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研究キーワード:理化学研究所における「類似度」 に関係する研究一覧:6件
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発表日:2025年10月2日
1
細菌がつくるナノサイズの遺伝子カプセルが進化を促す
-疾患診断におけるバイオマーカーとしての展開に期待-
理化学研究所(理研)バイオリソース研究センター 統合情報開発室の高野 壮太朗 開発研究員らの共同研究グループは、細菌がつくり出すナノサイズの粒子(細菌膜小胞[1])に含まれる遺伝子配列を網羅的に解析する技術を開発し、細菌膜小胞がヒトやウイルスとの相互作用に重要な遺伝子を特に多く含んでいること、それらが細菌同士で遺伝子をやり取りする仕組み(遺伝子水平伝...
キーワード:スループット/データ駆動/類似度/ドロップレット/フィルム/高分子/遺伝情報/塩基配列/系統樹/比較ゲノム解析/微小液滴/ACT/ベシクル/固体表面/物質輸送/ナノサイズ/ナノメートル/マイクロ/自動化/ハイスループット/遺伝子クラスター/CRISPR-Cas/マッピング/biosynthesis/ゲノム配列/病原菌/環境ストレス/ゲノム編集技術/感染防御/生態系/環境応答/形質転換/病原性/比較ゲノム/微生物/免疫系/獲得免疫/細胞膜/CRISPR/レドックス/遺伝子解析/染色体/ゲノム解析/ゲノム編集/歯周病/CRISPR-Cas9/PCR/ファージ/リポ多糖/抗生物質/細胞死/創薬/代謝物/ウイルス/ゲノム/ストレス/バイオフィルム/バイオマーカー/マイクロバイオーム/ワクチン/遺伝子/公衆衛生/細菌/細菌叢/腸内細菌/腸内細菌叢
他の関係分野:情報学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日:2025年9月7日
2
ヒト毛周期に伴う皮膚組織再構築の仕組み
-1細胞解析により毛周期の時間軸を再構成-
理化学研究所(理研)生命機能科学研究センター 細胞外環境研究チームの藤原 裕展 チームディレクター、ポーラ化成工業株式会社 フロンティアリサーチセンターの横田 絢 副主任研究員(理研 生命機能科学研究センター 細胞外環境研究チーム 客員研究員)らの共同研究チームは、ヒト毛周期[1]の時系列的な1細胞遺伝子発現解析[2]手...
キーワード:マルチモーダル/類似度/アルゴリズム/オントロジー/位置情報/時系列解析/情報システム/巡回セールスマン問題/低次元/器官形成/結合組織/胚発生/ダイナミクス/遺伝子クラスター/一細胞/カルス/マッピング/TEMPO/環境応答/細胞間コミュニケーション/機能解析/好酸球/脂肪細胞分化/ラミニン/遺伝子発現解析/角化細胞/血管内皮/細胞外環境/組織再構築/発現解析/免疫染色/毛包/リンパ球/脂肪細胞/寿命/成長期/生理機能/白血球/Wnt/Wntシグナル/線維芽細胞/組織幹細胞/組織再生/RNA/アポトーシス/コラーゲン/遺伝子ネットワーク/一細胞解析/幹細胞/基底膜/血液/血管新生/血管内皮細胞/好中球/再生医療/細胞外マトリックス/細胞分化/受容体/転写因子/内皮細胞/免疫細胞/ウイルス/コミュニケーション/遺伝子/遺伝子発現/概日リズム/細菌/標準化
他の関係分野:情報学数物系科学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年7月31日
3
日本人のアルコールの効き方、3タイプに分類可能
-若年日本人を対象とした包括的遺伝解析から解明-
理化学研究所(理研)生命医科学研究センター ゲノム解析応用研究チームの寺尾 知可史 チームディレクター(静岡県立総合病院 免疫研究部長、静岡県立大学 特任教授)、ファーマコゲノミクス研究チームの曳野 圭子 研究員、莚田 泰誠 チームディレクター、国立病院機構久里浜医療センターの松下 幸生 院長らの共同研究グループは、日本人のアルコール反応性に着目し、健常な若年成人を対象に包括的なクラスタリング解析[1]を実施しまし...
キーワード:身体感覚/類似度/クラスタリング/時系列データ/主成分分析/ゲノミクス/遺伝情報/遺伝的多型/アルコール脱水素酵素/脱水素/モデル化/遺伝的変異/アルデヒド/集団遺伝学/ゲノムワイド/ゲノム情報/環境要因/強皮症/精神医学/バイオバンク/ヒトゲノム/関節/関節炎/予後因子/SNP/アルコール/ゲノムワイド関連解析/ゲノム解析/自己評価/評価法/エンハンサー/病態解明/イミン/ラット/リウマチ/関節リウマチ/発現制御/GWAS/アレルギー/ゲノム/遺伝学/遺伝子/一塩基多型/公衆衛生/精神疾患/臨床研究
他の関係分野:情報学生物学総合理工工学農学
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発表日:2025年7月31日
4
空間的な生物多様性を推論するための理論を構築
-生物多様性の地域間の違いや増減を定量評価-
理化学研究所(理研)数理創造研究センター 数理基礎部門の入谷 亮介 上級研究員、京都大学 大学院農学研究科の辰巳 晋一 准教授らの国際共同研究グループは、空間的な生物多様性の確率分布を推定するための理論を構築しました。本理論は、生物種の在・不在をファジー集合理論[1]の枠組みを用いて表現し、理論物理学で用いられる手法や数学的概念を駆使して解析を行った学際的研究成果です。本成果は、生息する生物種数の地域間の...
キーワード:類似度/情報理論/外来種/環境変動/多項式/応用数学/対称性/エントロピー/気候変動/生物群集/定量評価/熱力学/数値モデル/生態系/生物間相互作用/生態学/生物多様性/異質性
他の関係分野:情報学環境学数物系科学生物学工学農学
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発表日:2025年7月31日
5
口腔細菌叢の乱れは腸内細菌叢の乱れ
-歯周病に罹患すると腸内細菌叢が乱れて全身に悪影響の恐れ-
理化学研究所(理研)生命医科学研究センター 粘膜システム研究チームの山崎 和久 客員主管研究員(新潟大学 名誉教授)、宮内 栄治 客員研究員(群馬大学 生体調節研究所 粘膜エコシステム制御分野 准教授)、大野 博司 チームディレクターらの国際共同研究グループは、歯周病[1]以外に全身的な疾患のない患者と歯周病を含む全身的な疾患のない健康な対象者の唾液、ならびにふん便中の細菌叢(そう)を網羅的に解析し、歯周病患者では...
キーワード:情報量/類似度/人工知能(AI)/因果関係/フィルム/タンパク質複合体/システム制御/インフォマティクス/rRNA/16S rRNA/有機酸/微生物/脂肪酸合成/dysbiosis/オミクス/オミクス解析/遺伝子解析/炎症性腸疾患/滑膜/肝硬変/肝疾患/関節/血清/疾患モデル動物/病理/アルコール/外傷/寿命/心臓/代謝産物/大腸/短鎖脂肪酸/歯学/歯周病/RNA/アミノ酸/アルツハイマー病/クロマトグラフィー/タンパク質分解/マウス/モデル動物/リウマチ/リポタンパク質/リポ多糖/炎症性サイトカイン/関節リウマチ/血液/抗炎症/抗炎症作用/脂肪酸/上皮細胞/代謝物/大腸がん/2型糖尿病/アレルギー/サイトカイン/ディスバイオーシス/バイオフィルム/メタボローム/メタボローム解析/遺伝子/疫学/疫学研究/健康寿命/細菌/細菌叢/疾患モデル/唾液/腸内細菌/腸内細菌叢/糖尿病/動脈硬化
他の関係分野:情報学数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年7月31日
6
大切な情報を抽出する神経回路モデル
-脳が非線形次元削減を実行している可能性-
理化学研究所(理研)脳神経科学研究センター 数理脳科学研究チームの吉田 健祐 特別研究員、豊泉 太郎 チームリーダーの研究チームは、脳に存在する神経回路構造と脳型のシナプス可塑性学習則[1]を用いて、工学的な非線形次元削減[2]手法と同様の計算を実現する神経回路の数理モデルを提案し、この数理モデルが実際の神経回路の情報処理で活用されている可能性を示しました。本研究成果は、脳内での複雑な情報処理の...
キーワード:画像データ/高次元データ/データ駆動/類似度/アルゴリズム/ニューラルネットワーク/機械学習/神経回路モデル/人工知能(AI)/低次元/非線形/ノイズ/理論的研究/ニューロモルフィック/エネルギー効率/ニューラルネット/接合部/キノコ体/シナプス/神経活動/脳神経科学/脳科学/可塑性/感覚器/神経可塑性/シナプス可塑性/ショウジョウバエ/モデル動物/神経科学/神経回路/神経細胞/脳機能/睡眠
他の関係分野:情報学数物系科学生物学工学総合生物
理化学研究所 研究シーズ