東京科学大学 研究シーズ|
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研究キーワード：東京科学大学における「候補遺伝子」 に関係する研究一覧：2件
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発表日：2025年6月12日
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漬物由来の乳酸菌が持つ「免疫機能を調節する力」を解明
機能性食品等への応用が期待されるLactiplantibacillus属の比較ゲノム解析で明らかに
東京科学大学 生命理工学院 生命理工学系の山田拓司准教授と劉伊婷博士課程学生らは、日本の漬物から分離された乳酸菌[用語1]であるLactiplantibacillus plantarumおよびLactiplantibacillus pentosusの免疫機能を調節する能力の違いに注目し、比較ゲノム解析[用語2]を行いました。その結果、Lactiplantibacillu...
キーワード：深層学習/人工知能（AI）/検索システム/がん研究/免疫機能/遺伝情報/生存戦略/比較ゲノム解析/候補遺伝子/ペプチドグリカン/免疫調節/腸内フローラ/機能性/機能性食品/発酵/ゲノム配列/リン酸/プロバイオティクス/リンパ腫/細胞壁/病原性/生物資源/比較ゲノム/微生物/ELISA/メタゲノム解析/炎症反応/ゲノム解析/メタゲノム/大腸/腸内環境/がん化/発がん/T細胞/共培養/抗菌薬/大腸がん/白血病/免疫応答/免疫細胞/アレルギー/ゲノム/メタボローム/メタボローム解析/遺伝子/細菌/細菌叢/早期発見/腸内細菌/腸内細菌叢
他の関係分野：情報学複合領域生物学総合生物農学
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発表日：2025年4月21日
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オーファン酵素遺伝子を探索するための深層学習ベースの 計算手法「DeepES」を開発
オーファン酵素遺伝子の特定による代謝理解と酵素応用に期待
東京科学大学（Science Tokyo）生命理工学院 生命理工学系の山田拓司准教授と廣田佳亮大学院生とSalim Felix（サリム・フェリックス）博士らの研究チームは、細菌ゲノムからオーファン酵素[用語1]を効率的に探索するための深層学習ベースの計算手法として「DeepES」を開発しました。オーファン酵素とは酵素活性は確認されているものの、アミノ酸配列情報が知られていない酵素のことで、酵素データベース上に多数存在しています。オーファン酵素は、アミノ酸配列情報がないた...
キーワード：位置情報/言語モデル/自然言語/自然言語処理/情報学/深層学習/人工知能（AI）/検索システム/言語処理/がん研究/生命情報/生体触媒/候補遺伝子/機能予測/遺伝子クラスター/腸内フローラ/リンパ腫/酵素活性/生合成/生合成遺伝子/アミノ酸配列/ゲノム科学/メタゲノム解析/酵素反応/代謝物質/ゲノム解析/メタゲノム/大腸/短鎖脂肪酸/腸内環境/予測モデル/がん化/発がん/T細胞/アミノ酸/ラット/脂肪酸/代謝物/大腸がん/白血病/連続反応/ゲノム/メタボローム/メタボローム解析/遺伝子/細菌/細菌叢/真菌/早期発見/腸内細菌/腸内細菌叢/予防医学
他の関係分野：情報学複合領域生物学総合理工総合生物農学