タンパク質・糖鎖相互作用予測システムおよびデータベースの開発
【研究分野】生体生命情報学
【研究キーワード】
タンパク質 / 糖鎖 / 相互作用予測 / データベース / バイオインフォマティクス / 糖 / 相互作用 / 予測機能
【研究成果の概要】
本研究では、タンパク質-糖鎖の相互作用に関して、糖鎖結合タンパク質予測(与えられたタンパク質が糖鎖と結合するかどうかを予測)、タンパク質-糖鎖結合部位予測(与えられたタンパク質が糖鎖と結合する残基、構造が得られている場合は空間上の位置を予測)、結合糖鎖予測(与えられたタンパク質に結合する糖鎖を予測)、タンパク質-糖鎖ドッキング予測、タンパク質-糖鎖相互作用解析、糖修飾部位予測(タンパク質が糖鎖修飾を受ける部位を予測)の各手法を実現し、統合的に利用できるようにするとともに、タンパ質-糖鎖の相互作用
に関して、配列、構造、機能に関するさまざまな情報を登録した総合的なデータベースを構築した。
【研究代表者】
【研究分担者】 |
寺田 透 | 東京大学 | 大学院農学生命科学研究科 | 准教授 | (Kakenデータベース) |
角越 和也 | 東京大学 | 大学院農学生命科学研究科 | 助教 | (Kakenデータベース) |
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【研究種目】基盤研究(B)
【研究期間】2011-04-01 - 2015-03-31
【配分額】18,980千円 (直接経費: 14,600千円、間接経費: 4,380千円)