐...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】鈴木 徹 岐阜大学, 応用生物科学部, 教授 (20235972)

【キーワード】微生物 / 腸内細菌 / ビフィズス菌 / 腸内フローラ / 遺伝子破壊 (他9件)

【概要】我々が開発したビフィズス菌の遺伝子破壊法を用い、ビフィズス菌の腸内環境に対する適応戦略に関わる可能性のある遺伝子群の系統的遺伝子破壊コレクションの作成を行った。ビフィズス菌の二成分制御系のレスポンスレギュレーター(RR)遺伝子9つの破壊株を取得し、そのトランスクリプトーム解析を行った。結果、一つのRR遺伝子が70個以上の遺伝子の発現調節に関与していることがあきらかになった。これらは、酸素耐性、酸耐...

【研究テーマ】生物・生体工学

【研究種目】基盤研究(S)

【研究期間】2002 - 2006

【研究代表者】今中 忠行 京都大学, 工学研究科, 教授 (30029219)

【キーワード】超好熱菌 / 機能未知遺伝子 / 遺伝子破壊 / 始原菌 / 新規代謝系 (他12件)

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明 炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【研究テーマ】応用ゲノム科学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 助教授 (20304066)

【キーワード】レンチウイルスベクター / 遺伝子組換え動物 / 性染色体 / 遺伝子改変動物 / 遺伝子破壊 (他7件)

【概要】レンチウイルスベクターを受精卵に感染させれば、非常に効率良く多数の遺伝子座にGFP発現遺伝子を組み込むことができる。そのことを利用して、GFP遺伝子を性染色体に組み込むと同時に内在性遺伝子を破壊することにより、性染色体の遺伝子機能を解析することを目的として研究を進めてきた。 これまでに、酸性処理による透明帯除去ではなく、ガラスキャピラリーを用いて透明帯と卵の隙間にウイルスを注入するマイクロインジェ...

【研究テーマ】応用ゲノム科学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 助教授 (20304066)

【キーワード】レンチウイルスベクター / 遺伝子組換え動物 / 性染色体 / 遺伝子改変動物 / 遺伝子破壊 (他7件)

【概要】レンチウイルスベクターを受精卵に感染させれば、非常に効率良く多数の遺伝子座にGFP発現遺伝子を組み込むことができる。そのことを利用して、GFP遺伝子を性染色体に組み込むと同時に内在性遺伝子を破壊することにより、性染色体の遺伝子機能を解析することを目的として研究を進めてきた。 これまでに、酸性処理による透明帯除去ではなく、ガラスキャピラリーを用いて透明帯と卵の隙間にウイルスを注入するマイクロインジェ...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2000 - 2001

【研究代表者】井上 純一郎 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (70176428)

【キーワード】GTP結合タンパク質 / 細胞周期 / アポトーシス / RNP Kホモロジードメイン / RNA結合タンパク質 (他11件)

【概要】アポトーシス及び細胞周期の進行制御の関与すると予想されるGTP結合タンパク質ERAのヒトおよびマウスホモログの完全長cDNAクローニングを行った。ついでヒトERAの生理機能及びその作用機構の解明を目指し以下の結果を得た。 (1)ERAはRNA結合タンパク質である。 ERAのC末端側にはRNA結合能を有すると考えられるhn RNP K homology(KH)ドメインが存在する。リコンビナントERA...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (20304066)

【キーワード】ゲノム編集 / 生殖不全 / 遺伝子破壊 / 点変異 / ES細胞 (他16件)

【概要】本研究課題では、ZFNやTALENに代わる新しい遺伝子改変技術であるCRISPR/Cas9システムを用いてマウス個体レベルでのゲノム編集技術を確立した。まずpCAG-EGxxFPプラスミドを作製し、EGFP蛍光を指標に培養細胞内でのDNA切断効率を判定する系を確立した。次に、標的配列を認識するgRNAとDNA切断するCAS9酵素を発現するプラスミドを受精卵に注入し、両者を一過性に発現させることで、...

【研究テーマ】生物・生体工学

【研究種目】基盤研究(S)

【研究期間】2002 - 2006

【研究代表者】今中 忠行 京都大学, 工学研究科, 教授 (30029219)

【キーワード】超好熱菌 / 機能未知遺伝子 / 遺伝子破壊 / 始原菌 / 新規代謝系 (他12件)

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明 炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【研究テーマ】応用ゲノム科学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 助教授 (20304066)

【キーワード】レンチウイルスベクター / 遺伝子組換え動物 / 性染色体 / 遺伝子改変動物 / 遺伝子破壊 (他7件)

【概要】レンチウイルスベクターを受精卵に感染させれば、非常に効率良く多数の遺伝子座にGFP発現遺伝子を組み込むことができる。そのことを利用して、GFP遺伝子を性染色体に組み込むと同時に内在性遺伝子を破壊することにより、性染色体の遺伝子機能を解析することを目的として研究を進めてきた。 これまでに、酸性処理による透明帯除去ではなく、ガラスキャピラリーを用いて透明帯と卵の隙間にウイルスを注入するマイクロインジェ...

【研究テーマ】応用ゲノム科学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 助教授 (20304066)

【キーワード】レンチウイルスベクター / 遺伝子組換え動物 / 性染色体 / 遺伝子改変動物 / 遺伝子破壊 (他7件)

【概要】レンチウイルスベクターを受精卵に感染させれば、非常に効率良く多数の遺伝子座にGFP発現遺伝子を組み込むことができる。そのことを利用して、GFP遺伝子を性染色体に組み込むと同時に内在性遺伝子を破壊することにより、性染色体の遺伝子機能を解析することを目的として研究を進めてきた。 これまでに、酸性処理による透明帯除去ではなく、ガラスキャピラリーを用いて透明帯と卵の隙間にウイルスを注入するマイクロインジェ...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2006 - 2008

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 准教授 (20304066)

【キーワード】レンチウイルス / 遺伝子組換え / 胎盤 / トランスジェニック / ノックアウト (他9件)

【概要】レンチウイルスベクターはHuman Immunodeficiency Virus(HIV)由来のレトロウイルスベクターの1種であるが、特筆すべき利点として、非分裂期にある細胞にも効率良く感染できる特徴や、遺伝子発現が抑制されにくい特徴を併せ持つ。本研究では、動物個体レベルで遺伝子機能を解析するツールとして、レンチウイルスベクターの有用性について検討することを目的としている。これまでにレンチウイルス...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (20304066)

【キーワード】ゲノム編集 / 生殖不全 / 遺伝子破壊 / 点変異 / ES細胞 (他16件)

【概要】本研究課題では、ZFNやTALENに代わる新しい遺伝子改変技術であるCRISPR/Cas9システムを用いてマウス個体レベルでのゲノム編集技術を確立した。まずpCAG-EGxxFPプラスミドを作製し、EGFP蛍光を指標に培養細胞内でのDNA切断効率を判定する系を確立した。次に、標的配列を認識するgRNAとDNA切断するCAS9酵素を発現するプラスミドを受精卵に注入し、両者を一過性に発現させることで、...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2006 - 2008

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 准教授 (20304066)

【キーワード】レンチウイルス / 遺伝子組換え / 胎盤 / トランスジェニック / ノックアウト (他9件)

【概要】レンチウイルスベクターはHuman Immunodeficiency Virus(HIV)由来のレトロウイルスベクターの1種であるが、特筆すべき利点として、非分裂期にある細胞にも効率良く感染できる特徴や、遺伝子発現が抑制されにくい特徴を併せ持つ。本研究では、動物個体レベルで遺伝子機能を解析するツールとして、レンチウイルスベクターの有用性について検討することを目的としている。これまでにレンチウイルス...

【研究テーマ】応用ゲノム科学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 助教授 (20304066)

【キーワード】レンチウイルスベクター / 遺伝子組換え動物 / 性染色体 / 遺伝子改変動物 / 遺伝子破壊 (他7件)

【概要】レンチウイルスベクターを受精卵に感染させれば、非常に効率良く多数の遺伝子座にGFP発現遺伝子を組み込むことができる。そのことを利用して、GFP遺伝子を性染色体に組み込むと同時に内在性遺伝子を破壊することにより、性染色体の遺伝子機能を解析することを目的として研究を進めてきた。 これまでに、酸性処理による透明帯除去ではなく、ガラスキャピラリーを用いて透明帯と卵の隙間にウイルスを注入するマイクロインジェ...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (20304066)

【キーワード】ゲノム編集 / 生殖不全 / 遺伝子破壊 / 点変異 / ES細胞 (他16件)

【概要】本研究課題では、ZFNやTALENに代わる新しい遺伝子改変技術であるCRISPR/Cas9システムを用いてマウス個体レベルでのゲノム編集技術を確立した。まずpCAG-EGxxFPプラスミドを作製し、EGFP蛍光を指標に培養細胞内でのDNA切断効率を判定する系を確立した。次に、標的配列を認識するgRNAとDNA切断するCAS9酵素を発現するプラスミドを受精卵に注入し、両者を一過性に発現させることで、...

【研究テーマ】生物・生体工学

【研究種目】基盤研究(S)

【研究期間】2002 - 2006

【研究代表者】今中 忠行 京都大学, 工学研究科, 教授 (30029219)

【キーワード】超好熱菌 / 機能未知遺伝子 / 遺伝子破壊 / 始原菌 / 新規代謝系 (他12件)

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明 炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (20304066)

【キーワード】ゲノム編集 / 生殖不全 / 遺伝子破壊 / 点変異 / ES細胞 (他16件)

【概要】本研究課題では、ZFNやTALENに代わる新しい遺伝子改変技術であるCRISPR/Cas9システムを用いてマウス個体レベルでのゲノム編集技術を確立した。まずpCAG-EGxxFPプラスミドを作製し、EGFP蛍光を指標に培養細胞内でのDNA切断効率を判定する系を確立した。次に、標的配列を認識するgRNAとDNA切断するCAS9酵素を発現するプラスミドを受精卵に注入し、両者を一過性に発現させることで、...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (20304066)

【キーワード】ゲノム編集 / 生殖不全 / 遺伝子破壊 / 点変異 / ES細胞 (他16件)

【概要】本研究課題では、ZFNやTALENに代わる新しい遺伝子改変技術であるCRISPR/Cas9システムを用いてマウス個体レベルでのゲノム編集技術を確立した。まずpCAG-EGxxFPプラスミドを作製し、EGFP蛍光を指標に培養細胞内でのDNA切断効率を判定する系を確立した。次に、標的配列を認識するgRNAとDNA切断するCAS9酵素を発現するプラスミドを受精卵に注入し、両者を一過性に発現させることで、...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2000 - 2001

【研究代表者】井上 純一郎 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (70176428)

【キーワード】GTP結合タンパク質 / 細胞周期 / アポトーシス / RNP Kホモロジードメイン / RNA結合タンパク質 (他11件)

【概要】アポトーシス及び細胞周期の進行制御の関与すると予想されるGTP結合タンパク質ERAのヒトおよびマウスホモログの完全長cDNAクローニングを行った。ついでヒトERAの生理機能及びその作用機構の解明を目指し以下の結果を得た。 (1)ERAはRNA結合タンパク質である。 ERAのC末端側にはRNA結合能を有すると考えられるhn RNP K homology(KH)ドメインが存在する。リコンビナントERA...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2000 - 2001

【研究代表者】井上 純一郎 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (70176428)

【キーワード】GTP結合タンパク質 / 細胞周期 / アポトーシス / RNP Kホモロジードメイン / RNA結合タンパク質 (他11件)

【概要】アポトーシス及び細胞周期の進行制御の関与すると予想されるGTP結合タンパク質ERAのヒトおよびマウスホモログの完全長cDNAクローニングを行った。ついでヒトERAの生理機能及びその作用機構の解明を目指し以下の結果を得た。 (1)ERAはRNA結合タンパク質である。 ERAのC末端側にはRNA結合能を有すると考えられるhn RNP K homology(KH)ドメインが存在する。リコンビナントERA...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (20304066)

【キーワード】ゲノム編集 / 生殖不全 / 遺伝子破壊 / 点変異 / ES細胞 (他16件)

【概要】本研究課題では、ZFNやTALENに代わる新しい遺伝子改変技術であるCRISPR/Cas9システムを用いてマウス個体レベルでのゲノム編集技術を確立した。まずpCAG-EGxxFPプラスミドを作製し、EGFP蛍光を指標に培養細胞内でのDNA切断効率を判定する系を確立した。次に、標的配列を認識するgRNAとDNA切断するCAS9酵素を発現するプラスミドを受精卵に注入し、両者を一過性に発現させることで、...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2000 - 2001

【研究代表者】井上 純一郎 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (70176428)

【キーワード】GTP結合タンパク質 / 細胞周期 / アポトーシス / RNP Kホモロジードメイン / RNA結合タンパク質 (他11件)

【概要】アポトーシス及び細胞周期の進行制御の関与すると予想されるGTP結合タンパク質ERAのヒトおよびマウスホモログの完全長cDNAクローニングを行った。ついでヒトERAの生理機能及びその作用機構の解明を目指し以下の結果を得た。 (1)ERAはRNA結合タンパク質である。 ERAのC末端側にはRNA結合能を有すると考えられるhn RNP K homology(KH)ドメインが存在する。リコンビナントERA...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2000 - 2001

【研究代表者】井上 純一郎 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (70176428)

【キーワード】GTP結合タンパク質 / 細胞周期 / アポトーシス / RNP Kホモロジードメイン / RNA結合タンパク質 (他11件)

【概要】アポトーシス及び細胞周期の進行制御の関与すると予想されるGTP結合タンパク質ERAのヒトおよびマウスホモログの完全長cDNAクローニングを行った。ついでヒトERAの生理機能及びその作用機構の解明を目指し以下の結果を得た。 (1)ERAはRNA結合タンパク質である。 ERAのC末端側にはRNA結合能を有すると考えられるhn RNP K homology(KH)ドメインが存在する。リコンビナントERA...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2000 - 2001

【研究代表者】井上 純一郎 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (70176428)

【キーワード】GTP結合タンパク質 / 細胞周期 / アポトーシス / RNP Kホモロジードメイン / RNA結合タンパク質 (他11件)

【概要】アポトーシス及び細胞周期の進行制御の関与すると予想されるGTP結合タンパク質ERAのヒトおよびマウスホモログの完全長cDNAクローニングを行った。ついでヒトERAの生理機能及びその作用機構の解明を目指し以下の結果を得た。 (1)ERAはRNA結合タンパク質である。 ERAのC末端側にはRNA結合能を有すると考えられるhn RNP K homology(KH)ドメインが存在する。リコンビナントERA...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2006 - 2008

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 准教授 (20304066)

【キーワード】レンチウイルス / 遺伝子組換え / 胎盤 / トランスジェニック / ノックアウト (他9件)

【概要】レンチウイルスベクターはHuman Immunodeficiency Virus(HIV)由来のレトロウイルスベクターの1種であるが、特筆すべき利点として、非分裂期にある細胞にも効率良く感染できる特徴や、遺伝子発現が抑制されにくい特徴を併せ持つ。本研究では、動物個体レベルで遺伝子機能を解析するツールとして、レンチウイルスベクターの有用性について検討することを目的としている。これまでにレンチウイルス...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2000 - 2001

【研究代表者】井上 純一郎 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (70176428)

【キーワード】GTP結合タンパク質 / 細胞周期 / アポトーシス / RNP Kホモロジードメイン / RNA結合タンパク質 (他11件)

【概要】アポトーシス及び細胞周期の進行制御の関与すると予想されるGTP結合タンパク質ERAのヒトおよびマウスホモログの完全長cDNAクローニングを行った。ついでヒトERAの生理機能及びその作用機構の解明を目指し以下の結果を得た。 (1)ERAはRNA結合タンパク質である。 ERAのC末端側にはRNA結合能を有すると考えられるhn RNP K homology(KH)ドメインが存在する。リコンビナントERA...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (20304066)

【キーワード】ゲノム編集 / 生殖不全 / 遺伝子破壊 / 点変異 / ES細胞 (他16件)

【概要】本研究課題では、ZFNやTALENに代わる新しい遺伝子改変技術であるCRISPR/Cas9システムを用いてマウス個体レベルでのゲノム編集技術を確立した。まずpCAG-EGxxFPプラスミドを作製し、EGFP蛍光を指標に培養細胞内でのDNA切断効率を判定する系を確立した。次に、標的配列を認識するgRNAとDNA切断するCAS9酵素を発現するプラスミドを受精卵に注入し、両者を一過性に発現させることで、...

【研究テーマ】基礎ゲノム科学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2009 - 2011

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 准教授 (80271542)

【キーワード】ゲノム発現 / 超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / 遺伝子破壊 (他8件)

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (20304066)

【キーワード】ゲノム編集 / 生殖不全 / 遺伝子破壊 / 点変異 / ES細胞 (他16件)

【概要】本研究課題では、ZFNやTALENに代わる新しい遺伝子改変技術であるCRISPR/Cas9システムを用いてマウス個体レベルでのゲノム編集技術を確立した。まずpCAG-EGxxFPプラスミドを作製し、EGFP蛍光を指標に培養細胞内でのDNA切断効率を判定する系を確立した。次に、標的配列を認識するgRNAとDNA切断するCAS9酵素を発現するプラスミドを受精卵に注入し、両者を一過性に発現させることで、...

【研究テーマ】実験動物学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2006 - 2008

【研究代表者】伊川 正人 大阪大学, 微生物病研究所, 准教授 (20304066)

【キーワード】レンチウイルス / 遺伝子組換え / 胎盤 / トランスジェニック / ノックアウト (他9件)

【概要】レンチウイルスベクターはHuman Immunodeficiency Virus(HIV)由来のレトロウイルスベクターの1種であるが、特筆すべき利点として、非分裂期にある細胞にも効率良く感染できる特徴や、遺伝子発現が抑制されにくい特徴を併せ持つ。本研究では、動物個体レベルで遺伝子機能を解析するツールとして、レンチウイルスベクターの有用性について検討することを目的としている。これまでにレンチウイルス...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】鈴木 徹 岐阜大学, 応用生物科学部, 教授 (20235972)

【キーワード】微生物 / 腸内細菌 / ビフィズス菌 / 腸内フローラ / 遺伝子破壊 (他9件)

【概要】我々が開発したビフィズス菌の遺伝子破壊法を用い、ビフィズス菌の腸内環境に対する適応戦略に関わる可能性のある遺伝子群の系統的遺伝子破壊コレクションの作成を行った。ビフィズス菌の二成分制御系のレスポンスレギュレーター(RR)遺伝子9つの破壊株を取得し、そのトランスクリプトーム解析を行った。結果、一つのRR遺伝子が70個以上の遺伝子の発現調節に関与していることがあきらかになった。これらは、酸素耐性、酸耐...

【研究テーマ】応用微生物学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】鈴木 徹 岐阜大学, 応用生物科学部, 教授 (20235972)

【キーワード】微生物 / 腸内細菌 / ビフィズス菌 / 腸内フローラ / 遺伝子破壊 (他9件)

【概要】我々が開発したビフィズス菌の遺伝子破壊法を用い、ビフィズス菌の腸内環境に対する適応戦略に関わる可能性のある遺伝子群の系統的遺伝子破壊コレクションの作成を行った。ビフィズス菌の二成分制御系のレスポンスレギュレーター(RR)遺伝子9つの破壊株を取得し、そのトランスクリプトーム解析を行った。結果、一つのRR遺伝子が70個以上の遺伝子の発現調節に関与していることがあきらかになった。これらは、酸素耐性、酸耐...

【研究テーマ】応用生物化学

【研究種目】萌芽研究

【研究期間】2004

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (80271542)

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / 超好熱性 (他6件)

【概要】超好熱菌(hyperthermophile)は90℃以上でも生育可能な微生物であるが、生物がなぜこのような高温環境で生育し増殖できるのかという命題は極めて興味深い。これまでにタンパクの高い熱安定性、エーテル脂質・tRNAの特異修飾などが指摘されているが、実際には数多くの要因からなる相加的・相乗的な効果により超好熱性が達成されているものと推測される。本研究では我々が独自にゲノム解析した超好熱始原菌T...

【研究テーマ】応用ゲノム科学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2004 - 2006

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 助教授 (80271542)

【キーワード】超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / ゲノム / Missing gene (他8件)

【概要】90℃以上でも生育可能な超好熱菌においては生育に必須な機構や代謝を構成する遺伝子群がそのゲノム中に見いだされても、その一部は相同性解析から全く同定できない"missing gene"となっているケースが多い。本研究では、T.kodakaraensisのゲノム情報と遺伝子操作技術により本菌の2.09Mbpゲノム上に散在する"missing gene"の同定と機能検証を...

【研究テーマ】生物・生体工学

【研究種目】基盤研究(S)

【研究期間】2002 - 2006

【研究代表者】今中 忠行 京都大学, 工学研究科, 教授 (30029219)

【キーワード】超好熱菌 / 機能未知遺伝子 / 遺伝子破壊 / 始原菌 / 新規代謝系 (他12件)

【概要】1.超好熱菌遺伝子破壊系の改良 ΔpyrF株を宿主とし、pyrFマーカー遺伝子の上流および下流に相同領域を導入することにより、一段階目の相同組換えの後にpyrFマーカー遺伝子がゲノム上から脱落する系を開発した。この系では原理的には如何なる数の遺伝子でも破壊・導入が可能となる。 2.中央代謝経路の解明 炭素中央代謝に着目し、ゲノム情報からその存在が不明であった多数の遺伝子を特定した。 (1)我々は超...

【研究テーマ】基礎ゲノム科学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2009 - 2011

【研究代表者】福居 俊昭 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 准教授 (80271542)

【キーワード】ゲノム発現 / 超好熱菌 / 始原菌 / アーキア / 遺伝子破壊 (他8件)

【概要】超好熱始原菌は少ない遺伝子数にもかかわらず外的環境の変化に自律的に適応できる生物であり、その極限的な環境の変化に応答する機構は興味深い。本研究では超好熱始原菌Thermococcus kodakarensisの環境適応における遺伝子発現制御機構の解析を行った。DNA結合因子依存型の発現制御としてNikRによるNi^<2+>輸送レギュロン、Phrによる熱ショック応答レギュロンを同定した。...