東京科学大学 研究シーズ|
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研究キーワード：東京科学大学における「蛍光タンパク質」 に関係する研究一覧：6件
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発表日：2025年11月19日 この記事は2025年12月3日号以降に掲載されます。
1
細胞内のATP濃度を決定できる蛍光寿命型センサーの開発に成功
この記事は2025年12月3日号以降に掲載されます。
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発表日：2025年10月18日
2
酵素断片の「トラップ＆リリース」に基づく抗原依存的酵素スイッチ
任意の分子によるタンパク質機能の自由自在な制御を目指して
東京科学大学（Science Tokyo）総合研究院 化学生命科学研究所の北口哲也准教授と安田貴信助教らの研究チームは、東北大学 多元物質科学研究所の田口真彦助教、理化学研究所の木川隆則博士、信州大学の新井亮一教授と共同で、抗体に酵素の断片を融合させることにより、抗原に応答して活性が上昇する酵素スイッチ「Switchbody」 を開発しました。タンパク質は多様な機能を持ち、さまざまな生命現象に関与しています。その中でも、外的刺激に応答してオン・オフのスイッチとして機能するタンパク質は、細胞生理機能を動的に制御する上で重要な役割を果たします。このスイッチ機能を人工的...
キーワード：スループット/深層学習/デルタ/クロスオーバー/原子核/磁気共鳴/物質科学/蛍光センサー/生物発光/X線結晶構造解析/グルコース/ハイスループットスクリーニング/結晶構造解析/核スピン/静電相互作用/シミュレーション/スピン/センサー/ダイナミクス/トラップ/マイクロ/結晶化/光センサー/分子デザイン/ハイスループット/神経活動/生体内/X線結晶構造/発酵/結晶構造/変異体/タンパク質工学/酵素活性/一本鎖抗体/ELISA/MDシミュレーション/アミノ酸配列/細胞膜/cGMP/蛍光タンパク質/細胞内シグナル/生理機能/大腸/ATP/アミノ酸/ケミカルバイオロジー/シグナル分子/スクリーニング/バイオイメージング/マウス/リガンド/遺伝子導入/蛍光色素/血液/抗原/構造変化/骨粗鬆症/細胞増殖/細胞培養/受容体/代謝酵素/大腸菌/培養細胞/分子認識/膜電位/免疫応答/立体構造/アレルギー/遺伝学/遺伝子/抗体
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年8月26日
3
神経回路の発達：シナプス伝達は“勝者”の選別には不要だが 配線の“精緻化”には不可欠
発達障害や運動失調症などの理解・治療標的探索に新しい視点を提供
東京科学大学 医歯学総合研究科 認知神経生物学分野の上阪直史教授（研究当時：東京大学 大学院医学系研究科 講師）、帝京大学 先端総合研究機構の狩野方伸特任教授（東京大学 大学院医学系研究科 名誉教授）、東京大学 大学院医学系研究科のKao Tzu-Huei研究員（研究当時）、帝京大学 先端総合研究機構研究員の奥野優人研究員、らの研究グループは、小脳において、運動制御だけでなく社会性や認知機能を担うプルキンエ細胞[用語1]にシナプス入力する...
キーワード：学習アルゴリズム/アルゴリズム/ニューラルネットワーク/最適化/人工知能（AI）/化学物質/機能分化/ニューラルネット/運動制御/シナプス/シナプス小胞/運動失調/小脳/神経回路形成/生後発達/登上線維/オミックス/細胞膜/CRISPR/オミックス解析/蛍光タンパク質/治療標的/生体イメージング/免疫染色/緑色蛍光タンパク質(GFP)/神経伝達物質/歯学/イミン/グルタミン酸/シナプス刈り込み/スクリーニング/マウス/受容体/樹状突起/神経回路/神経細胞/神経生物学/電気生理学/遺伝学/生理学/認知機能/発達障害/網羅的解析
他の関係分野：情報学環境学生物学工学総合生物
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発表日：2025年5月12日
4
酸化ストレス応答に着目したデータベース「Localizatome」を開発
8,000種超のタンパク質局在変化を網羅的解析、老化・がんなどの研究や創薬に貢献
東京科学大学（Science Tokyo）大学院医歯学総合研究科 システム発生再生医学分野の松島隆英助教および淺原弘嗣教授を中心に、大阪大学、理化学研究所、武蔵野大学、産業総合研究所の研究チームは、酸化ストレス[用語1]に応答して細胞内局在が変化するタンパク質を網羅的...
キーワード：スループット/学習アルゴリズム/アルゴリズム/機械学習/生細胞/ロボット/ハイスループット/機能性/細胞応答/アミノ酸配列/ストレス顆粒/オミクス/蛍光タンパク質/整形外科学/再生医学/歯学/発生学/アミノ酸/オートファジー/スーパーオキシド/ストレス応答/タンパク質分解/プロテオミクス/リウマチ/活性酸素/活性酸素種/構造変化/細胞周期/細胞内局在/細胞分化/細胞分裂/小胞体/小胞体ストレス/創薬/ストレス/バイオマーカー/遺伝子/遺伝子発現/酸化ストレス/分子生物学/網羅的解析/老化
他の関係分野：情報学化学工学総合生物農学
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発表日：2025年4月9日
5
人工進化が生んだ超高親和性RNA–タンパク質ペアの構造基盤解明
宮崎大学 テニュアトラック推進室 福永圭佑准教授（前東京科学大学特任助教）、九州大学 大学院農学研究院 寺本岳大助教、同角田佳充教授、沖縄科学技術大学院大学（以下OIST） 核酸化学・工学ユニット 横林洋平教授、東京科学大学 地球生命研究所 松浦友亮教授らは、X線結晶構造解析の手法を用いて二つの人工RNA−タンパク質複合体（RNP）の結合様式の違いを解明することに成功しました。さらに、これらRNPを活用した高性能リボスイッチ（遺伝子発現制御用のRNAスイッチ）の開発を行い、無細胞タンパク質合成系（セルフリーシステム）...
キーワード：電気通信/オープンアクセス/情報学/検索システム/産学連携/二量体/ディスプレイ/核酸化学/生細胞/EGFP/タンパク質合成/X線結晶構造解析/タンパク質複合体/共進化/結晶構造解析/共結晶/選択性/マイクロ/マイクロ流路/モーター/論理回路/タンパク質合成系/無細胞タンパク質合成系/進化実験/人工細胞/リボソーム/X線結晶構造/古細菌/RNAポリメラーゼ/結晶構造/進化分子工学/ウサギ/RNAアプタマー/プロモーター/脂質二重膜/翻訳制御/蛍光タンパク質/mRNA/大腸/in vitro/RNA/アミノ酸/スクリーニング/ファージ/ラット/リガンド/遺伝子発現制御/合成生物学/赤血球/大腸菌/発現制御/分子認識/膜タンパク質/ツール開発/遺伝子/遺伝子発現/細菌/脂質
他の関係分野：情報学複合領域化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年4月4日
6
独自の深層学習モデルによる蛍光免疫センサーの高性能化
アミノ酸配列のみから機能の有無が予測可能に
東京科学大学 総合研究院 化学生命科学研究所の北口哲也准教授と朱博助教、生命理工学院の井上暁人大学院生（研究当時）らの研究チームは、同工学院の小林健准教授と米国カリフォルニア大学アーバイン校のChang C. Liu教授と共同で、蛍光免疫センサーを高性能化させる独自の深層学習モデル「NanoQ-model 1.0」を構築しました。標的分子を検出できる免疫センサーは、環境調査や食品分析、医療などで不可欠です。しかし、高感度なセンサーの開発には膨大な試行錯誤が必要で、数ヵ月を要していました。本研究では、深層学習を利用して構築した分類モデルにより、このプロセスをわずか数...
キーワード：スループット/AI/機械学習/言語モデル/情報学/深層学習/人工知能（AI）/検索システム/産学連携/相補性/二量体/蛍光センサー/電子移動/グルコース/ハイスループットスクリーニング/光応答/有害物質/シリコン/センサー/バイオセンサー/レーザー/光センサー/ハイスループット/機能予測/変異体/アレルゲン/酵素活性/性決定/アミノ酸配列/SARS-CoV-2/cGMP/FACS/蛍光タンパク質/健康診断/新型コロナウイルス/大腸/臨床検査/フローサイトメトリー/ATP/in vitro/RNA/アミノ酸/スクリーニング/トリプトファン/ヘリックス/マウス/リガンド/蛍光色素/蛍光標識/光誘起電子移動/抗原/抗体医薬/受容体/大腸菌/アレルギー/ウイルス/ゲノム/ワクチン/遺伝子/感染症/抗体
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学化学生物学工学総合生物農学