理化学研究所 研究シーズ|
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研究キーワード：理化学研究所における「微生物叢」 に関係する研究一覧：4件
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発表日：2025年10月15日
1
遺伝子と腸内細菌の相互作用を日本の研究で確認
－統計的厳密性と手法標準化の重要性を強調－
理化学研究所（理研）生命医科学研究センター ゲノム解析応用研究チームの寺尾 知可史 チームディレクター、デイビッド・オルテガ＝レイエス 大学院生リサーチ・アソシエイト（研究当時、現 粘膜システム研究チーム 特別研究員）、粘膜システム研究チームの大野 博司 チームディレクターらの共同研究グループは、欧州でしか研究されてこなかったヒト遺伝子が腸内細菌叢（さいきんそう）[1]の構成に与える影響について、東京大学医学部附属...
キーワード：統計モデル/ロジスティック回帰/回帰分析/プロトコル/免疫機能/遺伝と環境/微生物群集/ゲノムDNA/ゲノミクス/コドン/生物群集/マイクロ/統計解析/ビフィズス菌/変異体/嗅覚受容体/遺伝的変異/共生微生物/炭水化物/抵抗性/微生物/アミノ酸配列/免疫系/ゲノムワイド/環境要因/強皮症/微生物叢/ヒトゲノム/病理/予後因子/アルコール/ゲノムワイド関連解析/ゲノム解析/メタゲノム/寿命/エンハンサー/統計的手法/病態解明/B細胞/アミノ酸/インスリン/ラット/炎症性サイトカイン/血液/細胞分化/受容体/転写因子/内分泌/白血病/発現制御/免疫細胞/2型糖尿病/GWAS/インスリン抵抗性/ゲノム/サイトカイン/マイクロバイオーム/リスク因子/遺伝子/遺伝子変異/健康寿命/細菌/細菌叢/精神疾患/腸内細菌/腸内細菌叢/糖尿病/標準化/予防医学
他の関係分野：情報学複合領域環境学化学生物学工学農学
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発表日：2025年8月27日
2
環境保全型養殖への魚体画像診断イノベーション
－抗病性に貢献する好熱菌発酵飼料の機能性を評価－
理化学研究所（理研）環境資源科学研究センター 環境代謝分析研究チームの菊地 淳 チームディレクター、生命医科学研究センター 粘膜システム研究チームの大野 博司 チームディレクター、宮本 浩邦 客員主管研究員、バイオリソース研究センター 統合情報開発室の鈴木 健大 研究員、北里大学 医療衛生学部 血液学研究室の佐藤 隆司 講師らの共同研究グループは、医工学分野で活用される画像診断のための計算手法を応用し、魚体の画像を用いて非侵襲的に健康状態を評価する技術を開発しました。本開発技術の検証では、マダイの感染症発症と...
キーワード：ランダムフォレスト/画像データ/画像情報/ブースティング/学習アルゴリズム/AI/アルゴリズム/フレームワーク/機械学習/品質管理/一酸化二窒素/窒素循環/定量的評価/温室効果ガス/化学物質/海洋/普遍性/エントロピー/ノイズ/温室効果/惑星/植物相/生体触媒/定量評価/バイオリアクター/生物工学/持続可能/社会貢献/持続可能な開発/評価手法/カーボン/AMR/テクスチャ/メタン/リサイクル/環境負荷/自動化/生産性/医工学/園芸学/機能性/好熱菌/発酵/病原菌/共生細菌/環境保全/技術革新/ウシ/生態系/バイオマス/土壌/土壌微生物/病原性/生物多様性/微生物/病原体/細胞膜/微生物叢/HSV/生体防御/白血球/発展途上国/画像診断/血液/抗菌薬/迅速診断/スマートフォン/感染症/細菌/細菌叢/真菌/非侵襲/薬剤耐性
他の関係分野：情報学複合領域環境学数物系科学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年8月2日
3
日本人集団初の免疫細胞シングルセルアトラスの創生
－多層オミクス情報をシングルセル空間へ投影するフレームワークを開発－
大阪大学 大学院医学系研究科の枝廣 龍哉 助教（遺伝統計学/呼吸器・免疫内科学/理化学研究所 生命医科学研究センター システム遺伝学チーム 客員研究員）、佐藤 豪さん（当時：博士課程、現在：東京大学 大学院医学系研究科 遺伝情報学 助教/理化学研究所 生命医科学研究センター システム遺伝学チーム 客員研究員）、熊ノ郷 淳 教授（呼吸器・免疫内科学）、岡田 随象 教授（遺伝統計学/東京大学 大学院医学系研究科 遺伝情報学 教授/理化学研究所 生命医科学研究センター システム遺伝学チーム チームディレクター）らの研究グループは、日本人集団235名（新型コロナウイルス感染症：COVID-19患者88...
キーワード：フレームワーク/情報学/遺伝情報/生殖/微生物/シークエンス/遺伝統計学/生殖細胞/微生物叢/ウイルス感染症/オミクス/ヒトゲノム/体細胞変異/新型コロナウイルス/トランスクリプトーム/免疫細胞/ウイルス/ゲノム/遺伝学/感染症/新型コロナウイルス感染症/新型コロナウイルス感染症
他の関係分野：情報学生物学農学
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発表日：2025年7月31日
4
微生物群と代謝物のデータを統合し分類する新解析法I-SVVSを開発
東京大学 大学院農学生命科学研究科の岩田 洋佳 教授らは、統合確率的変分変数選択（I-SVVS）という新しい手法を開発しました。これは、植物の根圏土壌や動物の腸内など、ホスト生物の近傍に存在する微生物叢（マイクロバイオーム）と代謝物（メタボローム）のデータを統合し、分類（クラスタリング）を行うことで、微生物と代謝物の関係を解明する技術です。詳細は東京大学大学院農学生命科学研究科・農学部のホームページをご覧くださ...
キーワード：変数選択/クラスタリング/マイクロ/土壌/微生物/微生物叢/代謝物/マイクロバイオーム/メタボローム
他の関係分野：情報学工学農学