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研究キーワード：東京科学大学における「ゲノム解析」 に関係する研究一覧：11件
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発表日：2025年11月18日 この記事は2025年12月2日号以降に掲載されます。
1
麹菌の菌核内部に未知の構造体を発見
麹菌にも「性」の痕跡
この記事は2025年12月2日号以降に掲載されます。
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発表日：2025年10月7日
2
ヒトの7倍の巨大ゲノムを解読
イベリアトゲイモリが示す発生・再生・進化・行動の謎
有尾両生類であるイモリは、古くから発生や再生の研究において重要な役割を果たしてきました。しかしイモリのゲノムは、反復配列によりヒトの数倍から十数倍と巨大であるため、長らく決定が困難でした。今回、主に国内の研究者からなる「イベリアトゲイモリ研究コンソーシアム」を中心として、日本で樹立された近交系統イベリアトゲイモリ[用語1]を対象に最新の高精度ロングリードシークエンス技術を用いてゲノム解読に成功しました。そのゲノムは約200億塩基対に達し、ヒトの約7倍もの大きさです。解析の結果、ゲノム巨大化に関わる...
キーワード：データ統合/コウモリ/外来種/ゲノムDNA/人工DNA/シクリッド/フェロモン/フェロモン受容体/生殖/両生類/脊椎動物/適応進化/前駆体/モデル生物/トランスポゾン/イントロン/トランスオミクス/哺乳類/ゲノム配列/シークエンス/骨形成因子/器官再生/DNA二本鎖切断/ゲノムシークエンス/ゲノム多型/ニワトリ/CRISPR/オミクス/オミクス解析/プロテオグリカン/受精/受精卵/染色体/mRNA/ゲノム解析/ホルモン/筋肉/脊椎/反復配列/BMP/エンハンサー/ゲノム編集/再生医学/アミノ酸/ゲノムプロジェクト/ヘッジホッグ/マウス/モデル動物/遺伝子発現制御/形態形成/骨形成/再生医療/受容体/精子/転写制御/転写調節/発現制御/ゲノム/遺伝学/遺伝子/遺伝子発現
他の関係分野：情報学環境学化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年9月27日
3
遺伝子が転写される場所を可視化できるマウスの作製
生体組織内の転写制御機構の解明と創薬への応用に期待
東京科学大学（Science Tokyo） 総合研究院 細胞制御工学研究センターの木村宏教授、九州大学 生体防御医学研究所の馬場義裕教授、大川恭行教授、大阪大学 微生物病研究所の伊川正人教授らの研究チームは、生きた細胞で遺伝子が転写されている場所を観察できる新しいマウスモデルを開発しました。遺伝子からmRNAを作る酵素であるRNAポリメラーゼIIが遺伝子を読み取る際に受けるリン酸化[用語1]に着目し、これを認識する蛍光抗体を全身で発現するマウスを作製しました。このマウス...
キーワード：検索システム/空間分布/細胞イメージング/生細胞/遺伝情報/減数分裂/生殖/性染色体/ヒストン/ナノメートル/制御工学/超解像/分解能/ヌクレオソーム/人工細胞/光学顕微鏡/生体内/RNAポリメラーゼ/リン酸/クロマチン構造/環境応答/微生物/ヘテロクロマチン/生体組織/ゲノム情報/精子形成/クロマチン/マウスモデル/脂肪組織/受精/受精卵/精巣/染色体/免疫染色/卵子/mRNA/ゲノム解析/生体防御/胎児/エピゲノム解析/ヘルパーT細胞/モデルマウス/線維芽細胞/脱リン酸化/B細胞/DNA複製/RNA/T細胞/オートファジー/ヒストン修飾/プローブ/マウス/メチル化/幹細胞/蛍光顕微鏡/好中球/抗原/高次構造/細胞核/細胞分化/疾患モデルマウス/小胞体/腎臓/精子/創薬/転写制御/培養細胞/翻訳後修飾/免疫応答/免疫学/免疫細胞/脾臓/ゲノム/遺伝子/遺伝子発現
他の関係分野：複合領域環境学化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年9月7日
4
全ゲノムシークエンス解析により乾癬の新規関連遺伝子を発見
見逃されてきた希少変異と構造変異の関与を解明
東京科学大学（Science Tokyo） 大学院医歯学総合研究科 免疫学分野の佐藤荘教授、光井雄一助教、東京大学大学院医学系研究科遺伝情報学の曽根原究人助教（研究当時、現：ウェルカム・サンガー研究所Postdoctoral Fellow）、岡田随象教授（兼：大阪大学大学院医学系研究科 遺伝統計学 教授、理化学研究所生命医科学研究センター チームディレクター）、東京大学医科学研究所 附属ヒトゲノム解析センター シークエンス技術開発分野の松田浩一特任教授（兼：同大学大学院新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻クリニカルシークエンス分野 教授）、名古屋市立大学大学院医学研究科加齢・環境皮膚...
キーワード：アノテーション/位置情報/機械学習/情報学/シナジー/学際研究/ブレイン/ゲノミクス/遺伝情報/生殖/ダイナミクス/接合部/インフォマティクス/配列解析/一細胞/マッピング/ゲノム配列/病原性/遺伝的多様性/シークエンス/遺伝統計学/細胞運命/生殖細胞/オミックス/ゲノムシークエンス/ゲノムワイド/ゲノム情報/抗原特異性/脳神経科学/オミクス/オミクス解析/オミックス解析/バイオバンク/ヒトゲノム/遺伝子解析/炎症反応/乾癬/関節/治療標的/実験モデル/若返り/浸潤/染色体/体細胞変異/分子機能/DNAチップ/SNP/ゲノムワイド関連解析/ゲノム解析/評価法/エンハンサー/マルチオミックス/歯学/自己抗原/線維芽細胞/統計的手法/病態解明/DDS/T細胞/サーベイランス/トランスクリプトーム/ノックアウトマウス/ファージ/マウス/マクロファージ/リウマチ/遺伝子ノックアウト/遺伝子欠損マウス/遺伝子発現制御/関節リウマチ/抗原/自己免疫/神経科学/創薬/発現制御
他の関係分野：情報学複合領域環境学数物系科学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年8月6日
5
老化した細胞が鉄で死なない仕組みを解明
リソソームの酸性度が細胞死の鍵を握る
東京科学大学 総合研究院 M&Dデータ科学センター AI技術開発分野の鎌谷 高志講師、がん研究会がん研究所細胞老化研究部の羅智文特任研究員、周翔宇博士研究員、高橋暁子部長を中心とするグループは、正常な細胞においては酸性に保たれている細胞内分解器官であるリソソーム[用語1]の内部が...
キーワード：アバター/人工知能（AI）/がん研究/閉じ込め/陽子/悪性化/タンパク質複合体/ミトコンドリアDNA/アミン/加水分解/水分解/遠隔制御/鉄代謝/生体内/輸送体/抵抗性/プロトン/細胞内分解/免疫系/機能解析/細胞膜/翻訳制御/DNA損傷応答/がん抗原/がん免疫/がん免疫療法/関節/血管内皮/抗腫瘍免疫/細胞老化/治療抵抗性/治療標的/浸潤/微小環境/免疫制御/老化細胞/膵臓/ゲノム解析/ポリアミン/生理機能/分子機構/がん微小環境/モデルマウス/線維芽細胞/免疫療法/DNA損傷/T細胞/がん細胞/がん治療/マウス/ミトコンドリア/ラジカル/リウマチ/リソソーム/活性酸素/間質細胞/関節リウマチ/血管内皮細胞/抗原/細胞死/細胞増殖/細胞分裂/酸化反応/脂肪酸/腫瘍免疫/神経変性/神経変性疾患/内皮細胞/不飽和脂肪酸/免疫細胞/膵臓がん/エクソソーム/ゲノム/ストレス/レジリエント
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年7月24日
6
若年発症肺腺がんの一部にBRCA2やTP53遺伝子の遺伝的要因が関与することを解明
日本人の若年発症肺腺がんを対象とした初の大規模ゲノム解析の成
国立研究開発法人国立がん研究センター（東京都中央区、理事長：間野博行）、研究所 ゲノム生物学研究分野の白石航也ユニット長、河野隆志分野長、張萌琳外来研究員、東京科学大学 医歯学総合研究科 統合呼吸器病学分野の本多隆行医学部内講師らは、全国8施設からなる研究コンソーシアムを構築し、日本人の肺腺がんについて大規模に解析し、若年（40歳以下）で発症する肺腺がんの原因を調べました。本研究において肺腺がんの若年発症例と非若年発症例を比較した結果、若年発症例ではTP53遺伝子、BRCA2遺伝子に生まれつき変異している...
キーワード：情報サービス/危機管理/がん研究/ゲノムDNA/相同組み換え/塩基配列/生殖/紫外線/デジタルツイン/組み換え/診断法/ゲノム配列/リン酸/シークエンス/生殖細胞/ゲノムシークエンス/タバコ/環境要因/DNA修復/EGFR/PARP阻害剤/TP53/アデノシン/エクソーム/がん遺伝子/バイオバンク/次世代シークエンサー/全エクソームシークエンス/早期診断/体細胞変異/肺腺がん/放射線治療/融合遺伝子/卵巣/ゲノム解析/死亡率/症例対照研究/分子標的/卵巣がん/歯学/発がん/HLA/がん細胞/がん治療/サーベイランス/血液/阻害剤/創薬/がん患者/ゲノム/リスク因子/遺伝子/遺伝子変異/危険因子/抗がん剤/手術/乳がん/肺がん/分子標的治療/分子標的薬/放射線
他の関係分野：情報学複合領域化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年6月20日
7
ホップの性決定システムの解明に成功
東京科学大学（Science Tokyo）生命理工学院 生命理工学系の田中裕之助教、伊藤武彦教授および岡山大学、サントリーグローバルイノベーションセンター（株）などの研究チームは、ホップのゲノム配列を高精度に決定し、近縁のカナムグラのゲノム配列を含めた詳細な比較解析などを行うことで、長年未解明であったホップにおける性決定システムの解明に成功しました。本研究の成果は、6月18日付（現地時間）の「Nature Plants」誌に掲載されました。背景多くの植物は花の中におしべとめしべを持つ両性花であり、自分自身で種子をつけることができ...
キーワード：検索システム/シクリッド/ヒトデ/生殖/適応進化/耐久性/エチレン/哺乳類/ゲノム配列/性決定/性分化/微生物/ゲノム情報/微生物叢/染色体/ゲノム解析/受容体/ゲノム/遺伝子
他の関係分野：複合領域生物学工学農学
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発表日：2025年6月12日
8
漬物由来の乳酸菌が持つ「免疫機能を調節する力」を解明
機能性食品等への応用が期待されるLactiplantibacillus属の比較ゲノム解析で明らかに
東京科学大学 生命理工学院 生命理工学系の山田拓司准教授と劉伊婷博士課程学生らは、日本の漬物から分離された乳酸菌[用語1]であるLactiplantibacillus plantarumおよびLactiplantibacillus pentosusの免疫機能を調節する能力の違いに注目し、比較ゲノム解析[用語2]を行いました。その結果、Lactiplantibacillu...
キーワード：深層学習/人工知能（AI）/検索システム/がん研究/免疫機能/遺伝情報/生存戦略/比較ゲノム解析/候補遺伝子/ペプチドグリカン/免疫調節/腸内フローラ/機能性/機能性食品/発酵/ゲノム配列/リン酸/プロバイオティクス/リンパ腫/細胞壁/病原性/生物資源/比較ゲノム/微生物/ELISA/メタゲノム解析/炎症反応/ゲノム解析/メタゲノム/大腸/腸内環境/がん化/発がん/T細胞/共培養/抗菌薬/大腸がん/白血病/免疫応答/免疫細胞/アレルギー/ゲノム/メタボローム/メタボローム解析/遺伝子/細菌/細菌叢/早期発見/腸内細菌/腸内細菌叢
他の関係分野：情報学複合領域生物学総合生物農学
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発表日：2025年6月9日
9
魚類の繁殖戦略における進化的バイアスを分子レベルで解明
240魚種の比較から見えてきた「進化の袋小路」
東京科学大学（Science Tokyo） 生命理工学院 生命理工学系の長澤竜樹助教、待井長敏大学院生、相原光人研究員、二階堂雅人准教授および上智大学の川口眞理准教授、安増茂樹教授の共同研究チームは、魚類の多様な繁殖戦略に関わる分子メカニズムを明らかにし、繁殖戦略における進化的バイアスを遺伝子レベルで裏付ける初めての証拠を発見しました。脊椎動物の繁殖様式の進化は、生活史戦略や生息環境に強く影響され、特定の方向に偏った進化（進化的バイアス）を示すことが知られています。例えば魚類の進化過程では、親が卵を保護する繁殖戦略（卵保護戦略）をとる種が系統的に何度も出現していま...
キーワード：スーパーコンピュータ/検索システム/環境変化/コウモリ/極地/外来種/ゲノム進化/シクリッド/フェロモン/フェロモン受容体/系統樹/初期発生/進化生物学/分子系統解析/グッピー/脊椎動物/適応進化/分子系統/分子進化/哺乳類/ゲノム配列/系統解析/サケ/生態学/繁殖生態/ゲノム多型/発生生物学/プロテオグリカン/受精/受精卵/ゲノム解析/脊椎/形態形成/受容体/糖タンパク質/膜タンパク質/ゲノム/ストレス/遺伝学/遺伝子/育児/細菌/非侵襲
他の関係分野：情報学複合領域環境学生物学農学
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発表日：2025年6月5日
10
Y染色体はどこへ？—ユニークな進化の軌跡
トゲネズミ性染色体の長年の謎が明らかに
東京科学大学 生命理工学院 生命理工学系の伊藤武彦教授、北海道大学大学院 理学研究院の黒岩麻里教授、久留米大学 医学部の奥野未来講師らの研究グループは、性染色体に大変ユニークな特徴をもつ日本固有のトゲネズミのゲノム配列を解読し、Y染色体の進化の軌跡を明らかにしました。ヒトを含む哺乳類では、性染色体がXY型だと男性（オス）、XX型だと女性（メス）になります。しかし、奄美大島と徳之島にそれぞれ生息するアマミトゲネズミとトクノシマトゲネズミはY染色体を失っており、オスもメスもX染色体１本のXO/XO型です。一方で、沖縄に生息するオキナワトゲネズミはXX/XY型ではあるも...
キーワード：検索システム/シクリッド/ヒトデ/種分化/進化学/性染色体/適応進化/シナリオ/耐久性/染色体構造/哺乳類/ゲノム構造/ゲノム配列/性決定/性決定遺伝子/性分化/微生物/Sry/ゲノム情報/微生物叢/Sox9/染色体/ゲノム解析/マウス/ラット/構造変化/細胞核/精子/ゲノム/遺伝学/遺伝子/分子生物学
他の関係分野：複合領域生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年4月21日
11
オーファン酵素遺伝子を探索するための深層学習ベースの 計算手法「DeepES」を開発
オーファン酵素遺伝子の特定による代謝理解と酵素応用に期待
東京科学大学（Science Tokyo）生命理工学院 生命理工学系の山田拓司准教授と廣田佳亮大学院生とSalim Felix（サリム・フェリックス）博士らの研究チームは、細菌ゲノムからオーファン酵素[用語1]を効率的に探索するための深層学習ベースの計算手法として「DeepES」を開発しました。オーファン酵素とは酵素活性は確認されているものの、アミノ酸配列情報が知られていない酵素のことで、酵素データベース上に多数存在しています。オーファン酵素は、アミノ酸配列情報がないた...
キーワード：位置情報/言語モデル/自然言語/自然言語処理/情報学/深層学習/人工知能（AI）/検索システム/言語処理/がん研究/生命情報/生体触媒/候補遺伝子/機能予測/遺伝子クラスター/腸内フローラ/リンパ腫/酵素活性/生合成/生合成遺伝子/アミノ酸配列/ゲノム科学/メタゲノム解析/酵素反応/代謝物質/ゲノム解析/メタゲノム/大腸/短鎖脂肪酸/腸内環境/予測モデル/がん化/発がん/T細胞/アミノ酸/ラット/脂肪酸/代謝物/大腸がん/白血病/連続反応/ゲノム/メタボローム/メタボローム解析/遺伝子/細菌/細菌叢/真菌/早期発見/腸内細菌/腸内細菌叢/予防医学
他の関係分野：情報学複合領域生物学総合理工総合生物農学