多様性創出新機構の探索:同一個体内ゲノムの体細胞間変異の定量化
【研究分野】生物多様性・分類
【研究キーワード】
植物 / モデル化 / 生理学 / 遺伝子 / 環境
【研究成果の概要】
北海道大学苫小牧研究林の林冠観測用クレーンシステムを利用して樹高約20m,樹齢150年以上のミズナラとカエデを対象に,異なる枝位置から各3反復ずつ葉と花組織の採取を行った.得られたサンプルから全DNAを抽出し,次世代シーケンサーを用いて大規模塩基配列を取得した結果,約1500遺伝子座において総数100,000塩基の配列情報を取得した.塩基置換が生じた配列を探索した結果,同一個体あたり最大2個の突然変異が検出された.突然変異が観察された位置を分析した結果,一度突然変異が生じるとそれは後に形成された枝に引き継がれていることが確認されたため,同一個体内におけるモザイク状ゲノム構成の存在が示唆された.
【研究代表者】
【研究分担者】 |
陶山 佳久 | 東北大学 | 農学研究科 | 准教授 | (Kakenデータベース) |
日浦 勉 | 北海道大学 | 北方生物圏フィールド科学センター | 教授 | (Kakenデータベース) |
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【研究種目】挑戦的萌芽研究
【研究期間】2014-04-01 - 2015-03-31
【配分額】4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)