【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...

【研究テーマ】生体分子化学およびその関連分野

【研究種目】挑戦的研究(萌芽)

【研究期間】2017-06-30 - 2020-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】分子クラウディング / 蛋白質ダイナミクス / 分子動力学シミュレーション / 溶液中性子散乱 / 溶液X戦散乱 (他13件)

【概要】細胞内環境は生体分子が混み合った分子クラウディング環境であり、近年、そのような環境下における蛋白質の機能は、従来用いられてきたin vitroの希薄溶液環境下のそれから大きな変調を受けることが指摘されている。分子クラウディング環境下における機能変調メカニズムを明らかにするためには、そのような環境下における蛋白質の構造揺らぎを可視化する必要が有るが、それを可能とする測定手法は存在しない。そこで、本研...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...

【研究テーマ】生体分子化学およびその関連分野

【研究種目】挑戦的研究(萌芽)

【研究期間】2017-06-30 - 2020-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】分子クラウディング / 蛋白質ダイナミクス / 分子動力学シミュレーション / 溶液中性子散乱 / 溶液X戦散乱 (他13件)

【概要】細胞内環境は生体分子が混み合った分子クラウディング環境であり、近年、そのような環境下における蛋白質の機能は、従来用いられてきたin vitroの希薄溶液環境下のそれから大きな変調を受けることが指摘されている。分子クラウディング環境下における機能変調メカニズムを明らかにするためには、そのような環境下における蛋白質の構造揺らぎを可視化する必要が有るが、それを可能とする測定手法は存在しない。そこで、本研...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2019-04-01 - 2022-03-31

【研究代表者】近藤 徹 東京工業大学, 生命理工学院, 講師 (30452204)

【キーワード】１分子分光 / 顕微分光 / 生体系の動的挙動と機能の相関 / 光合成 / タンパク質ダイナミクス (他9件)

【概要】本課題では、１分子レベルでの吸収分光解析を達成するために高感度吸収顕微鏡の開発に取り組んだ。通常１分子分光に利用される蛍光検出に比べて吸収検出は難易度が高く、当初はノイズの大きさに悩まされたが、レーザー光源の強度や偏光特性の安定化、光学系の光散乱の軽減化、光学素子の最適化、高感度光検出器の導入、光学系の温度安定化、安定除振台の導入、などの様々な工夫を施した結果、回折限界空間分解能（半波長程度）で ...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2019-04-01 - 2022-03-31

【研究代表者】近藤 徹 東京工業大学, 生命理工学院, 講師 (30452204)

【キーワード】１分子分光 / 顕微分光 / 生体系の動的挙動と機能の相関 / 光合成 / タンパク質ダイナミクス (他9件)

【概要】本課題では、１分子レベルでの吸収分光解析を達成するために高感度吸収顕微鏡の開発に取り組んだ。通常１分子分光に利用される蛍光検出に比べて吸収検出は難易度が高く、当初はノイズの大きさに悩まされたが、レーザー光源の強度や偏光特性の安定化、光学系の光散乱の軽減化、光学素子の最適化、高感度光検出器の導入、光学系の温度安定化、安定除振台の導入、などの様々な工夫を施した結果、回折限界空間分解能（半波長程度）で ...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2019-04-01 - 2022-03-31

【研究代表者】近藤 徹 東京工業大学, 生命理工学院, 講師 (30452204)

【キーワード】１分子分光 / 顕微分光 / 生体系の動的挙動と機能の相関 / 光合成 / タンパク質ダイナミクス (他9件)

【概要】本課題では、１分子レベルでの吸収分光解析を達成するために高感度吸収顕微鏡の開発に取り組んだ。通常１分子分光に利用される蛍光検出に比べて吸収検出は難易度が高く、当初はノイズの大きさに悩まされたが、レーザー光源の強度や偏光特性の安定化、光学系の光散乱の軽減化、光学素子の最適化、高感度光検出器の導入、光学系の温度安定化、安定除振台の導入、などの様々な工夫を施した結果、回折限界空間分解能（半波長程度）で ...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2022-04-01 - 2025-03-31

【研究代表者】近藤 徹 東京工業大学, 生命理工学院, 講師 (30452204)

【キーワード】１分子分光 / 超高速スペクトル分光 / 光合成光反応 / タンパク質ダイナミクス / 生体光反応のロバスト性

【概要】

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2019-04-01 - 2022-03-31

【研究代表者】近藤 徹 東京工業大学, 生命理工学院, 講師 (30452204)

【キーワード】１分子分光 / 顕微分光 / 生体系の動的挙動と機能の相関 / 光合成 / タンパク質ダイナミクス (他9件)

【概要】本課題では、１分子レベルでの吸収分光解析を達成するために高感度吸収顕微鏡の開発に取り組んだ。通常１分子分光に利用される蛍光検出に比べて吸収検出は難易度が高く、当初はノイズの大きさに悩まされたが、レーザー光源の強度や偏光特性の安定化、光学系の光散乱の軽減化、光学素子の最適化、高感度光検出器の導入、光学系の温度安定化、安定除振台の導入、などの様々な工夫を施した結果、回折限界空間分解能（半波長程度）で ...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2019-04-01 - 2022-03-31

【研究代表者】近藤 徹 東京工業大学, 生命理工学院, 講師 (30452204)

【キーワード】１分子分光 / 顕微分光 / 生体系の動的挙動と機能の相関 / 光合成 / タンパク質ダイナミクス (他9件)

【概要】本課題では、１分子レベルでの吸収分光解析を達成するために高感度吸収顕微鏡の開発に取り組んだ。通常１分子分光に利用される蛍光検出に比べて吸収検出は難易度が高く、当初はノイズの大きさに悩まされたが、レーザー光源の強度や偏光特性の安定化、光学系の光散乱の軽減化、光学素子の最適化、高感度光検出器の導入、光学系の温度安定化、安定除振台の導入、などの様々な工夫を施した結果、回折限界空間分解能（半波長程度）で ...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2019-04-01 - 2022-03-31

【研究代表者】近藤 徹 東京工業大学, 生命理工学院, 講師 (30452204)

【キーワード】１分子分光 / 顕微分光 / 生体系の動的挙動と機能の相関 / 光合成 / タンパク質ダイナミクス (他9件)

【概要】本課題では、１分子レベルでの吸収分光解析を達成するために高感度吸収顕微鏡の開発に取り組んだ。通常１分子分光に利用される蛍光検出に比べて吸収検出は難易度が高く、当初はノイズの大きさに悩まされたが、レーザー光源の強度や偏光特性の安定化、光学系の光散乱の軽減化、光学素子の最適化、高感度光検出器の導入、光学系の温度安定化、安定除振台の導入、などの様々な工夫を施した結果、回折限界空間分解能（半波長程度）で ...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2022-04-01 - 2025-03-31

【研究代表者】近藤 徹 東京工業大学, 生命理工学院, 講師 (30452204)

【キーワード】１分子分光 / 超高速スペクトル分光 / 光合成光反応 / タンパク質ダイナミクス / 生体光反応のロバスト性

【概要】

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2022-04-01 - 2025-03-31

【研究代表者】近藤 徹 東京工業大学, 生命理工学院, 講師 (30452204)

【キーワード】１分子分光 / 超高速スペクトル分光 / 光合成光反応 / タンパク質ダイナミクス / 生体光反応のロバスト性

【概要】

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2022-04-01 - 2025-03-31

【研究代表者】近藤 徹 東京工業大学, 生命理工学院, 講師 (30452204)

【キーワード】１分子分光 / 超高速スペクトル分光 / 光合成光反応 / タンパク質ダイナミクス / 生体光反応のロバスト性

【概要】

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2019-04-01 - 2022-03-31

【研究代表者】近藤 徹 東京工業大学, 生命理工学院, 講師 (30452204)

【キーワード】１分子分光 / 顕微分光 / 生体系の動的挙動と機能の相関 / 光合成 / タンパク質ダイナミクス (他9件)

【概要】本課題では、１分子レベルでの吸収分光解析を達成するために高感度吸収顕微鏡の開発に取り組んだ。通常１分子分光に利用される蛍光検出に比べて吸収検出は難易度が高く、当初はノイズの大きさに悩まされたが、レーザー光源の強度や偏光特性の安定化、光学系の光散乱の軽減化、光学素子の最適化、高感度光検出器の導入、光学系の温度安定化、安定除振台の導入、などの様々な工夫を施した結果、回折限界空間分解能（半波長程度）で ...

【研究テーマ】

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2019-04-01 - 2022-03-31

【研究代表者】近藤 徹 東京工業大学, 生命理工学院, 講師 (30452204)

【キーワード】１分子分光 / 顕微分光 / 生体系の動的挙動と機能の相関 / 光合成 / タンパク質ダイナミクス (他9件)

【概要】本課題では、１分子レベルでの吸収分光解析を達成するために高感度吸収顕微鏡の開発に取り組んだ。通常１分子分光に利用される蛍光検出に比べて吸収検出は難易度が高く、当初はノイズの大きさに悩まされたが、レーザー光源の強度や偏光特性の安定化、光学系の光散乱の軽減化、光学素子の最適化、高感度光検出器の導入、光学系の温度安定化、安定除振台の導入、などの様々な工夫を施した結果、回折限界空間分解能（半波長程度）で ...

【研究テーマ】生体分子化学およびその関連分野

【研究種目】挑戦的研究(萌芽)

【研究期間】2017-06-30 - 2020-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】分子クラウディング / 蛋白質ダイナミクス / 分子動力学シミュレーション / 溶液中性子散乱 / 溶液X戦散乱 (他13件)

【概要】細胞内環境は生体分子が混み合った分子クラウディング環境であり、近年、そのような環境下における蛋白質の機能は、従来用いられてきたin vitroの希薄溶液環境下のそれから大きな変調を受けることが指摘されている。分子クラウディング環境下における機能変調メカニズムを明らかにするためには、そのような環境下における蛋白質の構造揺らぎを可視化する必要が有るが、それを可能とする測定手法は存在しない。そこで、本研...

【研究テーマ】生体分子化学およびその関連分野

【研究種目】挑戦的研究(萌芽)

【研究期間】2017-06-30 - 2020-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】分子クラウディング / 蛋白質ダイナミクス / 分子動力学シミュレーション / 溶液中性子散乱 / 溶液X戦散乱 (他13件)

【概要】細胞内環境は生体分子が混み合った分子クラウディング環境であり、近年、そのような環境下における蛋白質の機能は、従来用いられてきたin vitroの希薄溶液環境下のそれから大きな変調を受けることが指摘されている。分子クラウディング環境下における機能変調メカニズムを明らかにするためには、そのような環境下における蛋白質の構造揺らぎを可視化する必要が有るが、それを可能とする測定手法は存在しない。そこで、本研...

【研究テーマ】生体分子化学およびその関連分野

【研究種目】挑戦的研究(萌芽)

【研究期間】2017-06-30 - 2020-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】分子クラウディング / 蛋白質ダイナミクス / 分子動力学シミュレーション / 溶液中性子散乱 / 溶液X戦散乱 (他13件)

【概要】細胞内環境は生体分子が混み合った分子クラウディング環境であり、近年、そのような環境下における蛋白質の機能は、従来用いられてきたin vitroの希薄溶液環境下のそれから大きな変調を受けることが指摘されている。分子クラウディング環境下における機能変調メカニズムを明らかにするためには、そのような環境下における蛋白質の構造揺らぎを可視化する必要が有るが、それを可能とする測定手法は存在しない。そこで、本研...

【研究テーマ】生体分子化学およびその関連分野

【研究種目】挑戦的研究(萌芽)

【研究期間】2017-06-30 - 2020-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】分子クラウディング / 蛋白質ダイナミクス / 分子動力学シミュレーション / 溶液中性子散乱 / 溶液X戦散乱 (他13件)

【概要】細胞内環境は生体分子が混み合った分子クラウディング環境であり、近年、そのような環境下における蛋白質の機能は、従来用いられてきたin vitroの希薄溶液環境下のそれから大きな変調を受けることが指摘されている。分子クラウディング環境下における機能変調メカニズムを明らかにするためには、そのような環境下における蛋白質の構造揺らぎを可視化する必要が有るが、それを可能とする測定手法は存在しない。そこで、本研...

【研究テーマ】生体分子化学およびその関連分野

【研究種目】挑戦的研究(萌芽)

【研究期間】2017-06-30 - 2020-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】分子クラウディング / 蛋白質ダイナミクス / 分子動力学シミュレーション / 溶液中性子散乱 / 溶液X戦散乱 (他13件)

【概要】細胞内環境は生体分子が混み合った分子クラウディング環境であり、近年、そのような環境下における蛋白質の機能は、従来用いられてきたin vitroの希薄溶液環境下のそれから大きな変調を受けることが指摘されている。分子クラウディング環境下における機能変調メカニズムを明らかにするためには、そのような環境下における蛋白質の構造揺らぎを可視化する必要が有るが、それを可能とする測定手法は存在しない。そこで、本研...

【研究テーマ】生体分子化学およびその関連分野

【研究種目】挑戦的研究(萌芽)

【研究期間】2017-06-30 - 2020-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】分子クラウディング / 蛋白質ダイナミクス / 分子動力学シミュレーション / 溶液中性子散乱 / 溶液X戦散乱 (他13件)

【概要】細胞内環境は生体分子が混み合った分子クラウディング環境であり、近年、そのような環境下における蛋白質の機能は、従来用いられてきたin vitroの希薄溶液環境下のそれから大きな変調を受けることが指摘されている。分子クラウディング環境下における機能変調メカニズムを明らかにするためには、そのような環境下における蛋白質の構造揺らぎを可視化する必要が有るが、それを可能とする測定手法は存在しない。そこで、本研...

【研究テーマ】生体分子化学およびその関連分野

【研究種目】挑戦的研究(萌芽)

【研究期間】2017-06-30 - 2020-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】分子クラウディング / 蛋白質ダイナミクス / 分子動力学シミュレーション / 溶液中性子散乱 / 溶液X戦散乱 (他13件)

【概要】細胞内環境は生体分子が混み合った分子クラウディング環境であり、近年、そのような環境下における蛋白質の機能は、従来用いられてきたin vitroの希薄溶液環境下のそれから大きな変調を受けることが指摘されている。分子クラウディング環境下における機能変調メカニズムを明らかにするためには、そのような環境下における蛋白質の構造揺らぎを可視化する必要が有るが、それを可能とする測定手法は存在しない。そこで、本研...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...

【研究テーマ】生体分子化学およびその関連分野

【研究種目】挑戦的研究(萌芽)

【研究期間】2017-06-30 - 2020-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】分子クラウディング / 蛋白質ダイナミクス / 分子動力学シミュレーション / 溶液中性子散乱 / 溶液X戦散乱 (他13件)

【概要】細胞内環境は生体分子が混み合った分子クラウディング環境であり、近年、そのような環境下における蛋白質の機能は、従来用いられてきたin vitroの希薄溶液環境下のそれから大きな変調を受けることが指摘されている。分子クラウディング環境下における機能変調メカニズムを明らかにするためには、そのような環境下における蛋白質の構造揺らぎを可視化する必要が有るが、それを可能とする測定手法は存在しない。そこで、本研...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...

【研究テーマ】生物物理・化学物理・ソフトマターの物理

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2017-04-01 - 2021-03-31

【研究代表者】苙口 友隆 慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 講師 (90589821)

【キーワード】生体分子 / 機能的構造変化 / 水和構造 / 溶媒和自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション (他17件)

【概要】本研究の目的は、「蛋白質の構造変化過程における水和構造の役割の解明」である。この目的のためには、蛋白質の溶液中における構造アンサンブルを可視化し、そのアンサンブルの形成におけるすわい構造の自由エネルギー寄与を明らかにする必要がある。そのために、(1)実験とMDシミュレーションの統合的手法による蛋白質構造アンサンブル可視化法の開発を行い、さらに、(2)蛋白質構造変化に伴う溶媒和自由エネルギー変化の解...