理化学研究所 研究シーズ|
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研究キーワード：理化学研究所における「マイクロバイオーム」 に関係する研究一覧：3件
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発表日：2025年10月15日
1
遺伝子と腸内細菌の相互作用を日本の研究で確認
－統計的厳密性と手法標準化の重要性を強調－
理化学研究所（理研）生命医科学研究センター ゲノム解析応用研究チームの寺尾 知可史 チームディレクター、デイビッド・オルテガ＝レイエス 大学院生リサーチ・アソシエイト（研究当時、現 粘膜システム研究チーム 特別研究員）、粘膜システム研究チームの大野 博司 チームディレクターらの共同研究グループは、欧州でしか研究されてこなかったヒト遺伝子が腸内細菌叢（さいきんそう）[1]の構成に与える影響について、東京大学医学部附属...
キーワード：統計モデル/ロジスティック回帰/回帰分析/プロトコル/免疫機能/遺伝と環境/微生物群集/ゲノムDNA/ゲノミクス/コドン/生物群集/マイクロ/統計解析/ビフィズス菌/変異体/嗅覚受容体/遺伝的変異/共生微生物/炭水化物/抵抗性/微生物/アミノ酸配列/免疫系/ゲノムワイド/環境要因/強皮症/微生物叢/ヒトゲノム/病理/予後因子/アルコール/ゲノムワイド関連解析/ゲノム解析/メタゲノム/寿命/エンハンサー/統計的手法/病態解明/B細胞/アミノ酸/インスリン/ラット/炎症性サイトカイン/血液/細胞分化/受容体/転写因子/内分泌/白血病/発現制御/免疫細胞/2型糖尿病/GWAS/インスリン抵抗性/ゲノム/サイトカイン/マイクロバイオーム/リスク因子/遺伝子/遺伝子変異/健康寿命/細菌/細菌叢/精神疾患/腸内細菌/腸内細菌叢/糖尿病/標準化/予防医学
他の関係分野：情報学複合領域環境学化学生物学工学農学
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発表日：2025年10月2日
2
細菌がつくるナノサイズの遺伝子カプセルが進化を促す
－疾患診断におけるバイオマーカーとしての展開に期待－
理化学研究所（理研）バイオリソース研究センター 統合情報開発室の高野 壮太朗 開発研究員らの共同研究グループは、細菌がつくり出すナノサイズの粒子（細菌膜小胞[1]）に含まれる遺伝子配列を網羅的に解析する技術を開発し、細菌膜小胞がヒトやウイルスとの相互作用に重要な遺伝子を特に多く含んでいること、それらが細菌同士で遺伝子をやり取りする仕組み（遺伝子水平伝...
キーワード：スループット/データ駆動/類似度/ドロップレット/フィルム/高分子/遺伝情報/塩基配列/系統樹/比較ゲノム解析/微小液滴/ACT/ベシクル/固体表面/物質輸送/ナノサイズ/ナノメートル/マイクロ/自動化/ハイスループット/遺伝子クラスター/CRISPR-Cas/マッピング/biosynthesis/ゲノム配列/病原菌/環境ストレス/ゲノム編集技術/感染防御/生態系/環境応答/形質転換/病原性/比較ゲノム/微生物/免疫系/獲得免疫/細胞膜/CRISPR/レドックス/遺伝子解析/染色体/ゲノム解析/ゲノム編集/歯周病/CRISPR-Cas9/PCR/ファージ/リポ多糖/抗生物質/細胞死/創薬/代謝物/ウイルス/ゲノム/ストレス/バイオフィルム/バイオマーカー/マイクロバイオーム/ワクチン/遺伝子/公衆衛生/細菌/細菌叢/腸内細菌/腸内細菌叢
他の関係分野：情報学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年7月31日
3
微生物群と代謝物のデータを統合し分類する新解析法I-SVVSを開発
東京大学 大学院農学生命科学研究科の岩田 洋佳 教授らは、統合確率的変分変数選択（I-SVVS）という新しい手法を開発しました。これは、植物の根圏土壌や動物の腸内など、ホスト生物の近傍に存在する微生物叢（マイクロバイオーム）と代謝物（メタボローム）のデータを統合し、分類（クラスタリング）を行うことで、微生物と代謝物の関係を解明する技術です。詳細は東京大学大学院農学生命科学研究科・農学部のホームページをご覧くださ...
キーワード：変数選択/クラスタリング/マイクロ/土壌/微生物/微生物叢/代謝物/マイクロバイオーム/メタボローム
他の関係分野：情報学工学農学