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研究キーワード:理化学研究所における「構造変化」 に関係する研究一覧:12件
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発表日:2025年11月20日
1
遺伝子スケールのクロマチンを設計し再構成する
-3次元DNA構造の構築原理に迫る、ゲノム物理の新基盤-
理化学研究所(理研)生命機能科学研究センター 生体非平衡物理学理研白眉研究チーム(研究当時)の深井 洋佑 研究員(研究当時、現 開拓研究所 川口生体非平衡物理学研究室 研究員)、川口 喬吾 理研白眉研究チームリーダー(研究当時、現 開拓研究所 川口生体非平衡物理学研究室 主任研究員、東京大学 大学院理学系研究科附属知の物理学研究センター 准教授)、エピジェネティクス制御研究チーム(研究当時)の若森 昌聡 技師(研究当時)、梅原 崇史 チームリーダー(研究当時、現 立命館大学 薬学部 教授)、東京大学 定量生命科学研究所 先端定量生命科学研究部門 クロマチン構造機能研究分野の鯨井 智也 講師、胡...
キーワード:コンパートメント/先端技術/非平衡/非平衡物理/非平衡物理学/輸送現象/一分子観察/遺伝情報/ACT/ヒストン/単一分子/ドメイン構造/3次元構造/カリウム/ダイナミクス/ナノメートル/ポリマー/原子間力顕微鏡/物理モデル/流体力/流体力学/Hi-C/ヌクレオソーム/遺伝子クラスター/カルス/ゲノム構造/タンパク質修飾/クロマチン構造/細胞運命/ゲノム情報/DNA修復/エピジェネティクス制御/クロマチン/遺伝子制御/染色体/免疫制御/ゆらぎ/エンハンサー/DNAメチル化/in vitro/アセチル化/がん細胞/ヒストン修飾/メチル化/ラット/蛍光色素/蛍光標識/構造変化/細胞核/自然免疫/生体分子/創薬/翻訳後修飾/立体構造/ゲノム/遺伝子/遺伝子発現/網羅的解析
他の関係分野:情報学複合領域数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年11月15日 この記事は2025年11月29日号以降に掲載されます。
2
細胞膜がタンパク質の形を変える鍵だった
-分子スイッチ「Rac1」を活性化する分子複合体の構造を解明-
この記事は2025年11月29日号以降に掲載されます。
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発表日:2025年11月11日
3
機械学習が導く「水を抱える材料」の設計方程式
-ワンヘルスに寄与する高分子材料の創出法を確立-
理化学研究所(理研)環境資源科学研究センター 環境代謝分析研究チームの岡田 真幸 研修生、朱 文睿 人材派遣職員、天本 義史 客員研究員、菊地 淳 チームディレクターの研究チームは、データ駆動型アプローチ[1]による高分子材料の新規設計に寄与する手法論(方程式の創出法)を構築しました。本研究成果で得られた知見は、紙おむつなどで使われる水を抱える材料(ハイドロゲル)の設計をデータ駆動型アプローチに変換し、ワンヘルス[...
キーワード:データ駆動/AI/ディープラーニング/機械学習/人工知能(AI)/環境汚染/分析技術/化学物質/環境浄化/原子核/磁気共鳴/水分子/水溶液/ガラス転移/安定同位体/気候変動/水蒸気/相転移/同位体/磁場/分子運動/高分子/ハイドロゲル/持続可能/持続可能な開発/透明性/材料設計/エンジン/シミュレーション/スピン/プラスチック/ポリマー/結晶化/高分子材料/水素原子/性能評価/半導体/技術革新/生物多様性/発展途上国/カップリング/DDS/アミノ酸/リガンド/核磁気共鳴/核磁気共鳴法/官能基/構造変化/受容体/創薬/相互作用解析
他の関係分野:情報学環境学数物系科学化学工学農学
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発表日:2025年10月30日
4
イヌの薬物代謝の個体差における原因の一端を解明
-CYP2B6解析でヒトやイヌの安全な薬物治療の発展に貢献-
理化学研究所(理研)生命医科学研究センター 基盤技術開発研究チームの桃沢 幸秀 チームディレクター(生命医科学研究センター 副センター長)、ファーマコゲノミクス研究チームの福永 航也 上級研究員、鹿児島大学 共同獣医学部の宇野 泰広 教授、昭和薬科大学 薬物動態学研究室の山崎 浩史 教授、東京大学 大学院農学生命科学研究科の富安 博隆 准教授、日本動物高度医療センターの辻本 元 科長、ITEA株式会社 東京環境アレルギー研究所の阪口 雅弘 所長、麻布大学 獣医学部 小動物内科学研究室の久末 正晴 教授らの共同研究グル...
キーワード:協同性/タンパク質構造/ゲノミクス/遺伝情報/塩基配列/クロム/構造モデル/反応速度/シミュレーション/ドッキング/生体内/イントロン/カルス/酸化酵素/哺乳類/P450/ゲノム配列/ウシ/獣医学/酵素活性/遺伝的多様性/アミノ酸配列/機能解析/マウスモデル/酵素反応/ゲノム解析/大腸/アミノ酸置換/in vitro/アミノ酸/グルタミン酸/スプライシング/チトクロームP450/マウス/モデル動物/リガンド/構造変化/酸化反応/受容体/創薬/体内動態/代謝酵素/大腸菌/副作用/薬物代謝/薬物代謝酵素/薬物動態学/立体構造/臨床試験/アレルギー/ゲノム/遺伝学/遺伝子/肝移植/個別化医療/網羅的解析/薬物相互作用/薬物動態
他の関係分野:化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年9月27日
5
ゲノム構造は“多重の守り”で維持される
-発生や疾患における構造変化の理解に新たな手がかり-
理化学研究所(理研)開拓研究所 眞貝細胞記憶研究室の福田 渓 客員研究員、志村 知古 テクニカルスタッフⅠ、眞貝 洋一 主任研究員の研究チームは、空間的ゲノム構造(3Dゲノム)[1]が複数のクロマチン修飾[2]によって安定的に維持されていることを明らかにしました。この成果は、発生や疾患で見られる3Dゲノムの変化や異常のメカニズムの解明に貢献すると期待されます。研究チームは、独自に作製し...
キーワード:プロファイル/初期胚/タンパク質複合体/胚発生/ヒストン/ドメイン構造/3次元構造/モーター/構造制御/Hi-C/コヒーシン/ゲノム機能/トランスポゾン/カルス/哺乳類/ゲノム構造/クロマチン構造/酵素活性/サイレンシング/ヘテロクロマチン/初期胚発生/接着因子/転写抑制/プロモーター/ポリコーム/酵素阻害/クロマチン/ゲノム安定性/細胞株/染色体/胎児/反復配列/分子機構/エンハンサー/次世代シーケンサー/線維芽細胞/RNA/ヒストン修飾/マウス/メチル化/遺伝子発現制御/構造変化/酵素阻害剤/細胞核/細胞分化/阻害剤/転写因子/発現制御/ゲノム/遺伝子/遺伝子発現/発達障害/老化
他の関係分野:情報学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年9月17日
6
コヒーレントX線により金属材料内部のナノ構造変化を”動画”で観察
-高性能材料開発に繋がる新手法-
東北大学 国際放射光イノベーション・スマート研究センターの高澤 駿太郎 助教(理化学研究所 放射光科学研究センター イメージングシステム開発チーム 客員研究員)と高橋 幸生 教授(理化学研究所 放射光科学研究センター イメージングシステム開発チーム チームリーダー)らは、二宮 翔 助教、星野 大樹 准教授、西堀 麻衣子 教授、理化学研究所 放射光科学研究センター放射光機器開発チームの初井 宇記 チームリーダー、北陸先端科学技術大学院大学 共創インテリジェンス研究領域のダム ヒョウ チ 教授らと共同で、コヒーレントX線回折を用いる複数の手法を統合した新しい解析フレームワークを構築しました。...
キーワード:インテリジェンス/フレームワーク/システム開発/コヒーレント/X線回折/放射光/ナノ構造/金属材料/構造変化
他の関係分野:情報学複合領域数物系科学工学
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発表日:2025年9月14日
7
補酵素骨格を転移する生合成酵素の触媒機構を解明
-酵素を使った抗生物質のカスタム化へつながる一歩-
理化学研究所(理研)環境資源科学研究センター ケミカルバイオロジー・生合成研究チームの淡川 孝義 チームディレクター、全 智揚 研究員らの共同研究グループは、抗生物質の生合成においてメチル化に関わる補酵素[1]のS-アデノシルメチオニン(SAM)[2]の代謝に関係する新規酵素の触媒機構の解明に成功しました。本研...
キーワード:水分子/分子動力学シミュレーション/X線回折/二量体/アンモニア/求核置換反応/触媒反応/天然物合成/反応機構/RNA修飾/アミン/触媒機能/遷移状態/活性化エネルギー/シミュレーション/酸化物/動力学/分解能/分子動力学/量子力学/酵素工学/天然物化学/物質生産/生物物理学/X線結晶構造/システイン/部位特異的変異/biosynthesis/結晶構造/変異体/細胞壁/病原性/生合成/生合成遺伝子/生合成酵素/微生物/アミノ酸配列/プロトン/ビタミン/アルギニン/エピジェネティクス制御/酵素反応/ポリアミン/生物物理/ATP/RNA/アミノ酸/グルタミン酸/ケミカルバイオロジー/ヘリックス/メチル化/ラジカル/ラット/リガンド/化合物ライブラリー/官能基/抗菌薬/抗生物質/構造変化/合成生物学/生体分子/阻害剤/創薬/低分子化合物/誘導体/立体構造/ゲノム/遺伝子/細菌/疼痛
他の関係分野:数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年8月20日
8
生体分子モーターの回転駆動機構を原子レベルで解明
-「歪み」と「押し出し」から成る駆動力-
理化学研究所(理研)開拓研究所 杉田理論分子科学研究室の杉田 有治 主任研究員(計算科学研究センター 粒子系生物物理研究チーム チームプリンシパル)、本橋 昌大 大学院生リサーチ・アソシエイトらの共同研究グループは、生体内でエネルギー変換を担う分子モーター[1]である「F1-ATPase」の回転機構について、計算機シミュレーションを用いて解析し、原子レベルの「歪(ひず)み」と「押し出し」によっ...
キーワード:データ駆動/スーパーコンピュータ/最適化/自由エネルギー/人工知能(AI)/計算量/分子動力学シミュレーション/計算機シミュレーション/分子構造/一分子観察/高分子/ATP合成/静電相互作用/材料科学/生体分子モーター/結合状態/加水分解/遷移状態/水分解/単一分子/TMD/シミュレーション/ナノスケール/ポリマー/マルチスケール/モーター/モデリング/結晶化/大規模計算/電子顕微鏡/電子顕微鏡法/動力学/分解能/分子シミュレーション/分子動力学/並列計算/生体内/エネルギー変換/好熱菌/リン酸/スギ/ATP合成酵素/MDシミュレーション/クライオ電子顕微鏡/分子モーター/高分解能/細胞膜/アデノシン/ナノマシン/生物物理/動態解析/分子機構/ナノテクノロジー/ATP/アミノ酸/ミトコンドリア/構造変化/高次構造/細胞骨格/生体高分子/生体分子/生体膜/分子動力学計算/立体構造/細菌/脂質
他の関係分野:情報学数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日:2025年7月31日
9
カーボンナノベルトの一挙多官能基化に成功
-分子性ナノカーボン材料の応用研究を加速する発見-
理化学研究所(理研)開拓研究所 伊丹分子創造研究室の伊丹 健一郎 主任研究員(環境資源科学研究センター 拡張ケミカルスペース研究チーム チームディレクター、名古屋大学トランスフォーマティブ生命分子研究所(WPI-ITbM)主任研究者)、奥村 翼 研修生(名古屋大学 大学院理学研究科 博士前期課程学生)らの国際共同研究グループは、炭素でできた筒状分子であるカーボンナノベルトの一挙多官能基(機能を持った原子団)化法の開発に成功しました。本研究成果により、カーボンナノベルトが...
キーワード:原子核/磁気共鳴/対称性/スペクトル/磁場/大環状分子/分子構造/アントラセン/自己組織/エステル/ピリジン/機能性分子/高分子/超分子化学/有機エレクトロニクス/有機分子/材料科学/ナノカーボン/ベンゼン/単結晶/カーボン/センサー/マグネシウム/水素原子/単結晶X線構造解析/電磁波/分子センサー/X線構造解析/バイオマテリアル/生体内/疎水性相互作用/カルス/機能性/運動神経/カーボン材料/組織化/超分子/分子機能/交感神経/神経伝達物質/副交感神経/アセチルコリン/アミノ酸/核磁気共鳴/官能基/構造変化/生体高分子/付加反応/分子認識
他の関係分野:数物系科学化学総合理工工学総合生物農学
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発表日:2025年7月31日
10
高伝導性フラストレート磁性体における巨大ホール効果
-磁性体における異常ホール効果の新しい発現機構を実証-
理化学研究所(理研)創発物性科学研究センター 創発機能磁性材料研究ユニットの軽部 皓介 ユニットリーダー、強相関物質研究グループの田口 康二郎 グループディレクター、計算物質科学研究チームの有田 亮太郎 チームディレクター、強相関量子構造研究グループの有馬 孝尚 グループディレクター、強相関物性研究グループの十倉 好紀 グループディレクター、日本原子力研究開発機構 J-PARCセンターの大原 高志 研究主幹、総合科学研究機構 中性子科学センターの宗 像孝司 副主任技師らの共同研究グループは、高伝導性...
キーワード:効果測定/カイラリティ/カゴメ格子/シュレーディンガー方程式/スピン系/スピン偏極/バンド構造/フェルミ面/フラストレーション/ベリー位相/異常ホール効果/幾何学/強磁場/三角格子/磁気構造/磁気相転移/磁気秩序/対称性/電子散乱/熱測定/非線形/非線形伝導/物質科学/物性物理/輸送現象/揺らぎ/量子伝導/J-PARC/ガドリニウム/スケーリング/ホール効果/異方性/相転移/中性子/中性子回折/磁場/超伝導/高移動度/キラル/カイラル磁性体/トポロジカル/幾何学的フラストレーション/強相関/磁性体/バンド計算/FET/キャリア/強磁性/量子構造/強磁性体/局所構造/金属間化合物/金属物性/原子構造/磁性材料/単結晶/電気抵抗/電子構造/電子状態/ウラン/スピン/センサー/モデル化/移動度/機構総合/金属材料/原子力/第一原理/第一原理計算/半導体/密度汎関数理論/量子力学/カルス/構造変化
他の関係分野:複合領域数物系科学化学総合理工工学農学
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発表日:2025年7月31日
11
神経回路の形成に重要なmRNAのメチル化
-細胞体でのメチル化が成長円錐での翻訳を制御-
理化学研究所(理研)生命機能科学研究センター 脳エピトランスクリプトミクス研究チーム(研究当時)の王 丹 チームリーダー(研究当時)、ロイック・ブロワ JSPS外国人特別研究員(研究当時)、ロヒニ・ロイ テクニカルスタッフⅡ(研究当時)らの国際共同研究グループは、RNA結合タンパク質[1]の一種、APC[2]の...
キーワード:RNA修飾/タンパク質合成/ナノメートル/マイクロ/統合システム/シナプス/神経回路形成/成長円錐/大脳/イントロン/カルス/変異体/アミノ酸配列/環境要因/統合失調症/脳神経科学/APC/アデノシン/mRNA/軸索輸送/胎児/大腸/微小管/解剖学/RNA/RNA結合タンパク質/アクチン/アミノ酸/シナプス形成/チューブリン/トランスクリプトミクス/ヌクレオシド/マウス/メチル化/構造変化/細胞骨格/樹状突起/神経科学/神経回路/神経細胞/生体分子/発現制御/コミュニケーション/遺伝子/遺伝子発現/遺伝子変異/海馬/自閉スペクトラム症/精神疾患
他の関係分野:生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年7月31日
12
人工イオンチャネルの精密デザインに成功
-膜ペプチドの集まる数を自在に制御して新機能の創出へ-
理化学研究所(理研)生命機能科学研究センター 生体分子動態デザイン研究チームの新津 藍 チームリーダー、開拓研究本部 杉田理論分子科学研究室の杉田 有治 主任研究員、ジョン・ジェウン 専任技師、環境資源科学研究センター 触媒・融合研究グループの袖岡 幹子 グループディレクター、ブリストル大学のデレック・ウルフソン 教授、キングス・カレッジ・ロンドンのマーク・ワレス 教授らの国際共同研究グループは、自然界にはないタンパク質を理論的に設計する独自の手法を用いて、...
キーワード:スーパーコンピュータ/機械学習/人工知能(AI)/システム開発/水分子/水溶液/分子動力学シミュレーション/閉じ込め/バクテリア/α-ヘリックス/自己組織/アルキル化/一分子観察/自己集合/タンパク質合成/ロイシン/細胞内小器官/膜輸送/遺伝情報/抗菌ペプチド/膜輸送体/タンパク質デザイン/メモリ/絶縁体/選択性/構造モデル/動的挙動/二次構造/電気抵抗/HPC/シミュレーション/ナノメートル/モデリング/界面活性剤/生産システム/設計法/動力学/導電性/分子動力学/タンパク質合成系/親水性/人工タンパク質/物質生産/人工細胞/超並列/分子システム/カルシウムイオン/システイン/ペプチド合成/輸送体/二重構造/スギ/Ca2+/アミノ酸配列/全反射蛍光顕微鏡/細胞膜/脂質二重膜/抗菌性/アミノ酸/イオンチャネル/カルシウム/ヘリックス/リン脂質/一分子イメージング/蛍光顕微鏡/蛍光色素/蛍光標識/抗生物質/構造変化/受容体/神経細胞/生体分子/生体膜/分子イメージング/分子動力学計算
他の関係分野:情報学複合領域数物系科学化学生物学工学総合生物農学
理化学研究所 研究シーズ