東京科学大学 研究シーズ|
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研究キーワード：東京科学大学における「分子認識」 に関係する研究一覧：6件
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発表日：2025年11月6日
1
タンパク質結晶内でゆらぐ糖分子を観る
糖分子ダイナミクスを可視化するバイオマテリアル技術
東京科学大学（Science Tokyo） 生命理工学院 生命理工学系の小島摩利子大学院生（現 東北大学助教）、Yao Xinchen（ヤオ・シンチェン）大学院生（研究当時）、安部聡助教（現 京都府立大学准教授）、古田忠臣助教、上野隆史教授（兼 科学技術創成研究院 自律システム材料学研究センター）らの研究グループは、糖鎖の柔軟な構造と動態を原子レベルで解明する新しい解析基盤を開発しました。研究グループは、白血球に存在する糖結合性タンパク質の一種「...
キーワード：自律システム/スーパーコンピュータ/最適化/幾何学/物質科学/分子動力学シミュレーション/閉じ込め/分子構造/二量体/分子ダイナミクス/タンパク質合成/X線結晶構造解析/グルコース/結晶構造解析/光合成/原子分解能/持続可能/3Dプリンター/シミュレーション/ダイナミクス/結晶化/動力学/分解能/分子動力学/タンパク質結晶/免疫調節/バイオマテリアル/生体内/X線結晶構造/結晶構造/構造決定/変異体/タンパク質工学/機能解析/好酸球/ゆらぎ/腸内環境/白血球/分子標的/喘息/アミノ酸/スクリーニング/タンパク質発現/レクチン/構造変化/阻害剤/創薬/分子設計/分子認識/立体構造/分子標的薬
他の関係分野：情報学数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年11月1日
2
酵素Sir2のタンデムアロステリック効果
脱アセチル化反応を効率的に行う仕組みを解明
東京科学大学（Science Tokyo） 生命理工学院 生命理工学院系の白臻（バイ・ジェン）博士課程学生、Tran Phuoc Duy（チャン・フ・ズイ）助教、北尾彰朗教授は、酵素Sir2が連続する2段階のアロステリック効果[用語1]、「タンデムアロステリック効果」によって、タンパク質の脱アセチル化反応を効率的に行っていることを明らかにしました。Sir2はDNAと結合するヒストンタンパク質やがん抑制因子p53などの様々なタンパク質を脱アセチル化するサーチュインという酵...
キーワード：PCクラスタ/スーパーコンピュータ/自由エネルギー/健康増進/計算機シミュレーション/ヒストン/ポリエチレン/ボトムアップ/シミュレーション/金属イオン/大規模計算/動力学/分子動力学/リボソーム/生物物理学/エチレン/脱アセチル化/キチン/アミノ酸配列/DNA修復/p53/酵素反応/新型コロナウイルス/生物物理/GPCR/Gタンパク質/アセチル化/アミノ酸/メチル化/ユビキチン/ユビキチン化/受容体/創薬/低分子化合物/分子認識/翻訳後修飾/立体構造/ウイルス/サーチュイン/抗体/脂質/老化
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学工学総合生物農学
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発表日：2025年10月18日
3
酵素断片の「トラップ＆リリース」に基づく抗原依存的酵素スイッチ
任意の分子によるタンパク質機能の自由自在な制御を目指して
東京科学大学（Science Tokyo）総合研究院 化学生命科学研究所の北口哲也准教授と安田貴信助教らの研究チームは、東北大学 多元物質科学研究所の田口真彦助教、理化学研究所の木川隆則博士、信州大学の新井亮一教授と共同で、抗体に酵素の断片を融合させることにより、抗原に応答して活性が上昇する酵素スイッチ「Switchbody」 を開発しました。タンパク質は多様な機能を持ち、さまざまな生命現象に関与しています。その中でも、外的刺激に応答してオン・オフのスイッチとして機能するタンパク質は、細胞生理機能を動的に制御する上で重要な役割を果たします。このスイッチ機能を人工的...
キーワード：スループット/深層学習/デルタ/クロスオーバー/原子核/磁気共鳴/物質科学/蛍光センサー/生物発光/X線結晶構造解析/グルコース/ハイスループットスクリーニング/結晶構造解析/核スピン/静電相互作用/シミュレーション/スピン/センサー/ダイナミクス/トラップ/マイクロ/結晶化/光センサー/分子デザイン/ハイスループット/神経活動/生体内/X線結晶構造/発酵/結晶構造/変異体/タンパク質工学/酵素活性/一本鎖抗体/ELISA/MDシミュレーション/アミノ酸配列/細胞膜/cGMP/蛍光タンパク質/細胞内シグナル/生理機能/大腸/ATP/アミノ酸/ケミカルバイオロジー/シグナル分子/スクリーニング/バイオイメージング/マウス/リガンド/遺伝子導入/蛍光色素/血液/抗原/構造変化/骨粗鬆症/細胞増殖/細胞培養/受容体/代謝酵素/大腸菌/培養細胞/分子認識/膜電位/免疫応答/立体構造/アレルギー/遺伝学/遺伝子/抗体
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年4月9日
4
人工進化が生んだ超高親和性RNA–タンパク質ペアの構造基盤解明
宮崎大学 テニュアトラック推進室 福永圭佑准教授（前東京科学大学特任助教）、九州大学 大学院農学研究院 寺本岳大助教、同角田佳充教授、沖縄科学技術大学院大学（以下OIST） 核酸化学・工学ユニット 横林洋平教授、東京科学大学 地球生命研究所 松浦友亮教授らは、X線結晶構造解析の手法を用いて二つの人工RNA−タンパク質複合体（RNP）の結合様式の違いを解明することに成功しました。さらに、これらRNPを活用した高性能リボスイッチ（遺伝子発現制御用のRNAスイッチ）の開発を行い、無細胞タンパク質合成系（セルフリーシステム）...
キーワード：電気通信/オープンアクセス/情報学/検索システム/産学連携/二量体/ディスプレイ/核酸化学/生細胞/EGFP/タンパク質合成/X線結晶構造解析/タンパク質複合体/共進化/結晶構造解析/共結晶/選択性/マイクロ/マイクロ流路/モーター/論理回路/タンパク質合成系/無細胞タンパク質合成系/進化実験/人工細胞/リボソーム/X線結晶構造/古細菌/RNAポリメラーゼ/結晶構造/進化分子工学/ウサギ/RNAアプタマー/プロモーター/脂質二重膜/翻訳制御/蛍光タンパク質/mRNA/大腸/in vitro/RNA/アミノ酸/スクリーニング/ファージ/ラット/リガンド/遺伝子発現制御/合成生物学/赤血球/大腸菌/発現制御/分子認識/膜タンパク質/ツール開発/遺伝子/遺伝子発現/細菌/脂質
他の関係分野：情報学複合領域化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年4月3日
5
ペプチドでできた編み込みナノチューブ構造の合成に成功
東京科学大学（Science Tokyo）総合研究院 化学生命科学研究所の澤田知久准教授らの研究チームは、タンパク質の材料であるペプチド[用語1]からなる結び目構造[用語2]を合体させた...
キーワード：オープンアクセス/情報学/検索システム/産学連携/絡み目/トポロジー/幾何学/結び目/原子核/磁気共鳴/対称性/化学組成/磁場/分子構造/自己組織/キラル/機能性分子/自己集合/超分子化学/X線結晶構造解析/結晶構造解析/配位結合/銀イオン/テンプレート/秩序構造/単結晶/カーボン/カーボンナノチューブ/ナノメートル/ナノ構造/ナノ材料/金属イオン/周波数/設計法/電磁波/分解能/ナノチューブ/X線結晶構造/機能性/結晶構造/分子機械/組織化/超分子/日常生活/アミノ酸/核磁気共鳴/生体分子/分子認識/立体構造
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年3月3日
6
蛍光分子との結合でタンパク質が動き出す「分子ドミノ」
東京科学大学（Science Tokyo）※ 生命理工学院 生命理工学系の菱川湧輝博士と上野隆史教授らは、東京科学大学 総合研究院 科学生命科学研究所の吉沢道人教授、および東京大学 大学院工学系研究科の津本浩平教授、長門石曉准教授の研究グループと共同で、蛍光分子等のスイッチ分子の結合をトリガーとして、タンパク質の動きを協働的に制御する分子設計技術「分子ドミノ」を開発しました。...
キーワード：情報学/人工知能（AI）/分子ロボット/検索システム/産学連携/幾何学/閉じ込め/分光学/芳香環/芳香族/分子カプセル/電子移動/分子デバイス/芳香族化合物/タンパク質合成/X線結晶構造解析/結晶構造解析/光合成/タンパク質デザイン/バイオセンシング/動的挙動/熱安定性/3Dプリンター/センシング/ナノスケール/ロボット/金属イオン/結晶化/分子制御/たんぱく/タンパク質結晶/バイオマテリアル/X線結晶構造/機能性/結晶構造/タンパク質工学/大腸/アミノ酸/ドキソルビシン/トリプトファン/フラーレン/構造変化/合成生物学/生体分子/創薬/大腸菌/分子設計/分子認識/抗がん剤
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学化学生物学工学総合生物農学