【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】櫻井 実 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50162342)

【キーワード】イエロー蛋白質 / PYP / 分子動力学シミュレーション / QM / MM法 (他16件)

【概要】本研究では、光受容イエロー蛋白質の光反応過程の諸性質を計算化学的手法を用いて原子・電子レベルで明らかにした。(1)発色団を取り囲む蛋白部位の電子分極効果を明示的に考慮可能な吸収波長計算の量子化学理論を定式化し、イエロー蛋白質およびレチナール蛋白質に適用した。その結果、発色団の波長を可視光域へシフトさせる主要因の一つは、蛋白質の電子分極応答であり、活性中心での量子的過程は、蛋白質部位の電子分極により...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】櫻井 実 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50162342)

【キーワード】イエロー蛋白質 / PYP / 分子動力学シミュレーション / QM / MM法 (他16件)

【概要】本研究では、光受容イエロー蛋白質の光反応過程の諸性質を計算化学的手法を用いて原子・電子レベルで明らかにした。(1)発色団を取り囲む蛋白部位の電子分極効果を明示的に考慮可能な吸収波長計算の量子化学理論を定式化し、イエロー蛋白質およびレチナール蛋白質に適用した。その結果、発色団の波長を可視光域へシフトさせる主要因の一つは、蛋白質の電子分極応答であり、活性中心での量子的過程は、蛋白質部位の電子分極により...

【研究テーマ】生体物性学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1990

【研究代表者】神山 勉 理化学研究所, 生物物理研究室, 研究員 (30170210)

【キーワード】膜蛋白質 / 蛋白質の結晶化 / バクテリオロドプシン / 電子線構造解析 / プロトン輸送 (他8件)

【概要】膜蛋白質の新しい構造解析法の確立を目指して,(1)膜蛋白の結晶化技術の開発・改良,(2)3次元結晶の電子線回折像から膜蛋白質の立体構造を求める方法の開発,の2点について研究した。(1)に関しては,光プロトンポンプとして知られるバクテリオロドプシンの結晶化を試み,3種類の微結晶を得るのに成功し、目標を達成した。また、温度勾配存在下で蒸気拡散を行なう新しい蛋白質結晶化法を開発し、結晶化プロセスの迅速化...

【研究テーマ】生体物性学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1990

【研究代表者】神山 勉 理化学研究所, 生物物理研究室, 研究員 (30170210)

【キーワード】膜蛋白質 / 蛋白質の結晶化 / バクテリオロドプシン / 電子線構造解析 / プロトン輸送 (他8件)

【概要】膜蛋白質の新しい構造解析法の確立を目指して,(1)膜蛋白の結晶化技術の開発・改良,(2)3次元結晶の電子線回折像から膜蛋白質の立体構造を求める方法の開発,の2点について研究した。(1)に関しては,光プロトンポンプとして知られるバクテリオロドプシンの結晶化を試み,3種類の微結晶を得るのに成功し、目標を達成した。また、温度勾配存在下で蒸気拡散を行なう新しい蛋白質結晶化法を開発し、結晶化プロセスの迅速化...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】櫻井 実 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50162342)

【キーワード】イエロー蛋白質 / PYP / 分子動力学シミュレーション / QM / MM法 (他16件)

【概要】本研究では、光受容イエロー蛋白質の光反応過程の諸性質を計算化学的手法を用いて原子・電子レベルで明らかにした。(1)発色団を取り囲む蛋白部位の電子分極効果を明示的に考慮可能な吸収波長計算の量子化学理論を定式化し、イエロー蛋白質およびレチナール蛋白質に適用した。その結果、発色団の波長を可視光域へシフトさせる主要因の一つは、蛋白質の電子分極応答であり、活性中心での量子的過程は、蛋白質部位の電子分極により...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】櫻井 実 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50162342)

【キーワード】イエロー蛋白質 / PYP / 分子動力学シミュレーション / QM / MM法 (他16件)

【概要】本研究では、光受容イエロー蛋白質の光反応過程の諸性質を計算化学的手法を用いて原子・電子レベルで明らかにした。(1)発色団を取り囲む蛋白部位の電子分極効果を明示的に考慮可能な吸収波長計算の量子化学理論を定式化し、イエロー蛋白質およびレチナール蛋白質に適用した。その結果、発色団の波長を可視光域へシフトさせる主要因の一つは、蛋白質の電子分極応答であり、活性中心での量子的過程は、蛋白質部位の電子分極により...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】櫻井 実 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50162342)

【キーワード】イエロー蛋白質 / PYP / 分子動力学シミュレーション / QM / MM法 (他16件)

【概要】本研究では、光受容イエロー蛋白質の光反応過程の諸性質を計算化学的手法を用いて原子・電子レベルで明らかにした。(1)発色団を取り囲む蛋白部位の電子分極効果を明示的に考慮可能な吸収波長計算の量子化学理論を定式化し、イエロー蛋白質およびレチナール蛋白質に適用した。その結果、発色団の波長を可視光域へシフトさせる主要因の一つは、蛋白質の電子分極応答であり、活性中心での量子的過程は、蛋白質部位の電子分極により...

【研究テーマ】ナノバイオサイエンス

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】リポソーム / PURE system / ATP合成酵素 / バクテリオロドプシン / 光合成 (他15件)

【概要】人工細胞を目標として、再構築型遺伝子発現系PURE systemによるバイオシステムの構築を進めた。細胞分裂システムを、リポソーム内で合成し、変形するリポソームを作製した。ATP合成酵素とバクテリオロドプシンを、リポソーム内で発現させ、光依存的なエネルギー生産システムを構築した。リボソームの小サブユニットについては、生合成因子の存在下、生理的条件下でのアセンブリー系を構築した。大サブユニットについ...

【研究テーマ】ナノバイオサイエンス

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】リポソーム / PURE system / ATP合成酵素 / バクテリオロドプシン / 光合成 (他15件)

【概要】人工細胞を目標として、再構築型遺伝子発現系PURE systemによるバイオシステムの構築を進めた。細胞分裂システムを、リポソーム内で合成し、変形するリポソームを作製した。ATP合成酵素とバクテリオロドプシンを、リポソーム内で発現させ、光依存的なエネルギー生産システムを構築した。リボソームの小サブユニットについては、生合成因子の存在下、生理的条件下でのアセンブリー系を構築した。大サブユニットについ...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】櫻井 実 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50162342)

【キーワード】イエロー蛋白質 / PYP / 分子動力学シミュレーション / QM / MM法 (他16件)

【概要】本研究では、光受容イエロー蛋白質の光反応過程の諸性質を計算化学的手法を用いて原子・電子レベルで明らかにした。(1)発色団を取り囲む蛋白部位の電子分極効果を明示的に考慮可能な吸収波長計算の量子化学理論を定式化し、イエロー蛋白質およびレチナール蛋白質に適用した。その結果、発色団の波長を可視光域へシフトさせる主要因の一つは、蛋白質の電子分極応答であり、活性中心での量子的過程は、蛋白質部位の電子分極により...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】櫻井 実 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50162342)

【キーワード】イエロー蛋白質 / PYP / 分子動力学シミュレーション / QM / MM法 (他16件)

【概要】本研究では、光受容イエロー蛋白質の光反応過程の諸性質を計算化学的手法を用いて原子・電子レベルで明らかにした。(1)発色団を取り囲む蛋白部位の電子分極効果を明示的に考慮可能な吸収波長計算の量子化学理論を定式化し、イエロー蛋白質およびレチナール蛋白質に適用した。その結果、発色団の波長を可視光域へシフトさせる主要因の一つは、蛋白質の電子分極応答であり、活性中心での量子的過程は、蛋白質部位の電子分極により...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】櫻井 実 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50162342)

【キーワード】イエロー蛋白質 / PYP / 分子動力学シミュレーション / QM / MM法 (他16件)

【概要】本研究では、光受容イエロー蛋白質の光反応過程の諸性質を計算化学的手法を用いて原子・電子レベルで明らかにした。(1)発色団を取り囲む蛋白部位の電子分極効果を明示的に考慮可能な吸収波長計算の量子化学理論を定式化し、イエロー蛋白質およびレチナール蛋白質に適用した。その結果、発色団の波長を可視光域へシフトさせる主要因の一つは、蛋白質の電子分極応答であり、活性中心での量子的過程は、蛋白質部位の電子分極により...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】櫻井 実 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50162342)

【キーワード】イエロー蛋白質 / PYP / 分子動力学シミュレーション / QM / MM法 (他16件)

【概要】本研究では、光受容イエロー蛋白質の光反応過程の諸性質を計算化学的手法を用いて原子・電子レベルで明らかにした。(1)発色団を取り囲む蛋白部位の電子分極効果を明示的に考慮可能な吸収波長計算の量子化学理論を定式化し、イエロー蛋白質およびレチナール蛋白質に適用した。その結果、発色団の波長を可視光域へシフトさせる主要因の一つは、蛋白質の電子分極応答であり、活性中心での量子的過程は、蛋白質部位の電子分極により...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】櫻井 実 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50162342)

【キーワード】イエロー蛋白質 / PYP / 分子動力学シミュレーション / QM / MM法 (他16件)

【概要】本研究では、光受容イエロー蛋白質の光反応過程の諸性質を計算化学的手法を用いて原子・電子レベルで明らかにした。(1)発色団を取り囲む蛋白部位の電子分極効果を明示的に考慮可能な吸収波長計算の量子化学理論を定式化し、イエロー蛋白質およびレチナール蛋白質に適用した。その結果、発色団の波長を可視光域へシフトさせる主要因の一つは、蛋白質の電子分極応答であり、活性中心での量子的過程は、蛋白質部位の電子分極により...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】櫻井 実 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50162342)

【キーワード】イエロー蛋白質 / PYP / 分子動力学シミュレーション / QM / MM法 (他16件)

【概要】本研究では、光受容イエロー蛋白質の光反応過程の諸性質を計算化学的手法を用いて原子・電子レベルで明らかにした。(1)発色団を取り囲む蛋白部位の電子分極効果を明示的に考慮可能な吸収波長計算の量子化学理論を定式化し、イエロー蛋白質およびレチナール蛋白質に適用した。その結果、発色団の波長を可視光域へシフトさせる主要因の一つは、蛋白質の電子分極応答であり、活性中心での量子的過程は、蛋白質部位の電子分極により...

【研究テーマ】ナノバイオサイエンス

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】リポソーム / PURE system / ATP合成酵素 / バクテリオロドプシン / 光合成 (他15件)

【概要】人工細胞を目標として、再構築型遺伝子発現系PURE systemによるバイオシステムの構築を進めた。細胞分裂システムを、リポソーム内で合成し、変形するリポソームを作製した。ATP合成酵素とバクテリオロドプシンを、リポソーム内で発現させ、光依存的なエネルギー生産システムを構築した。リボソームの小サブユニットについては、生合成因子の存在下、生理的条件下でのアセンブリー系を構築した。大サブユニットについ...

【研究テーマ】ナノバイオサイエンス

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】リポソーム / PURE system / ATP合成酵素 / バクテリオロドプシン / 光合成 (他15件)

【概要】人工細胞を目標として、再構築型遺伝子発現系PURE systemによるバイオシステムの構築を進めた。細胞分裂システムを、リポソーム内で合成し、変形するリポソームを作製した。ATP合成酵素とバクテリオロドプシンを、リポソーム内で発現させ、光依存的なエネルギー生産システムを構築した。リボソームの小サブユニットについては、生合成因子の存在下、生理的条件下でのアセンブリー系を構築した。大サブユニットについ...

【研究テーマ】応用生物化学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2014-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】バクテリオロドプシン / ＡＴＰ合成酵素 / 光合成 / ATP合成酵素 / リポソーム (他7件)

【概要】バクテリオロドプシンとFoF1-ATP合成酵素を組み込んだ（BR-FoF1）リポソームベースのバイオナノリアクターの構築が研究目的である。PURE systemによりFoF1-ATP合成酵素の全サブユニットをリポソーム上に発現させた。特に、各サブユニットの合成量が等しくなるように、ＤＮＡ量の条件検討を行った。合成されたATP合成酵素が十分な活性を有していることを見いだした。バクテリオロドプシンにつ...

【研究テーマ】生体物性学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1990

【研究代表者】神山 勉 理化学研究所, 生物物理研究室, 研究員 (30170210)

【キーワード】膜蛋白質 / 蛋白質の結晶化 / バクテリオロドプシン / 電子線構造解析 / プロトン輸送 (他8件)

【概要】膜蛋白質の新しい構造解析法の確立を目指して,(1)膜蛋白の結晶化技術の開発・改良,(2)3次元結晶の電子線回折像から膜蛋白質の立体構造を求める方法の開発,の2点について研究した。(1)に関しては,光プロトンポンプとして知られるバクテリオロドプシンの結晶化を試み,3種類の微結晶を得るのに成功し、目標を達成した。また、温度勾配存在下で蒸気拡散を行なう新しい蛋白質結晶化法を開発し、結晶化プロセスの迅速化...

【研究テーマ】生体物性学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1990

【研究代表者】神山 勉 理化学研究所, 生物物理研究室, 研究員 (30170210)

【キーワード】膜蛋白質 / 蛋白質の結晶化 / バクテリオロドプシン / 電子線構造解析 / プロトン輸送 (他8件)

【概要】膜蛋白質の新しい構造解析法の確立を目指して,(1)膜蛋白の結晶化技術の開発・改良,(2)3次元結晶の電子線回折像から膜蛋白質の立体構造を求める方法の開発,の2点について研究した。(1)に関しては,光プロトンポンプとして知られるバクテリオロドプシンの結晶化を試み,3種類の微結晶を得るのに成功し、目標を達成した。また、温度勾配存在下で蒸気拡散を行なう新しい蛋白質結晶化法を開発し、結晶化プロセスの迅速化...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】櫻井 実 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50162342)

【キーワード】イエロー蛋白質 / PYP / 分子動力学シミュレーション / QM / MM法 (他16件)

【概要】本研究では、光受容イエロー蛋白質の光反応過程の諸性質を計算化学的手法を用いて原子・電子レベルで明らかにした。(1)発色団を取り囲む蛋白部位の電子分極効果を明示的に考慮可能な吸収波長計算の量子化学理論を定式化し、イエロー蛋白質およびレチナール蛋白質に適用した。その結果、発色団の波長を可視光域へシフトさせる主要因の一つは、蛋白質の電子分極応答であり、活性中心での量子的過程は、蛋白質部位の電子分極により...

【研究テーマ】生体物性学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1990

【研究代表者】神山 勉 理化学研究所, 生物物理研究室, 研究員 (30170210)

【キーワード】膜蛋白質 / 蛋白質の結晶化 / バクテリオロドプシン / 電子線構造解析 / プロトン輸送 (他8件)

【概要】膜蛋白質の新しい構造解析法の確立を目指して,(1)膜蛋白の結晶化技術の開発・改良,(2)3次元結晶の電子線回折像から膜蛋白質の立体構造を求める方法の開発,の2点について研究した。(1)に関しては,光プロトンポンプとして知られるバクテリオロドプシンの結晶化を試み,3種類の微結晶を得るのに成功し、目標を達成した。また、温度勾配存在下で蒸気拡散を行なう新しい蛋白質結晶化法を開発し、結晶化プロセスの迅速化...

【研究テーマ】ナノバイオサイエンス

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】リポソーム / PURE system / ATP合成酵素 / バクテリオロドプシン / 光合成 (他15件)

【概要】人工細胞を目標として、再構築型遺伝子発現系PURE systemによるバイオシステムの構築を進めた。細胞分裂システムを、リポソーム内で合成し、変形するリポソームを作製した。ATP合成酵素とバクテリオロドプシンを、リポソーム内で発現させ、光依存的なエネルギー生産システムを構築した。リボソームの小サブユニットについては、生合成因子の存在下、生理的条件下でのアセンブリー系を構築した。大サブユニットについ...

【研究テーマ】ナノバイオサイエンス

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】リポソーム / PURE system / ATP合成酵素 / バクテリオロドプシン / 光合成 (他15件)

【概要】人工細胞を目標として、再構築型遺伝子発現系PURE systemによるバイオシステムの構築を進めた。細胞分裂システムを、リポソーム内で合成し、変形するリポソームを作製した。ATP合成酵素とバクテリオロドプシンを、リポソーム内で発現させ、光依存的なエネルギー生産システムを構築した。リボソームの小サブユニットについては、生合成因子の存在下、生理的条件下でのアセンブリー系を構築した。大サブユニットについ...

【研究テーマ】ナノバイオサイエンス

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】リポソーム / PURE system / ATP合成酵素 / バクテリオロドプシン / 光合成 (他15件)

【概要】人工細胞を目標として、再構築型遺伝子発現系PURE systemによるバイオシステムの構築を進めた。細胞分裂システムを、リポソーム内で合成し、変形するリポソームを作製した。ATP合成酵素とバクテリオロドプシンを、リポソーム内で発現させ、光依存的なエネルギー生産システムを構築した。リボソームの小サブユニットについては、生合成因子の存在下、生理的条件下でのアセンブリー系を構築した。大サブユニットについ...

【研究テーマ】応用生物化学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2014-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】バクテリオロドプシン / ＡＴＰ合成酵素 / 光合成 / ATP合成酵素 / リポソーム (他7件)

【概要】バクテリオロドプシンとFoF1-ATP合成酵素を組み込んだ（BR-FoF1）リポソームベースのバイオナノリアクターの構築が研究目的である。PURE systemによりFoF1-ATP合成酵素の全サブユニットをリポソーム上に発現させた。特に、各サブユニットの合成量が等しくなるように、ＤＮＡ量の条件検討を行った。合成されたATP合成酵素が十分な活性を有していることを見いだした。バクテリオロドプシンにつ...

【研究テーマ】ナノバイオサイエンス

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】リポソーム / PURE system / ATP合成酵素 / バクテリオロドプシン / 光合成 (他15件)

【概要】人工細胞を目標として、再構築型遺伝子発現系PURE systemによるバイオシステムの構築を進めた。細胞分裂システムを、リポソーム内で合成し、変形するリポソームを作製した。ATP合成酵素とバクテリオロドプシンを、リポソーム内で発現させ、光依存的なエネルギー生産システムを構築した。リボソームの小サブユニットについては、生合成因子の存在下、生理的条件下でのアセンブリー系を構築した。大サブユニットについ...

【研究テーマ】応用生物化学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2014-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】バクテリオロドプシン / ＡＴＰ合成酵素 / 光合成 / ATP合成酵素 / リポソーム (他7件)

【概要】バクテリオロドプシンとFoF1-ATP合成酵素を組み込んだ（BR-FoF1）リポソームベースのバイオナノリアクターの構築が研究目的である。PURE systemによりFoF1-ATP合成酵素の全サブユニットをリポソーム上に発現させた。特に、各サブユニットの合成量が等しくなるように、ＤＮＡ量の条件検討を行った。合成されたATP合成酵素が十分な活性を有していることを見いだした。バクテリオロドプシンにつ...

【研究テーマ】ナノバイオサイエンス

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】リポソーム / PURE system / ATP合成酵素 / バクテリオロドプシン / 光合成 (他15件)

【概要】人工細胞を目標として、再構築型遺伝子発現系PURE systemによるバイオシステムの構築を進めた。細胞分裂システムを、リポソーム内で合成し、変形するリポソームを作製した。ATP合成酵素とバクテリオロドプシンを、リポソーム内で発現させ、光依存的なエネルギー生産システムを構築した。リボソームの小サブユニットについては、生合成因子の存在下、生理的条件下でのアセンブリー系を構築した。大サブユニットについ...

【研究テーマ】応用生物化学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2014-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】バクテリオロドプシン / ＡＴＰ合成酵素 / 光合成 / ATP合成酵素 / リポソーム (他7件)

【概要】バクテリオロドプシンとFoF1-ATP合成酵素を組み込んだ（BR-FoF1）リポソームベースのバイオナノリアクターの構築が研究目的である。PURE systemによりFoF1-ATP合成酵素の全サブユニットをリポソーム上に発現させた。特に、各サブユニットの合成量が等しくなるように、ＤＮＡ量の条件検討を行った。合成されたATP合成酵素が十分な活性を有していることを見いだした。バクテリオロドプシンにつ...

【研究テーマ】ナノバイオサイエンス

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】リポソーム / PURE system / ATP合成酵素 / バクテリオロドプシン / 光合成 (他15件)

【概要】人工細胞を目標として、再構築型遺伝子発現系PURE systemによるバイオシステムの構築を進めた。細胞分裂システムを、リポソーム内で合成し、変形するリポソームを作製した。ATP合成酵素とバクテリオロドプシンを、リポソーム内で発現させ、光依存的なエネルギー生産システムを構築した。リボソームの小サブユニットについては、生合成因子の存在下、生理的条件下でのアセンブリー系を構築した。大サブユニットについ...

【研究テーマ】ナノバイオサイエンス

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】リポソーム / PURE system / ATP合成酵素 / バクテリオロドプシン / 光合成 (他15件)

【概要】人工細胞を目標として、再構築型遺伝子発現系PURE systemによるバイオシステムの構築を進めた。細胞分裂システムを、リポソーム内で合成し、変形するリポソームを作製した。ATP合成酵素とバクテリオロドプシンを、リポソーム内で発現させ、光依存的なエネルギー生産システムを構築した。リボソームの小サブユニットについては、生合成因子の存在下、生理的条件下でのアセンブリー系を構築した。大サブユニットについ...

【研究テーマ】生体物性学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1990

【研究代表者】神山 勉 理化学研究所, 生物物理研究室, 研究員 (30170210)

【キーワード】膜蛋白質 / 蛋白質の結晶化 / バクテリオロドプシン / 電子線構造解析 / プロトン輸送 (他8件)

【概要】膜蛋白質の新しい構造解析法の確立を目指して,(1)膜蛋白の結晶化技術の開発・改良,(2)3次元結晶の電子線回折像から膜蛋白質の立体構造を求める方法の開発,の2点について研究した。(1)に関しては,光プロトンポンプとして知られるバクテリオロドプシンの結晶化を試み,3種類の微結晶を得るのに成功し、目標を達成した。また、温度勾配存在下で蒸気拡散を行なう新しい蛋白質結晶化法を開発し、結晶化プロセスの迅速化...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】櫻井 実 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50162342)

【キーワード】イエロー蛋白質 / PYP / 分子動力学シミュレーション / QM / MM法 (他16件)

【概要】本研究では、光受容イエロー蛋白質の光反応過程の諸性質を計算化学的手法を用いて原子・電子レベルで明らかにした。(1)発色団を取り囲む蛋白部位の電子分極効果を明示的に考慮可能な吸収波長計算の量子化学理論を定式化し、イエロー蛋白質およびレチナール蛋白質に適用した。その結果、発色団の波長を可視光域へシフトさせる主要因の一つは、蛋白質の電子分極応答であり、活性中心での量子的過程は、蛋白質部位の電子分極により...

【研究テーマ】応用生物化学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2014-04-01 - 2016-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】バクテリオロドプシン / ＡＴＰ合成酵素 / 光合成 / ATP合成酵素 / リポソーム (他7件)

【概要】バクテリオロドプシンとFoF1-ATP合成酵素を組み込んだ（BR-FoF1）リポソームベースのバイオナノリアクターの構築が研究目的である。PURE systemによりFoF1-ATP合成酵素の全サブユニットをリポソーム上に発現させた。特に、各サブユニットの合成量が等しくなるように、ＤＮＡ量の条件検討を行った。合成されたATP合成酵素が十分な活性を有していることを見いだした。バクテリオロドプシンにつ...

【研究テーマ】生体物性学

【研究種目】一般研究(C)

【研究期間】1990

【研究代表者】神山 勉 理化学研究所, 生物物理研究室, 研究員 (30170210)

【キーワード】膜蛋白質 / 蛋白質の結晶化 / バクテリオロドプシン / 電子線構造解析 / プロトン輸送 (他8件)

【概要】膜蛋白質の新しい構造解析法の確立を目指して,(1)膜蛋白の結晶化技術の開発・改良,(2)3次元結晶の電子線回折像から膜蛋白質の立体構造を求める方法の開発,の2点について研究した。(1)に関しては,光プロトンポンプとして知られるバクテリオロドプシンの結晶化を試み,3種類の微結晶を得るのに成功し、目標を達成した。また、温度勾配存在下で蒸気拡散を行なう新しい蛋白質結晶化法を開発し、結晶化プロセスの迅速化...

【研究テーマ】ナノバイオサイエンス

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2016-04-01 - 2019-03-31

【研究代表者】上田 卓也 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (80184927)

【キーワード】リポソーム / PURE system / ATP合成酵素 / バクテリオロドプシン / 光合成 (他15件)

【概要】人工細胞を目標として、再構築型遺伝子発現系PURE systemによるバイオシステムの構築を進めた。細胞分裂システムを、リポソーム内で合成し、変形するリポソームを作製した。ATP合成酵素とバクテリオロドプシンを、リポソーム内で発現させ、光依存的なエネルギー生産システムを構築した。リボソームの小サブユニットについては、生合成因子の存在下、生理的条件下でのアセンブリー系を構築した。大サブユニットについ...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】櫻井 実 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50162342)

【キーワード】イエロー蛋白質 / PYP / 分子動力学シミュレーション / QM / MM法 (他16件)

【概要】本研究では、光受容イエロー蛋白質の光反応過程の諸性質を計算化学的手法を用いて原子・電子レベルで明らかにした。(1)発色団を取り囲む蛋白部位の電子分極効果を明示的に考慮可能な吸収波長計算の量子化学理論を定式化し、イエロー蛋白質およびレチナール蛋白質に適用した。その結果、発色団の波長を可視光域へシフトさせる主要因の一つは、蛋白質の電子分極応答であり、活性中心での量子的過程は、蛋白質部位の電子分極により...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2000 - 2002

【研究代表者】櫻井 実 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (50162342)

【キーワード】イエロー蛋白質 / PYP / 分子動力学シミュレーション / QM / MM法 (他16件)

【概要】本研究では、光受容イエロー蛋白質の光反応過程の諸性質を計算化学的手法を用いて原子・電子レベルで明らかにした。(1)発色団を取り囲む蛋白部位の電子分極効果を明示的に考慮可能な吸収波長計算の量子化学理論を定式化し、イエロー蛋白質およびレチナール蛋白質に適用した。その結果、発色団の波長を可視光域へシフトさせる主要因の一つは、蛋白質の電子分極応答であり、活性中心での量子的過程は、蛋白質部位の電子分極により...