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東京科学大学 研究シーズDiscovery Saga
研究キーワード:東京科学大学における「変異体」 に関係する研究一覧:7
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情報学 情報学複合領域 複合領域環境学 環境学数物系科学 数物系科学化学 化学生物学 生物学総合理工 総合理工工学 工学総合生物 総合生物農学 農学医歯薬学 医歯薬学
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発表日:2025年11月6日
1
タンパク質結晶内でゆらぐ糖分子を観る
糖分子ダイナミクスを可視化するバイオマテリアル技術
東京科学大学(Science Tokyo) 生命理工学院 生命理工学系の小島摩利子大学院生(現 東北大学助教)、Yao Xinchen(ヤオ・シンチェン)大学院生(研究当時)、安部聡助教(現 京都府立大学准教授)、古田忠臣助教、上野隆史教授(兼 科学技術創成研究院 自律システム材料学研究センター)らの研究グループは、糖鎖の柔軟な構造と動態を原子レベルで解明する新しい解析基盤を開発しました。研究グループは、白血球に存在する糖結合性タンパク質の一種「...
キーワード:自律システム/スーパーコンピュータ/最適化/幾何学/物質科学/分子動力学シミュレーション/閉じ込め/分子構造/二量体/分子ダイナミクス/タンパク質合成/X線結晶構造解析/グルコース/結晶構造解析/光合成/原子分解能/持続可能/3Dプリンター/シミュレーション/ダイナミクス/結晶化/動力学/分解能/分子動力学/タンパク質結晶/免疫調節/バイオマテリアル/生体内/X線結晶構造/結晶構造/構造決定/変異体/タンパク質工学/機能解析/好酸球/ゆらぎ/腸内環境/白血球/分子標的/喘息/アミノ酸/スクリーニング/タンパク質発現/レクチン/構造変化/阻害剤/創薬/分子設計/分子認識/立体構造/分子標的薬
他の関係分野:情報学数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年10月18日
2
酵素断片の「トラップ&リリース」に基づく抗原依存的酵素スイッチ
任意の分子によるタンパク質機能の自由自在な制御を目指して
東京科学大学(Science Tokyo)総合研究院 化学生命科学研究所の北口哲也准教授と安田貴信助教らの研究チームは、東北大学 多元物質科学研究所の田口真彦助教、理化学研究所の木川隆則博士、信州大学の新井亮一教授と共同で、抗体に酵素の断片を融合させることにより、抗原に応答して活性が上昇する酵素スイッチ「Switchbody」 を開発しました。タンパク質は多様な機能を持ち、さまざまな生命現象に関与しています。その中でも、外的刺激に応答してオン・オフのスイッチとして機能するタンパク質は、細胞生理機能を動的に制御する上で重要な役割を果たします。このスイッチ機能を人工的...
キーワード:スループット/深層学習/デルタ/クロスオーバー/原子核/磁気共鳴/物質科学/蛍光センサー/生物発光/X線結晶構造解析/グルコース/ハイスループットスクリーニング/結晶構造解析/核スピン/静電相互作用/シミュレーション/スピン/センサー/ダイナミクス/トラップ/マイクロ/結晶化/光センサー/分子デザイン/ハイスループット/神経活動/生体内/X線結晶構造/発酵/結晶構造/変異体/タンパク質工学/酵素活性/一本鎖抗体/ELISA/MDシミュレーション/アミノ酸配列/細胞膜/cGMP/蛍光タンパク質/細胞内シグナル/生理機能/大腸/ATP/アミノ酸/ケミカルバイオロジー/シグナル分子/スクリーニング/バイオイメージング/マウス/リガンド/遺伝子導入/蛍光色素/血液/抗原/構造変化/骨粗鬆症/細胞増殖/細胞培養/受容体/代謝酵素/大腸菌/培養細胞/分子認識/膜電位/免疫応答/立体構造/アレルギー/遺伝学/遺伝子/抗体
他の関係分野:情報学複合領域数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日:2025年10月15日
3
進化の過程で失われた機能が復活
ウナギにおいて広い溶質選択性を再獲得したアクアポリン10パラログを発見
東京科学大学(Science Tokyo) 生命理工学院 生命理工学系の永嶌鮎美助教、日髙進一郎大学院生、太田地洋大学院生、加藤明准教授らの研究チームは、同学院の古⽥忠⾂助教、東京⼤学 農学生命科学研究科 フォーデイズ株式会社寄付講座 食と生体機能モデル学研究室(現:加齢生体機能学研究社会連携講座)の伊藤公一特任准教授、山中大介特任助教(研究当時)、信州⼤学の中田勉准教授との共同研究により、ウナギが過去に失った広い溶質選択性を持つ膜輸送体タンパク質と同等の機能を、遺伝子重複[用語1]と変異による...
キーワード:環境変化/海洋/幾何学/水分子/輸送特性/芳香族/膜輸送/アフリカツメガエル/ツメガエル/ホウ酸/膜輸送体/卵母細胞/遺伝子重複/環境適応/機能分化/脊椎動物/選択性/哺乳類/変異体/輸送体/哺乳動物/ウナギ/ニホンウナギ/生物多様性/ダイバーシティ/アルギニン/機能解析/細胞膜/脊椎/アミノ酸置換/アクアポリン/アミノ酸/イミン/小腸/腎臓/水チャネル/低分子化合物/膜タンパク質/ゲノム/遺伝子/育児/栄養指導/加齢/生理学
他の関係分野:複合領域環境学数物系科学化学生物学工学農学
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発表日:2025年9月14日
4
アクアグリセロポリンが尿素・ホウ酸の透過性を制限する仕組みを解明
遺伝子配列から活性予測を可能に
東京科学大学(Science Tokyo)生命理工学院 生命理工学系の永嶌鮎美助教、潮和敬大学院生(研究当時)、加藤明准教授らの研究チームは、同 古田忠臣助教、近畿大学 農学部の西原秀典准教授と共同で、水とグリセロールのチャネルとして知られるアクアグリセロポリン[用語1]Aqp10がグリセロール以外の小分子(尿素・ホウ酸)の透過を制御する仕組みを明らかにしました。これまで、アクアグリセロポリンが水以外の小分子の透過を制御するメカニズムはよく分かっていませんでした。今回、尿素・ホウ酸を輸送するタイプ...
キーワード:検索システム/幾何学/水分子/微量元素/芳香族/アンモニア/アフリカツメガエル/グルコース/ゲノム進化/ツメガエル/ホウ酸/系統樹/進化学/分子系統解析/卵母細胞/両生類/爬虫類/遺伝子重複/環境適応/機能分化/脊椎動物/分子系統/加水分解/水分解/選択性/細孔構造/モデリング/構造予測/生物物理学/窒素代謝/哺乳類/ゲノム配列/変異体/輸送体/哺乳動物/系統解析/アミノ酸配列/ダイバーシティ/アルギニン/細胞膜/糖新生/生物物理/生理機能/脊椎/代謝産物/分子機構/アクアポリン/アミノ酸/イミン/エネルギー代謝/ゲノムプロジェクト/タンパク質発現/水チャネル/低分子化合物/膜タンパク質/立体構造/ゲノム/遺伝子/育児/生理学
他の関係分野:複合領域数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年8月30日
5
光合成の安全装置「DLDG1」の役割を解明
植物が強い光から身を守る仕組みに新たな知見
私たちの暮らしを支える植物は、光合成によって太陽の光エネルギーを使って有機物を作り出しています。しかし、光が強すぎると、逆に植物の体内では有害な活性酸素が発生し、細胞を傷つける恐れがあります。こうしたダメージを防ぐため、植物は「余分な光エネルギーを熱として逃がす」仕組みを備えており、これを熱放散[用語1]と呼びます。本研究では、この熱放散の調節に関わるDLDG1[用語2]とい...
キーワード:検索システム/光エネルギー/普遍性/太陽/ATP合成/ppGpp/光合成/高等植物/植物生理学/電子伝達/変動光/葉緑体/環境適応/太陽光/持続可能/センサー/バイオセンサー/生産性/有機物/リン酸/植物ホルモン/変異体/輸送体/シロイヌナズナ/環境ストレス/ストレス耐性/バイオマス/土壌/カロテノイド/ATP合成酵素/ホルモン/ATP/アミノ酸/活性酸素/抗生物質/硫化水素/ストレス/遺伝学/遺伝子/遺伝子発現/細菌/生理学
他の関係分野:複合領域環境学数物系科学生物学総合理工工学農学
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発表日:2025年4月4日
6
独自の深層学習モデルによる蛍光免疫センサーの高性能化
アミノ酸配列のみから機能の有無が予測可能に
東京科学大学 総合研究院 化学生命科学研究所の北口哲也准教授と朱博助教、生命理工学院の井上暁人大学院生(研究当時)らの研究チームは、同工学院の小林健准教授と米国カリフォルニア大学アーバイン校のChang C. Liu教授と共同で、蛍光免疫センサーを高性能化させる独自の深層学習モデル「NanoQ-model 1.0」を構築しました。標的分子を検出できる免疫センサーは、環境調査や食品分析、医療などで不可欠です。しかし、高感度なセンサーの開発には膨大な試行錯誤が必要で、数ヵ月を要していました。本研究では、深層学習を利用して構築した分類モデルにより、このプロセスをわずか数...
キーワード:スループット/AI/機械学習/言語モデル/情報学/深層学習/人工知能(AI)/検索システム/産学連携/相補性/二量体/蛍光センサー/電子移動/グルコース/ハイスループットスクリーニング/光応答/有害物質/シリコン/センサー/バイオセンサー/レーザー/光センサー/ハイスループット/機能予測/変異体/アレルゲン/酵素活性/性決定/アミノ酸配列/SARS-CoV-2/cGMP/FACS/蛍光タンパク質/健康診断/新型コロナウイルス/大腸/臨床検査/フローサイトメトリー/ATP/in vitro/RNA/アミノ酸/スクリーニング/トリプトファン/ヘリックス/マウス/リガンド/蛍光色素/蛍光標識/光誘起電子移動/抗原/抗体医薬/受容体/大腸菌/アレルギー/ウイルス/ゲノム/ワクチン/遺伝子/感染症/抗体
他の関係分野:情報学複合領域数物系科学化学生物学工学総合生物農学
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発表日:2025年3月25日
7
アクアポリン3の新規チャネル閉鎖構造を発見
クライオ電子顕微鏡でアクアポリン3の構造を解析し、他の水チャネルには見られない、水の通路が塞がれた構造を解明
東京科学大学(Science Tokyo)総合研究院 高等研究府 細胞構造生理学研究室の藤吉好則特別栄誉教授、香西大輔プロジェクト助教らは、横浜市立大学 大学院生命医科学研究科の池口満徳教授、井上雅郎特任助教らと共同で、細胞内外の水輸送に関与する膜タンパク質として知られる水チャネル[用...
キーワード:先端技術/産学連携/分子動力学シミュレーション/芳香環/生命情報/水輸送/原子分解能/構造モデル/3次元構造/シミュレーション/界面活性剤/電子顕微鏡/電子顕微鏡観察/動力学/分解能/分子シミュレーション/分子動力学/生体内/哺乳類/変異体/アミノ酸配列/クライオ電子顕微鏡/免疫系/アルギニン/筋炎/細胞膜/脂質二重膜/心筋/新型コロナウイルス/大腸/ペプチド医薬/RNA/アクアポリン/アミノ酸/がん細胞/ラット/医薬品開発/上皮細胞/腎臓/水チャネル/生体膜/阻害剤/創薬/大腸菌/動的構造/膜タンパク質/立体構造/立体構造解析/ウイルス/ストレス/遺伝子/酸化ストレス/脂質/生理学/唾液
他の関係分野:複合領域数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学