RNA・タンパク質相互作用の網羅的予測と検証
【研究分野】生命・健康・医療情報学
【研究キーワード】
RNA2次構造 / RNA-タンパク質相互作用 / ドッキング計算 / RNAタンパク質相互作用 / RNA・タンパク質相互作用 / RNA立体構造 / RNA2次構造
【研究成果の概要】
RNAとタンパク質の相互作用の有無及び複合体構造予測を行うことを目指した。PDBのRNA-タンパク質複合体の情報解析から、2次構造で塩基対を形成せずアミノ酸と水素結合を形成する塩基は、2次構造での塩基対形成もアミノ酸との水素結合もない塩基に比べて,低い塩基対確率を持つことがわかった。RNA2次構造を多面的に解析するため、参照構造からの2次構造のハミング距離毎の構造全ての確率の合計の分布を高速に計算する方法を開発した。RNAとタンパク質の物理化学的性質を考慮した力場を導入したRNA-タンパク質複合体のドッキング手法を開発し、既存の方法よりも大幅に性能が改善することを明らかとなり、論文発表した。
【研究代表者】