【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2002 - 2005

【研究代表者】新宅 純二郎 東京大学, 大学院・経済学研究科, 助教授 (00216219)

【キーワード】技術移転 / 特許 / リソースベース / 光ディスク / モジュール (他24件)

【概要】本研究の前半では、まず特許等の知的財産権を中心にして、技術移転プロセスに関する制度や実態の調査を行った。技術移転にはライセンシングに限らず様々なパターンがあるが、大学を中心とした技術移転、特に大学発ベンチャーには発明をビジネスとして扱う発想が乏しいことが明らかになった。今ある技術シーズよりも、広い意味での技術力やビジネス面での経営者の力量が、技術移転の成功にとって大きな鍵であることが分かってきた。...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2002 - 2005

【研究代表者】新宅 純二郎 東京大学, 大学院・経済学研究科, 助教授 (00216219)

【キーワード】技術移転 / 特許 / リソースベース / 光ディスク / モジュール (他24件)

【概要】本研究の前半では、まず特許等の知的財産権を中心にして、技術移転プロセスに関する制度や実態の調査を行った。技術移転にはライセンシングに限らず様々なパターンがあるが、大学を中心とした技術移転、特に大学発ベンチャーには発明をビジネスとして扱う発想が乏しいことが明らかになった。今ある技術シーズよりも、広い意味での技術力やビジネス面での経営者の力量が、技術移転の成功にとって大きな鍵であることが分かってきた。...

【研究テーマ】知覚情報処理・知能ロボティクス

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2006 - 2007

【研究代表者】山崎 信行 慶應大, 理工学部, 助教授 (80317338)

【キーワード】モジュール / ヒューマノイド / ロボット / 分散 / 再構成 (他8件)

【概要】近い将来、ヒューマノイドロボットがオフィスや家庭で利用されるようになるためには、ユーザの様々な要求に対応するために、多様な機能を持たなければならない。本研究では、用途に応じてユーザが手動でまたはロボットが自律的にシステムを再構成でき、開発も要素ごとに行なえる再構成可能なモジュール型ヒューマノイドロボットを提案し、その実現への基盤となる分散制御デバイス及びモジュールの研究開発を目的とする。 本年度は...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2002 - 2003

【研究代表者】馬場 靖憲 東京大学, 先端経済工学研究センター, 教授 (80238229)

【キーワード】モジュール / 設計 / 製品開発 / デジタルコンテンツ / Eラーニング (他13件)

【概要】現在、製品・サービスにかかわる諸要素をモジュール化し再利用してスケールエコノミーを実現するコスト削減型製品開発が望まれている。しかし、企業がビジネスの構成要素を技術的にモジュール化する能力を獲得しただけでは、企業競争力の獲得にはほど遠い。モジュールをどのようなビジネス・プラットフォームに配置して消費者に製品・サービスを提供するのか、ビジネスモデルが不在の場合、モジュール化は自己満足となる。企業がど...

【研究テーマ】知覚情報処理・知能ロボティクス

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2006 - 2007

【研究代表者】山崎 信行 慶應大, 理工学部, 助教授 (80317338)

【キーワード】モジュール / ヒューマノイド / ロボット / 分散 / 再構成 (他8件)

【概要】近い将来、ヒューマノイドロボットがオフィスや家庭で利用されるようになるためには、ユーザの様々な要求に対応するために、多様な機能を持たなければならない。本研究では、用途に応じてユーザが手動でまたはロボットが自律的にシステムを再構成でき、開発も要素ごとに行なえる再構成可能なモジュール型ヒューマノイドロボットを提案し、その実現への基盤となる分散制御デバイス及びモジュールの研究開発を目的とする。 本年度は...

【研究テーマ】知覚情報処理・知能ロボティクス

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2006 - 2007

【研究代表者】山崎 信行 慶應大, 理工学部, 助教授 (80317338)

【キーワード】モジュール / ヒューマノイド / ロボット / 分散 / 再構成 (他8件)

【概要】近い将来、ヒューマノイドロボットがオフィスや家庭で利用されるようになるためには、ユーザの様々な要求に対応するために、多様な機能を持たなければならない。本研究では、用途に応じてユーザが手動でまたはロボットが自律的にシステムを再構成でき、開発も要素ごとに行なえる再構成可能なモジュール型ヒューマノイドロボットを提案し、その実現への基盤となる分散制御デバイス及びモジュールの研究開発を目的とする。 本年度は...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2002 - 2003

【研究代表者】馬場 靖憲 東京大学, 先端経済工学研究センター, 教授 (80238229)

【キーワード】モジュール / 設計 / 製品開発 / デジタルコンテンツ / Eラーニング (他13件)

【概要】現在、製品・サービスにかかわる諸要素をモジュール化し再利用してスケールエコノミーを実現するコスト削減型製品開発が望まれている。しかし、企業がビジネスの構成要素を技術的にモジュール化する能力を獲得しただけでは、企業競争力の獲得にはほど遠い。モジュールをどのようなビジネス・プラットフォームに配置して消費者に製品・サービスを提供するのか、ビジネスモデルが不在の場合、モジュール化は自己満足となる。企業がど...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】立花 和則 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (60212031)

【キーワード】減数分裂 / 細胞周期 / MAPキナーゼ / Mos / 情報伝達 (他15件)

【概要】本研究では、受精のシグナルがMAPキナーゼ情報伝達系を経由してDNA複製開始につながる全経路を明らかにしようとした。そのストラテジーとしては情報のながれる上流からと下流からの両方向からこれらの接点にあたるところの分子の探索を行った。第一には情報伝達系からのシグナルの流れを下り、受精の信号を細胞周期の制御機構(この場合DNA複製の開始)を操作するためのシグナル転換装置(これをとよぶ)に迫ろうとするも...

【研究テーマ】社会心理学

【研究種目】萌芽研究

【研究期間】2005 - 2006

【研究代表者】亀田 達也 北海道大学, 大学院文学研究科, 教授 (20214554)

【キーワード】地位 / モジュール / 適応 / 進化 / 社会制御 (他7件)

【概要】本研究は人間の社会性の理解にとって重要でありながら、体系的に検討されることの少なかった「人間の集団内地位行動」に進化・生態学的観点から接近を試みる。近年の霊長類学や行動生態学の知見が示すように、霊長類は、地位構造を含む集団内の社会関係を巧みに利用しながら集団生活への適応を実現している。マキャヴェリ的知性に関する研究は、チンパンジーのオスが社会的序列を利用した複雑な同盟関係を結び、メスもまたそうした...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2002 - 2003

【研究代表者】馬場 靖憲 東京大学, 先端経済工学研究センター, 教授 (80238229)

【キーワード】モジュール / 設計 / 製品開発 / デジタルコンテンツ / Eラーニング (他13件)

【概要】現在、製品・サービスにかかわる諸要素をモジュール化し再利用してスケールエコノミーを実現するコスト削減型製品開発が望まれている。しかし、企業がビジネスの構成要素を技術的にモジュール化する能力を獲得しただけでは、企業競争力の獲得にはほど遠い。モジュールをどのようなビジネス・プラットフォームに配置して消費者に製品・サービスを提供するのか、ビジネスモデルが不在の場合、モジュール化は自己満足となる。企業がど...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2002 - 2003

【研究代表者】馬場 靖憲 東京大学, 先端経済工学研究センター, 教授 (80238229)

【キーワード】モジュール / 設計 / 製品開発 / デジタルコンテンツ / Eラーニング (他13件)

【概要】現在、製品・サービスにかかわる諸要素をモジュール化し再利用してスケールエコノミーを実現するコスト削減型製品開発が望まれている。しかし、企業がビジネスの構成要素を技術的にモジュール化する能力を獲得しただけでは、企業競争力の獲得にはほど遠い。モジュールをどのようなビジネス・プラットフォームに配置して消費者に製品・サービスを提供するのか、ビジネスモデルが不在の場合、モジュール化は自己満足となる。企業がど...

【研究テーマ】生体生命情報学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2010 - 2012

【研究代表者】澤井 哲 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (20500367)

【キーワード】生体情報 / 振動 / 適応 / 粘菌 / 入出力関係 (他11件)

【概要】複数の時間スケールで生じる適応的、振動的な細胞応答について細胞性粘菌のcAMP刺激にたいする細胞内cAMPの一過的な上昇を題材にとり、定量的な解析をおこなった。早い最初のピークが相対変化検出をおこない、絶対濃度にたいして変化した出力であり、かつ周波数応答性をもつのにたいし、後者は絶対濃度に依存すること、また前者が受容体レベルの修飾に依存するのにたいし、後者はアクチン重合を介したフィードバックによる...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】由良 敬 特殊法人日本原子力研究所, 計算科学技術推進センター, 研究員 (50252226)

【キーワード】モジュール / ゲノム配列 / 3Dキーノート / 機能予測 / シアノバクテリア (他12件)

【概要】全ゲノム配列が発表されている生物種は、100種を越えた。生体で機能している高分子は大部分がタンパク質であるため、集積されたゲノム配列にどのような機能を持ったタンパク質があるかを知る必要がある。しかし、ゲノム配列からタンパク質の機能を推定する方法はまだ確立していない。ゲノムにあるORFの約半数は機能が推定できていない。申請者は立体構造が類似であり、機能部位の詳細な構造が類似のリン酸基結合モジュールを...

【研究テーマ】日本語教育

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2000 - 2003

【研究代表者】鎌田 修 南山大学, 人文学部, 教授 (20257760)

【キーワード】接触場面 / 教材バンク / 接触場面の目録化 / 言語活動 / 族類似カテゴリー (他17件)

【概要】所期の目的を達すべく以下のように主なる活動を行ってきた。 ・2000年度 日本及び、欧州の拠点地にて基礎調査、研究集会を行った。 ・2001年度 日独ベルリンセンターにて本研究に関与する日本語教師、及び、日本語教育研究者があつまり、本プロジェクトの大枠作りを行った。 ・2002年度 日本、および、欧州の拠点地にて「接触場面」のビデオ取りとその分析を開始、また、日独ベルリンセンターに集まり、それらの...

【研究テーマ】生体生命情報学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2010 - 2012

【研究代表者】澤井 哲 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (20500367)

【キーワード】生体情報 / 振動 / 適応 / 粘菌 / 入出力関係 (他11件)

【概要】複数の時間スケールで生じる適応的、振動的な細胞応答について細胞性粘菌のcAMP刺激にたいする細胞内cAMPの一過的な上昇を題材にとり、定量的な解析をおこなった。早い最初のピークが相対変化検出をおこない、絶対濃度にたいして変化した出力であり、かつ周波数応答性をもつのにたいし、後者は絶対濃度に依存すること、また前者が受容体レベルの修飾に依存するのにたいし、後者はアクチン重合を介したフィードバックによる...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2002 - 2003

【研究代表者】馬場 靖憲 東京大学, 先端経済工学研究センター, 教授 (80238229)

【キーワード】モジュール / 設計 / 製品開発 / デジタルコンテンツ / Eラーニング (他13件)

【概要】現在、製品・サービスにかかわる諸要素をモジュール化し再利用してスケールエコノミーを実現するコスト削減型製品開発が望まれている。しかし、企業がビジネスの構成要素を技術的にモジュール化する能力を獲得しただけでは、企業競争力の獲得にはほど遠い。モジュールをどのようなビジネス・プラットフォームに配置して消費者に製品・サービスを提供するのか、ビジネスモデルが不在の場合、モジュール化は自己満足となる。企業がど...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2002 - 2005

【研究代表者】新宅 純二郎 東京大学, 大学院・経済学研究科, 助教授 (00216219)

【キーワード】技術移転 / 特許 / リソースベース / 光ディスク / モジュール (他24件)

【概要】本研究の前半では、まず特許等の知的財産権を中心にして、技術移転プロセスに関する制度や実態の調査を行った。技術移転にはライセンシングに限らず様々なパターンがあるが、大学を中心とした技術移転、特に大学発ベンチャーには発明をビジネスとして扱う発想が乏しいことが明らかになった。今ある技術シーズよりも、広い意味での技術力やビジネス面での経営者の力量が、技術移転の成功にとって大きな鍵であることが分かってきた。...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2002 - 2005

【研究代表者】新宅 純二郎 東京大学, 大学院・経済学研究科, 助教授 (00216219)

【キーワード】技術移転 / 特許 / リソースベース / 光ディスク / モジュール (他24件)

【概要】本研究の前半では、まず特許等の知的財産権を中心にして、技術移転プロセスに関する制度や実態の調査を行った。技術移転にはライセンシングに限らず様々なパターンがあるが、大学を中心とした技術移転、特に大学発ベンチャーには発明をビジネスとして扱う発想が乏しいことが明らかになった。今ある技術シーズよりも、広い意味での技術力やビジネス面での経営者の力量が、技術移転の成功にとって大きな鍵であることが分かってきた。...

【研究テーマ】科学教育

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】札野 順 東京工業大学, リベラルアーツ研究教育院, 教授 (90229089)

【キーワード】技術者倫理 / 工学教育 / 学習・教育目標 / モデル・シラバス / モジュール (他11件)

【概要】国境を越えて、国際的に通用する技術者倫理教育の学習・教育目標（22項目）を、国内外のシラバスの精査・整理、及び国内外のエキスパートを対象とするデルファイ法によるアンケート調査を実施することにより策定した。さらに、この学習・教育目標を、２領域、４カテゴリにに分類し、特に、情意領域（価値・態度）の目標の重要性を示した。 上記の学習・教育目標を達成するために、具体的に教育内容、方法、測定・評価手法等を含...

【研究テーマ】科学教育

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】札野 順 東京工業大学, リベラルアーツ研究教育院, 教授 (90229089)

【キーワード】技術者倫理 / 工学教育 / 学習・教育目標 / モデル・シラバス / モジュール (他11件)

【概要】国境を越えて、国際的に通用する技術者倫理教育の学習・教育目標（22項目）を、国内外のシラバスの精査・整理、及び国内外のエキスパートを対象とするデルファイ法によるアンケート調査を実施することにより策定した。さらに、この学習・教育目標を、２領域、４カテゴリにに分類し、特に、情意領域（価値・態度）の目標の重要性を示した。 上記の学習・教育目標を達成するために、具体的に教育内容、方法、測定・評価手法等を含...

【研究テーマ】科学教育

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】札野 順 東京工業大学, リベラルアーツ研究教育院, 教授 (90229089)

【キーワード】技術者倫理 / 工学教育 / 学習・教育目標 / モデル・シラバス / モジュール (他11件)

【概要】国境を越えて、国際的に通用する技術者倫理教育の学習・教育目標（22項目）を、国内外のシラバスの精査・整理、及び国内外のエキスパートを対象とするデルファイ法によるアンケート調査を実施することにより策定した。さらに、この学習・教育目標を、２領域、４カテゴリにに分類し、特に、情意領域（価値・態度）の目標の重要性を示した。 上記の学習・教育目標を達成するために、具体的に教育内容、方法、測定・評価手法等を含...

【研究テーマ】科学教育

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】札野 順 東京工業大学, リベラルアーツ研究教育院, 教授 (90229089)

【キーワード】技術者倫理 / 工学教育 / 学習・教育目標 / モデル・シラバス / モジュール (他11件)

【概要】国境を越えて、国際的に通用する技術者倫理教育の学習・教育目標（22項目）を、国内外のシラバスの精査・整理、及び国内外のエキスパートを対象とするデルファイ法によるアンケート調査を実施することにより策定した。さらに、この学習・教育目標を、２領域、４カテゴリにに分類し、特に、情意領域（価値・態度）の目標の重要性を示した。 上記の学習・教育目標を達成するために、具体的に教育内容、方法、測定・評価手法等を含...

【研究テーマ】科学教育

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】札野 順 東京工業大学, リベラルアーツ研究教育院, 教授 (90229089)

【キーワード】技術者倫理 / 工学教育 / 学習・教育目標 / モデル・シラバス / モジュール (他11件)

【概要】国境を越えて、国際的に通用する技術者倫理教育の学習・教育目標（22項目）を、国内外のシラバスの精査・整理、及び国内外のエキスパートを対象とするデルファイ法によるアンケート調査を実施することにより策定した。さらに、この学習・教育目標を、２領域、４カテゴリにに分類し、特に、情意領域（価値・態度）の目標の重要性を示した。 上記の学習・教育目標を達成するために、具体的に教育内容、方法、測定・評価手法等を含...

【研究テーマ】科学教育

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】札野 順 東京工業大学, リベラルアーツ研究教育院, 教授 (90229089)

【キーワード】技術者倫理 / 工学教育 / 学習・教育目標 / モデル・シラバス / モジュール (他11件)

【概要】国境を越えて、国際的に通用する技術者倫理教育の学習・教育目標（22項目）を、国内外のシラバスの精査・整理、及び国内外のエキスパートを対象とするデルファイ法によるアンケート調査を実施することにより策定した。さらに、この学習・教育目標を、２領域、４カテゴリにに分類し、特に、情意領域（価値・態度）の目標の重要性を示した。 上記の学習・教育目標を達成するために、具体的に教育内容、方法、測定・評価手法等を含...

【研究テーマ】日本語教育

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2000 - 2003

【研究代表者】鎌田 修 南山大学, 人文学部, 教授 (20257760)

【キーワード】接触場面 / 教材バンク / 接触場面の目録化 / 言語活動 / 族類似カテゴリー (他17件)

【概要】所期の目的を達すべく以下のように主なる活動を行ってきた。 ・2000年度 日本及び、欧州の拠点地にて基礎調査、研究集会を行った。 ・2001年度 日独ベルリンセンターにて本研究に関与する日本語教師、及び、日本語教育研究者があつまり、本プロジェクトの大枠作りを行った。 ・2002年度 日本、および、欧州の拠点地にて「接触場面」のビデオ取りとその分析を開始、また、日独ベルリンセンターに集まり、それらの...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2002 - 2005

【研究代表者】新宅 純二郎 東京大学, 大学院・経済学研究科, 助教授 (00216219)

【キーワード】技術移転 / 特許 / リソースベース / 光ディスク / モジュール (他24件)

【概要】本研究の前半では、まず特許等の知的財産権を中心にして、技術移転プロセスに関する制度や実態の調査を行った。技術移転にはライセンシングに限らず様々なパターンがあるが、大学を中心とした技術移転、特に大学発ベンチャーには発明をビジネスとして扱う発想が乏しいことが明らかになった。今ある技術シーズよりも、広い意味での技術力やビジネス面での経営者の力量が、技術移転の成功にとって大きな鍵であることが分かってきた。...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】1996 - 1997

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】蛋白質可溶化 / バルナーゼ / ミニ蛋白質 / 逆転写酵素 / アミノ酸置換 (他8件)

【概要】巨大な蛋白質や複合蛋白質の機能構造を知るために、(1)蛋白質の部分構造を安定に切り出す手法と、(2)その部分構造を可溶化させる方法が要求されており、これらの手法の確立が必要である。蛋白質の部分構造を切り出して可溶化させるためのデザイン手法を開発すること、さらにデザインされた部分構造が可溶であり安定な構造を形成することを検証することを目的に研究を行った。生物進化の過程では、ドメインやモジュールの融合...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】由良 敬 特殊法人日本原子力研究所, 計算科学技術推進センター, 研究員 (50252226)

【キーワード】モジュール / ゲノム配列 / 3Dキーノート / 機能予測 / シアノバクテリア (他12件)

【概要】全ゲノム配列が発表されている生物種は、100種を越えた。生体で機能している高分子は大部分がタンパク質であるため、集積されたゲノム配列にどのような機能を持ったタンパク質があるかを知る必要がある。しかし、ゲノム配列からタンパク質の機能を推定する方法はまだ確立していない。ゲノムにあるORFの約半数は機能が推定できていない。申請者は立体構造が類似であり、機能部位の詳細な構造が類似のリン酸基結合モジュールを...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2002 - 2005

【研究代表者】新宅 純二郎 東京大学, 大学院・経済学研究科, 助教授 (00216219)

【キーワード】技術移転 / 特許 / リソースベース / 光ディスク / モジュール (他24件)

【概要】本研究の前半では、まず特許等の知的財産権を中心にして、技術移転プロセスに関する制度や実態の調査を行った。技術移転にはライセンシングに限らず様々なパターンがあるが、大学を中心とした技術移転、特に大学発ベンチャーには発明をビジネスとして扱う発想が乏しいことが明らかになった。今ある技術シーズよりも、広い意味での技術力やビジネス面での経営者の力量が、技術移転の成功にとって大きな鍵であることが分かってきた。...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1997 - 1998

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / ヘリックス・ターン・ヘリックス / リン酸基結合 / DNAポリメラーゼβ / 434Cro (他15件)

【概要】転写因子において塩基認識部位には共通の立体構造が存在することが知られている。それでは、これらのタンパク質のリン酸基結合部位には共通の構造が存在するのであろうか。タンパク質-DNA複合体のモジュール構造を調べたところ、DNAのリン酸基にのみ結合するモジュールが存在することがわかった。リン酸基結合モジュールを比較した結果、原核生物と真核生物の転写因子及びポリメラーゼの4つのタンパク質に、類似の立体構造...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】1996 - 1997

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】蛋白質可溶化 / バルナーゼ / ミニ蛋白質 / 逆転写酵素 / アミノ酸置換 (他8件)

【概要】巨大な蛋白質や複合蛋白質の機能構造を知るために、(1)蛋白質の部分構造を安定に切り出す手法と、(2)その部分構造を可溶化させる方法が要求されており、これらの手法の確立が必要である。蛋白質の部分構造を切り出して可溶化させるためのデザイン手法を開発すること、さらにデザインされた部分構造が可溶であり安定な構造を形成することを検証することを目的に研究を行った。生物進化の過程では、ドメインやモジュールの融合...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】1996 - 1997

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】蛋白質可溶化 / バルナーゼ / ミニ蛋白質 / 逆転写酵素 / アミノ酸置換 (他8件)

【概要】巨大な蛋白質や複合蛋白質の機能構造を知るために、(1)蛋白質の部分構造を安定に切り出す手法と、(2)その部分構造を可溶化させる方法が要求されており、これらの手法の確立が必要である。蛋白質の部分構造を切り出して可溶化させるためのデザイン手法を開発すること、さらにデザインされた部分構造が可溶であり安定な構造を形成することを検証することを目的に研究を行った。生物進化の過程では、ドメインやモジュールの融合...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2002 - 2005

【研究代表者】新宅 純二郎 東京大学, 大学院・経済学研究科, 助教授 (00216219)

【キーワード】技術移転 / 特許 / リソースベース / 光ディスク / モジュール (他24件)

【概要】本研究の前半では、まず特許等の知的財産権を中心にして、技術移転プロセスに関する制度や実態の調査を行った。技術移転にはライセンシングに限らず様々なパターンがあるが、大学を中心とした技術移転、特に大学発ベンチャーには発明をビジネスとして扱う発想が乏しいことが明らかになった。今ある技術シーズよりも、広い意味での技術力やビジネス面での経営者の力量が、技術移転の成功にとって大きな鍵であることが分かってきた。...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2002 - 2005

【研究代表者】新宅 純二郎 東京大学, 大学院・経済学研究科, 助教授 (00216219)

【キーワード】技術移転 / 特許 / リソースベース / 光ディスク / モジュール (他24件)

【概要】本研究の前半では、まず特許等の知的財産権を中心にして、技術移転プロセスに関する制度や実態の調査を行った。技術移転にはライセンシングに限らず様々なパターンがあるが、大学を中心とした技術移転、特に大学発ベンチャーには発明をビジネスとして扱う発想が乏しいことが明らかになった。今ある技術シーズよりも、広い意味での技術力やビジネス面での経営者の力量が、技術移転の成功にとって大きな鍵であることが分かってきた。...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】1996 - 1997

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】蛋白質可溶化 / バルナーゼ / ミニ蛋白質 / 逆転写酵素 / アミノ酸置換 (他8件)

【概要】巨大な蛋白質や複合蛋白質の機能構造を知るために、(1)蛋白質の部分構造を安定に切り出す手法と、(2)その部分構造を可溶化させる方法が要求されており、これらの手法の確立が必要である。蛋白質の部分構造を切り出して可溶化させるためのデザイン手法を開発すること、さらにデザインされた部分構造が可溶であり安定な構造を形成することを検証することを目的に研究を行った。生物進化の過程では、ドメインやモジュールの融合...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2002 - 2003

【研究代表者】馬場 靖憲 東京大学, 先端経済工学研究センター, 教授 (80238229)

【キーワード】モジュール / 設計 / 製品開発 / デジタルコンテンツ / Eラーニング (他13件)

【概要】現在、製品・サービスにかかわる諸要素をモジュール化し再利用してスケールエコノミーを実現するコスト削減型製品開発が望まれている。しかし、企業がビジネスの構成要素を技術的にモジュール化する能力を獲得しただけでは、企業競争力の獲得にはほど遠い。モジュールをどのようなビジネス・プラットフォームに配置して消費者に製品・サービスを提供するのか、ビジネスモデルが不在の場合、モジュール化は自己満足となる。企業がど...

【研究テーマ】科学教育

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】札野 順 東京工業大学, リベラルアーツ研究教育院, 教授 (90229089)

【キーワード】技術者倫理 / 工学教育 / 学習・教育目標 / モデル・シラバス / モジュール (他11件)

【概要】国境を越えて、国際的に通用する技術者倫理教育の学習・教育目標（22項目）を、国内外のシラバスの精査・整理、及び国内外のエキスパートを対象とするデルファイ法によるアンケート調査を実施することにより策定した。さらに、この学習・教育目標を、２領域、４カテゴリにに分類し、特に、情意領域（価値・態度）の目標の重要性を示した。 上記の学習・教育目標を達成するために、具体的に教育内容、方法、測定・評価手法等を含...

【研究テーマ】科学教育

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】札野 順 東京工業大学, リベラルアーツ研究教育院, 教授 (90229089)

【キーワード】技術者倫理 / 工学教育 / 学習・教育目標 / モデル・シラバス / モジュール (他11件)

【概要】国境を越えて、国際的に通用する技術者倫理教育の学習・教育目標（22項目）を、国内外のシラバスの精査・整理、及び国内外のエキスパートを対象とするデルファイ法によるアンケート調査を実施することにより策定した。さらに、この学習・教育目標を、２領域、４カテゴリにに分類し、特に、情意領域（価値・態度）の目標の重要性を示した。 上記の学習・教育目標を達成するために、具体的に教育内容、方法、測定・評価手法等を含...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】1996 - 1997

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】蛋白質可溶化 / バルナーゼ / ミニ蛋白質 / 逆転写酵素 / アミノ酸置換 (他8件)

【概要】巨大な蛋白質や複合蛋白質の機能構造を知るために、(1)蛋白質の部分構造を安定に切り出す手法と、(2)その部分構造を可溶化させる方法が要求されており、これらの手法の確立が必要である。蛋白質の部分構造を切り出して可溶化させるためのデザイン手法を開発すること、さらにデザインされた部分構造が可溶であり安定な構造を形成することを検証することを目的に研究を行った。生物進化の過程では、ドメインやモジュールの融合...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】科学教育

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】札野 順 東京工業大学, リベラルアーツ研究教育院, 教授 (90229089)

【キーワード】技術者倫理 / 工学教育 / 学習・教育目標 / モデル・シラバス / モジュール (他11件)

【概要】国境を越えて、国際的に通用する技術者倫理教育の学習・教育目標（22項目）を、国内外のシラバスの精査・整理、及び国内外のエキスパートを対象とするデルファイ法によるアンケート調査を実施することにより策定した。さらに、この学習・教育目標を、２領域、４カテゴリにに分類し、特に、情意領域（価値・態度）の目標の重要性を示した。 上記の学習・教育目標を達成するために、具体的に教育内容、方法、測定・評価手法等を含...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】若杉 桂輔 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教授 (20322167)

【キーワード】蛋白質工学 / シグナル伝達 / 酸化ストレス / 細胞死 / 人工制御 (他15件)

【概要】1.トリプトファニルtRNA合成酵素(TrpRS)の酸化ストレス下での新規機能の解明 TrpRSは、tRNAにトリプトファンを結合させる反応(アミノアシル化)を触媒する酵素である。今回、ヒトのTrpRSの新規機能を探索したところ、酸化ストレス下で、ある有機化合物と複合体を形成することを発見した。現在、部位特異的アミノ酸置換体を作製し、分子レベルでの制御メカニズム、及び、生理機能の解明を目指している...

【研究テーマ】日本語教育

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2000 - 2003

【研究代表者】鎌田 修 南山大学, 人文学部, 教授 (20257760)

【キーワード】接触場面 / 教材バンク / 接触場面の目録化 / 言語活動 / 族類似カテゴリー (他17件)

【概要】所期の目的を達すべく以下のように主なる活動を行ってきた。 ・2000年度 日本及び、欧州の拠点地にて基礎調査、研究集会を行った。 ・2001年度 日独ベルリンセンターにて本研究に関与する日本語教師、及び、日本語教育研究者があつまり、本プロジェクトの大枠作りを行った。 ・2002年度 日本、および、欧州の拠点地にて「接触場面」のビデオ取りとその分析を開始、また、日独ベルリンセンターに集まり、それらの...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】由良 敬 特殊法人日本原子力研究所, 計算科学技術推進センター, 研究員 (50252226)

【キーワード】モジュール / ゲノム配列 / 3Dキーノート / 機能予測 / シアノバクテリア (他12件)

【概要】全ゲノム配列が発表されている生物種は、100種を越えた。生体で機能している高分子は大部分がタンパク質であるため、集積されたゲノム配列にどのような機能を持ったタンパク質があるかを知る必要がある。しかし、ゲノム配列からタンパク質の機能を推定する方法はまだ確立していない。ゲノムにあるORFの約半数は機能が推定できていない。申請者は立体構造が類似であり、機能部位の詳細な構造が類似のリン酸基結合モジュールを...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1999 - 2000

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / 金属イオン / 亜鉛 / マグネシウム / カルシウム (他7件)

【概要】本年度は、立体構造が判明しているタンパク質で数多く見られるすべての金属イオン、カルシウム、マグネシウム及び亜鉛イオンにおいて、それぞれのイオンがいくつのモジュールに配位するのか、及びそれぞれのイオンの配位部位に類似のモジュールが存在するのかを調べた。タンパク質における金属イオン配位子の今までの研究では、タンパク質における金属イオンの配位子は、アミノ酸配列上全体に散らばっていると考えられていた。しか...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1997 - 1998

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / ヘリックス・ターン・ヘリックス / リン酸基結合 / DNAポリメラーゼβ / 434Cro (他15件)

【概要】転写因子において塩基認識部位には共通の立体構造が存在することが知られている。それでは、これらのタンパク質のリン酸基結合部位には共通の構造が存在するのであろうか。タンパク質-DNA複合体のモジュール構造を調べたところ、DNAのリン酸基にのみ結合するモジュールが存在することがわかった。リン酸基結合モジュールを比較した結果、原核生物と真核生物の転写因子及びポリメラーゼの4つのタンパク質に、類似の立体構造...

【研究テーマ】日本語教育

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2000 - 2003

【研究代表者】鎌田 修 南山大学, 人文学部, 教授 (20257760)

【キーワード】接触場面 / 教材バンク / 接触場面の目録化 / 言語活動 / 族類似カテゴリー (他17件)

【概要】所期の目的を達すべく以下のように主なる活動を行ってきた。 ・2000年度 日本及び、欧州の拠点地にて基礎調査、研究集会を行った。 ・2001年度 日独ベルリンセンターにて本研究に関与する日本語教師、及び、日本語教育研究者があつまり、本プロジェクトの大枠作りを行った。 ・2002年度 日本、および、欧州の拠点地にて「接触場面」のビデオ取りとその分析を開始、また、日独ベルリンセンターに集まり、それらの...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】若杉 桂輔 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教授 (20322167)

【キーワード】蛋白質工学 / シグナル伝達 / 酸化ストレス / 細胞死 / 人工制御 (他15件)

【概要】1.トリプトファニルtRNA合成酵素(TrpRS)の酸化ストレス下での新規機能の解明 TrpRSは、tRNAにトリプトファンを結合させる反応(アミノアシル化)を触媒する酵素である。今回、ヒトのTrpRSの新規機能を探索したところ、酸化ストレス下で、ある有機化合物と複合体を形成することを発見した。現在、部位特異的アミノ酸置換体を作製し、分子レベルでの制御メカニズム、及び、生理機能の解明を目指している...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】若杉 桂輔 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教授 (20322167)

【キーワード】蛋白質工学 / シグナル伝達 / 酸化ストレス / 細胞死 / 人工制御 (他15件)

【概要】1.トリプトファニルtRNA合成酵素(TrpRS)の酸化ストレス下での新規機能の解明 TrpRSは、tRNAにトリプトファンを結合させる反応(アミノアシル化)を触媒する酵素である。今回、ヒトのTrpRSの新規機能を探索したところ、酸化ストレス下で、ある有機化合物と複合体を形成することを発見した。現在、部位特異的アミノ酸置換体を作製し、分子レベルでの制御メカニズム、及び、生理機能の解明を目指している...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】若杉 桂輔 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教授 (20322167)

【キーワード】蛋白質工学 / シグナル伝達 / 酸化ストレス / 細胞死 / 人工制御 (他15件)

【概要】1.トリプトファニルtRNA合成酵素(TrpRS)の酸化ストレス下での新規機能の解明 TrpRSは、tRNAにトリプトファンを結合させる反応(アミノアシル化)を触媒する酵素である。今回、ヒトのTrpRSの新規機能を探索したところ、酸化ストレス下で、ある有機化合物と複合体を形成することを発見した。現在、部位特異的アミノ酸置換体を作製し、分子レベルでの制御メカニズム、及び、生理機能の解明を目指している...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】若杉 桂輔 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教授 (20322167)

【キーワード】蛋白質工学 / シグナル伝達 / 酸化ストレス / 細胞死 / 人工制御 (他15件)

【概要】1.トリプトファニルtRNA合成酵素(TrpRS)の酸化ストレス下での新規機能の解明 TrpRSは、tRNAにトリプトファンを結合させる反応(アミノアシル化)を触媒する酵素である。今回、ヒトのTrpRSの新規機能を探索したところ、酸化ストレス下で、ある有機化合物と複合体を形成することを発見した。現在、部位特異的アミノ酸置換体を作製し、分子レベルでの制御メカニズム、及び、生理機能の解明を目指している...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2006 - 2009

【研究代表者】郷 通子 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 特別客員教授 (70037290)

【キーワード】タンパク質立体構造 / 選択的スプライシング / ホモロジーモデリング / データベース / RNA編集 (他12件)

【概要】ゲノムにコードされている遺伝子の数は予想よりも少なく、遺伝子の転写後に起きる選択的スプライシングによって、ひとつの遺伝子から複数個の転写産物ができることが明らかになっている。ひとつの遺伝子由来の複数のタンパク質にどのような構造の違いがあり、どのように機能が変化しているのかを実験的に調べることは困難である。そこでタンパク質の構造と機能の変化を計算生物学の手法で推定できるようにした。選択的スプライシン...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1994

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 理学部, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / シトクロムP-450cam / Camリプレッサー / カンファー / 転写制御因子 (他7件)

【概要】転写制御因子に結合する分子が、制御されている遺伝子のコードしている蛋白質の基質である場合、両蛋白質における分子結合部分に共通のモジュールが用いられていないだろうか。以上の問題に答えることを目的として、転写制御因子であるCamリプレッサー(CamR)と、制御されている蛋白質、シトクロムP-450cam(P-450cam)のアミノ酸配列をモジュール単位で比較した。CamRはDNAに結合し、カムオペロン...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1997 - 1998

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / ヘリックス・ターン・ヘリックス / リン酸基結合 / DNAポリメラーゼβ / 434Cro (他15件)

【概要】転写因子において塩基認識部位には共通の立体構造が存在することが知られている。それでは、これらのタンパク質のリン酸基結合部位には共通の構造が存在するのであろうか。タンパク質-DNA複合体のモジュール構造を調べたところ、DNAのリン酸基にのみ結合するモジュールが存在することがわかった。リン酸基結合モジュールを比較した結果、原核生物と真核生物の転写因子及びポリメラーゼの4つのタンパク質に、類似の立体構造...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1996

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / リン酸基結合モジュール / HTHモジュール / 塩基認識モジュール / 434Cro (他8件)

【概要】DNAに結合するタンパク質の塩基認識部位には共通の部分構造が用いられている場合が多い。それではリン酸基と結合する部分にも、共通の構造が存在しないだろうか。本研究は、DNA結合タンパク質のリン酸基結合部位に共通のモジュールが存在するかを明らかにすることを目的に行われた。モジュールとはコンパクトな構造をもつタンパク質の構造単位である。イントロンの位置とモジュールの境界の相関より進化の単位でもあると考え...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1997 - 1998

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / ヘリックス・ターン・ヘリックス / リン酸基結合 / DNAポリメラーゼβ / 434Cro (他15件)

【概要】転写因子において塩基認識部位には共通の立体構造が存在することが知られている。それでは、これらのタンパク質のリン酸基結合部位には共通の構造が存在するのであろうか。タンパク質-DNA複合体のモジュール構造を調べたところ、DNAのリン酸基にのみ結合するモジュールが存在することがわかった。リン酸基結合モジュールを比較した結果、原核生物と真核生物の転写因子及びポリメラーゼの4つのタンパク質に、類似の立体構造...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1996

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / リン酸基結合モジュール / HTHモジュール / 塩基認識モジュール / 434Cro (他8件)

【概要】DNAに結合するタンパク質の塩基認識部位には共通の部分構造が用いられている場合が多い。それではリン酸基と結合する部分にも、共通の構造が存在しないだろうか。本研究は、DNA結合タンパク質のリン酸基結合部位に共通のモジュールが存在するかを明らかにすることを目的に行われた。モジュールとはコンパクトな構造をもつタンパク質の構造単位である。イントロンの位置とモジュールの境界の相関より進化の単位でもあると考え...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1996 - 1998

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / イントロンの起源 / キシラナーゼ (他13件)

【概要】立体構造既知の蛋白質のすべてをモジュールに分解し、モジュール境界と遺伝子上のイントロンの位置との対応を統計的に調べ、モジュール境界とイントロンの対応がタンパク質に普遍的に成り立つ事実であることを明らかにすることが本研究の目的であった。 本研究で完成したモジュール全自動同定法を使って、立体構造が既知であって原子座標が公開されているすべてのタンパク質をモジュールに分類した。最終的に50を越える多数のタ...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1996 - 1998

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / イントロンの起源 / キシラナーゼ (他13件)

【概要】立体構造既知の蛋白質のすべてをモジュールに分解し、モジュール境界と遺伝子上のイントロンの位置との対応を統計的に調べ、モジュール境界とイントロンの対応がタンパク質に普遍的に成り立つ事実であることを明らかにすることが本研究の目的であった。 本研究で完成したモジュール全自動同定法を使って、立体構造が既知であって原子座標が公開されているすべてのタンパク質をモジュールに分類した。最終的に50を越える多数のタ...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】一般研究(B)

【研究期間】1994 - 1995

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 理学部, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / タンパク質立体構造 / 機能部品 (他12件)

【概要】イントロンはタンパク質の部品「モジュール」の境界によく対応していることから、分子進化において、モジュールが「かき混ぜられた」基本構造部品であることが明らかになってきた。本研究の目的はモジュールを分類し、機能の異なるタンパク質間の共有されるモジュールを明らかにすることであった。本研究の成果はモジュールを分類できる見通しが得られ、すでにモジュールの一部分がカタログ化できたことである。モジュール図鑑の電...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1996

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / リン酸基結合モジュール / HTHモジュール / 塩基認識モジュール / 434Cro (他8件)

【概要】DNAに結合するタンパク質の塩基認識部位には共通の部分構造が用いられている場合が多い。それではリン酸基と結合する部分にも、共通の構造が存在しないだろうか。本研究は、DNA結合タンパク質のリン酸基結合部位に共通のモジュールが存在するかを明らかにすることを目的に行われた。モジュールとはコンパクトな構造をもつタンパク質の構造単位である。イントロンの位置とモジュールの境界の相関より進化の単位でもあると考え...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1997 - 1998

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / ヘリックス・ターン・ヘリックス / リン酸基結合 / DNAポリメラーゼβ / 434Cro (他15件)

【概要】転写因子において塩基認識部位には共通の立体構造が存在することが知られている。それでは、これらのタンパク質のリン酸基結合部位には共通の構造が存在するのであろうか。タンパク質-DNA複合体のモジュール構造を調べたところ、DNAのリン酸基にのみ結合するモジュールが存在することがわかった。リン酸基結合モジュールを比較した結果、原核生物と真核生物の転写因子及びポリメラーゼの4つのタンパク質に、類似の立体構造...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1996 - 1998

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / イントロンの起源 / キシラナーゼ (他13件)

【概要】立体構造既知の蛋白質のすべてをモジュールに分解し、モジュール境界と遺伝子上のイントロンの位置との対応を統計的に調べ、モジュール境界とイントロンの対応がタンパク質に普遍的に成り立つ事実であることを明らかにすることが本研究の目的であった。 本研究で完成したモジュール全自動同定法を使って、立体構造が既知であって原子座標が公開されているすべてのタンパク質をモジュールに分類した。最終的に50を越える多数のタ...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】由良 敬 特殊法人日本原子力研究所, 計算科学技術推進センター, 研究員 (50252226)

【キーワード】モジュール / ゲノム配列 / 3Dキーノート / 機能予測 / シアノバクテリア (他12件)

【概要】全ゲノム配列が発表されている生物種は、100種を越えた。生体で機能している高分子は大部分がタンパク質であるため、集積されたゲノム配列にどのような機能を持ったタンパク質があるかを知る必要がある。しかし、ゲノム配列からタンパク質の機能を推定する方法はまだ確立していない。ゲノムにあるORFの約半数は機能が推定できていない。申請者は立体構造が類似であり、機能部位の詳細な構造が類似のリン酸基結合モジュールを...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】一般研究(B)

【研究期間】1994 - 1995

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 理学部, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / タンパク質立体構造 / 機能部品 (他12件)

【概要】イントロンはタンパク質の部品「モジュール」の境界によく対応していることから、分子進化において、モジュールが「かき混ぜられた」基本構造部品であることが明らかになってきた。本研究の目的はモジュールを分類し、機能の異なるタンパク質間の共有されるモジュールを明らかにすることであった。本研究の成果はモジュールを分類できる見通しが得られ、すでにモジュールの一部分がカタログ化できたことである。モジュール図鑑の電...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1996 - 1998

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / イントロンの起源 / キシラナーゼ (他13件)

【概要】立体構造既知の蛋白質のすべてをモジュールに分解し、モジュール境界と遺伝子上のイントロンの位置との対応を統計的に調べ、モジュール境界とイントロンの対応がタンパク質に普遍的に成り立つ事実であることを明らかにすることが本研究の目的であった。 本研究で完成したモジュール全自動同定法を使って、立体構造が既知であって原子座標が公開されているすべてのタンパク質をモジュールに分類した。最終的に50を越える多数のタ...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】一般研究(B)

【研究期間】1994 - 1995

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 理学部, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / タンパク質立体構造 / 機能部品 (他12件)

【概要】イントロンはタンパク質の部品「モジュール」の境界によく対応していることから、分子進化において、モジュールが「かき混ぜられた」基本構造部品であることが明らかになってきた。本研究の目的はモジュールを分類し、機能の異なるタンパク質間の共有されるモジュールを明らかにすることであった。本研究の成果はモジュールを分類できる見通しが得られ、すでにモジュールの一部分がカタログ化できたことである。モジュール図鑑の電...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1996 - 1998

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / イントロンの起源 / キシラナーゼ (他13件)

【概要】立体構造既知の蛋白質のすべてをモジュールに分解し、モジュール境界と遺伝子上のイントロンの位置との対応を統計的に調べ、モジュール境界とイントロンの対応がタンパク質に普遍的に成り立つ事実であることを明らかにすることが本研究の目的であった。 本研究で完成したモジュール全自動同定法を使って、立体構造が既知であって原子座標が公開されているすべてのタンパク質をモジュールに分類した。最終的に50を越える多数のタ...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1994

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 理学部, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / シトクロムP-450cam / Camリプレッサー / カンファー / 転写制御因子 (他7件)

【概要】転写制御因子に結合する分子が、制御されている遺伝子のコードしている蛋白質の基質である場合、両蛋白質における分子結合部分に共通のモジュールが用いられていないだろうか。以上の問題に答えることを目的として、転写制御因子であるCamリプレッサー(CamR)と、制御されている蛋白質、シトクロムP-450cam(P-450cam)のアミノ酸配列をモジュール単位で比較した。CamRはDNAに結合し、カムオペロン...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1997 - 1998

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / ヘリックス・ターン・ヘリックス / リン酸基結合 / DNAポリメラーゼβ / 434Cro (他15件)

【概要】転写因子において塩基認識部位には共通の立体構造が存在することが知られている。それでは、これらのタンパク質のリン酸基結合部位には共通の構造が存在するのであろうか。タンパク質-DNA複合体のモジュール構造を調べたところ、DNAのリン酸基にのみ結合するモジュールが存在することがわかった。リン酸基結合モジュールを比較した結果、原核生物と真核生物の転写因子及びポリメラーゼの4つのタンパク質に、類似の立体構造...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】一般研究(B)

【研究期間】1994 - 1995

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 理学部, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / タンパク質立体構造 / 機能部品 (他12件)

【概要】イントロンはタンパク質の部品「モジュール」の境界によく対応していることから、分子進化において、モジュールが「かき混ぜられた」基本構造部品であることが明らかになってきた。本研究の目的はモジュールを分類し、機能の異なるタンパク質間の共有されるモジュールを明らかにすることであった。本研究の成果はモジュールを分類できる見通しが得られ、すでにモジュールの一部分がカタログ化できたことである。モジュール図鑑の電...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2006 - 2009

【研究代表者】郷 通子 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 特別客員教授 (70037290)

【キーワード】タンパク質立体構造 / 選択的スプライシング / ホモロジーモデリング / データベース / RNA編集 (他12件)

【概要】ゲノムにコードされている遺伝子の数は予想よりも少なく、遺伝子の転写後に起きる選択的スプライシングによって、ひとつの遺伝子から複数個の転写産物ができることが明らかになっている。ひとつの遺伝子由来の複数のタンパク質にどのような構造の違いがあり、どのように機能が変化しているのかを実験的に調べることは困難である。そこでタンパク質の構造と機能の変化を計算生物学の手法で推定できるようにした。選択的スプライシン...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】由良 敬 特殊法人日本原子力研究所, 計算科学技術推進センター, 研究員 (50252226)

【キーワード】モジュール / ゲノム配列 / 3Dキーノート / 機能予測 / シアノバクテリア (他12件)

【概要】全ゲノム配列が発表されている生物種は、100種を越えた。生体で機能している高分子は大部分がタンパク質であるため、集積されたゲノム配列にどのような機能を持ったタンパク質があるかを知る必要がある。しかし、ゲノム配列からタンパク質の機能を推定する方法はまだ確立していない。ゲノムにあるORFの約半数は機能が推定できていない。申請者は立体構造が類似であり、機能部位の詳細な構造が類似のリン酸基結合モジュールを...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1996 - 1998

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / イントロンの起源 / キシラナーゼ (他13件)

【概要】立体構造既知の蛋白質のすべてをモジュールに分解し、モジュール境界と遺伝子上のイントロンの位置との対応を統計的に調べ、モジュール境界とイントロンの対応がタンパク質に普遍的に成り立つ事実であることを明らかにすることが本研究の目的であった。 本研究で完成したモジュール全自動同定法を使って、立体構造が既知であって原子座標が公開されているすべてのタンパク質をモジュールに分類した。最終的に50を越える多数のタ...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1996

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / リン酸基結合モジュール / HTHモジュール / 塩基認識モジュール / 434Cro (他8件)

【概要】DNAに結合するタンパク質の塩基認識部位には共通の部分構造が用いられている場合が多い。それではリン酸基と結合する部分にも、共通の構造が存在しないだろうか。本研究は、DNA結合タンパク質のリン酸基結合部位に共通のモジュールが存在するかを明らかにすることを目的に行われた。モジュールとはコンパクトな構造をもつタンパク質の構造単位である。イントロンの位置とモジュールの境界の相関より進化の単位でもあると考え...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2006 - 2009

【研究代表者】郷 通子 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 特別客員教授 (70037290)

【キーワード】タンパク質立体構造 / 選択的スプライシング / ホモロジーモデリング / データベース / RNA編集 (他12件)

【概要】ゲノムにコードされている遺伝子の数は予想よりも少なく、遺伝子の転写後に起きる選択的スプライシングによって、ひとつの遺伝子から複数個の転写産物ができることが明らかになっている。ひとつの遺伝子由来の複数のタンパク質にどのような構造の違いがあり、どのように機能が変化しているのかを実験的に調べることは困難である。そこでタンパク質の構造と機能の変化を計算生物学の手法で推定できるようにした。選択的スプライシン...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1997 - 1998

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / ヘリックス・ターン・ヘリックス / リン酸基結合 / DNAポリメラーゼβ / 434Cro (他15件)

【概要】転写因子において塩基認識部位には共通の立体構造が存在することが知られている。それでは、これらのタンパク質のリン酸基結合部位には共通の構造が存在するのであろうか。タンパク質-DNA複合体のモジュール構造を調べたところ、DNAのリン酸基にのみ結合するモジュールが存在することがわかった。リン酸基結合モジュールを比較した結果、原核生物と真核生物の転写因子及びポリメラーゼの4つのタンパク質に、類似の立体構造...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1996

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / リン酸基結合モジュール / HTHモジュール / 塩基認識モジュール / 434Cro (他8件)

【概要】DNAに結合するタンパク質の塩基認識部位には共通の部分構造が用いられている場合が多い。それではリン酸基と結合する部分にも、共通の構造が存在しないだろうか。本研究は、DNA結合タンパク質のリン酸基結合部位に共通のモジュールが存在するかを明らかにすることを目的に行われた。モジュールとはコンパクトな構造をもつタンパク質の構造単位である。イントロンの位置とモジュールの境界の相関より進化の単位でもあると考え...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1997 - 1998

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / ヘリックス・ターン・ヘリックス / リン酸基結合 / DNAポリメラーゼβ / 434Cro (他15件)

【概要】転写因子において塩基認識部位には共通の立体構造が存在することが知られている。それでは、これらのタンパク質のリン酸基結合部位には共通の構造が存在するのであろうか。タンパク質-DNA複合体のモジュール構造を調べたところ、DNAのリン酸基にのみ結合するモジュールが存在することがわかった。リン酸基結合モジュールを比較した結果、原核生物と真核生物の転写因子及びポリメラーゼの4つのタンパク質に、類似の立体構造...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1994

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 理学部, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / シトクロムP-450cam / Camリプレッサー / カンファー / 転写制御因子 (他7件)

【概要】転写制御因子に結合する分子が、制御されている遺伝子のコードしている蛋白質の基質である場合、両蛋白質における分子結合部分に共通のモジュールが用いられていないだろうか。以上の問題に答えることを目的として、転写制御因子であるCamリプレッサー(CamR)と、制御されている蛋白質、シトクロムP-450cam(P-450cam)のアミノ酸配列をモジュール単位で比較した。CamRはDNAに結合し、カムオペロン...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2006 - 2009

【研究代表者】郷 通子 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 特別客員教授 (70037290)

【キーワード】タンパク質立体構造 / 選択的スプライシング / ホモロジーモデリング / データベース / RNA編集 (他12件)

【概要】ゲノムにコードされている遺伝子の数は予想よりも少なく、遺伝子の転写後に起きる選択的スプライシングによって、ひとつの遺伝子から複数個の転写産物ができることが明らかになっている。ひとつの遺伝子由来の複数のタンパク質にどのような構造の違いがあり、どのように機能が変化しているのかを実験的に調べることは困難である。そこでタンパク質の構造と機能の変化を計算生物学の手法で推定できるようにした。選択的スプライシン...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】一般研究(B)

【研究期間】1994 - 1995

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 理学部, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / タンパク質立体構造 / 機能部品 (他12件)

【概要】イントロンはタンパク質の部品「モジュール」の境界によく対応していることから、分子進化において、モジュールが「かき混ぜられた」基本構造部品であることが明らかになってきた。本研究の目的はモジュールを分類し、機能の異なるタンパク質間の共有されるモジュールを明らかにすることであった。本研究の成果はモジュールを分類できる見通しが得られ、すでにモジュールの一部分がカタログ化できたことである。モジュール図鑑の電...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1996

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / リン酸基結合モジュール / HTHモジュール / 塩基認識モジュール / 434Cro (他8件)

【概要】DNAに結合するタンパク質の塩基認識部位には共通の部分構造が用いられている場合が多い。それではリン酸基と結合する部分にも、共通の構造が存在しないだろうか。本研究は、DNA結合タンパク質のリン酸基結合部位に共通のモジュールが存在するかを明らかにすることを目的に行われた。モジュールとはコンパクトな構造をもつタンパク質の構造単位である。イントロンの位置とモジュールの境界の相関より進化の単位でもあると考え...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1997 - 1998

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / ヘリックス・ターン・ヘリックス / リン酸基結合 / DNAポリメラーゼβ / 434Cro (他15件)

【概要】転写因子において塩基認識部位には共通の立体構造が存在することが知られている。それでは、これらのタンパク質のリン酸基結合部位には共通の構造が存在するのであろうか。タンパク質-DNA複合体のモジュール構造を調べたところ、DNAのリン酸基にのみ結合するモジュールが存在することがわかった。リン酸基結合モジュールを比較した結果、原核生物と真核生物の転写因子及びポリメラーゼの4つのタンパク質に、類似の立体構造...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1996

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / リン酸基結合モジュール / HTHモジュール / 塩基認識モジュール / 434Cro (他8件)

【概要】DNAに結合するタンパク質の塩基認識部位には共通の部分構造が用いられている場合が多い。それではリン酸基と結合する部分にも、共通の構造が存在しないだろうか。本研究は、DNA結合タンパク質のリン酸基結合部位に共通のモジュールが存在するかを明らかにすることを目的に行われた。モジュールとはコンパクトな構造をもつタンパク質の構造単位である。イントロンの位置とモジュールの境界の相関より進化の単位でもあると考え...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1994

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 理学部, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / シトクロムP-450cam / Camリプレッサー / カンファー / 転写制御因子 (他7件)

【概要】転写制御因子に結合する分子が、制御されている遺伝子のコードしている蛋白質の基質である場合、両蛋白質における分子結合部分に共通のモジュールが用いられていないだろうか。以上の問題に答えることを目的として、転写制御因子であるCamリプレッサー(CamR)と、制御されている蛋白質、シトクロムP-450cam(P-450cam)のアミノ酸配列をモジュール単位で比較した。CamRはDNAに結合し、カムオペロン...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】由良 敬 特殊法人日本原子力研究所, 計算科学技術推進センター, 研究員 (50252226)

【キーワード】モジュール / ゲノム配列 / 3Dキーノート / 機能予測 / シアノバクテリア (他12件)

【概要】全ゲノム配列が発表されている生物種は、100種を越えた。生体で機能している高分子は大部分がタンパク質であるため、集積されたゲノム配列にどのような機能を持ったタンパク質があるかを知る必要がある。しかし、ゲノム配列からタンパク質の機能を推定する方法はまだ確立していない。ゲノムにあるORFの約半数は機能が推定できていない。申請者は立体構造が類似であり、機能部位の詳細な構造が類似のリン酸基結合モジュールを...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1994

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 理学部, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / シトクロムP-450cam / Camリプレッサー / カンファー / 転写制御因子 (他7件)

【概要】転写制御因子に結合する分子が、制御されている遺伝子のコードしている蛋白質の基質である場合、両蛋白質における分子結合部分に共通のモジュールが用いられていないだろうか。以上の問題に答えることを目的として、転写制御因子であるCamリプレッサー(CamR)と、制御されている蛋白質、シトクロムP-450cam(P-450cam)のアミノ酸配列をモジュール単位で比較した。CamRはDNAに結合し、カムオペロン...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】知覚情報処理・知能ロボティクス

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2006 - 2007

【研究代表者】山崎 信行 慶應大, 理工学部, 助教授 (80317338)

【キーワード】モジュール / ヒューマノイド / ロボット / 分散 / 再構成 (他8件)

【概要】近い将来、ヒューマノイドロボットがオフィスや家庭で利用されるようになるためには、ユーザの様々な要求に対応するために、多様な機能を持たなければならない。本研究では、用途に応じてユーザが手動でまたはロボットが自律的にシステムを再構成でき、開発も要素ごとに行なえる再構成可能なモジュール型ヒューマノイドロボットを提案し、その実現への基盤となる分散制御デバイス及びモジュールの研究開発を目的とする。 本年度は...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】立花 和則 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (60212031)

【キーワード】減数分裂 / 細胞周期 / MAPキナーゼ / Mos / 情報伝達 (他15件)

【概要】本研究では、受精のシグナルがMAPキナーゼ情報伝達系を経由してDNA複製開始につながる全経路を明らかにしようとした。そのストラテジーとしては情報のながれる上流からと下流からの両方向からこれらの接点にあたるところの分子の探索を行った。第一には情報伝達系からのシグナルの流れを下り、受精の信号を細胞周期の制御機構(この場合DNA複製の開始)を操作するためのシグナル転換装置(これをとよぶ)に迫ろうとするも...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】立花 和則 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (60212031)

【キーワード】減数分裂 / 細胞周期 / MAPキナーゼ / Mos / 情報伝達 (他15件)

【概要】本研究では、受精のシグナルがMAPキナーゼ情報伝達系を経由してDNA複製開始につながる全経路を明らかにしようとした。そのストラテジーとしては情報のながれる上流からと下流からの両方向からこれらの接点にあたるところの分子の探索を行った。第一には情報伝達系からのシグナルの流れを下り、受精の信号を細胞周期の制御機構(この場合DNA複製の開始)を操作するためのシグナル転換装置(これをとよぶ)に迫ろうとするも...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】立花 和則 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (60212031)

【キーワード】減数分裂 / 細胞周期 / MAPキナーゼ / Mos / 情報伝達 (他15件)

【概要】本研究では、受精のシグナルがMAPキナーゼ情報伝達系を経由してDNA複製開始につながる全経路を明らかにしようとした。そのストラテジーとしては情報のながれる上流からと下流からの両方向からこれらの接点にあたるところの分子の探索を行った。第一には情報伝達系からのシグナルの流れを下り、受精の信号を細胞周期の制御機構(この場合DNA複製の開始)を操作するためのシグナル転換装置(これをとよぶ)に迫ろうとするも...

【研究テーマ】生体生命情報学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2010 - 2012

【研究代表者】澤井 哲 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (20500367)

【キーワード】生体情報 / 振動 / 適応 / 粘菌 / 入出力関係 (他11件)

【概要】複数の時間スケールで生じる適応的、振動的な細胞応答について細胞性粘菌のcAMP刺激にたいする細胞内cAMPの一過的な上昇を題材にとり、定量的な解析をおこなった。早い最初のピークが相対変化検出をおこない、絶対濃度にたいして変化した出力であり、かつ周波数応答性をもつのにたいし、後者は絶対濃度に依存すること、また前者が受容体レベルの修飾に依存するのにたいし、後者はアクチン重合を介したフィードバックによる...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2006 - 2009

【研究代表者】郷 通子 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 特別客員教授 (70037290)

【キーワード】タンパク質立体構造 / 選択的スプライシング / ホモロジーモデリング / データベース / RNA編集 (他12件)

【概要】ゲノムにコードされている遺伝子の数は予想よりも少なく、遺伝子の転写後に起きる選択的スプライシングによって、ひとつの遺伝子から複数個の転写産物ができることが明らかになっている。ひとつの遺伝子由来の複数のタンパク質にどのような構造の違いがあり、どのように機能が変化しているのかを実験的に調べることは困難である。そこでタンパク質の構造と機能の変化を計算生物学の手法で推定できるようにした。選択的スプライシン...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】由良 敬 特殊法人日本原子力研究所, 計算科学技術推進センター, 研究員 (50252226)

【キーワード】モジュール / ゲノム配列 / 3Dキーノート / 機能予測 / シアノバクテリア (他12件)

【概要】全ゲノム配列が発表されている生物種は、100種を越えた。生体で機能している高分子は大部分がタンパク質であるため、集積されたゲノム配列にどのような機能を持ったタンパク質があるかを知る必要がある。しかし、ゲノム配列からタンパク質の機能を推定する方法はまだ確立していない。ゲノムにあるORFの約半数は機能が推定できていない。申請者は立体構造が類似であり、機能部位の詳細な構造が類似のリン酸基結合モジュールを...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1997 - 1998

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / ヘリックス・ターン・ヘリックス / リン酸基結合 / DNAポリメラーゼβ / 434Cro (他15件)

【概要】転写因子において塩基認識部位には共通の立体構造が存在することが知られている。それでは、これらのタンパク質のリン酸基結合部位には共通の構造が存在するのであろうか。タンパク質-DNA複合体のモジュール構造を調べたところ、DNAのリン酸基にのみ結合するモジュールが存在することがわかった。リン酸基結合モジュールを比較した結果、原核生物と真核生物の転写因子及びポリメラーゼの4つのタンパク質に、類似の立体構造...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】立花 和則 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (60212031)

【キーワード】減数分裂 / 細胞周期 / MAPキナーゼ / Mos / 情報伝達 (他15件)

【概要】本研究では、受精のシグナルがMAPキナーゼ情報伝達系を経由してDNA複製開始につながる全経路を明らかにしようとした。そのストラテジーとしては情報のながれる上流からと下流からの両方向からこれらの接点にあたるところの分子の探索を行った。第一には情報伝達系からのシグナルの流れを下り、受精の信号を細胞周期の制御機構(この場合DNA複製の開始)を操作するためのシグナル転換装置(これをとよぶ)に迫ろうとするも...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】立花 和則 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (60212031)

【キーワード】減数分裂 / 細胞周期 / MAPキナーゼ / Mos / 情報伝達 (他15件)

【概要】本研究では、受精のシグナルがMAPキナーゼ情報伝達系を経由してDNA複製開始につながる全経路を明らかにしようとした。そのストラテジーとしては情報のながれる上流からと下流からの両方向からこれらの接点にあたるところの分子の探索を行った。第一には情報伝達系からのシグナルの流れを下り、受精の信号を細胞周期の制御機構(この場合DNA複製の開始)を操作するためのシグナル転換装置(これをとよぶ)に迫ろうとするも...

【研究テーマ】生体生命情報学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2010 - 2012

【研究代表者】澤井 哲 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (20500367)

【キーワード】生体情報 / 振動 / 適応 / 粘菌 / 入出力関係 (他11件)

【概要】複数の時間スケールで生じる適応的、振動的な細胞応答について細胞性粘菌のcAMP刺激にたいする細胞内cAMPの一過的な上昇を題材にとり、定量的な解析をおこなった。早い最初のピークが相対変化検出をおこない、絶対濃度にたいして変化した出力であり、かつ周波数応答性をもつのにたいし、後者は絶対濃度に依存すること、また前者が受容体レベルの修飾に依存するのにたいし、後者はアクチン重合を介したフィードバックによる...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】立花 和則 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (60212031)

【キーワード】減数分裂 / 細胞周期 / MAPキナーゼ / Mos / 情報伝達 (他15件)

【概要】本研究では、受精のシグナルがMAPキナーゼ情報伝達系を経由してDNA複製開始につながる全経路を明らかにしようとした。そのストラテジーとしては情報のながれる上流からと下流からの両方向からこれらの接点にあたるところの分子の探索を行った。第一には情報伝達系からのシグナルの流れを下り、受精の信号を細胞周期の制御機構(この場合DNA複製の開始)を操作するためのシグナル転換装置(これをとよぶ)に迫ろうとするも...

【研究テーマ】知覚情報処理・知能ロボティクス

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2006 - 2007

【研究代表者】山崎 信行 慶應大, 理工学部, 助教授 (80317338)

【キーワード】モジュール / ヒューマノイド / ロボット / 分散 / 再構成 (他8件)

【概要】近い将来、ヒューマノイドロボットがオフィスや家庭で利用されるようになるためには、ユーザの様々な要求に対応するために、多様な機能を持たなければならない。本研究では、用途に応じてユーザが手動でまたはロボットが自律的にシステムを再構成でき、開発も要素ごとに行なえる再構成可能なモジュール型ヒューマノイドロボットを提案し、その実現への基盤となる分散制御デバイス及びモジュールの研究開発を目的とする。 本年度は...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1996 - 1998

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / イントロンの起源 / キシラナーゼ (他13件)

【概要】立体構造既知の蛋白質のすべてをモジュールに分解し、モジュール境界と遺伝子上のイントロンの位置との対応を統計的に調べ、モジュール境界とイントロンの対応がタンパク質に普遍的に成り立つ事実であることを明らかにすることが本研究の目的であった。 本研究で完成したモジュール全自動同定法を使って、立体構造が既知であって原子座標が公開されているすべてのタンパク質をモジュールに分類した。最終的に50を越える多数のタ...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】一般研究(B)

【研究期間】1994 - 1995

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 理学部, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / タンパク質立体構造 / 機能部品 (他12件)

【概要】イントロンはタンパク質の部品「モジュール」の境界によく対応していることから、分子進化において、モジュールが「かき混ぜられた」基本構造部品であることが明らかになってきた。本研究の目的はモジュールを分類し、機能の異なるタンパク質間の共有されるモジュールを明らかにすることであった。本研究の成果はモジュールを分類できる見通しが得られ、すでにモジュールの一部分がカタログ化できたことである。モジュール図鑑の電...

【研究テーマ】社会心理学

【研究種目】萌芽研究

【研究期間】2005 - 2006

【研究代表者】亀田 達也 北海道大学, 大学院文学研究科, 教授 (20214554)

【キーワード】地位 / モジュール / 適応 / 進化 / 社会制御 (他7件)

【概要】本研究は人間の社会性の理解にとって重要でありながら、体系的に検討されることの少なかった「人間の集団内地位行動」に進化・生態学的観点から接近を試みる。近年の霊長類学や行動生態学の知見が示すように、霊長類は、地位構造を含む集団内の社会関係を巧みに利用しながら集団生活への適応を実現している。マキャヴェリ的知性に関する研究は、チンパンジーのオスが社会的序列を利用した複雑な同盟関係を結び、メスもまたそうした...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2002 - 2005

【研究代表者】新宅 純二郎 東京大学, 大学院・経済学研究科, 助教授 (00216219)

【キーワード】技術移転 / 特許 / リソースベース / 光ディスク / モジュール (他24件)

【概要】本研究の前半では、まず特許等の知的財産権を中心にして、技術移転プロセスに関する制度や実態の調査を行った。技術移転にはライセンシングに限らず様々なパターンがあるが、大学を中心とした技術移転、特に大学発ベンチャーには発明をビジネスとして扱う発想が乏しいことが明らかになった。今ある技術シーズよりも、広い意味での技術力やビジネス面での経営者の力量が、技術移転の成功にとって大きな鍵であることが分かってきた。...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2002 - 2005

【研究代表者】新宅 純二郎 東京大学, 大学院・経済学研究科, 助教授 (00216219)

【キーワード】技術移転 / 特許 / リソースベース / 光ディスク / モジュール (他24件)

【概要】本研究の前半では、まず特許等の知的財産権を中心にして、技術移転プロセスに関する制度や実態の調査を行った。技術移転にはライセンシングに限らず様々なパターンがあるが、大学を中心とした技術移転、特に大学発ベンチャーには発明をビジネスとして扱う発想が乏しいことが明らかになった。今ある技術シーズよりも、広い意味での技術力やビジネス面での経営者の力量が、技術移転の成功にとって大きな鍵であることが分かってきた。...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2002 - 2003

【研究代表者】馬場 靖憲 東京大学, 先端経済工学研究センター, 教授 (80238229)

【キーワード】モジュール / 設計 / 製品開発 / デジタルコンテンツ / Eラーニング (他13件)

【概要】現在、製品・サービスにかかわる諸要素をモジュール化し再利用してスケールエコノミーを実現するコスト削減型製品開発が望まれている。しかし、企業がビジネスの構成要素を技術的にモジュール化する能力を獲得しただけでは、企業競争力の獲得にはほど遠い。モジュールをどのようなビジネス・プラットフォームに配置して消費者に製品・サービスを提供するのか、ビジネスモデルが不在の場合、モジュール化は自己満足となる。企業がど...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1999 - 2000

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / 金属イオン / 亜鉛 / マグネシウム / カルシウム (他7件)

【概要】本年度は、立体構造が判明しているタンパク質で数多く見られるすべての金属イオン、カルシウム、マグネシウム及び亜鉛イオンにおいて、それぞれのイオンがいくつのモジュールに配位するのか、及びそれぞれのイオンの配位部位に類似のモジュールが存在するのかを調べた。タンパク質における金属イオン配位子の今までの研究では、タンパク質における金属イオンの配位子は、アミノ酸配列上全体に散らばっていると考えられていた。しか...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】知覚情報処理・知能ロボティクス

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2006 - 2007

【研究代表者】山崎 信行 慶應大, 理工学部, 助教授 (80317338)

【キーワード】モジュール / ヒューマノイド / ロボット / 分散 / 再構成 (他8件)

【概要】近い将来、ヒューマノイドロボットがオフィスや家庭で利用されるようになるためには、ユーザの様々な要求に対応するために、多様な機能を持たなければならない。本研究では、用途に応じてユーザが手動でまたはロボットが自律的にシステムを再構成でき、開発も要素ごとに行なえる再構成可能なモジュール型ヒューマノイドロボットを提案し、その実現への基盤となる分散制御デバイス及びモジュールの研究開発を目的とする。 本年度は...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1996 - 1998

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / イントロンの起源 / キシラナーゼ (他13件)

【概要】立体構造既知の蛋白質のすべてをモジュールに分解し、モジュール境界と遺伝子上のイントロンの位置との対応を統計的に調べ、モジュール境界とイントロンの対応がタンパク質に普遍的に成り立つ事実であることを明らかにすることが本研究の目的であった。 本研究で完成したモジュール全自動同定法を使って、立体構造が既知であって原子座標が公開されているすべてのタンパク質をモジュールに分類した。最終的に50を越える多数のタ...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】一般研究(B)

【研究期間】1994 - 1995

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 理学部, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / タンパク質立体構造 / 機能部品 (他12件)

【概要】イントロンはタンパク質の部品「モジュール」の境界によく対応していることから、分子進化において、モジュールが「かき混ぜられた」基本構造部品であることが明らかになってきた。本研究の目的はモジュールを分類し、機能の異なるタンパク質間の共有されるモジュールを明らかにすることであった。本研究の成果はモジュールを分類できる見通しが得られ、すでにモジュールの一部分がカタログ化できたことである。モジュール図鑑の電...

【研究テーマ】船舶海洋工学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2015-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】青山 和浩 東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 教授 (80222488)

【キーワード】モジュール / 製品系列設計 / 製品ファミリ / 品質表 / コンフィグレーションマネジメント (他6件)

【概要】本研究では，製品ファミリ設計・アップグレード設計・設計変更をコンフィグレーションマネジメントという共通の枠組みの中で考えることで，製品開発計画を広範に捉えた計画とマネジメントを実現することを目標としている．平成28年度は，前年度に提案した製品ファミリ設計における複数製品間のモジュールのコンフィグレーションマネジメントのモデルと支援手法をもとに，アップグレード設計と設計変更への適応を検討した． ...

【研究テーマ】船舶海洋工学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2015-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】青山 和浩 東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 教授 (80222488)

【キーワード】モジュール / 製品系列設計 / 製品ファミリ / 品質表 / コンフィグレーションマネジメント (他6件)

【概要】本研究では，製品ファミリ設計・アップグレード設計・設計変更をコンフィグレーションマネジメントという共通の枠組みの中で考えることで，製品開発計画を広範に捉えた計画とマネジメントを実現することを目標としている．平成28年度は，前年度に提案した製品ファミリ設計における複数製品間のモジュールのコンフィグレーションマネジメントのモデルと支援手法をもとに，アップグレード設計と設計変更への適応を検討した． ...

【研究テーマ】船舶海洋工学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2015-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】青山 和浩 東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 教授 (80222488)

【キーワード】モジュール / 製品系列設計 / 製品ファミリ / 品質表 / コンフィグレーションマネジメント (他6件)

【概要】本研究では，製品ファミリ設計・アップグレード設計・設計変更をコンフィグレーションマネジメントという共通の枠組みの中で考えることで，製品開発計画を広範に捉えた計画とマネジメントを実現することを目標としている．平成28年度は，前年度に提案した製品ファミリ設計における複数製品間のモジュールのコンフィグレーションマネジメントのモデルと支援手法をもとに，アップグレード設計と設計変更への適応を検討した． ...

【研究テーマ】知覚情報処理・知能ロボティクス

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2006 - 2007

【研究代表者】山崎 信行 慶應大, 理工学部, 助教授 (80317338)

【キーワード】モジュール / ヒューマノイド / ロボット / 分散 / 再構成 (他8件)

【概要】近い将来、ヒューマノイドロボットがオフィスや家庭で利用されるようになるためには、ユーザの様々な要求に対応するために、多様な機能を持たなければならない。本研究では、用途に応じてユーザが手動でまたはロボットが自律的にシステムを再構成でき、開発も要素ごとに行なえる再構成可能なモジュール型ヒューマノイドロボットを提案し、その実現への基盤となる分散制御デバイス及びモジュールの研究開発を目的とする。 本年度は...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2002 - 2003

【研究代表者】馬場 靖憲 東京大学, 先端経済工学研究センター, 教授 (80238229)

【キーワード】モジュール / 設計 / 製品開発 / デジタルコンテンツ / Eラーニング (他13件)

【概要】現在、製品・サービスにかかわる諸要素をモジュール化し再利用してスケールエコノミーを実現するコスト削減型製品開発が望まれている。しかし、企業がビジネスの構成要素を技術的にモジュール化する能力を獲得しただけでは、企業競争力の獲得にはほど遠い。モジュールをどのようなビジネス・プラットフォームに配置して消費者に製品・サービスを提供するのか、ビジネスモデルが不在の場合、モジュール化は自己満足となる。企業がど...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1999 - 2000

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / 金属イオン / 亜鉛 / マグネシウム / カルシウム (他7件)

【概要】本年度は、立体構造が判明しているタンパク質で数多く見られるすべての金属イオン、カルシウム、マグネシウム及び亜鉛イオンにおいて、それぞれのイオンがいくつのモジュールに配位するのか、及びそれぞれのイオンの配位部位に類似のモジュールが存在するのかを調べた。タンパク質における金属イオン配位子の今までの研究では、タンパク質における金属イオンの配位子は、アミノ酸配列上全体に散らばっていると考えられていた。しか...

【研究テーマ】船舶海洋工学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2015-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】青山 和浩 東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 教授 (80222488)

【キーワード】モジュール / 製品系列設計 / 製品ファミリ / 品質表 / コンフィグレーションマネジメント (他6件)

【概要】本研究では，製品ファミリ設計・アップグレード設計・設計変更をコンフィグレーションマネジメントという共通の枠組みの中で考えることで，製品開発計画を広範に捉えた計画とマネジメントを実現することを目標としている．平成28年度は，前年度に提案した製品ファミリ設計における複数製品間のモジュールのコンフィグレーションマネジメントのモデルと支援手法をもとに，アップグレード設計と設計変更への適応を検討した． ...

【研究テーマ】生体生命情報学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2010 - 2012

【研究代表者】澤井 哲 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (20500367)

【キーワード】生体情報 / 振動 / 適応 / 粘菌 / 入出力関係 (他11件)

【概要】複数の時間スケールで生じる適応的、振動的な細胞応答について細胞性粘菌のcAMP刺激にたいする細胞内cAMPの一過的な上昇を題材にとり、定量的な解析をおこなった。早い最初のピークが相対変化検出をおこない、絶対濃度にたいして変化した出力であり、かつ周波数応答性をもつのにたいし、後者は絶対濃度に依存すること、また前者が受容体レベルの修飾に依存するのにたいし、後者はアクチン重合を介したフィードバックによる...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2002 - 2005

【研究代表者】新宅 純二郎 東京大学, 大学院・経済学研究科, 助教授 (00216219)

【キーワード】技術移転 / 特許 / リソースベース / 光ディスク / モジュール (他24件)

【概要】本研究の前半では、まず特許等の知的財産権を中心にして、技術移転プロセスに関する制度や実態の調査を行った。技術移転にはライセンシングに限らず様々なパターンがあるが、大学を中心とした技術移転、特に大学発ベンチャーには発明をビジネスとして扱う発想が乏しいことが明らかになった。今ある技術シーズよりも、広い意味での技術力やビジネス面での経営者の力量が、技術移転の成功にとって大きな鍵であることが分かってきた。...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2006 - 2009

【研究代表者】郷 通子 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 特別客員教授 (70037290)

【キーワード】タンパク質立体構造 / 選択的スプライシング / ホモロジーモデリング / データベース / RNA編集 (他12件)

【概要】ゲノムにコードされている遺伝子の数は予想よりも少なく、遺伝子の転写後に起きる選択的スプライシングによって、ひとつの遺伝子から複数個の転写産物ができることが明らかになっている。ひとつの遺伝子由来の複数のタンパク質にどのような構造の違いがあり、どのように機能が変化しているのかを実験的に調べることは困難である。そこでタンパク質の構造と機能の変化を計算生物学の手法で推定できるようにした。選択的スプライシン...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】1996 - 1997

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】蛋白質可溶化 / バルナーゼ / ミニ蛋白質 / 逆転写酵素 / アミノ酸置換 (他8件)

【概要】巨大な蛋白質や複合蛋白質の機能構造を知るために、(1)蛋白質の部分構造を安定に切り出す手法と、(2)その部分構造を可溶化させる方法が要求されており、これらの手法の確立が必要である。蛋白質の部分構造を切り出して可溶化させるためのデザイン手法を開発すること、さらにデザインされた部分構造が可溶であり安定な構造を形成することを検証することを目的に研究を行った。生物進化の過程では、ドメインやモジュールの融合...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】由良 敬 特殊法人日本原子力研究所, 計算科学技術推進センター, 研究員 (50252226)

【キーワード】モジュール / ゲノム配列 / 3Dキーノート / 機能予測 / シアノバクテリア (他12件)

【概要】全ゲノム配列が発表されている生物種は、100種を越えた。生体で機能している高分子は大部分がタンパク質であるため、集積されたゲノム配列にどのような機能を持ったタンパク質があるかを知る必要がある。しかし、ゲノム配列からタンパク質の機能を推定する方法はまだ確立していない。ゲノムにあるORFの約半数は機能が推定できていない。申請者は立体構造が類似であり、機能部位の詳細な構造が類似のリン酸基結合モジュールを...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】生体生命情報学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2010 - 2012

【研究代表者】澤井 哲 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (20500367)

【キーワード】生体情報 / 振動 / 適応 / 粘菌 / 入出力関係 (他11件)

【概要】複数の時間スケールで生じる適応的、振動的な細胞応答について細胞性粘菌のcAMP刺激にたいする細胞内cAMPの一過的な上昇を題材にとり、定量的な解析をおこなった。早い最初のピークが相対変化検出をおこない、絶対濃度にたいして変化した出力であり、かつ周波数応答性をもつのにたいし、後者は絶対濃度に依存すること、また前者が受容体レベルの修飾に依存するのにたいし、後者はアクチン重合を介したフィードバックによる...

【研究テーマ】船舶海洋工学

【研究種目】挑戦的萌芽研究

【研究期間】2015-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】青山 和浩 東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 教授 (80222488)

【キーワード】モジュール / 製品系列設計 / 製品ファミリ / 品質表 / コンフィグレーションマネジメント (他6件)

【概要】本研究では，製品ファミリ設計・アップグレード設計・設計変更をコンフィグレーションマネジメントという共通の枠組みの中で考えることで，製品開発計画を広範に捉えた計画とマネジメントを実現することを目標としている．平成28年度は，前年度に提案した製品ファミリ設計における複数製品間のモジュールのコンフィグレーションマネジメントのモデルと支援手法をもとに，アップグレード設計と設計変更への適応を検討した． ...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1996 - 1998

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / イントロンの起源 / キシラナーゼ (他13件)

【概要】立体構造既知の蛋白質のすべてをモジュールに分解し、モジュール境界と遺伝子上のイントロンの位置との対応を統計的に調べ、モジュール境界とイントロンの対応がタンパク質に普遍的に成り立つ事実であることを明らかにすることが本研究の目的であった。 本研究で完成したモジュール全自動同定法を使って、立体構造が既知であって原子座標が公開されているすべてのタンパク質をモジュールに分類した。最終的に50を越える多数のタ...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】由良 敬 特殊法人日本原子力研究所, 計算科学技術推進センター, 研究員 (50252226)

【キーワード】モジュール / ゲノム配列 / 3Dキーノート / 機能予測 / シアノバクテリア (他12件)

【概要】全ゲノム配列が発表されている生物種は、100種を越えた。生体で機能している高分子は大部分がタンパク質であるため、集積されたゲノム配列にどのような機能を持ったタンパク質があるかを知る必要がある。しかし、ゲノム配列からタンパク質の機能を推定する方法はまだ確立していない。ゲノムにあるORFの約半数は機能が推定できていない。申請者は立体構造が類似であり、機能部位の詳細な構造が類似のリン酸基結合モジュールを...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1996 - 1998

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / イントロンの起源 / キシラナーゼ (他13件)

【概要】立体構造既知の蛋白質のすべてをモジュールに分解し、モジュール境界と遺伝子上のイントロンの位置との対応を統計的に調べ、モジュール境界とイントロンの対応がタンパク質に普遍的に成り立つ事実であることを明らかにすることが本研究の目的であった。 本研究で完成したモジュール全自動同定法を使って、立体構造が既知であって原子座標が公開されているすべてのタンパク質をモジュールに分類した。最終的に50を越える多数のタ...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1996 - 1998

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / イントロンの起源 / キシラナーゼ (他13件)

【概要】立体構造既知の蛋白質のすべてをモジュールに分解し、モジュール境界と遺伝子上のイントロンの位置との対応を統計的に調べ、モジュール境界とイントロンの対応がタンパク質に普遍的に成り立つ事実であることを明らかにすることが本研究の目的であった。 本研究で完成したモジュール全自動同定法を使って、立体構造が既知であって原子座標が公開されているすべてのタンパク質をモジュールに分類した。最終的に50を越える多数のタ...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】由良 敬 特殊法人日本原子力研究所, 計算科学技術推進センター, 研究員 (50252226)

【キーワード】モジュール / ゲノム配列 / 3Dキーノート / 機能予測 / シアノバクテリア (他12件)

【概要】全ゲノム配列が発表されている生物種は、100種を越えた。生体で機能している高分子は大部分がタンパク質であるため、集積されたゲノム配列にどのような機能を持ったタンパク質があるかを知る必要がある。しかし、ゲノム配列からタンパク質の機能を推定する方法はまだ確立していない。ゲノムにあるORFの約半数は機能が推定できていない。申請者は立体構造が類似であり、機能部位の詳細な構造が類似のリン酸基結合モジュールを...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】若杉 桂輔 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教授 (20322167)

【キーワード】蛋白質工学 / シグナル伝達 / 酸化ストレス / 細胞死 / 人工制御 (他15件)

【概要】1.トリプトファニルtRNA合成酵素(TrpRS)の酸化ストレス下での新規機能の解明 TrpRSは、tRNAにトリプトファンを結合させる反応(アミノアシル化)を触媒する酵素である。今回、ヒトのTrpRSの新規機能を探索したところ、酸化ストレス下で、ある有機化合物と複合体を形成することを発見した。現在、部位特異的アミノ酸置換体を作製し、分子レベルでの制御メカニズム、及び、生理機能の解明を目指している...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】一般研究(B)

【研究期間】1994 - 1995

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 理学部, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / タンパク質立体構造 / 機能部品 (他12件)

【概要】イントロンはタンパク質の部品「モジュール」の境界によく対応していることから、分子進化において、モジュールが「かき混ぜられた」基本構造部品であることが明らかになってきた。本研究の目的はモジュールを分類し、機能の異なるタンパク質間の共有されるモジュールを明らかにすることであった。本研究の成果はモジュールを分類できる見通しが得られ、すでにモジュールの一部分がカタログ化できたことである。モジュール図鑑の電...

【研究テーマ】科学教育

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2013-04-01 - 2017-03-31

【研究代表者】札野 順 東京工業大学, リベラルアーツ研究教育院, 教授 (90229089)

【キーワード】技術者倫理 / 工学教育 / 学習・教育目標 / モデル・シラバス / モジュール (他11件)

【概要】国境を越えて、国際的に通用する技術者倫理教育の学習・教育目標（22項目）を、国内外のシラバスの精査・整理、及び国内外のエキスパートを対象とするデルファイ法によるアンケート調査を実施することにより策定した。さらに、この学習・教育目標を、２領域、４カテゴリにに分類し、特に、情意領域（価値・態度）の目標の重要性を示した。 上記の学習・教育目標を達成するために、具体的に教育内容、方法、測定・評価手法等を含...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1997 - 1998

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / ヘリックス・ターン・ヘリックス / リン酸基結合 / DNAポリメラーゼβ / 434Cro (他15件)

【概要】転写因子において塩基認識部位には共通の立体構造が存在することが知られている。それでは、これらのタンパク質のリン酸基結合部位には共通の構造が存在するのであろうか。タンパク質-DNA複合体のモジュール構造を調べたところ、DNAのリン酸基にのみ結合するモジュールが存在することがわかった。リン酸基結合モジュールを比較した結果、原核生物と真核生物の転写因子及びポリメラーゼの4つのタンパク質に、類似の立体構造...

【研究テーマ】生体生命情報学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2010 - 2012

【研究代表者】澤井 哲 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (20500367)

【キーワード】生体情報 / 振動 / 適応 / 粘菌 / 入出力関係 (他11件)

【概要】複数の時間スケールで生じる適応的、振動的な細胞応答について細胞性粘菌のcAMP刺激にたいする細胞内cAMPの一過的な上昇を題材にとり、定量的な解析をおこなった。早い最初のピークが相対変化検出をおこない、絶対濃度にたいして変化した出力であり、かつ周波数応答性をもつのにたいし、後者は絶対濃度に依存すること、また前者が受容体レベルの修飾に依存するのにたいし、後者はアクチン重合を介したフィードバックによる...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1996 - 1998

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / イントロンの起源 / キシラナーゼ (他13件)

【概要】立体構造既知の蛋白質のすべてをモジュールに分解し、モジュール境界と遺伝子上のイントロンの位置との対応を統計的に調べ、モジュール境界とイントロンの対応がタンパク質に普遍的に成り立つ事実であることを明らかにすることが本研究の目的であった。 本研究で完成したモジュール全自動同定法を使って、立体構造が既知であって原子座標が公開されているすべてのタンパク質をモジュールに分類した。最終的に50を越える多数のタ...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1994

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 理学部, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / シトクロムP-450cam / Camリプレッサー / カンファー / 転写制御因子 (他7件)

【概要】転写制御因子に結合する分子が、制御されている遺伝子のコードしている蛋白質の基質である場合、両蛋白質における分子結合部分に共通のモジュールが用いられていないだろうか。以上の問題に答えることを目的として、転写制御因子であるCamリプレッサー(CamR)と、制御されている蛋白質、シトクロムP-450cam(P-450cam)のアミノ酸配列をモジュール単位で比較した。CamRはDNAに結合し、カムオペロン...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2006 - 2009

【研究代表者】郷 通子 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 特別客員教授 (70037290)

【キーワード】タンパク質立体構造 / 選択的スプライシング / ホモロジーモデリング / データベース / RNA編集 (他12件)

【概要】ゲノムにコードされている遺伝子の数は予想よりも少なく、遺伝子の転写後に起きる選択的スプライシングによって、ひとつの遺伝子から複数個の転写産物ができることが明らかになっている。ひとつの遺伝子由来の複数のタンパク質にどのような構造の違いがあり、どのように機能が変化しているのかを実験的に調べることは困難である。そこでタンパク質の構造と機能の変化を計算生物学の手法で推定できるようにした。選択的スプライシン...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】若杉 桂輔 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教授 (20322167)

【キーワード】蛋白質工学 / シグナル伝達 / 酸化ストレス / 細胞死 / 人工制御 (他15件)

【概要】1.トリプトファニルtRNA合成酵素(TrpRS)の酸化ストレス下での新規機能の解明 TrpRSは、tRNAにトリプトファンを結合させる反応(アミノアシル化)を触媒する酵素である。今回、ヒトのTrpRSの新規機能を探索したところ、酸化ストレス下で、ある有機化合物と複合体を形成することを発見した。現在、部位特異的アミノ酸置換体を作製し、分子レベルでの制御メカニズム、及び、生理機能の解明を目指している...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】若杉 桂輔 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教授 (20322167)

【キーワード】蛋白質工学 / シグナル伝達 / 酸化ストレス / 細胞死 / 人工制御 (他15件)

【概要】1.トリプトファニルtRNA合成酵素(TrpRS)の酸化ストレス下での新規機能の解明 TrpRSは、tRNAにトリプトファンを結合させる反応(アミノアシル化)を触媒する酵素である。今回、ヒトのTrpRSの新規機能を探索したところ、酸化ストレス下で、ある有機化合物と複合体を形成することを発見した。現在、部位特異的アミノ酸置換体を作製し、分子レベルでの制御メカニズム、及び、生理機能の解明を目指している...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2006 - 2009

【研究代表者】郷 通子 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 特別客員教授 (70037290)

【キーワード】タンパク質立体構造 / 選択的スプライシング / ホモロジーモデリング / データベース / RNA編集 (他12件)

【概要】ゲノムにコードされている遺伝子の数は予想よりも少なく、遺伝子の転写後に起きる選択的スプライシングによって、ひとつの遺伝子から複数個の転写産物ができることが明らかになっている。ひとつの遺伝子由来の複数のタンパク質にどのような構造の違いがあり、どのように機能が変化しているのかを実験的に調べることは困難である。そこでタンパク質の構造と機能の変化を計算生物学の手法で推定できるようにした。選択的スプライシン...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】立花 和則 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (60212031)

【キーワード】減数分裂 / 細胞周期 / MAPキナーゼ / Mos / 情報伝達 (他15件)

【概要】本研究では、受精のシグナルがMAPキナーゼ情報伝達系を経由してDNA複製開始につながる全経路を明らかにしようとした。そのストラテジーとしては情報のながれる上流からと下流からの両方向からこれらの接点にあたるところの分子の探索を行った。第一には情報伝達系からのシグナルの流れを下り、受精の信号を細胞周期の制御機構(この場合DNA複製の開始)を操作するためのシグナル転換装置(これをとよぶ)に迫ろうとするも...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2006 - 2009

【研究代表者】郷 通子 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 特別客員教授 (70037290)

【キーワード】タンパク質立体構造 / 選択的スプライシング / ホモロジーモデリング / データベース / RNA編集 (他12件)

【概要】ゲノムにコードされている遺伝子の数は予想よりも少なく、遺伝子の転写後に起きる選択的スプライシングによって、ひとつの遺伝子から複数個の転写産物ができることが明らかになっている。ひとつの遺伝子由来の複数のタンパク質にどのような構造の違いがあり、どのように機能が変化しているのかを実験的に調べることは困難である。そこでタンパク質の構造と機能の変化を計算生物学の手法で推定できるようにした。選択的スプライシン...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】1996 - 1997

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】蛋白質可溶化 / バルナーゼ / ミニ蛋白質 / 逆転写酵素 / アミノ酸置換 (他8件)

【概要】巨大な蛋白質や複合蛋白質の機能構造を知るために、(1)蛋白質の部分構造を安定に切り出す手法と、(2)その部分構造を可溶化させる方法が要求されており、これらの手法の確立が必要である。蛋白質の部分構造を切り出して可溶化させるためのデザイン手法を開発すること、さらにデザインされた部分構造が可溶であり安定な構造を形成することを検証することを目的に研究を行った。生物進化の過程では、ドメインやモジュールの融合...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1999 - 2000

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / 金属イオン / 亜鉛 / マグネシウム / カルシウム (他7件)

【概要】本年度は、立体構造が判明しているタンパク質で数多く見られるすべての金属イオン、カルシウム、マグネシウム及び亜鉛イオンにおいて、それぞれのイオンがいくつのモジュールに配位するのか、及びそれぞれのイオンの配位部位に類似のモジュールが存在するのかを調べた。タンパク質における金属イオン配位子の今までの研究では、タンパク質における金属イオンの配位子は、アミノ酸配列上全体に散らばっていると考えられていた。しか...

【研究テーマ】生体生命情報学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2010 - 2012

【研究代表者】澤井 哲 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (20500367)

【キーワード】生体情報 / 振動 / 適応 / 粘菌 / 入出力関係 (他11件)

【概要】複数の時間スケールで生じる適応的、振動的な細胞応答について細胞性粘菌のcAMP刺激にたいする細胞内cAMPの一過的な上昇を題材にとり、定量的な解析をおこなった。早い最初のピークが相対変化検出をおこない、絶対濃度にたいして変化した出力であり、かつ周波数応答性をもつのにたいし、後者は絶対濃度に依存すること、また前者が受容体レベルの修飾に依存するのにたいし、後者はアクチン重合を介したフィードバックによる...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】立花 和則 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (60212031)

【キーワード】減数分裂 / 細胞周期 / MAPキナーゼ / Mos / 情報伝達 (他15件)

【概要】本研究では、受精のシグナルがMAPキナーゼ情報伝達系を経由してDNA複製開始につながる全経路を明らかにしようとした。そのストラテジーとしては情報のながれる上流からと下流からの両方向からこれらの接点にあたるところの分子の探索を行った。第一には情報伝達系からのシグナルの流れを下り、受精の信号を細胞周期の制御機構(この場合DNA複製の開始)を操作するためのシグナル転換装置(これをとよぶ)に迫ろうとするも...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】若杉 桂輔 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教授 (20322167)

【キーワード】蛋白質工学 / シグナル伝達 / 酸化ストレス / 細胞死 / 人工制御 (他15件)

【概要】1.トリプトファニルtRNA合成酵素(TrpRS)の酸化ストレス下での新規機能の解明 TrpRSは、tRNAにトリプトファンを結合させる反応(アミノアシル化)を触媒する酵素である。今回、ヒトのTrpRSの新規機能を探索したところ、酸化ストレス下で、ある有機化合物と複合体を形成することを発見した。現在、部位特異的アミノ酸置換体を作製し、分子レベルでの制御メカニズム、及び、生理機能の解明を目指している...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】立花 和則 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (60212031)

【キーワード】減数分裂 / 細胞周期 / MAPキナーゼ / Mos / 情報伝達 (他15件)

【概要】本研究では、受精のシグナルがMAPキナーゼ情報伝達系を経由してDNA複製開始につながる全経路を明らかにしようとした。そのストラテジーとしては情報のながれる上流からと下流からの両方向からこれらの接点にあたるところの分子の探索を行った。第一には情報伝達系からのシグナルの流れを下り、受精の信号を細胞周期の制御機構(この場合DNA複製の開始)を操作するためのシグナル転換装置(これをとよぶ)に迫ろうとするも...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】立花 和則 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (60212031)

【キーワード】減数分裂 / 細胞周期 / MAPキナーゼ / Mos / 情報伝達 (他15件)

【概要】本研究では、受精のシグナルがMAPキナーゼ情報伝達系を経由してDNA複製開始につながる全経路を明らかにしようとした。そのストラテジーとしては情報のながれる上流からと下流からの両方向からこれらの接点にあたるところの分子の探索を行った。第一には情報伝達系からのシグナルの流れを下り、受精の信号を細胞周期の制御機構(この場合DNA複製の開始)を操作するためのシグナル転換装置(これをとよぶ)に迫ろうとするも...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】立花 和則 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (60212031)

【キーワード】減数分裂 / 細胞周期 / MAPキナーゼ / Mos / 情報伝達 (他15件)

【概要】本研究では、受精のシグナルがMAPキナーゼ情報伝達系を経由してDNA複製開始につながる全経路を明らかにしようとした。そのストラテジーとしては情報のながれる上流からと下流からの両方向からこれらの接点にあたるところの分子の探索を行った。第一には情報伝達系からのシグナルの流れを下り、受精の信号を細胞周期の制御機構(この場合DNA複製の開始)を操作するためのシグナル転換装置(これをとよぶ)に迫ろうとするも...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1999 - 2000

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / 金属イオン / 亜鉛 / マグネシウム / カルシウム (他7件)

【概要】本年度は、立体構造が判明しているタンパク質で数多く見られるすべての金属イオン、カルシウム、マグネシウム及び亜鉛イオンにおいて、それぞれのイオンがいくつのモジュールに配位するのか、及びそれぞれのイオンの配位部位に類似のモジュールが存在するのかを調べた。タンパク質における金属イオン配位子の今までの研究では、タンパク質における金属イオンの配位子は、アミノ酸配列上全体に散らばっていると考えられていた。しか...

【研究テーマ】細胞生物学

【研究種目】基盤研究(C)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】立花 和則 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (60212031)

【キーワード】減数分裂 / 細胞周期 / MAPキナーゼ / Mos / 情報伝達 (他15件)

【概要】本研究では、受精のシグナルがMAPキナーゼ情報伝達系を経由してDNA複製開始につながる全経路を明らかにしようとした。そのストラテジーとしては情報のながれる上流からと下流からの両方向からこれらの接点にあたるところの分子の探索を行った。第一には情報伝達系からのシグナルの流れを下り、受精の信号を細胞周期の制御機構(この場合DNA複製の開始)を操作するためのシグナル転換装置(これをとよぶ)に迫ろうとするも...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2002 - 2005

【研究代表者】新宅 純二郎 東京大学, 大学院・経済学研究科, 助教授 (00216219)

【キーワード】技術移転 / 特許 / リソースベース / 光ディスク / モジュール (他24件)

【概要】本研究の前半では、まず特許等の知的財産権を中心にして、技術移転プロセスに関する制度や実態の調査を行った。技術移転にはライセンシングに限らず様々なパターンがあるが、大学を中心とした技術移転、特に大学発ベンチャーには発明をビジネスとして扱う発想が乏しいことが明らかになった。今ある技術シーズよりも、広い意味での技術力やビジネス面での経営者の力量が、技術移転の成功にとって大きな鍵であることが分かってきた。...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】若杉 桂輔 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教授 (20322167)

【キーワード】蛋白質工学 / シグナル伝達 / 酸化ストレス / 細胞死 / 人工制御 (他15件)

【概要】1.トリプトファニルtRNA合成酵素(TrpRS)の酸化ストレス下での新規機能の解明 TrpRSは、tRNAにトリプトファンを結合させる反応(アミノアシル化)を触媒する酵素である。今回、ヒトのTrpRSの新規機能を探索したところ、酸化ストレス下で、ある有機化合物と複合体を形成することを発見した。現在、部位特異的アミノ酸置換体を作製し、分子レベルでの制御メカニズム、及び、生理機能の解明を目指している...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】若杉 桂輔 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教授 (20322167)

【キーワード】蛋白質工学 / シグナル伝達 / 酸化ストレス / 細胞死 / 人工制御 (他15件)

【概要】1.トリプトファニルtRNA合成酵素(TrpRS)の酸化ストレス下での新規機能の解明 TrpRSは、tRNAにトリプトファンを結合させる反応(アミノアシル化)を触媒する酵素である。今回、ヒトのTrpRSの新規機能を探索したところ、酸化ストレス下で、ある有機化合物と複合体を形成することを発見した。現在、部位特異的アミノ酸置換体を作製し、分子レベルでの制御メカニズム、及び、生理機能の解明を目指している...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】一般研究(B)

【研究期間】1994 - 1995

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 理学部, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / イントロン / エクソンかき混ぜ / タンパク質立体構造 / 機能部品 (他12件)

【概要】イントロンはタンパク質の部品「モジュール」の境界によく対応していることから、分子進化において、モジュールが「かき混ぜられた」基本構造部品であることが明らかになってきた。本研究の目的はモジュールを分類し、機能の異なるタンパク質間の共有されるモジュールを明らかにすることであった。本研究の成果はモジュールを分類できる見通しが得られ、すでにモジュールの一部分がカタログ化できたことである。モジュール図鑑の電...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1999 - 2000

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / 金属イオン / 亜鉛 / マグネシウム / カルシウム (他7件)

【概要】本年度は、立体構造が判明しているタンパク質で数多く見られるすべての金属イオン、カルシウム、マグネシウム及び亜鉛イオンにおいて、それぞれのイオンがいくつのモジュールに配位するのか、及びそれぞれのイオンの配位部位に類似のモジュールが存在するのかを調べた。タンパク質における金属イオン配位子の今までの研究では、タンパク質における金属イオンの配位子は、アミノ酸配列上全体に散らばっていると考えられていた。しか...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール分類 / シャッフリング / イントロン / 膜タンパク質 / ペルオキシターゼ (他24件)

【概要】タンパク質の機能は全体構造に担われているわけではなく、(1)むしろ局所構造としてのモジュールが機能を担うこと、(2)モジュールを部品として生物が進化の過程で行ってきたタンパク質デザインの実体を明らかとする目的で本研究を開始した。結果として、タンパク質の各種の機能は局所的であり、ほとんどの機能はモジュールにアサインできることがわかった。例えば、(1)ファミリー10キシラナーゼの触媒ドメインにおいて、...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2006 - 2009

【研究代表者】郷 通子 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 特別客員教授 (70037290)

【キーワード】タンパク質立体構造 / 選択的スプライシング / ホモロジーモデリング / データベース / RNA編集 (他12件)

【概要】ゲノムにコードされている遺伝子の数は予想よりも少なく、遺伝子の転写後に起きる選択的スプライシングによって、ひとつの遺伝子から複数個の転写産物ができることが明らかになっている。ひとつの遺伝子由来の複数のタンパク質にどのような構造の違いがあり、どのように機能が変化しているのかを実験的に調べることは困難である。そこでタンパク質の構造と機能の変化を計算生物学の手法で推定できるようにした。選択的スプライシン...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1997 - 1998

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / ヘリックス・ターン・ヘリックス / リン酸基結合 / DNAポリメラーゼβ / 434Cro (他15件)

【概要】転写因子において塩基認識部位には共通の立体構造が存在することが知られている。それでは、これらのタンパク質のリン酸基結合部位には共通の構造が存在するのであろうか。タンパク質-DNA複合体のモジュール構造を調べたところ、DNAのリン酸基にのみ結合するモジュールが存在することがわかった。リン酸基結合モジュールを比較した結果、原核生物と真核生物の転写因子及びポリメラーゼの4つのタンパク質に、類似の立体構造...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】若杉 桂輔 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教授 (20322167)

【キーワード】蛋白質工学 / シグナル伝達 / 酸化ストレス / 細胞死 / 人工制御 (他15件)

【概要】1.トリプトファニルtRNA合成酵素(TrpRS)の酸化ストレス下での新規機能の解明 TrpRSは、tRNAにトリプトファンを結合させる反応(アミノアシル化)を触媒する酵素である。今回、ヒトのTrpRSの新規機能を探索したところ、酸化ストレス下で、ある有機化合物と複合体を形成することを発見した。現在、部位特異的アミノ酸置換体を作製し、分子レベルでの制御メカニズム、及び、生理機能の解明を目指している...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1997 - 1998

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / ヘリックス・ターン・ヘリックス / リン酸基結合 / DNAポリメラーゼβ / 434Cro (他15件)

【概要】転写因子において塩基認識部位には共通の立体構造が存在することが知られている。それでは、これらのタンパク質のリン酸基結合部位には共通の構造が存在するのであろうか。タンパク質-DNA複合体のモジュール構造を調べたところ、DNAのリン酸基にのみ結合するモジュールが存在することがわかった。リン酸基結合モジュールを比較した結果、原核生物と真核生物の転写因子及びポリメラーゼの4つのタンパク質に、類似の立体構造...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】奨励研究(A)

【研究期間】1997 - 1998

【研究代表者】由良 敬 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50252226)

【キーワード】モジュール / ヘリックス・ターン・ヘリックス / リン酸基結合 / DNAポリメラーゼβ / 434Cro (他15件)

【概要】転写因子において塩基認識部位には共通の立体構造が存在することが知られている。それでは、これらのタンパク質のリン酸基結合部位には共通の構造が存在するのであろうか。タンパク質-DNA複合体のモジュール構造を調べたところ、DNAのリン酸基にのみ結合するモジュールが存在することがわかった。リン酸基結合モジュールを比較した結果、原核生物と真核生物の転写因子及びポリメラーゼの4つのタンパク質に、類似の立体構造...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2006 - 2009

【研究代表者】郷 通子 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 特別客員教授 (70037290)

【キーワード】タンパク質立体構造 / 選択的スプライシング / ホモロジーモデリング / データベース / RNA編集 (他12件)

【概要】ゲノムにコードされている遺伝子の数は予想よりも少なく、遺伝子の転写後に起きる選択的スプライシングによって、ひとつの遺伝子から複数個の転写産物ができることが明らかになっている。ひとつの遺伝子由来の複数のタンパク質にどのような構造の違いがあり、どのように機能が変化しているのかを実験的に調べることは困難である。そこでタンパク質の構造と機能の変化を計算生物学の手法で推定できるようにした。選択的スプライシン...

【研究テーマ】生物物理学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2001 - 2002

【研究代表者】由良 敬 特殊法人日本原子力研究所, 計算科学技術推進センター, 研究員 (50252226)

【キーワード】モジュール / ゲノム配列 / 3Dキーノート / 機能予測 / シアノバクテリア (他12件)

【概要】全ゲノム配列が発表されている生物種は、100種を越えた。生体で機能している高分子は大部分がタンパク質であるため、集積されたゲノム配列にどのような機能を持ったタンパク質があるかを知る必要がある。しかし、ゲノム配列からタンパク質の機能を推定する方法はまだ確立していない。ゲノムにあるORFの約半数は機能が推定できていない。申請者は立体構造が類似であり、機能部位の詳細な構造が類似のリン酸基結合モジュールを...

【研究テーマ】広領域

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】1999 - 2002

【研究代表者】郷 通子 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70037290)

【キーワード】モジュール / 機能予測 / 3Dキーノート / ヒトゲノム / ゲノム情報 (他18件)

【概要】本研究の目的はモジュールに基づいてプロテオームの機能を予測する技術を研究開発することであった。モジュールは空間情報であるため、進化の過程でアミノ酸配列よりも保存されることから、モジュールを使えばモチーフを使うよりも高感度に機能予測ができる。モジュールの知識情報を見通しよく整理して分類することにより、ゲノム情報からタンパク質機能を予測する方法の確立と実用化を目的とした。立体構造が解析されたタンパク質...

【研究テーマ】経営学

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2002 - 2005

【研究代表者】新宅 純二郎 東京大学, 大学院・経済学研究科, 助教授 (00216219)

【キーワード】技術移転 / 特許 / リソースベース / 光ディスク / モジュール (他24件)

【概要】本研究の前半では、まず特許等の知的財産権を中心にして、技術移転プロセスに関する制度や実態の調査を行った。技術移転にはライセンシングに限らず様々なパターンがあるが、大学を中心とした技術移転、特に大学発ベンチャーには発明をビジネスとして扱う発想が乏しいことが明らかになった。今ある技術シーズよりも、広い意味での技術力やビジネス面での経営者の力量が、技術移転の成功にとって大きな鍵であることが分かってきた。...

【研究テーマ】生体生命情報学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2010 - 2012

【研究代表者】澤井 哲 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (20500367)

【キーワード】生体情報 / 振動 / 適応 / 粘菌 / 入出力関係 (他11件)

【概要】複数の時間スケールで生じる適応的、振動的な細胞応答について細胞性粘菌のcAMP刺激にたいする細胞内cAMPの一過的な上昇を題材にとり、定量的な解析をおこなった。早い最初のピークが相対変化検出をおこない、絶対濃度にたいして変化した出力であり、かつ周波数応答性をもつのにたいし、後者は絶対濃度に依存すること、また前者が受容体レベルの修飾に依存するのにたいし、後者はアクチン重合を介したフィードバックによる...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】若杉 桂輔 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教授 (20322167)

【キーワード】蛋白質工学 / シグナル伝達 / 酸化ストレス / 細胞死 / 人工制御 (他15件)

【概要】1.トリプトファニルtRNA合成酵素(TrpRS)の酸化ストレス下での新規機能の解明 TrpRSは、tRNAにトリプトファンを結合させる反応(アミノアシル化)を触媒する酵素である。今回、ヒトのTrpRSの新規機能を探索したところ、酸化ストレス下で、ある有機化合物と複合体を形成することを発見した。現在、部位特異的アミノ酸置換体を作製し、分子レベルでの制御メカニズム、及び、生理機能の解明を目指している...

【研究テーマ】機能生物化学

【研究種目】若手研究(B)

【研究期間】2003 - 2005

【研究代表者】若杉 桂輔 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教授 (20322167)

【キーワード】蛋白質工学 / シグナル伝達 / 酸化ストレス / 細胞死 / 人工制御 (他15件)

【概要】1.トリプトファニルtRNA合成酵素(TrpRS)の酸化ストレス下での新規機能の解明 TrpRSは、tRNAにトリプトファンを結合させる反応(アミノアシル化)を触媒する酵素である。今回、ヒトのTrpRSの新規機能を探索したところ、酸化ストレス下で、ある有機化合物と複合体を形成することを発見した。現在、部位特異的アミノ酸置換体を作製し、分子レベルでの制御メカニズム、及び、生理機能の解明を目指している...

【研究テーマ】生体生命情報学

【研究種目】若手研究(A)

【研究期間】2010 - 2012

【研究代表者】澤井 哲 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 准教授 (20500367)

【キーワード】生体情報 / 振動 / 適応 / 粘菌 / 入出力関係 (他11件)

【概要】複数の時間スケールで生じる適応的、振動的な細胞応答について細胞性粘菌のcAMP刺激にたいする細胞内cAMPの一過的な上昇を題材にとり、定量的な解析をおこなった。早い最初のピークが相対変化検出をおこない、絶対濃度にたいして変化した出力であり、かつ周波数応答性をもつのにたいし、後者は絶対濃度に依存すること、また前者が受容体レベルの修飾に依存するのにたいし、後者はアクチン重合を介したフィードバックによる...

【研究テーマ】社会心理学

【研究種目】萌芽研究

【研究期間】2005 - 2006

【研究代表者】亀田 達也 北海道大学, 大学院文学研究科, 教授 (20214554)

【キーワード】地位 / モジュール / 適応 / 進化 / 社会制御 (他7件)

【概要】本研究は人間の社会性の理解にとって重要でありながら、体系的に検討されることの少なかった「人間の集団内地位行動」に進化・生態学的観点から接近を試みる。近年の霊長類学や行動生態学の知見が示すように、霊長類は、地位構造を含む集団内の社会関係を巧みに利用しながら集団生活への適応を実現している。マキャヴェリ的知性に関する研究は、チンパンジーのオスが社会的序列を利用した複雑な同盟関係を結び、メスもまたそうした...

【研究テーマ】日本語教育

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2000 - 2003

【研究代表者】鎌田 修 南山大学, 人文学部, 教授 (20257760)

【キーワード】接触場面 / 教材バンク / 接触場面の目録化 / 言語活動 / 族類似カテゴリー (他17件)

【概要】所期の目的を達すべく以下のように主なる活動を行ってきた。 ・2000年度 日本及び、欧州の拠点地にて基礎調査、研究集会を行った。 ・2001年度 日独ベルリンセンターにて本研究に関与する日本語教師、及び、日本語教育研究者があつまり、本プロジェクトの大枠作りを行った。 ・2002年度 日本、および、欧州の拠点地にて「接触場面」のビデオ取りとその分析を開始、また、日独ベルリンセンターに集まり、それらの...