東京科学大学 研究シーズ|
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研究キーワード：東京科学大学における「酵素反応」 に関係する研究一覧：6件
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発表日：2025年11月1日
1
酵素Sir2のタンデムアロステリック効果
脱アセチル化反応を効率的に行う仕組みを解明
東京科学大学（Science Tokyo） 生命理工学院 生命理工学院系の白臻（バイ・ジェン）博士課程学生、Tran Phuoc Duy（チャン・フ・ズイ）助教、北尾彰朗教授は、酵素Sir2が連続する2段階のアロステリック効果[用語1]、「タンデムアロステリック効果」によって、タンパク質の脱アセチル化反応を効率的に行っていることを明らかにしました。Sir2はDNAと結合するヒストンタンパク質やがん抑制因子p53などの様々なタンパク質を脱アセチル化するサーチュインという酵...
キーワード：PCクラスタ/スーパーコンピュータ/自由エネルギー/健康増進/計算機シミュレーション/ヒストン/ポリエチレン/ボトムアップ/シミュレーション/金属イオン/大規模計算/動力学/分子動力学/リボソーム/生物物理学/エチレン/脱アセチル化/キチン/アミノ酸配列/DNA修復/p53/酵素反応/新型コロナウイルス/生物物理/GPCR/Gタンパク質/アセチル化/アミノ酸/メチル化/ユビキチン/ユビキチン化/受容体/創薬/低分子化合物/分子認識/翻訳後修飾/立体構造/ウイルス/サーチュイン/抗体/脂質/老化
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学工学総合生物農学
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発表日：2025年9月18日
2
試験管内でオートファジーの初期過程を再現することに成功
オートファジー促進剤の開発に期待
北海道大学 遺伝子病制御研究所の藤岡優子准教授および野田展生教授、東京科学大学（Science Tokyo） 総合研究院 細胞制御工学研究センターの中戸川仁教授らの研究グループは、オートファジーの中核であるオートファゴソーム[用語1]新生の初期過程を試験管内で再構成することに成功し、液−液相分離[用語2]によりオートファジーが始まるメカニズムの詳細を明らかにすることに成功しました。...
キーワード：検索システム/相分離/ホスファチジルエタノールアミン/Atg/オルガネラ/ゴルジ体/栄養飢餓/アミン/前駆体/エタノール/制御工学/電子顕微鏡/たんぱく/オートファゴソーム/脂質膜/キチン/微生物/膜たんぱく/酵素反応/日常生活/分子機構/ATP/オートファジー/ミトコンドリア/ユビキチン/リソソーム/リン脂質/凝集体/蛍光顕微鏡/蛍光色素/構造生物学/細胞核/小胞体/神経変性/神経変性疾患/阻害剤/遺伝子/脂質/分子生物学
他の関係分野：複合領域数物系科学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年8月7日
3
糖鎖による抗体ダイナミクスの制御機構を解明
分子経絡が抗体医薬設計の新たな鍵に
私たちの体には、病原体から身を守るための免疫システムが備わっています。その中心的な役割を担うのが「免疫グロブリンG（IgG）[用語3]」と呼ばれる抗体です。IgGは、特定の抗原を認識して結合するだけでなく、Fc受容体や補体といったエフェクター分子との相互作用を通じて、さまざまな免疫応答を誘導します。本研究では、IgGの...
キーワード：ネットワーク解析/最適化/検索システム/免疫機能/産学連携/分子動力学シミュレーション/安定同位体/同位体/分子構造/シミュレーション/スピン/ダイナミクス/動力学/分子動力学/医工学/構造・機能相関/病原体/遺伝子工学/糖鎖修飾/酵素反応/ナノテクノロジー/アミノ酸/コンフォメーション/ラット/抗原/抗体医薬/構造変化/自己免疫/自己免疫疾患/受容体/動的構造/免疫応答/遺伝子/抗体
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学化学工学総合生物
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発表日：2025年6月18日
4
DNA液滴の流動性を光で制御
インテリジェントな微小流体型分子コンピュータの実現に期待
東京科学大学 情報理工学院 情報工学系の瀧ノ上正浩教授、鵜殿寛岳特任助教と東北大学 大学院工学研究科 ロボティクス専攻の野村M.慎一郎准教授らの研究チームは、照射した光の波長[用語1]...
キーワード：コンピューティング/AI/最適化/人工知能（AI）/分子ロボット/分子ロボティクス/検索システム/局所化/水分子/水溶液/相補性/対称性/非対称性/閉じ込め/相分離/数値シミュレーション/らせん構造/光応答性/高分子/自己集合/細胞内小器官/遺伝情報/塩基配列/光応答/マイクロ流体工学/ハイドロゲル/ナノ構造体/可視光/光スイッチ/光スイッチング/ベンゼン/光照射/反応速度/シミュレーション/ナノメートル/ナノ構造/マイクロ/マイクロ流体/モーター/モデル化/ロケット/ロボット/ロボティクス/遠隔操作/界面活性剤/拡散係数/周波数/相変化/電磁波/微細加工/表面張力/流体工学/流体力/流体力学/DNAコンピュータ/医工学/人工細胞/微細加工技術/生体内/生物物理学/TEMPO/トレーサ/分子モーター/光制御/酵素反応/筋肉/生物物理/カップリング/ナノテクノロジー/RNA/アゾベンゼン/イミン/ラット/凝集体/構造変化
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年4月21日
5
オーファン酵素遺伝子を探索するための深層学習ベースの 計算手法「DeepES」を開発
オーファン酵素遺伝子の特定による代謝理解と酵素応用に期待
東京科学大学（Science Tokyo）生命理工学院 生命理工学系の山田拓司准教授と廣田佳亮大学院生とSalim Felix（サリム・フェリックス）博士らの研究チームは、細菌ゲノムからオーファン酵素[用語1]を効率的に探索するための深層学習ベースの計算手法として「DeepES」を開発しました。オーファン酵素とは酵素活性は確認されているものの、アミノ酸配列情報が知られていない酵素のことで、酵素データベース上に多数存在しています。オーファン酵素は、アミノ酸配列情報がないた...
キーワード：位置情報/言語モデル/自然言語/自然言語処理/情報学/深層学習/人工知能（AI）/検索システム/言語処理/がん研究/生命情報/生体触媒/候補遺伝子/機能予測/遺伝子クラスター/腸内フローラ/リンパ腫/酵素活性/生合成/生合成遺伝子/アミノ酸配列/ゲノム科学/メタゲノム解析/酵素反応/代謝物質/ゲノム解析/メタゲノム/大腸/短鎖脂肪酸/腸内環境/予測モデル/がん化/発がん/T細胞/アミノ酸/ラット/脂肪酸/代謝物/大腸がん/白血病/連続反応/ゲノム/メタボローム/メタボローム解析/遺伝子/細菌/細菌叢/真菌/早期発見/腸内細菌/腸内細菌叢/予防医学
他の関係分野：情報学複合領域生物学総合理工総合生物農学
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発表日：2025年3月4日
6
わずか2種類のアミノ酸で構成されたペプチドで 高活性人工酵素を構築
自己組織化を利用し、天然酵素と同等の活性を低コストで実現
東京科学大学（Science Tokyo）※ 物質理工学院 材料系の杉山茉莉絵修士課程学生、早水裕平准教授および、金沢大学ナノ生命科学研究所（WPI-NanoLSI）のAyhan Yurtsever（アイハン・ユルトセベル）特任助教、福間剛士教授らのチームは、自己組織化[用語1]ペプチド[用語2]を用いた人工酵素電極の簡便な形成技術を開発し、その界面分子構造と触媒反応の関係を分子...
キーワード：最適化/情報学/検索システム/産学連携/化学物質/環境計測/グラファイト/水溶液/分子構造/自己組織/モリブデン/金属錯体/触媒反応/人工酵素/ロイシン/2次元物質/カルコゲナイド/ナノ物質/酵素電極/遷移金属/2次元材料/カンチレバー/トランジスタ/ナノ界面/遷移金属ダイカルコゲナイド/単分子膜/電界効果トランジスタ/二硫化モリブデン/半導体デバイス/還元反応/秩序構造/ナノシート/ナノワイヤ/電界効果/AFM/グラフェン/センサー/センシング/ナノメートル/ナノ材料/バイオセンサー/金属イオン/原子間力顕微鏡/構造設計/周波数/電気化学/半導体/微細構造/分解能/ナノチューブ/表面構造/酵素活性/アミノ酸配列/空間分解能/酵素反応/組織化/筋萎縮/アミノ酸/ポルフィリン/電気化学測定/分子設計/ヘルスケア/感染症/筋萎縮性側索硬化症 /新型コロナウイルス感染症
他の関係分野：情報学複合領域環境学数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学