東京科学大学 研究シーズ|
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研究キーワード：東京科学大学における「機能予測」 に関係する研究一覧：3件
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発表日：2025年8月20日
1
AIとロボットが実験の「裏方作業」もする未来
実験室全体を完全自動化する設計思想の提案
東京科学大学総合研究院難治疾患研究所ロボット科学分野の神田元紀教授は、理化学研究所（理研）生命機能科学研究センターバイオコンピューティング研究チームの落合幸治研究員、高橋恒一チームディレクター、AI生物学研究チームの尾崎遼チームディレクター、筑波大学ヒューマニクス学位プログラムの田原（新井）悠也大学院生、梅馨堂合同会社の梅野真代表社員らの研究グループと共同で、...
キーワード：インターフェース/コンピューティング/AI/タスク/画像認識/自然言語/人工知能（AI）/実験計画/太陽/初期胚/塩基配列/太陽光/センサー/マイクロ/メンテナンス/ロボット/ロボットアーム/自動化/統合システム/機能予測/資源管理/iPS細胞/グリア細胞/自己複製/オルガノイド/ES細胞/イミン/グリア/ラット/幹細胞/再生医療/細胞培養/創薬/多能性幹細胞
他の関係分野：情報学数物系科学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年4月21日
2
オーファン酵素遺伝子を探索するための深層学習ベースの 計算手法「DeepES」を開発
オーファン酵素遺伝子の特定による代謝理解と酵素応用に期待
東京科学大学（Science Tokyo）生命理工学院 生命理工学系の山田拓司准教授と廣田佳亮大学院生とSalim Felix（サリム・フェリックス）博士らの研究チームは、細菌ゲノムからオーファン酵素[用語1]を効率的に探索するための深層学習ベースの計算手法として「DeepES」を開発しました。オーファン酵素とは酵素活性は確認されているものの、アミノ酸配列情報が知られていない酵素のことで、酵素データベース上に多数存在しています。オーファン酵素は、アミノ酸配列情報がないた...
キーワード：位置情報/言語モデル/自然言語/自然言語処理/情報学/深層学習/人工知能（AI）/検索システム/言語処理/がん研究/生命情報/生体触媒/候補遺伝子/機能予測/遺伝子クラスター/腸内フローラ/リンパ腫/酵素活性/生合成/生合成遺伝子/アミノ酸配列/ゲノム科学/メタゲノム解析/酵素反応/代謝物質/ゲノム解析/メタゲノム/大腸/短鎖脂肪酸/腸内環境/予測モデル/がん化/発がん/T細胞/アミノ酸/ラット/脂肪酸/代謝物/大腸がん/白血病/連続反応/ゲノム/メタボローム/メタボローム解析/遺伝子/細菌/細菌叢/真菌/早期発見/腸内細菌/腸内細菌叢/予防医学
他の関係分野：情報学複合領域生物学総合理工総合生物農学
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発表日：2025年4月4日
3
独自の深層学習モデルによる蛍光免疫センサーの高性能化
アミノ酸配列のみから機能の有無が予測可能に
東京科学大学 総合研究院 化学生命科学研究所の北口哲也准教授と朱博助教、生命理工学院の井上暁人大学院生（研究当時）らの研究チームは、同工学院の小林健准教授と米国カリフォルニア大学アーバイン校のChang C. Liu教授と共同で、蛍光免疫センサーを高性能化させる独自の深層学習モデル「NanoQ-model 1.0」を構築しました。標的分子を検出できる免疫センサーは、環境調査や食品分析、医療などで不可欠です。しかし、高感度なセンサーの開発には膨大な試行錯誤が必要で、数ヵ月を要していました。本研究では、深層学習を利用して構築した分類モデルにより、このプロセスをわずか数...
キーワード：スループット/AI/機械学習/言語モデル/情報学/深層学習/人工知能（AI）/検索システム/産学連携/相補性/二量体/蛍光センサー/電子移動/グルコース/ハイスループットスクリーニング/光応答/有害物質/シリコン/センサー/バイオセンサー/レーザー/光センサー/ハイスループット/機能予測/変異体/アレルゲン/酵素活性/性決定/アミノ酸配列/SARS-CoV-2/cGMP/FACS/蛍光タンパク質/健康診断/新型コロナウイルス/大腸/臨床検査/フローサイトメトリー/ATP/in vitro/RNA/アミノ酸/スクリーニング/トリプトファン/ヘリックス/マウス/リガンド/蛍光色素/蛍光標識/光誘起電子移動/抗原/抗体医薬/受容体/大腸菌/アレルギー/ウイルス/ゲノム/ワクチン/遺伝子/感染症/抗体
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学化学生物学工学総合生物農学