東京科学大学 研究シーズ|
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研究キーワード：東京科学大学における「オミクス」 に関係する研究一覧：9件
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発表日：2025年11月1日
1
シングルセル型PLOM-CON法を駆使した細胞周期依存的な薬効の解明と層別化
抗がん剤作用の超早期検出と予兆シグナル同定
東京科学大学（Science Tokyo）総合研究院 細胞制御工学研究センターの加納ふみ教授らの研究グループは、培養細胞に対する薬剤の効果を単一細胞レベルで高感度に評価する新手法「シングルセル型PLOM-CON（sc-PLOM-CON）法」を開発しました。本手法は、多重免疫蛍光染色と画像ベースの共変動ネットワーク[用語1]解析を統合することで、薬剤による細胞周期依存的な早期の細胞状態変化をタンパク質の共変動ネットワークで可視化できます。細胞周期は細胞分裂後に成長するG1...
キーワード：画像データ/高次元データ/情報数理/特徴抽出/インテリジェンス/ネットワーク解析/ネットワーク分析/社会ネットワーク/社会ネットワーク分析/主成分分析/検索システム/グラフ理論/非線形/揺らぎ/ノイズ/タンパク質合成/オルガネラ/状態推定/レーザー/安全性評価/実証実験/制御工学/DNA複製阻害/複製阻害/共焦点レーザー顕微鏡/相関解析/SUMO化/一細胞/細胞応答/リン酸/タンパク質翻訳/性周期/生体組織/DNA二本鎖切断/iPS細胞/オミクス/シグナル伝達系/細胞内シグナル/細胞老化/染色体/薬剤スクリーニング/フローサイトメトリー/不均一性/DNA損傷/DNA複製/Hela細胞/RNA/がん細胞/がん治療/スクリーニング/ストレス応答/ブレオマイシン/プロテオミクス/一細胞解析/細胞核/細胞周期/細胞生物学/細胞分化/細胞分裂/神経分化/神経変性/神経変性疾患/創薬/培養細胞/副作用/翻訳後修飾/薬剤感受性/ストレス/バイオマーカー/遺伝子/遺伝子発現/概日リズム/個別化医療/抗がん剤/抗体
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年10月8日
2
白血病の“系統転換再発”による免疫逃避
マルチオミクス解析で免疫抑制性を解明
京都大学 大学院医学研究科 発達小児科学 滝田順子 教授、加藤格 同講師、三上貴司 同特定研究員（現：同研究科附属がん免疫総合研究センター 特定助教）、東京科学大学 大学院医歯学総合研究科 発生発達病態学分野 髙木正稔 教授、大阪大学 感染症総合教育研究拠点感染症・生体防御研究部門 ヒト生体防御学チーム James Badger Wing 教授らの研究グループは、急性リンパ性白血病[用語1]（ALL）が治療中に別の系統である急性骨髄性白血病（AML）へと変化して再発する“系統転換（lineage ...
キーワード：がん研究/遺伝情報/ヒストン/システム制御/キメラ/抗原受容体/免疫系/CAR-T細胞療法/MLL/新規治療法/MDSC/エクソーム/エクソーム解析/オミクス/オミクス解析/がん免疫/がん免疫療法/マルチオミクス/マルチオミクス解析/遺伝子異常/抗体療法/子宮/治療標的/免疫逃避/免疫抑制/膀胱がん/子宮体がん/生体防御/大動脈/白血球/骨髄/歯学/病態解明/免疫療法/RNA/T細胞/がん細胞/がん治療/急性リンパ性白血病(ALL)/急性骨髄性白血病/共培養/血液/抗原/細胞療法/受容体/制御性T細胞/創薬/白血病/免疫チェックポイント/免疫チェックポイント阻害薬/免疫応答/免疫細胞/臨床試験/遺伝子/遺伝子発現/感染症/抗体/小児/難病
他の関係分野：複合領域生物学工学農学
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発表日：2025年10月7日
3
ヒトの7倍の巨大ゲノムを解読
イベリアトゲイモリが示す発生・再生・進化・行動の謎
有尾両生類であるイモリは、古くから発生や再生の研究において重要な役割を果たしてきました。しかしイモリのゲノムは、反復配列によりヒトの数倍から十数倍と巨大であるため、長らく決定が困難でした。今回、主に国内の研究者からなる「イベリアトゲイモリ研究コンソーシアム」を中心として、日本で樹立された近交系統イベリアトゲイモリ[用語1]を対象に最新の高精度ロングリードシークエンス技術を用いてゲノム解読に成功しました。そのゲノムは約200億塩基対に達し、ヒトの約7倍もの大きさです。解析の結果、ゲノム巨大化に関わる...
キーワード：データ統合/コウモリ/外来種/ゲノムDNA/人工DNA/シクリッド/フェロモン/フェロモン受容体/生殖/両生類/脊椎動物/適応進化/前駆体/モデル生物/トランスポゾン/イントロン/トランスオミクス/哺乳類/ゲノム配列/シークエンス/骨形成因子/器官再生/DNA二本鎖切断/ゲノムシークエンス/ゲノム多型/ニワトリ/CRISPR/オミクス/オミクス解析/プロテオグリカン/受精/受精卵/染色体/mRNA/ゲノム解析/ホルモン/筋肉/脊椎/反復配列/BMP/エンハンサー/ゲノム編集/再生医学/アミノ酸/ゲノムプロジェクト/ヘッジホッグ/マウス/モデル動物/遺伝子発現制御/形態形成/骨形成/再生医療/受容体/精子/転写制御/転写調節/発現制御/ゲノム/遺伝学/遺伝子/遺伝子発現
他の関係分野：情報学環境学化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年9月29日
4
副腎細胞が“脂肪細胞に変わる”仕組みを解明
脂質シグナルによる細胞運命スイッチを発見、ストレスや老化研究に新展開
東京科学大学（Science Tokyo） 総合研究院 難治疾患研究所 病態生理化学分野の柳井翔吾 日本学術振興会特別研究員（PD）、佐々木純子教授（キャリアアップ）、佐々木雄彦教授らの研究チームは、副腎皮質細胞が脂肪細胞様に分化転換する現象を、シグナル伝達リン脂質PI(3,4,5)P3[用語1]の蓄積が誘導することを明らかにしました。副腎はストレス応答の主要なエフェクター臓器であり、通常は成熟脂肪細胞を含みませんが、まれに副腎脂肪腫が認められ、その成因は不明でした。...
キーワード：ロバスト/ロバストネス/プログラミング/がん研究/脆弱性/因果関係/生細胞/クロストーク/神経系/副腎皮質/キャリア/高齢社会/モデル化/電子顕微鏡/遺伝子改変/実験動物/リン酸/Cre/細胞運命/視床/膜脂質/下垂体/細胞膜/脂肪細胞分化/視床下部/超高齢社会/発生生物学/副腎/Pten/オミクス/脂肪組織/動物モデル/分化転換/ホルモン/脂肪細胞/寿命/性ホルモン/不安障害/分子機構/PI3K/画像診断/細胞系譜/歯学/前駆細胞/AKT/PPAR/ステロイド/ストレス応答/マウス/リプログラミング/リン脂質/蛍光標識/再生医療/細胞増殖/細胞分化/受容体/腎機能/転写因子/転写制御/内分泌/免疫応答/うつ/うつ病/コルチゾール/ストレス/バイオマーカー/遺伝子/加齢/健康寿命/高齢化/脂質/生活習慣病/分子生物学/老化
他の関係分野：情報学複合領域環境学数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年9月21日
5
指定難病ネフロン癆（ろう）の病態解明とiPS創薬による新規治療薬候補の発見
ヒト腎臓オルガノイドでHippoシグナル阻害剤の有効性を実証
東京科学大学（Science Tokyo） 大学院医歯学総合研究科 腎臓内科学分野の蘇原映誠准教授、須佐紘一郎講師、鈴木健文大学院生らの研究チームは、ヒトiPS細胞から作製した腎オルガノイドモデルを用い、動物モデルでは再現が難しかったネフロン癆の疾患モデルを構築しました。さらに、このモデルを用いてネフロン癆の病態を解明し、新規治療薬候補の抽出にも成功しました。ネフロン癆は、腎臓が線維化して腎機能が低下する遺伝性疾患で、小児の末期腎不全の5～10%を占めるとともに、成人の慢性腎臓病の原因としても近年注目されています。しかし、これまで有効な治療法は見つかっておらず、人...
キーワード：遺伝性疾患/遺伝子改変/腎線維化/腎臓病/尿細管/尿細管細胞/CRISPR/iPS細胞/オミクス/細胞株/腎移植/腎不全/動物モデル/臨床応用/AMPK/オルガノイド/歯学/病態解明/in vitro/エネルギー代謝/プロテオミクス/炎症性サイトカイン/腎機能/腎臓/阻害剤/創薬/分化誘導/臨床試験/サイトカイン/ストレス/ヒトiPS細胞/遺伝学/遺伝子/遺伝子変異/疾患モデル/小児/線維化/難病/慢性腎臓病/網羅的解析
他の関係分野：生物学総合生物
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発表日：2025年9月7日
6
全ゲノムシークエンス解析により乾癬の新規関連遺伝子を発見
見逃されてきた希少変異と構造変異の関与を解明
東京科学大学（Science Tokyo） 大学院医歯学総合研究科 免疫学分野の佐藤荘教授、光井雄一助教、東京大学大学院医学系研究科遺伝情報学の曽根原究人助教（研究当時、現：ウェルカム・サンガー研究所Postdoctoral Fellow）、岡田随象教授（兼：大阪大学大学院医学系研究科 遺伝統計学 教授、理化学研究所生命医科学研究センター チームディレクター）、東京大学医科学研究所 附属ヒトゲノム解析センター シークエンス技術開発分野の松田浩一特任教授（兼：同大学大学院新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻クリニカルシークエンス分野 教授）、名古屋市立大学大学院医学研究科加齢・環境皮膚...
キーワード：アノテーション/位置情報/機械学習/情報学/シナジー/学際研究/ブレイン/ゲノミクス/遺伝情報/生殖/ダイナミクス/接合部/インフォマティクス/配列解析/一細胞/マッピング/ゲノム配列/病原性/遺伝的多様性/シークエンス/遺伝統計学/細胞運命/生殖細胞/オミックス/ゲノムシークエンス/ゲノムワイド/ゲノム情報/抗原特異性/脳神経科学/オミクス/オミクス解析/オミックス解析/バイオバンク/ヒトゲノム/遺伝子解析/炎症反応/乾癬/関節/治療標的/実験モデル/若返り/浸潤/染色体/体細胞変異/分子機能/DNAチップ/SNP/ゲノムワイド関連解析/ゲノム解析/評価法/エンハンサー/マルチオミックス/歯学/自己抗原/線維芽細胞/統計的手法/病態解明/DDS/T細胞/サーベイランス/トランスクリプトーム/ノックアウトマウス/ファージ/マウス/マクロファージ/リウマチ/遺伝子ノックアウト/遺伝子欠損マウス/遺伝子発現制御/関節リウマチ/抗原/自己免疫/神経科学/創薬/発現制御
他の関係分野：情報学複合領域環境学数物系科学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年9月2日
7
がん免疫療法、なぜ効かなくなる？治療に抵抗する“悪玉サブクローン”の正体を解明
転移性尿路上皮がんでは、抗PD-1抗体ペムブロリズマブ（商品名キイトルーダ）が2017年に承認されて以降、免疫チェックポイント阻害薬によるがん免疫療法が標準治療となりました。しかし、免疫チェックポイント阻害薬が無効な症例や耐性を獲得する症例が後を絶たず、このような症例の克服が臨床上の課題となっています。近年の技術の進歩により、がんの遺伝子異常の解析が進み、腫瘍内には遺伝子の一部が変異したクローンが何種類も不均一に存在することが明らかになり、一つの腫瘍といってもこの各クローンから増殖が起こる（多クローン性増殖）ことがわかってきました。しかし、がん免疫療法中に生じる多...
キーワード：プロファイル/人工知能（AI）/クローン/塩基配列/一細胞/マッピング/尿路上皮がん/PD-1/エクソーム/オミクス/オミクス解析/がん免疫/がん免疫療法/悪性度/遺伝子異常/遺伝子発現解析/浸潤/発現解析/微小環境/病理/免疫抑制/大動脈/次世代シーケンサー/腫瘍微小環境/免疫治療/免疫療法/RNA/T細胞/がん幹細胞/がん細胞/トランスクリプトーム/トランスクリプトミクス/ファージ/マクロファージ/一細胞解析/幹細胞/細胞増殖/免疫チェックポイント/免疫チェックポイント阻害薬/ゲノム/遺伝子/遺伝子発現/遺伝子変異/抗体
他の関係分野：情報学生物学総合生物農学
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発表日：2025年6月10日
8
内在性の“毒”の分解がパーキンソン病の発症を抑える
DJ-1によるcPGA分解機構の発見がもたらす新展開
東京科学大学（Science Tokyo） 総合研究院 難治疾患研究所 機能分子病態学分野の松田憲之教授と、同研究所 計算創薬科学分野の森脇由隆准教授らの研究チームは、遺伝性パーキンソン病の原因遺伝子DJ-1（PARK7）[用語1]がコードするDJ-1タンパク質が、糖の代謝過程で生じる有害な副生成物...
キーワード：アニオン/反応機構/オルガネラ/質量分析/加水分解/水分解/電気泳動/モデリング/移動度/可視化技術/システイン/酸化酵素/リン酸/加水分解酵素/酵素活性/オミクス/ホメオスタシス/分子機能/運動機能/分子機構/アミノ酸/オートファジー/パーキンソン病/ミトコンドリア/抗酸化/神経変性/神経変性疾患/創薬/代謝物/低分子化合物/翻訳後修飾/ストレス/遺伝子
他の関係分野：化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年5月12日
9
酸化ストレス応答に着目したデータベース「Localizatome」を開発
8,000種超のタンパク質局在変化を網羅的解析、老化・がんなどの研究や創薬に貢献
東京科学大学（Science Tokyo）大学院医歯学総合研究科 システム発生再生医学分野の松島隆英助教および淺原弘嗣教授を中心に、大阪大学、理化学研究所、武蔵野大学、産業総合研究所の研究チームは、酸化ストレス[用語1]に応答して細胞内局在が変化するタンパク質を網羅的...
キーワード：スループット/学習アルゴリズム/アルゴリズム/機械学習/生細胞/ロボット/ハイスループット/機能性/細胞応答/アミノ酸配列/ストレス顆粒/オミクス/蛍光タンパク質/整形外科学/再生医学/歯学/発生学/アミノ酸/オートファジー/スーパーオキシド/ストレス応答/タンパク質分解/プロテオミクス/リウマチ/活性酸素/活性酸素種/構造変化/細胞周期/細胞内局在/細胞分化/細胞分裂/小胞体/小胞体ストレス/創薬/ストレス/バイオマーカー/遺伝子/遺伝子発現/酸化ストレス/分子生物学/網羅的解析/老化
他の関係分野：情報学化学工学総合生物農学