東京科学大学 研究シーズ|
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研究キーワード：東京科学大学における「分子シミュレーション」 に関係する研究一覧：5件
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発表日：2025年9月18日
1
新しい数値指標『siRMSD』で副作用を予測し、安全なsiRNA医薬の設計へ
化学修飾による分子の形の変化を数値化し、副作用（オフターゲット効果）の仕組みを解明
東京科学大学（Science Tokyo）国際医工共創研究院 核酸・ペプチド創薬治療研究センターの安成鎮特任研究員、程久美子特任教授（兼務：東京大学 大学院理学系研究科）、名古屋大学 大学院理学研究科 物質理学専攻 化学系の阿部洋教授らの研究チームは、...
キーワード：TEI/最適化/量子化/分子構造/量子化学/量子化学計算/アミド/らせん構造/塩基配列/選択性/熱力学/シミュレーション/構造最適化/分子シミュレーション/アンチセンス/臨床応用/mRNA/ペプチド創薬/RNAi/RNA干渉/siRNA/アンチセンス核酸/スクリーニング/核酸医薬/官能基/構造変化/創薬/副作用/立体構造/miRNA/遺伝子/遺伝子発現
他の関係分野：情報学数物系科学化学生物学工学
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発表日：
2
タンパク質の構造領域と天然変性領域が協調したRNA配列認識機構の解明
多くの核酸認識に共通する可能性のあるメカニズムの発見
東京科学大学（Science Tokyo）生命理工学院 生命理工学系の博士課程学生 木島壮一朗と北尾彰朗教授らの研究チームは、RNA結合タンパク質「FUS」のジンクフィンガードメイン（構造領域）と隣接するRGG2ドメイン（IDR）がRNAの特定の配列を認識する仕組みを、分子シミュレーションを用いて研究しました。生命現象を包括的に理解するために、細胞内でタンパク質がRNAやDNAなどの核酸の特定の塩基配列をどのように認識しているかを解明することは重要です。核酸を認識するタンパク質の多くは、天然状態で立体構造が安定した「...
キーワード：塩基配列/シミュレーション/分子シミュレーション/配列解析/ジンクフィンガー/RNA/RNA結合タンパク質/創薬/分子設計/立体構造
他の関係分野：生物学工学総合生物
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発表日：2025年7月24日
3
熱伝導率が極めて高い液晶性ポリイミドの合成に成功
機械学習による効率的な分子設計で高機能材料開発を変革
東京科学大学（Science Tokyo） 物質理工学院 材料系の早川晃鏡教授、森川淳子教授（兼：同大学 総合研究院 自律システム材料学研究センター）、前田颯博士後期課程学生（研究当時）、中川栞修士課程学生（研究当時）、情報・システム研究機構 統計数理研究所の吉田亮教授、ウ・ステファン准教授らの研究グループは、機械学習を活用した分子設計手法により、高熱伝導性を有する...
キーワード：センサーアレイ/データ駆動/自律システム/機械学習/人工知能（AI）/検索システム/X線回折/相転移/放射光/近赤外/分子構造/円偏光発光/自己組織/ポリイミド/液晶/機能性高分子/広角X線回折/高分子/高分子合成/高分子物性/耐熱性/円偏光/材料科学/材料データベース/熱物性/温度センサー/絶縁材料/電子デバイス/半導体デバイス/分子配列/マネジメント/秩序構造/誘電特性/材料設計/熱拡散/熱拡散率/シミュレーション/シリコン/スピン/センサー/ポリマー/レーザー/高分子材料/自動化/自動車/動力学/熱伝導/熱伝導率/半導体/分子シミュレーション/分子動力学/分子動力学法/インフォマティクス/配向性/機能材料/機能性/結晶構造/組織化/高次構造/分子設計
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学化学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年6月20日
4
生物学の常識を覆す、「両利き」機能を持つ古代タンパク質
核酸結合タンパク質の進化的歴史に関する新たな手がかり
東京科学大学（Science Tokyo） 地球生命研究所（ELSI）のLiam M. Longo（リアムM. ロンゴ）特任准教授、同 Tatsuya Corlett（龍也・コレット）修士課程学生とエルサレム・ヘブライ大学のNorman Metanis（ノーマン・メタニス）教授らの国際共同研究チームは、全ての生物に進化的に保存されている、DNAやRNAに結合するシンプルな古代タンパク質が、分子の"利き手"（キラリティー[用語1]）を反転させてもなお機能することを示しました。...
キーワード：検索システム/キラリティー/タンパク質構造/らせん構造/進化学/シミュレーション/分子シミュレーション/生物物理学/D-アミノ酸/ELSI/生物物理/RNA/RNA結合タンパク質/アミノ酸/ヘリックス/立体構造
他の関係分野：複合領域化学生物学工学総合生物
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発表日：2025年3月25日
5
アクアポリン3の新規チャネル閉鎖構造を発見
クライオ電子顕微鏡でアクアポリン3の構造を解析し、他の水チャネルには見られない、水の通路が塞がれた構造を解明
東京科学大学（Science Tokyo）総合研究院 高等研究府 細胞構造生理学研究室の藤吉好則特別栄誉教授、香西大輔プロジェクト助教らは、横浜市立大学 大学院生命医科学研究科の池口満徳教授、井上雅郎特任助教らと共同で、細胞内外の水輸送に関与する膜タンパク質として知られる水チャネル[用...
キーワード：先端技術/産学連携/分子動力学シミュレーション/芳香環/生命情報/水輸送/原子分解能/構造モデル/3次元構造/シミュレーション/界面活性剤/電子顕微鏡/電子顕微鏡観察/動力学/分解能/分子シミュレーション/分子動力学/生体内/哺乳類/変異体/アミノ酸配列/クライオ電子顕微鏡/免疫系/アルギニン/筋炎/細胞膜/脂質二重膜/心筋/新型コロナウイルス/大腸/ペプチド医薬/RNA/アクアポリン/アミノ酸/がん細胞/ラット/医薬品開発/上皮細胞/腎臓/水チャネル/生体膜/阻害剤/創薬/大腸菌/動的構造/膜タンパク質/立体構造/立体構造解析/ウイルス/ストレス/遺伝子/酸化ストレス/脂質/生理学/唾液
他の関係分野：複合領域数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学