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東京科学大学 研究シーズDiscovery Saga
研究キーワード:東京科学大学における「アミノ酸」 に関係する研究一覧:33
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発表日:2025年11月18日 この記事は2025年12月2日号以降に掲載されます。
1
麹菌の菌核内部に未知の構造体を発見
麹菌にも「性」の痕跡
この記事は2025年12月2日号以降に掲載されます。
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発表日:2025年11月6日
2
タンパク質結晶内でゆらぐ糖分子を観る
糖分子ダイナミクスを可視化するバイオマテリアル技術
東京科学大学(Science Tokyo) 生命理工学院 生命理工学系の小島摩利子大学院生(現 東北大学助教)、Yao Xinchen(ヤオ・シンチェン)大学院生(研究当時)、安部聡助教(現 京都府立大学准教授)、古田忠臣助教、上野隆史教授(兼 科学技術創成研究院 自律システム材料学研究センター)らの研究グループは、糖鎖の柔軟な構造と動態を原子レベルで解明する新しい解析基盤を開発しました。研究グループは、白血球に存在する糖結合性タンパク質の一種「...
キーワード:自律システム/スーパーコンピュータ/最適化/幾何学/物質科学/分子動力学シミュレーション/閉じ込め/分子構造/二量体/分子ダイナミクス/タンパク質合成/X線結晶構造解析/グルコース/結晶構造解析/光合成/原子分解能/持続可能/3Dプリンター/シミュレーション/ダイナミクス/結晶化/動力学/分解能/分子動力学/タンパク質結晶/免疫調節/バイオマテリアル/生体内/X線結晶構造/結晶構造/構造決定/変異体/タンパク質工学/機能解析/好酸球/ゆらぎ/腸内環境/白血球/分子標的/喘息/アミノ酸/スクリーニング/タンパク質発現/レクチン/構造変化/阻害剤/創薬/分子設計/分子認識/立体構造/分子標的薬
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発表日:2025年11月1日
3
酵素Sir2のタンデムアロステリック効果
脱アセチル化反応を効率的に行う仕組みを解明
東京科学大学(Science Tokyo) 生命理工学院 生命理工学院系の白臻(バイ・ジェン)博士課程学生、Tran Phuoc Duy(チャン・フ・ズイ)助教、北尾彰朗教授は、酵素Sir2が連続する2段階のアロステリック効果[用語1]、「タンデムアロステリック効果」によって、タンパク質の脱アセチル化反応を効率的に行っていることを明らかにしました。Sir2はDNAと結合するヒストンタンパク質やがん抑制因子p53などの様々なタンパク質を脱アセチル化するサーチュインという酵...
キーワード:PCクラスタ/スーパーコンピュータ/自由エネルギー/健康増進/計算機シミュレーション/ヒストン/ポリエチレン/ボトムアップ/シミュレーション/金属イオン/大規模計算/動力学/分子動力学/リボソーム/生物物理学/エチレン/脱アセチル化/キチン/アミノ酸配列/DNA修復/p53/酵素反応/新型コロナウイルス/生物物理/GPCR/Gタンパク質/アセチル化/アミノ酸/メチル化/ユビキチン/ユビキチン化/受容体/創薬/低分子化合物/分子認識/翻訳後修飾/立体構造/ウイルス/サーチュイン/抗体/脂質/老化
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発表日:2025年10月18日
4
酵素断片の「トラップ&リリース」に基づく抗原依存的酵素スイッチ
任意の分子によるタンパク質機能の自由自在な制御を目指して
東京科学大学(Science Tokyo)総合研究院 化学生命科学研究所の北口哲也准教授と安田貴信助教らの研究チームは、東北大学 多元物質科学研究所の田口真彦助教、理化学研究所の木川隆則博士、信州大学の新井亮一教授と共同で、抗体に酵素の断片を融合させることにより、抗原に応答して活性が上昇する酵素スイッチ「Switchbody」 を開発しました。タンパク質は多様な機能を持ち、さまざまな生命現象に関与しています。その中でも、外的刺激に応答してオン・オフのスイッチとして機能するタンパク質は、細胞生理機能を動的に制御する上で重要な役割を果たします。このスイッチ機能を人工的...
キーワード:スループット/深層学習/デルタ/クロスオーバー/原子核/磁気共鳴/物質科学/蛍光センサー/生物発光/X線結晶構造解析/グルコース/ハイスループットスクリーニング/結晶構造解析/核スピン/静電相互作用/シミュレーション/スピン/センサー/ダイナミクス/トラップ/マイクロ/結晶化/光センサー/分子デザイン/ハイスループット/神経活動/生体内/X線結晶構造/発酵/結晶構造/変異体/タンパク質工学/酵素活性/一本鎖抗体/ELISA/MDシミュレーション/アミノ酸配列/細胞膜/cGMP/蛍光タンパク質/細胞内シグナル/生理機能/大腸/ATP/アミノ酸/ケミカルバイオロジー/シグナル分子/スクリーニング/バイオイメージング/マウス/リガンド/遺伝子導入/蛍光色素/血液/抗原/構造変化/骨粗鬆症/細胞増殖/細胞培養/受容体/代謝酵素/大腸菌/培養細胞/分子認識/膜電位/免疫応答/立体構造/アレルギー/遺伝学/遺伝子/抗体
他の関係分野:情報学複合領域数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日:2025年10月15日
5
進化の過程で失われた機能が復活
ウナギにおいて広い溶質選択性を再獲得したアクアポリン10パラログを発見
東京科学大学(Science Tokyo) 生命理工学院 生命理工学系の永嶌鮎美助教、日髙進一郎大学院生、太田地洋大学院生、加藤明准教授らの研究チームは、同学院の古⽥忠⾂助教、東京⼤学 農学生命科学研究科 フォーデイズ株式会社寄付講座 食と生体機能モデル学研究室(現:加齢生体機能学研究社会連携講座)の伊藤公一特任准教授、山中大介特任助教(研究当時)、信州⼤学の中田勉准教授との共同研究により、ウナギが過去に失った広い溶質選択性を持つ膜輸送体タンパク質と同等の機能を、遺伝子重複[用語1]と変異による...
キーワード:環境変化/海洋/幾何学/水分子/輸送特性/芳香族/膜輸送/アフリカツメガエル/ツメガエル/ホウ酸/膜輸送体/卵母細胞/遺伝子重複/環境適応/機能分化/脊椎動物/選択性/哺乳類/変異体/輸送体/哺乳動物/ウナギ/ニホンウナギ/生物多様性/ダイバーシティ/アルギニン/機能解析/細胞膜/脊椎/アミノ酸置換/アクアポリン/アミノ酸/イミン/小腸/腎臓/水チャネル/低分子化合物/膜タンパク質/ゲノム/遺伝子/育児/栄養指導/加齢/生理学
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発表日:2025年10月15日
6
低免疫原性肝臓オルガノイドを用いた世界初の体外循環治療システムUTOpiAを開発
重症肝不全モデル動物の生命予後を大幅に改善!
東京科学大学 大学院医歯学総合研究科の山口仁美医師(博士後期課程学生)、同 総合研究院 ヒト生物学研究ユニットの武部貴則教授(大阪大学 大学院医学系研究科 教授/同ヒューマン・メタバース疾患研究拠点 副拠点長)、大阪大学大学院医学系研究科の米山鷹介講師らの研究グループは、iPS細胞由来のオルガノイドを組み込んだ肝機能補助療法「UTOpiAシステム」を開発しました。肝硬変などの慢性肝不全の患者が感染症や消化管出血、アルコール多飲など何らかの誘因により発症し、28日以内に急激に肝機能が低下する疾患である慢性肝不全急性憎悪(ACLF: Acute-on-chronic ...
キーワード:アンモニア/消化管/遺伝構造/細胞運命/細胞間コミュニケーション/ビリルビン/肝炎/iPS細胞/遺伝子発現解析/炎症反応/肝硬変/肝再生/肝不全/人工肝臓/胆管/動物モデル/発現解析/mRNA/アルコール/死亡率/白血球/オルガノイド/ゲノム編集/歯学/成長因子/ES細胞/HLA/アミノ酸/アルブミン/スクリーニング/マウス/モデル動物/ラット/リポ多糖/遺伝子治療/幹細胞/肝細胞/肝障害/拒絶反応/血液/抗炎症/抗炎症作用/再生医療/細胞死/脂肪酸/腎障害/多能性幹細胞/臨床試験/アレルギー/ウイルス/ゲノム/コミュニケーション/ヒトiPS細胞/遺伝子/遺伝子発現/医師/感染症/肝移植/細菌/臓器移植
他の関係分野:化学農学
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発表日:2025年10月7日
7
ヒトの7倍の巨大ゲノムを解読
イベリアトゲイモリが示す発生・再生・進化・行動の謎
有尾両生類であるイモリは、古くから発生や再生の研究において重要な役割を果たしてきました。しかしイモリのゲノムは、反復配列によりヒトの数倍から十数倍と巨大であるため、長らく決定が困難でした。今回、主に国内の研究者からなる「イベリアトゲイモリ研究コンソーシアム」を中心として、日本で樹立された近交系統イベリアトゲイモリ[用語1]を対象に最新の高精度ロングリードシークエンス技術を用いてゲノム解読に成功しました。そのゲノムは約200億塩基対に達し、ヒトの約7倍もの大きさです。解析の結果、ゲノム巨大化に関わる...
キーワード:データ統合/コウモリ/外来種/ゲノムDNA/人工DNA/シクリッド/フェロモン/フェロモン受容体/生殖/両生類/脊椎動物/適応進化/前駆体/モデル生物/トランスポゾン/イントロン/トランスオミクス/哺乳類/ゲノム配列/シークエンス/骨形成因子/器官再生/DNA二本鎖切断/ゲノムシークエンス/ゲノム多型/ニワトリ/CRISPR/オミクス/オミクス解析/プロテオグリカン/受精/受精卵/染色体/mRNA/ゲノム解析/ホルモン/筋肉/脊椎/反復配列/BMP/エンハンサー/ゲノム編集/再生医学/アミノ酸/ゲノムプロジェクト/ヘッジホッグ/マウス/モデル動物/遺伝子発現制御/形態形成/骨形成/再生医療/受容体/精子/転写制御/転写調節/発現制御/ゲノム/遺伝学/遺伝子/遺伝子発現
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発表日:2025年9月25日
8
体内栄養状態を感知するmTORC1経路の活性制御機構を解明
リソソーム膜上におけるTSC2の選択的脱リン酸化がmTORC1の活性を厳密に制御する
東京科学大学(Science Tokyo) 生命理工学院 生命理工学系(神奈川県立がんセンター兼任)の越川直彦教授は、愛媛大学 先端研究院 プロテオサイエンスセンター病理学部門の中村貴紀助教、増本純也教授、澤崎達也教授の研究グループ、東京大学 医科学研究所 武川睦寛教授、大阪大学 先端モダリティ・DDS研究センター 岡田雅人特任教授、同数理・データ科学教育研究センター 鈴木貴特任教授(常勤)、新潟大学 大学院医歯学総合研究科 松本雅記教授らとの共同研究で、栄養シグナル伝達の中心的役割を担うタンパク質複合体mTORC1の活性制御機構を解明することに成功しました。mT...
キーワード:検索システム/がん研究/先端技術/高分子/高分子合成/GTPase/細胞内小器官/オルガネラ/タンパク質複合体/質量分析/分子制御/酸化酵素/リン酸/生合成/ビオチン/がん遺伝子/細胞内シグナル/染色体/増殖因子/病理/病理学/卵巣/腫瘍マーカー/大腸/分子機構/卵巣がん/PI3K/画像診断/歯学/脱リン酸化/AKT/DDS/in vitro/アミノ酸/インスリン/オートファジー/がん細胞/がん治療/がん抑制遺伝子/キナーゼ/タンパク質分解/ラット/リソソーム/リン酸化酵素/細胞内局在/酸化反応/生体高分子/阻害剤/創薬/大腸がん/遺伝子/遺伝子変異/脂質/糖尿病/難病
他の関係分野:複合領域化学生物学総合理工工学農学
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発表日:2025年9月14日
9
アクアグリセロポリンが尿素・ホウ酸の透過性を制限する仕組みを解明
遺伝子配列から活性予測を可能に
東京科学大学(Science Tokyo)生命理工学院 生命理工学系の永嶌鮎美助教、潮和敬大学院生(研究当時)、加藤明准教授らの研究チームは、同 古田忠臣助教、近畿大学 農学部の西原秀典准教授と共同で、水とグリセロールのチャネルとして知られるアクアグリセロポリン[用語1]Aqp10がグリセロール以外の小分子(尿素・ホウ酸)の透過を制御する仕組みを明らかにしました。これまで、アクアグリセロポリンが水以外の小分子の透過を制御するメカニズムはよく分かっていませんでした。今回、尿素・ホウ酸を輸送するタイプ...
キーワード:検索システム/幾何学/水分子/微量元素/芳香族/アンモニア/アフリカツメガエル/グルコース/ゲノム進化/ツメガエル/ホウ酸/系統樹/進化学/分子系統解析/卵母細胞/両生類/爬虫類/遺伝子重複/環境適応/機能分化/脊椎動物/分子系統/加水分解/水分解/選択性/細孔構造/モデリング/構造予測/生物物理学/窒素代謝/哺乳類/ゲノム配列/変異体/輸送体/哺乳動物/系統解析/アミノ酸配列/ダイバーシティ/アルギニン/細胞膜/糖新生/生物物理/生理機能/脊椎/代謝産物/分子機構/アクアポリン/アミノ酸/イミン/エネルギー代謝/ゲノムプロジェクト/タンパク質発現/水チャネル/低分子化合物/膜タンパク質/立体構造/ゲノム/遺伝子/育児/生理学
他の関係分野:複合領域数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年8月30日
10
光合成の安全装置「DLDG1」の役割を解明
植物が強い光から身を守る仕組みに新たな知見
私たちの暮らしを支える植物は、光合成によって太陽の光エネルギーを使って有機物を作り出しています。しかし、光が強すぎると、逆に植物の体内では有害な活性酸素が発生し、細胞を傷つける恐れがあります。こうしたダメージを防ぐため、植物は「余分な光エネルギーを熱として逃がす」仕組みを備えており、これを熱放散[用語1]と呼びます。本研究では、この熱放散の調節に関わるDLDG1[用語2]とい...
キーワード:検索システム/光エネルギー/普遍性/太陽/ATP合成/ppGpp/光合成/高等植物/植物生理学/電子伝達/変動光/葉緑体/環境適応/太陽光/持続可能/センサー/バイオセンサー/生産性/有機物/リン酸/植物ホルモン/変異体/輸送体/シロイヌナズナ/環境ストレス/ストレス耐性/バイオマス/土壌/カロテノイド/ATP合成酵素/ホルモン/ATP/アミノ酸/活性酸素/抗生物質/硫化水素/ストレス/遺伝学/遺伝子/遺伝子発現/細菌/生理学
他の関係分野:複合領域環境学数物系科学生物学総合理工工学農学
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発表日:2025年8月7日
11
糖鎖による抗体ダイナミクスの制御機構を解明
分子経絡が抗体医薬設計の新たな鍵に
私たちの体には、病原体から身を守るための免疫システムが備わっています。その中心的な役割を担うのが「免疫グロブリンG(IgG)[用語3]」と呼ばれる抗体です。IgGは、特定の抗原を認識して結合するだけでなく、Fc受容体や補体といったエフェクター分子との相互作用を通じて、さまざまな免疫応答を誘導します。本研究では、IgGの...
キーワード:ネットワーク解析/最適化/検索システム/免疫機能/産学連携/分子動力学シミュレーション/安定同位体/同位体/分子構造/シミュレーション/スピン/ダイナミクス/動力学/分子動力学/医工学/構造・機能相関/病原体/遺伝子工学/糖鎖修飾/酵素反応/ナノテクノロジー/アミノ酸/コンフォメーション/ラット/抗原/抗体医薬/構造変化/自己免疫/自己免疫疾患/受容体/動的構造/免疫応答/遺伝子/抗体
他の関係分野:情報学複合領域数物系科学化学工学総合生物
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発表日:2025年7月27日
12
金属含有色素を光学活性にするナノ道具
芳香環キラル空間の新たな光学機能を発見
東京科学大学(Science Tokyo)物質理工学院 応用化学系の橋本義久大学院生(博士後期課程2年)、同 総合研究院 化学生命科学研究所の田中裕也助教と吉沢道人教授らの研究グループは、キラル[用語1]なナノ道具を作製し、それを活用して非キラルな...
キーワード:オープンアクセス/検索システム/ダイマー/磁気共鳴/水溶液/動的光散乱/スペクトル/円二色性/芳香環/芳香族/分子カプセル/キラル/ナフタレン/ミセル/蛍光スペクトル/光学活性/触媒反応/超分子化学/分子集合体/両親媒性/円偏光/電極界面/分子エレクトロニクス/分子識別/両親媒性分子/光機能/フタロシアニン/メモリ/光散乱/ベンゼン/界面構造/光機能材料/熱電変換/光学特性/ナノメートル/ポリマー/モデリング/金属イオン/熱処理/親水性/ナノカプセル/機能材料/メタノール/テルペン/超分子/アミノ酸/パラジウム/ポルフィリン/核磁気共鳴/合成化学/錯体化学/刺激応答性/脂肪酸/不斉触媒/不斉触媒反応/分子集合
他の関係分野:情報学複合領域数物系科学化学総合理工工学総合生物農学
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発表日:2025年7月20日
13
新規共有結合性アスパラギン合成酵素阻害剤スタキベンザール類の発見
がん代謝特性を標的とする抗がん剤の開発に期待
東京科学大学 理学院 化学系の植草秀裕教授は、京都大学 大学院薬学研究科の掛谷秀昭教授、Lei Zhang博士後期課程学生、理化学研究所 環境資源科学研究センターの堂前直ユニットリーダー、慶應義塾大学 大学院理工学研究科の平野秀典特任准教授らの研究グループと共同で、新規共有結合性アスパラギン合成酵素(ASNS)阻害剤[...
キーワード:検索システム/スペクトル解析/スペクトル/円偏光発光/アンモニア/タンパク質合成/悪性化/X線結晶構造解析/結晶構造解析/円偏光/生成機構/加水分解/遷移状態/水分解/有機結晶/分解能/メロテルペノイド/X線結晶構造/システイン/微生物代謝/結晶構造/糸状菌/酵素活性/生合成/微生物/酵素阻害/高分解能/小細胞肺がん/がん代謝/細胞株/前立腺がん/代謝産物/大腸/分子標的/扁平上皮がん/ATP/HPLC/LC-MS/MS/アミノ酸/がん細胞/クロマトグラフィー/ケミカルバイオロジー/テルペノイド/急性リンパ性白血病(ALL)/抗がん剤耐性/構造活性相関/酵素阻害剤/高速液体クロマトグラフィー/阻害剤/創薬/大腸がん/白血病/非小細胞肺がん/膵がん/化学療法/抗がん剤/乳がん/肺がん
他の関係分野:複合領域数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日:2025年6月23日
14
髄鞘形成を促進する新規ECMタンパク質と合成ペプチドを発見
ラミニン-411およびその由来ペプチドA4G47がオリゴデンドロサイトによる髄鞘形成を活性化
東京科学大学(Science Tokyo) 大学院医歯学総合研究科 臨床分析・分子生物学分野の鈴木喜晴准教授らの研究チームは、多発性硬化症に代表される脱髄[用語1]疾患や、加齢による脳機能低下、アルツハイマー型認知症、うつ病などの精神疾患において、主因の一つとして知られる中枢神経系の髄鞘[用語2]機能に着目し、その制御メカニズムの解明を試みています。 本研究では、東京...
キーワード:高分子/ロイシン/神経系/絶縁体/オリゴデンドロサイト前駆細胞/神経活動/CD8/アミノ酸配列/層構造/生体組織/アイソフォーム/アルギニン/活動電位/機能解析/細胞膜/髄鞘/シュワン細胞/ラミニン/神経ネットワーク/中枢神経/末梢神経/中枢神経系/歯学/前駆細胞/多発性硬化症/アポトーシス/アミノ酸/アルツハイマー病/インテグリン/基底膜/細胞外マトリックス/細胞核/細胞骨格/細胞生物学/細胞接着/受容体/神経科学/神経細胞/生体高分子/生体分子/転写因子/脳機能/立体構造/うつ/うつ病/遺伝子/加齢/脂質/精神疾患/認知症/分子生物学
他の関係分野:化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年6月20日
15
標的細胞を見分ける“スマートカプセル”:無細胞で抗体を固定化したリポソーム開発
薬剤送達や遺伝子治療への応用が期待される細胞を使わないプラットフォーム
東京科学大学 総合研究院 細胞制御工学研究センターの丹羽達也助教と国立研究開発法人 海洋研究開発機構 超先鋭研究開発部門の車兪澈主任研究員、ジーンフロンティア株式会社の研究グループは、試験管内で合成した抗体タンパク質を脂質修飾し、脂質ナノカプセル(リポソーム)の表面に固定化する技術を開発しました(図1)。この方法は培養細胞などを使用しないため、これまでの技術では通常数週間から数ヵ月間かかっていた工程をわずか2日間で完了することができます。また抗体だけではなく、原理上全ての水溶性タンパク質をリポソームの表面に結合させることができます。この方法で低分子抗体(VHH抗体)を合成してリポソーム上に固...
キーワード:検索システム/技術戦略/海洋/海洋科学/アミド/機能性分子/タンパク質合成/遺伝情報/材料科学/タンパク質デザイン/キャリア/電気泳動/センサー/トンネル/ナノサイズ/バイオセンサー/制御工学/膜構造/タンパク質合成系/新生鎖/無細胞タンパク質合成系/ナノカプセル/リボソーム/機能性/脂質膜/アミノ酸配列/アルギニン/mRNA/大腸/HER2/siRNA/アミノ酸/アミロイド/がん細胞/がん治療/スクリーニング/バイオ医薬品/プロテアーゼ/ラット/リン脂質/遺伝子治療/抗原/合成生物学/細胞培養/創薬/大腸菌/培養細胞/ワクチン/遺伝子/遺伝子発現/抗がん剤/抗体/脂質/乳がん
他の関係分野:複合領域環境学化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年6月20日
16
生物学の常識を覆す、「両利き」機能を持つ古代タンパク質
核酸結合タンパク質の進化的歴史に関する新たな手がかり
東京科学大学(Science Tokyo) 地球生命研究所(ELSI)のLiam M. Longo(リアムM. ロンゴ)特任准教授、同 Tatsuya Corlett(龍也・コレット)修士課程学生とエルサレム・ヘブライ大学のNorman Metanis(ノーマン・メタニス)教授らの国際共同研究チームは、全ての生物に進化的に保存されている、DNAやRNAに結合するシンプルな古代タンパク質が、分子の"利き手"(キラリティー[用語1])を反転させてもなお機能することを示しました。...
キーワード:検索システム/キラリティー/タンパク質構造/らせん構造/進化学/シミュレーション/分子シミュレーション/生物物理学/D-アミノ酸/ELSI/生物物理/RNA/RNA結合タンパク質/アミノ酸/ヘリックス/立体構造
他の関係分野:複合領域化学生物学工学総合生物
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発表日:2025年6月10日
17
内在性の“毒”の分解がパーキンソン病の発症を抑える
DJ-1によるcPGA分解機構の発見がもたらす新展開
東京科学大学(Science Tokyo) 総合研究院 難治疾患研究所 機能分子病態学分野の松田憲之教授と、同研究所 計算創薬科学分野の森脇由隆准教授らの研究チームは、遺伝性パーキンソン病の原因遺伝子DJ-1(PARK7)[用語1]がコードするDJ-1タンパク質が、糖の代謝過程で生じる有害な副生成物...
キーワード:アニオン/反応機構/オルガネラ/質量分析/加水分解/水分解/電気泳動/モデリング/移動度/可視化技術/システイン/酸化酵素/リン酸/加水分解酵素/酵素活性/オミクス/ホメオスタシス/分子機能/運動機能/分子機構/アミノ酸/オートファジー/パーキンソン病/ミトコンドリア/抗酸化/神経変性/神経変性疾患/創薬/代謝物/低分子化合物/翻訳後修飾/ストレス/遺伝子
他の関係分野:化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日:2025年6月9日
18
病状の指標となる液性因子に応じて薬効タンパク質の産生量を自動調整する次世代mRNA医薬を開発
東京科学大学(Science Tokyo)総合研究院 生体材料工学研究所の中西秀之助教(現 大阪大学 感染症総合教育研究拠点(CiDER)特任講師(常勤))と位髙啓史教授(現 大阪大学 感染症総合教育研究拠点(CiDER)教授、東京科学大学 総合研究院 核酸・ペプチド創薬治療研究センター(TIDEセンター)特命教授を兼任)は、ホルモンなどの液性因子を検知し、それに応じて投与されたmRNAからタンパク質への...
キーワード:オープンアクセス/最適化/バクテリオファージ/ナノ粒子/バイオマテリアル/リン酸/翻訳抑制/技術革新/アミノ酸配列/アルギニン/タバコ/細胞膜/翻訳制御/炎症反応/脳虚血/mRNA/ホルモン/新型コロナウイルス/ペプチド創薬/液性因子/歯学/DDS/Gタンパク質/RNA結合タンパク質/アミノ酸/ファージ/プロスタグランジン/プロスタグランジンE2/プロテアーゼ/遺伝子治療/虚血/抗炎症/合成生物学/再生医療/受容体/生理活性/生理活性物質/創薬/培養細胞/副作用/ウイルス/ワクチン/遺伝子/感染症/脂質/生体材料/疼痛
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発表日:2025年5月15日
19
細胞分裂の基点となるセントロメアの新規クロマチン構造を提唱
CENP-A-H4オクタソームの発見と構造解明
染色体の中央に位置するセントロメアは、細胞の有糸分裂[用語1]の際に、姉妹染色分体を分離する紡錘体微小管が結合する動原体[用語2]が形成される領域です。セントロメアでは、ヒストンH3がそのバリアントであるCE...
キーワード:検索システム/ゲノムDNA/タンパク質複合体/塩基配列/出芽酵母/紡錘体/電子線/ヒストン/アイデンティティ/モデリング/極低温/電子顕微鏡/分解能/ヌクレオソーム/構造変換/生体内/ゲノム機能/クロマチン構造/クライオ電子顕微鏡/アルギニン/セントロメア/高分解能/クロマチン/染色体/微小管/がん化/リモデリング/RNA/アミノ酸/ヒストン修飾/メチル化/高次構造/細胞分裂/創薬/立体構造/ゲノム/遺伝子
他の関係分野:複合領域化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日:2025年5月12日
20
酸化ストレス応答に着目したデータベース「Localizatome」を開発
8,000種超のタンパク質局在変化を網羅的解析、老化・がんなどの研究や創薬に貢献
東京科学大学(Science Tokyo)大学院医歯学総合研究科 システム発生再生医学分野の松島隆英助教および淺原弘嗣教授を中心に、大阪大学、理化学研究所、武蔵野大学、産業総合研究所の研究チームは、酸化ストレス[用語1]に応答して細胞内局在が変化するタンパク質を網羅的...
キーワード:スループット/学習アルゴリズム/アルゴリズム/機械学習/生細胞/ロボット/ハイスループット/機能性/細胞応答/アミノ酸配列/ストレス顆粒/オミクス/蛍光タンパク質/整形外科学/再生医学/歯学/発生学/アミノ酸/オートファジー/スーパーオキシド/ストレス応答/タンパク質分解/プロテオミクス/リウマチ/活性酸素/活性酸素種/構造変化/細胞周期/細胞内局在/細胞分化/細胞分裂/小胞体/小胞体ストレス/創薬/ストレス/バイオマーカー/遺伝子/遺伝子発現/酸化ストレス/分子生物学/網羅的解析/老化
他の関係分野:情報学化学工学総合生物農学
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発表日:2025年5月2日
21
正十二面体リンクの球殻分子構造の構築に成功
ウイルスキャプシド状分子の化学合成に期待
東京科学大学(Science Tokyo)総合研究院 化学生命科学研究所の澤田知久准教授と東京大学の藤田誠卓越教授(兼 分子科学研究所 卓越教授)、お茶の水女子大学の下川航也教授らの研究チームは、ペプチド[用語1]を金属イオンと...
キーワード:オープンアクセス/検索システム/位相幾何学/結び目理論/多面体/幾何学/幾何構造/結び目/原子核/磁気共鳴/対称性/磁場/分子構造/自己組織/ナノマテリアル/機能性分子/高分子/自己集合/小角X線散乱/超分子化学/反応場/X線結晶構造解析/結晶構造解析/配位結合/有機分子/原子分解能/銀イオン/秩序構造/単結晶/銅イオン/ナノサイズ/ナノメートル/ナノ空間/ナノ構造/金属イオン/周波数/電磁波/分解能/ナノチューブ/構造予測/X線結晶構造/エチレン/機能性/結晶構造/金属タンパク質/組織化/超分子/サッカー/アミノ酸/フラーレン/プロリン/ラット/核磁気共鳴/官能基/生体高分子/配位子/分子設計/立体構造/ウイルス/ゲノム
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発表日:2025年4月23日
22
遺伝性疾患の原因遺伝子がDNA複製を制御する新たなメカニズムの発見
抗がん剤開発のための生体内標的として期待
東京科学大学総合研究院ゼロカーボンエネルギー研究所の島田幹男助教、塚田海馬博士研究員(現、コペンハーゲン大学博士研究員)、今村力也博士研究員(現、京都大学特定助教)、Fu Lingyan大学院生、松本義久教授と国立がんセンター研究所RI研究施設の石合正道施設長らの研究チームは、哺乳類細胞においてDNA修復酵素であるPNKP(Poly-nucleotide kinase phosphatase[用語1])がDNA複製に関与することを明らかにしました。PNKPはDNA末端をリン酸化あるいは脱リン酸化す...
キーワード:検索システム/突然変異/原子核/遺伝性疾患/ファイバー/紫外線/カーボン/原子力/遺伝子改変/生体内/酸化酵素/哺乳類/リン酸/環境ストレス/DNA二本鎖切断/重粒子線/発生生物学/DNA修復/iPS細胞/神経発生/眼球運動/大腸/分子機構/オルガノイド/ゲノム編集/脱リン酸化/発がん/発生学/病態解明/DNA損傷/DNA複製/アミノ酸/がん細胞/てんかん/マウス/リン酸化酵素/遺伝子改変マウス/遺伝病/活性酸素/細胞増殖/細胞分化/神経変性/神経変性疾患/大腸菌/培養細胞/ゲノム/ストレス/ヒトiPS細胞/遺伝子/遺伝子発現/海馬/抗がん剤/神経疾患/分子生物学/放射線/老化
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発表日:2025年4月21日
23
オーファン酵素遺伝子を探索するための深層学習ベースの 計算手法「DeepES」を開発
オーファン酵素遺伝子の特定による代謝理解と酵素応用に期待
東京科学大学(Science Tokyo)生命理工学院 生命理工学系の山田拓司准教授と廣田佳亮大学院生とSalim Felix(サリム・フェリックス)博士らの研究チームは、細菌ゲノムからオーファン酵素[用語1]を効率的に探索するための深層学習ベースの計算手法として「DeepES」を開発しました。オーファン酵素とは酵素活性は確認されているものの、アミノ酸配列情報が知られていない酵素のことで、酵素データベース上に多数存在しています。オーファン酵素は、アミノ酸配列情報がないた...
キーワード:位置情報/言語モデル/自然言語/自然言語処理/情報学/深層学習/人工知能(AI)/検索システム/言語処理/がん研究/生命情報/生体触媒/候補遺伝子/機能予測/遺伝子クラスター/腸内フローラ/リンパ腫/酵素活性/生合成/生合成遺伝子/アミノ酸配列/ゲノム科学/メタゲノム解析/酵素反応/代謝物質/ゲノム解析/メタゲノム/大腸/短鎖脂肪酸/腸内環境/予測モデル/がん化/発がん/T細胞/アミノ酸/ラット/脂肪酸/代謝物/大腸がん/白血病/連続反応/ゲノム/メタボローム/メタボローム解析/遺伝子/細菌/細菌叢/真菌/早期発見/腸内細菌/腸内細菌叢/予防医学
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発表日:2025年4月9日
24
人工進化が生んだ超高親和性RNA–タンパク質ペアの構造基盤解明
宮崎大学 テニュアトラック推進室 福永圭佑准教授(前東京科学大学特任助教)、九州大学 大学院農学研究院 寺本岳大助教、同角田佳充教授、沖縄科学技術大学院大学(以下OIST) 核酸化学・工学ユニット 横林洋平教授、東京科学大学 地球生命研究所 松浦友亮教授らは、X線結晶構造解析の手法を用いて二つの人工RNA−タンパク質複合体(RNP)の結合様式の違いを解明することに成功しました。さらに、これらRNPを活用した高性能リボスイッチ(遺伝子発現制御用のRNAスイッチ)の開発を行い、無細胞タンパク質合成系(セルフリーシステム)...
キーワード:電気通信/オープンアクセス/情報学/検索システム/産学連携/二量体/ディスプレイ/核酸化学/生細胞/EGFP/タンパク質合成/X線結晶構造解析/タンパク質複合体/共進化/結晶構造解析/共結晶/選択性/マイクロ/マイクロ流路/モーター/論理回路/タンパク質合成系/無細胞タンパク質合成系/進化実験/人工細胞/リボソーム/X線結晶構造/古細菌/RNAポリメラーゼ/結晶構造/進化分子工学/ウサギ/RNAアプタマー/プロモーター/脂質二重膜/翻訳制御/蛍光タンパク質/mRNA/大腸/in vitro/RNA/アミノ酸/スクリーニング/ファージ/ラット/リガンド/遺伝子発現制御/合成生物学/赤血球/大腸菌/発現制御/分子認識/膜タンパク質/ツール開発/遺伝子/遺伝子発現/細菌/脂質
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発表日:2025年4月4日
25
独自の深層学習モデルによる蛍光免疫センサーの高性能化
アミノ酸配列のみから機能の有無が予測可能に
東京科学大学 総合研究院 化学生命科学研究所の北口哲也准教授と朱博助教、生命理工学院の井上暁人大学院生(研究当時)らの研究チームは、同工学院の小林健准教授と米国カリフォルニア大学アーバイン校のChang C. Liu教授と共同で、蛍光免疫センサーを高性能化させる独自の深層学習モデル「NanoQ-model 1.0」を構築しました。標的分子を検出できる免疫センサーは、環境調査や食品分析、医療などで不可欠です。しかし、高感度なセンサーの開発には膨大な試行錯誤が必要で、数ヵ月を要していました。本研究では、深層学習を利用して構築した分類モデルにより、このプロセスをわずか数...
キーワード:スループット/AI/機械学習/言語モデル/情報学/深層学習/人工知能(AI)/検索システム/産学連携/相補性/二量体/蛍光センサー/電子移動/グルコース/ハイスループットスクリーニング/光応答/有害物質/シリコン/センサー/バイオセンサー/レーザー/光センサー/ハイスループット/機能予測/変異体/アレルゲン/酵素活性/性決定/アミノ酸配列/SARS-CoV-2/cGMP/FACS/蛍光タンパク質/健康診断/新型コロナウイルス/大腸/臨床検査/フローサイトメトリー/ATP/in vitro/RNA/アミノ酸/スクリーニング/トリプトファン/ヘリックス/マウス/リガンド/蛍光色素/蛍光標識/光誘起電子移動/抗原/抗体医薬/受容体/大腸菌/アレルギー/ウイルス/ゲノム/ワクチン/遺伝子/感染症/抗体
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発表日:2025年4月3日
26
ペプチドでできた編み込みナノチューブ構造の合成に成功
東京科学大学(Science Tokyo)総合研究院 化学生命科学研究所の澤田知久准教授らの研究チームは、タンパク質の材料であるペプチド[用語1]からなる結び目構造[用語2]を合体させた...
キーワード:オープンアクセス/情報学/検索システム/産学連携/絡み目/トポロジー/幾何学/結び目/原子核/磁気共鳴/対称性/化学組成/磁場/分子構造/自己組織/キラル/機能性分子/自己集合/超分子化学/X線結晶構造解析/結晶構造解析/配位結合/銀イオン/テンプレート/秩序構造/単結晶/カーボン/カーボンナノチューブ/ナノメートル/ナノ構造/ナノ材料/金属イオン/周波数/設計法/電磁波/分解能/ナノチューブ/X線結晶構造/機能性/結晶構造/分子機械/組織化/超分子/日常生活/アミノ酸/核磁気共鳴/生体分子/分子認識/立体構造
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発表日:2025年3月26日
27
藻類でのデンプン分解を調節する仕組みを解明
藻類による持続可能なデンプン生産に期待
東京科学大学(Science Tokyo)※総合研究院 化学生命科学研究所の今村壮輔特定教授(現 日本電信電話株式会社(NTT) 宇宙環境エネルギー研究所 上席特別研究員)、田中寛教授、東北大学 大学院医学系研究科の島弘季学術研究員、五十嵐和彦教授らの研究チームは、藻類(微細藻類)細胞内でのデンプン分解を調節する分子レベルの仕組みを解明し、デンプン蓄積量を向上させることに成功しました。今回の研究では、デンプン分解に関与するGWDタンパク質[用語1]...
キーワード:検索システム/産学連携/人間活動/地球温暖化/バクテリア/気候変動/フィルム/生分解性プラスチック/タンパク質合成/グルコース/シアノバクテリア/光合成/葉緑体/結合状態/生分解/持続可能/チタン/エタノール/プラスチック/環境負荷/環境問題/生産性/超解像/二酸化炭素/リボソーム/生分解性/酸化酵素/デンプン/リン酸/植物ホルモン/バイオエタノール/バイオマス/炭水化物/バイオ燃料/温暖化/生物資源/微細藻類/微生物/リン酸化プロテオーム/シグナル伝達系/タンパク質リン酸化/ベクター/細胞株/ホルモン/分子機構/脱リン酸化/アミノ酸/キナーゼ/グルタミン酸/システム生物学/リン酸化酵素/バイオフィルム/マラリア/概日リズム/分子生物学
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発表日:2025年3月26日
28
革新的mRNA医薬による難治疾患治療への新展開
筋ジストロフィー治療における新たな可能性を切り拓く
東京科学大学(Science Tokyo)※ 総合研究院 生体材料工学研究所の位髙啓史教授(大阪大学 感染症総合教育研究拠点 兼務)、中西秀之助教、申育實研究員(大阪大学)、杜璇(Du Xuan)大学院生、および国立精神・神経医療研究センター(NCNP)神経研究所の青木吉嗣部長、本橋紀夫室長、峰岸かつら室長、札幌医科大学 保健医療学部の山田崇史准教授らによる研究チームは、新しい創薬モダリティとして注目を集めるmRNA医薬を用い、難治性筋疾患であるデュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)[用語1...
キーワード:最適化/情報学/運動負荷/産学連携/静水圧/共重合体/ブロック共重合体/ミセル/共重合/遺伝性疾患/筋細胞/細胞内小器官/キャリア/ポリエチレン/ダイナミクス/ナノ粒子/ポリマー/機能制御/親水性/バイオマテリアル/筋ジストロフィー/エチレン/機能性/アイソフォーム/アンチセンス/肝炎/自閉症スペクトラム/神経内科学/PPARγ/SIRT1/アジュバント/ウイルス感染症/ナノミセル/遺伝子発現解析/炎症反応/関節/細胞内シグナル/脳虚血/発現解析/IGF-1/mRNA/筋収縮/筋肉/筋肥大/新型コロナウイルス/電気刺激/モデルマウス/関節軟骨/筋活動/軟骨/理学療法/DDS/PPAR/RNA/アポトーシス/アミノ酸/アンチセンス核酸/がん治療/ステロイド/マウス/ミトコンドリア/モデル動物/遺伝子治療/医薬品開発/核酸医薬/虚血/再生医療/細胞死/自閉症/疾患モデルマウス/創薬/転写因子/脳機能/誘導体/ウイルス
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発表日:2025年3月25日
29
アクアポリン3の新規チャネル閉鎖構造を発見
クライオ電子顕微鏡でアクアポリン3の構造を解析し、他の水チャネルには見られない、水の通路が塞がれた構造を解明
東京科学大学(Science Tokyo)総合研究院 高等研究府 細胞構造生理学研究室の藤吉好則特別栄誉教授、香西大輔プロジェクト助教らは、横浜市立大学 大学院生命医科学研究科の池口満徳教授、井上雅郎特任助教らと共同で、細胞内外の水輸送に関与する膜タンパク質として知られる水チャネル[用...
キーワード:先端技術/産学連携/分子動力学シミュレーション/芳香環/生命情報/水輸送/原子分解能/構造モデル/3次元構造/シミュレーション/界面活性剤/電子顕微鏡/電子顕微鏡観察/動力学/分解能/分子シミュレーション/分子動力学/生体内/哺乳類/変異体/アミノ酸配列/クライオ電子顕微鏡/免疫系/アルギニン/筋炎/細胞膜/脂質二重膜/心筋/新型コロナウイルス/大腸/ペプチド医薬/RNA/アクアポリン/アミノ酸/がん細胞/ラット/医薬品開発/上皮細胞/腎臓/水チャネル/生体膜/阻害剤/創薬/大腸菌/動的構造/膜タンパク質/立体構造/立体構造解析/ウイルス/ストレス/遺伝子/酸化ストレス/脂質/生理学/唾液
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発表日:2025年3月13日
30
タンパク質合成を停止させる新規ペプチド配列を発見
生命を形作るタンパク質は、DNAにコードされた遺伝子配列をもとに細胞内装置リボソーム[用語1]によって合成され、この過程は「翻訳」と呼ばれます。リボソームはどんなタンパク質でも合成可能、と思われがちですが、実際には合成しやすい配列と、合成が困難な「難翻訳配列[用語2]」が存在することが明らかになってきました。これまでにさまざまなアミノ酸配列が難翻訳であることが判明し、かつその一部は遺伝子発現制御に利用...
キーワード:検索システム/先端技術/環境変化/産学連携/水溶液/ポリペプチド/終止コドン/タンパク質合成/翻訳終結/tRNA/コドン/遺伝情報/トンネル/制御工学/大規模解析/電子顕微鏡/分解能/たんぱく/モデル生物/新生鎖/リボソーム/生体内/技術革新/生合成/アミノ酸配列/クライオ電子顕微鏡/シャペロン/細胞毒性/熱ショックタンパク質/ショック/筋萎縮/大腸/RNA/アミノ酸/アミロイド/ストレス応答/タンパク質発現/トリプトファン/プロリン/ラット/遺伝子発現制御/医薬品開発/創薬/大腸菌/発現制御/薬理学/ゲノム/ストレス/遺伝子/遺伝子発現/筋萎縮性側索硬化症 /生理学/認知症
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発表日:2025年3月5日
31
植物に学ぶ触媒デザインで酸素発生触媒の高性能化に成功
東京科学大学(Science Tokyo)※理学院 化学系の近藤美欧教授と小杉健斗助教、大阪大学 大学院工学研究科大学院生の松﨑拓実さん(博士前期課程・当時)と正岡重行教授らの共同研究チームは、東京大学 物性研究所の木内久雄助教と原田慈久教授、産業技術総合研究所の研究チームと共同で、植物をヒントに、(1)身の回りに豊富に存在する鉄イオンを持ち、(2)水溶液中で駆動可能で、(3)高い耐久性と反応速度を示す酸素発生触媒を得ることに初めて成功しました。エネルギー・環境問題を背景に、...
キーワード:検索システム/産学連携/光エネルギー/X線吸収分光/高エネルギー/水分子/水溶液/加速器/軟X線/分光学/放射光/X線分光/太陽/多核金属錯体/鉄錯体/アンモニア/金属錯体/錯体触媒/触媒反応/超分子化学/反応場/光合成/太陽光/赤外吸収分光/二酸化炭素還元/有機分子/マンガン/酸素発生反応/酸素分子/触媒化学/電気化学反応/人工光合成/選択性/軟X線分光/ボトルネック/還元反応/反応速度/局所構造/原子配列/電子状態/インピーダンス/ポリマー/界面化学/環境問題/金属イオン/耐久性/電荷移動/電気化学/二酸化炭素/カルシウムイオン/メタノール/超分子/寿命/反応時間/アミノ酸/カルシウム/錯体化学/酸化反応/電気化学測定/配位子
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発表日:2025年3月4日
32
わずか2種類のアミノ酸で構成されたペプチドで 高活性人工酵素を構築
自己組織化を利用し、天然酵素と同等の活性を低コストで実現
東京科学大学(Science Tokyo)※ 物質理工学院 材料系の杉山茉莉絵修士課程学生、早水裕平准教授および、金沢大学ナノ生命科学研究所(WPI-NanoLSI)のAyhan Yurtsever(アイハン・ユルトセベル)特任助教、福間剛士教授らのチームは、自己組織化[用語1]ペプチド[用語2]を用いた人工酵素電極の簡便な形成技術を開発し、その界面分子構造と触媒反応の関係を分子...
キーワード:最適化/情報学/検索システム/産学連携/化学物質/環境計測/グラファイト/水溶液/分子構造/自己組織/モリブデン/金属錯体/触媒反応/人工酵素/ロイシン/2次元物質/カルコゲナイド/ナノ物質/酵素電極/遷移金属/2次元材料/カンチレバー/トランジスタ/ナノ界面/遷移金属ダイカルコゲナイド/単分子膜/電界効果トランジスタ/二硫化モリブデン/半導体デバイス/還元反応/秩序構造/ナノシート/ナノワイヤ/電界効果/AFM/グラフェン/センサー/センシング/ナノメートル/ナノ材料/バイオセンサー/金属イオン/原子間力顕微鏡/構造設計/周波数/電気化学/半導体/微細構造/分解能/ナノチューブ/表面構造/酵素活性/アミノ酸配列/空間分解能/酵素反応/組織化/筋萎縮/アミノ酸/ポルフィリン/電気化学測定/分子設計/ヘルスケア/感染症/筋萎縮性側索硬化症 /新型コロナウイルス感染症
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発表日:2025年3月3日
33
蛍光分子との結合でタンパク質が動き出す「分子ドミノ」
東京科学大学(Science Tokyo)※ 生命理工学院 生命理工学系の菱川湧輝博士と上野隆史教授らは、東京科学大学 総合研究院 科学生命科学研究所の吉沢道人教授、および東京大学 大学院工学系研究科の津本浩平教授、長門石曉准教授の研究グループと共同で、蛍光分子等のスイッチ分子の結合をトリガーとして、タンパク質の動きを協働的に制御する分子設計技術「分子ドミノ」を開発しました。...
キーワード:情報学/人工知能(AI)/分子ロボット/検索システム/産学連携/幾何学/閉じ込め/分光学/芳香環/芳香族/分子カプセル/電子移動/分子デバイス/芳香族化合物/タンパク質合成/X線結晶構造解析/結晶構造解析/光合成/タンパク質デザイン/バイオセンシング/動的挙動/熱安定性/3Dプリンター/センシング/ナノスケール/ロボット/金属イオン/結晶化/分子制御/たんぱく/タンパク質結晶/バイオマテリアル/X線結晶構造/機能性/結晶構造/タンパク質工学/大腸/アミノ酸/ドキソルビシン/トリプトファン/フラーレン/構造変化/合成生物学/生体分子/創薬/大腸菌/分子設計/分子認識/抗がん剤
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