広島大学ゲノム編集イノベーションセンタープラチナバイオ共同研究講座の中前和恭共同研究講座助教、広島大学発スタートアップ企業であるプラチナバイオ株式会社の奥原啓輔CEO、中川佳子主任研究員、伊出佐耶研究員、大貫永輝研究員、そして坊農秀雅教授(広島大学大学院統合生命科学研究科・プラチナバイオ共同研究講座教授兼任)らは、ゲノム編集により生じる大規模な挿入・欠失変異(インデル)をサンガーシーケンスデータから高感度に推定できる新しい解析ソフトウェア「PtWAVE」(Progressive-type Wide-range Analysis of Varied Editsの略)を開発しました。本研究により...

　広島大学大学院統合生命科学研究科の鈴木貴之大学院生と坊農秀雅教授は、大規模言語モデル(LLM)を活用した、ゲノム編集メタデータベース(GEM)の機械的なデータ整備の検証を行なった。GEMとは、PubMedと呼ばれる38,481,722件(2025年3月4日時点)の文献を収載する生命科学研究における最大規模の文献データベースから、ゲノム編集に関わる情報を機械的に抽出し公開しているデータベースである。今後のゲノム編集研究の促進への貢献を目指したデータセットと考える。　本研究では、GEMが抱える課題の1つである、収集した遺伝子情報のエラー、を機械的に修正し、GEM活用の幅を広げることを目...