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研究キーワード:東京科学大学における「シークエンス」 に関係する研究一覧:5件
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発表日:2025年10月7日
1
ヒトの7倍の巨大ゲノムを解読
イベリアトゲイモリが示す発生・再生・進化・行動の謎
有尾両生類であるイモリは、古くから発生や再生の研究において重要な役割を果たしてきました。しかしイモリのゲノムは、反復配列によりヒトの数倍から十数倍と巨大であるため、長らく決定が困難でした。今回、主に国内の研究者からなる「イベリアトゲイモリ研究コンソーシアム」を中心として、日本で樹立された近交系統イベリアトゲイモリ[用語1]を対象に最新の高精度ロングリードシークエンス技術を用いてゲノム解読に成功しました。そのゲノムは約200億塩基対に達し、ヒトの約7倍もの大きさです。解析の結果、ゲノム巨大化に関わる...
キーワード:データ統合/コウモリ/外来種/ゲノムDNA/人工DNA/シクリッド/フェロモン/フェロモン受容体/生殖/両生類/脊椎動物/適応進化/前駆体/モデル生物/トランスポゾン/イントロン/トランスオミクス/哺乳類/ゲノム配列/シークエンス/骨形成因子/器官再生/DNA二本鎖切断/ゲノムシークエンス/ゲノム多型/ニワトリ/CRISPR/オミクス/オミクス解析/プロテオグリカン/受精/受精卵/染色体/mRNA/ゲノム解析/ホルモン/筋肉/脊椎/反復配列/BMP/エンハンサー/ゲノム編集/再生医学/アミノ酸/ゲノムプロジェクト/ヘッジホッグ/マウス/モデル動物/遺伝子発現制御/形態形成/骨形成/再生医療/受容体/精子/転写制御/転写調節/発現制御/ゲノム/遺伝学/遺伝子/遺伝子発現
他の関係分野:情報学環境学化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年9月7日
2
全ゲノムシークエンス解析により乾癬の新規関連遺伝子を発見
見逃されてきた希少変異と構造変異の関与を解明
東京科学大学(Science Tokyo) 大学院医歯学総合研究科 免疫学分野の佐藤荘教授、光井雄一助教、東京大学大学院医学系研究科遺伝情報学の曽根原究人助教(研究当時、現:ウェルカム・サンガー研究所Postdoctoral Fellow)、岡田随象教授(兼:大阪大学大学院医学系研究科 遺伝統計学 教授、理化学研究所生命医科学研究センター チームディレクター)、東京大学医科学研究所 附属ヒトゲノム解析センター シークエンス技術開発分野の松田浩一特任教授(兼:同大学大学院新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻クリニカルシークエンス分野 教授)、名古屋市立大学大学院医学研究科加齢・環境皮膚...
キーワード:アノテーション/位置情報/機械学習/情報学/シナジー/学際研究/ブレイン/ゲノミクス/遺伝情報/生殖/ダイナミクス/接合部/インフォマティクス/配列解析/一細胞/マッピング/ゲノム配列/病原性/遺伝的多様性/シークエンス/遺伝統計学/細胞運命/生殖細胞/オミックス/ゲノムシークエンス/ゲノムワイド/ゲノム情報/抗原特異性/脳神経科学/オミクス/オミクス解析/オミックス解析/バイオバンク/ヒトゲノム/遺伝子解析/炎症反応/乾癬/関節/治療標的/実験モデル/若返り/浸潤/染色体/体細胞変異/分子機能/DNAチップ/SNP/ゲノムワイド関連解析/ゲノム解析/評価法/エンハンサー/マルチオミックス/歯学/自己抗原/線維芽細胞/統計的手法/病態解明/DDS/T細胞/サーベイランス/トランスクリプトーム/ノックアウトマウス/ファージ/マウス/マクロファージ/リウマチ/遺伝子ノックアウト/遺伝子欠損マウス/遺伝子発現制御/関節リウマチ/抗原/自己免疫/神経科学/創薬/発現制御
他の関係分野:情報学複合領域環境学数物系科学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年7月24日
3
若年発症肺腺がんの一部にBRCA2やTP53遺伝子の遺伝的要因が関与することを解明
日本人の若年発症肺腺がんを対象とした初の大規模ゲノム解析の成
国立研究開発法人国立がん研究センター(東京都中央区、理事長:間野博行)、研究所 ゲノム生物学研究分野の白石航也ユニット長、河野隆志分野長、張萌琳外来研究員、東京科学大学 医歯学総合研究科 統合呼吸器病学分野の本多隆行医学部内講師らは、全国8施設からなる研究コンソーシアムを構築し、日本人の肺腺がんについて大規模に解析し、若年(40歳以下)で発症する肺腺がんの原因を調べました。本研究において肺腺がんの若年発症例と非若年発症例を比較した結果、若年発症例ではTP53遺伝子、BRCA2遺伝子に生まれつき変異している...
キーワード:情報サービス/危機管理/がん研究/ゲノムDNA/相同組み換え/塩基配列/生殖/紫外線/デジタルツイン/組み換え/診断法/ゲノム配列/リン酸/シークエンス/生殖細胞/ゲノムシークエンス/タバコ/環境要因/DNA修復/EGFR/PARP阻害剤/TP53/アデノシン/エクソーム/がん遺伝子/バイオバンク/次世代シークエンサー/全エクソームシークエンス/早期診断/体細胞変異/肺腺がん/放射線治療/融合遺伝子/卵巣/ゲノム解析/死亡率/症例対照研究/分子標的/卵巣がん/歯学/発がん/HLA/がん細胞/がん治療/サーベイランス/血液/阻害剤/創薬/がん患者/ゲノム/リスク因子/遺伝子/遺伝子変異/危険因子/抗がん剤/手術/乳がん/肺がん/分子標的治療/分子標的薬/放射線
他の関係分野:情報学複合領域化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年7月15日
4
女性の体がカロリーをより多く消費する理由を解明
褐色脂肪組織におけるミトコンドリアとPGC-1αの役割
東京科学大学(Science Tokyo)大学院医歯学総合研究科 分子内分泌代謝学分野の辻本和峰助教、竹内彬大学院生、青木惇大学院生、山田哲也教授らの研究チームは、東京大学 大学院薬学系研究科の河野望准教授、可野邦行助教、青木淳賢教授らの研究チームと共同で、脂肪を燃やしてカロリーを消費す褐色脂肪組織(BAT;Brown Adipose Tissue)[用語1]に見られる男女差の仕組みを明らかにしました。女性は男性よりも糖尿病や肥満になりにくいことが知られていますが、その...
キーワード:ATP合成/ホスファチジルエタノールアミン/電子伝達/質量分析/アミン/エネルギー消費/ライフスタイル/エタノール/質量分析計/電子顕微鏡/遺伝子改変/ペルオキシソーム/輸送体/クロマチン構造/形態変化/ATP合成酵素/シークエンス/プロトン/熱産生/アルドステロン/肥満症/クロマチン/遺伝子改変動物/脂肪組織/腫瘍内不均一性/心筋/増殖因子/ホルモン/褐色脂肪組織/骨格筋/脂肪細胞/心筋梗塞/性ホルモン/閉経/ATACシークエンス/歯学/病態解明/不均一性/ATP/エストロゲン/エネルギー代謝/トランスクリプトーム/ノックアウトマウス/マウス/ミトコンドリア/ラット/リン脂質/褐色脂肪/構造変化/受容体/転写因子/転写調節/電子伝達系/内分泌/脳梗塞/2型糖尿病/ゲノム/サーモグラフィ/メタボローム/メタボローム解析/遺伝子/遺伝子発現/個別化医療/脂質/脂質異常症/脂質代謝/糖尿病/有病率
他の関係分野:生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日:2025年2月28日
5
高悪性度肝がんの新たな治療戦略を提唱
東京科学大学(Science Tokyo)※ 大学院医歯学総合研究科 分子腫瘍医学分野の田中真二教授、島田周助教、秋山好光講師、波多野恵助教、谷合智彦連携研究員らの研究チームは、同大学の肝胆膵外科、肝臓病態制御学講座、および東京慈恵会医科大学外科学講座との共同研究において、以下の成果を明らかにしました。研究グループは、691症例のバルクデータと228,564細胞のシングルセルデータを統合解析し、肝がん細胞を5つのクラスター(1: 細胞分裂亢進、2: Wnt/β-cateninシグナル活性化、3: 解糖系亢進、4・5: 脂肪合成亢進)に分類し...
キーワード:スーパーコンピュータ/ネットワーク解析/プロファイル/時系列解析/情報学/産学連携/データ解析/MYC/悪性化/ヒストン/モデル化/医工学/一細胞/抵抗性/サイレンシング/シークエンス/肝臓学/肝炎/p53/PD-1/TP53/Tリンパ球/マウスモデル/悪性度/肝がん/肝疾患/血管内皮/個別化治療/細胞株/治療抵抗性/治療標的/浸潤/微小環境/病理/病理学/免疫抑制/予後予測因子/膵臓/アルコール/リンパ球/解糖系/大腸/予後予測/CT画像/Wnt/β-catenin/画像診断/歯学/腫瘍微小環境/線維芽細胞/病態モデル/免疫チェックポイント阻害剤/免疫療法/RNA/RNAシークエンス/T細胞/がん細胞/マウス/遺伝子治療/幹細胞/肝細胞/肝細胞がん/間質細胞/血管新生/血管新生阻害/血管内皮細胞/抗腫瘍効果/細胞分裂/阻害剤/内皮細胞/免疫チェックポイント/免疫チェックポイント阻害薬/免疫学/免疫細胞/ウイルス
他の関係分野:情報学複合領域数物系科学生物学工学総合生物農学
東京科学大学 研究シーズ