【研究分野】応用微生物学

【研究領域課題番号】26292047 (KAKENデータベースで見る）

【研究キーワード】

微生物機能 / 窒素固定 / 水素代謝 / 共生 / シングルセルゲノム / 還元的酢酸生成 / Bacteroidales目細菌 / スピロヘータ / ゲノム / 生態 / 進化 / 微生物 / 生態学 / 分類学 / 微生物ゲノム / 微生物進化 / 生物多様性 / 難培養微生物

【研究成果の概要】

Bacteroidales目細菌において、窒素固定あるいは古細菌の水素代謝に関連する遺伝子をゲノム上に有する細菌種を見出し、培養株で活性を検出した。シロアリ腸内の窒素固定と水素利用還元的酢酸生成に働く細菌として、セルロース分解性原生生物の細胞内共生スピロヘータを同定した。この細胞内共生細菌と原生生物の細胞表層に共生するBacteroidales目細菌２種について、シングルセルゲノム解析で機能と共生機構の解明を行なった。

【研究種目】基盤研究(B)

【研究期間】2014-04-01 - 2017-03-31

【配分額】16,640千円 (直接経費: 12,800千円、間接経費: 3,840千円)

【研究分野】土木環境システム

【研究領域課題番号】24254003 (KAKENデータベースで見る）

【研究キーワード】

生物多様性 / ＤＮＡ / 洪水氾濫原 / 生息場 / 河川 / 進化 / イタリアアルプス / 種分類 / 国際研究者交流 / イタリア / DNA / ドイツ

【研究成果の概要】

本研究は，ヨーロッパアルプスの中で例外的に残された北東イタリアの自然流域を参照し，自然再生で目指すべき種多様性の目標像を示すことを目的とする．DNA種分類に基づいて，未記載種も含む河川底生動物群集の種多様性を評価し，生息場間の環境多様性や流倒木などの微笑生息場の生態学的な重要性が確認された．また，自然氾濫原における洪水撹乱による生息場地形の更新（生息場寿命）が種多様性を維持する機構も解明した。

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2012-04-01 - 2015-03-31

【配分額】44,720千円 (直接経費: 34,400千円、間接経費: 10,320千円)

【研究分野】生物多様性・分類

【研究領域課題番号】21227002 (KAKENデータベースで見る）

【研究キーワード】

生物多様性 / 進化 / 種分化 / 大進化 / 新規形質獲得

【研究成果の概要】

本研究では、ビクトリア湖産シクリッドに注目した種分化・種形成に関わる遺伝領域の探索、および哺乳類の脳などの特異的な形態獲得に関与したシス制御配列の進化機構の研究をおこなった。シクリッドに関しては、性決定機構や嗅覚受容体遺伝子の多様化、光受容体遺伝子と体色の間の相関関係を明らかにし、また異種間交雑種を用いた連鎖群解析により性決定候補領域の特定に成功した。哺乳類に関しては、間脳や脳梁などの形態形成に関与するAmnSINE1由来エンハンサーに関して、その分子メカニズムと獲得過程を明らかにすることができた。本研究で明らかになった生物進化の分子機構は、多くの生物種において普遍的なものであると考えられる。

【研究種目】基盤研究(S)

【研究期間】2009-05-11 - 2014-03-31

【配分額】147,940千円 (直接経費: 113,800千円、間接経費: 34,140千円)

【研究分野】進化生物学

【研究領域課題番号】21247038 (KAKENデータベースで見る）

【研究キーワード】

進化 / 生物多様性 / 種分化 / エンハンサー

【研究成果の概要】

1)種分化研究
光受容体が生息する光環境に適応していることを明らかにするために、ビクトリア湖内のほぼすべての環境に生息する様々な種を用いて、光受容体遺伝子の配列決定を行った。また、それらの配列からタンパク質を産生し、視物質の再構築を行いその吸収波長を測定した。視物質の吸収からシクリッドの種は光受容体を光環境に適応させていることの一部が明らかになった。
2)哺乳類特異的に保存されたSINE由来エンハンサーの網羅的探索
哺乳類特異的に保存されたAmnSINE1配列の中で現在約100遺伝子座が未解析であるため、これらの一部に関して哺乳類特異的エンハンサーの網羅的スクリーニングをおこなった。その結果、エンハンサーの候補になる遺伝子座が得られた。また、これまでに得られているエンハンサーで、特に脳などの哺乳類特異的な組織において活性を持つものに着目し、その発現誘導の対象遺伝子を同定するために近傍遺伝子のin situ hybridizationを行った。そしてマウス発生過程におけるどの器官形成の発現調節に関与しているかの解析の一部を行った。その結果、器官形成の発現調節に関与している可能性がある結果が得られた。

【研究種目】基盤研究(A)

【研究期間】2009

【配分額】16,770千円 (直接経費: 12,900千円、間接経費: 3,870千円)