東京科学大学 研究シーズ|
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研究キーワード：東京科学大学における「塩基配列」 に関係する研究一覧：9件
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発表日：2025年9月18日
1
新しい数値指標『siRMSD』で副作用を予測し、安全なsiRNA医薬の設計へ
化学修飾による分子の形の変化を数値化し、副作用（オフターゲット効果）の仕組みを解明
東京科学大学（Science Tokyo）国際医工共創研究院 核酸・ペプチド創薬治療研究センターの安成鎮特任研究員、程久美子特任教授（兼務：東京大学 大学院理学系研究科）、名古屋大学 大学院理学研究科 物質理学専攻 化学系の阿部洋教授らの研究チームは、...
キーワード：TEI/最適化/量子化/分子構造/量子化学/量子化学計算/アミド/らせん構造/塩基配列/選択性/熱力学/シミュレーション/構造最適化/分子シミュレーション/アンチセンス/臨床応用/mRNA/ペプチド創薬/RNAi/RNA干渉/siRNA/アンチセンス核酸/スクリーニング/核酸医薬/官能基/構造変化/創薬/副作用/立体構造/miRNA/遺伝子/遺伝子発現
他の関係分野：情報学数物系科学化学生物学工学
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発表日：2025年9月2日
2
がん免疫療法、なぜ効かなくなる？治療に抵抗する“悪玉サブクローン”の正体を解明
転移性尿路上皮がんでは、抗PD-1抗体ペムブロリズマブ（商品名キイトルーダ）が2017年に承認されて以降、免疫チェックポイント阻害薬によるがん免疫療法が標準治療となりました。しかし、免疫チェックポイント阻害薬が無効な症例や耐性を獲得する症例が後を絶たず、このような症例の克服が臨床上の課題となっています。近年の技術の進歩により、がんの遺伝子異常の解析が進み、腫瘍内には遺伝子の一部が変異したクローンが何種類も不均一に存在することが明らかになり、一つの腫瘍といってもこの各クローンから増殖が起こる（多クローン性増殖）ことがわかってきました。しかし、がん免疫療法中に生じる多...
キーワード：プロファイル/人工知能（AI）/クローン/塩基配列/一細胞/マッピング/尿路上皮がん/PD-1/エクソーム/オミクス/オミクス解析/がん免疫/がん免疫療法/悪性度/遺伝子異常/遺伝子発現解析/浸潤/発現解析/微小環境/病理/免疫抑制/大動脈/次世代シーケンサー/腫瘍微小環境/免疫治療/免疫療法/RNA/T細胞/がん幹細胞/がん細胞/トランスクリプトーム/トランスクリプトミクス/ファージ/マクロファージ/一細胞解析/幹細胞/細胞増殖/免疫チェックポイント/免疫チェックポイント阻害薬/ゲノム/遺伝子/遺伝子発現/遺伝子変異/抗体
他の関係分野：情報学生物学総合生物農学
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発表日：
3
タンパク質の構造領域と天然変性領域が協調したRNA配列認識機構の解明
多くの核酸認識に共通する可能性のあるメカニズムの発見
東京科学大学（Science Tokyo）生命理工学院 生命理工学系の博士課程学生 木島壮一朗と北尾彰朗教授らの研究チームは、RNA結合タンパク質「FUS」のジンクフィンガードメイン（構造領域）と隣接するRGG2ドメイン（IDR）がRNAの特定の配列を認識する仕組みを、分子シミュレーションを用いて研究しました。生命現象を包括的に理解するために、細胞内でタンパク質がRNAやDNAなどの核酸の特定の塩基配列をどのように認識しているかを解明することは重要です。核酸を認識するタンパク質の多くは、天然状態で立体構造が安定した「...
キーワード：塩基配列/シミュレーション/分子シミュレーション/配列解析/ジンクフィンガー/RNA/RNA結合タンパク質/創薬/分子設計/立体構造
他の関係分野：生物学工学総合生物
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発表日：2025年8月20日
4
AIとロボットが実験の「裏方作業」もする未来
実験室全体を完全自動化する設計思想の提案
東京科学大学総合研究院難治疾患研究所ロボット科学分野の神田元紀教授は、理化学研究所（理研）生命機能科学研究センターバイオコンピューティング研究チームの落合幸治研究員、高橋恒一チームディレクター、AI生物学研究チームの尾崎遼チームディレクター、筑波大学ヒューマニクス学位プログラムの田原（新井）悠也大学院生、梅馨堂合同会社の梅野真代表社員らの研究グループと共同で、...
キーワード：インターフェース/コンピューティング/AI/タスク/画像認識/自然言語/人工知能（AI）/実験計画/太陽/初期胚/塩基配列/太陽光/センサー/マイクロ/メンテナンス/ロボット/ロボットアーム/自動化/統合システム/機能予測/資源管理/iPS細胞/グリア細胞/自己複製/オルガノイド/ES細胞/イミン/グリア/ラット/幹細胞/再生医療/細胞培養/創薬/多能性幹細胞
他の関係分野：情報学数物系科学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年7月24日
5
若年発症肺腺がんの一部にBRCA2やTP53遺伝子の遺伝的要因が関与することを解明
日本人の若年発症肺腺がんを対象とした初の大規模ゲノム解析の成
国立研究開発法人国立がん研究センター（東京都中央区、理事長：間野博行）、研究所 ゲノム生物学研究分野の白石航也ユニット長、河野隆志分野長、張萌琳外来研究員、東京科学大学 医歯学総合研究科 統合呼吸器病学分野の本多隆行医学部内講師らは、全国8施設からなる研究コンソーシアムを構築し、日本人の肺腺がんについて大規模に解析し、若年（40歳以下）で発症する肺腺がんの原因を調べました。本研究において肺腺がんの若年発症例と非若年発症例を比較した結果、若年発症例ではTP53遺伝子、BRCA2遺伝子に生まれつき変異している...
キーワード：情報サービス/危機管理/がん研究/ゲノムDNA/相同組み換え/塩基配列/生殖/紫外線/デジタルツイン/組み換え/診断法/ゲノム配列/リン酸/シークエンス/生殖細胞/ゲノムシークエンス/タバコ/環境要因/DNA修復/EGFR/PARP阻害剤/TP53/アデノシン/エクソーム/がん遺伝子/バイオバンク/次世代シークエンサー/全エクソームシークエンス/早期診断/体細胞変異/肺腺がん/放射線治療/融合遺伝子/卵巣/ゲノム解析/死亡率/症例対照研究/分子標的/卵巣がん/歯学/発がん/HLA/がん細胞/がん治療/サーベイランス/血液/阻害剤/創薬/がん患者/ゲノム/リスク因子/遺伝子/遺伝子変異/危険因子/抗がん剤/手術/乳がん/肺がん/分子標的治療/分子標的薬/放射線
他の関係分野：情報学複合領域化学生物学工学総合生物農学
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発表日：2025年7月1日
6
ヒストンシトルリン化を標的とした新規膵がん治療戦略
PAD2のがん促進作用とがん免疫回避メカニズムの解明
東京科学大学（Science Tokyo）大学院医歯学総合研究科 分子腫瘍医学分野の田中真二教授、秋山好光講師、梅村謙太郎大学院生らの研究グループは、同大学の肝胆膵外科学分野、信州大学 医学部外科学教室、東京慈恵会医科大学 外科学講座との共同研究において、以下の成果を明らかにしました。本研究では、膵がんにおいて...
キーワード：悪性化/塩基配列/ヒストン/抵抗性/サイレンシング/アルギニン/肝炎/PD-1/がん免疫/がん免疫療法/マウスモデル/悪性度/肝がん/細胞株/治療抵抗性/治療標的/浸潤/免疫抑制/予後予測因子/膵臓/大腸/予後予測/β-catenin/悪性腫瘍/歯学/線維芽細胞/免疫チェックポイント阻害剤/免疫治療/免疫療法/DNAメチル化/アセチル化/がん細胞/がん治療/タンパク質発現/ヒストン修飾/ファージ/マウス/マクロファージ/メチル化/肝細胞/肝細胞がん/腫瘍免疫/阻害剤/免疫チェックポイント/免疫チェックポイント阻害薬/免疫細胞/膵がん/ウイルス/がん患者/ゲノム/バイオマーカー/胃がん/遺伝子/遺伝子発現/個別化医療/抗がん剤/抗体/手術/早期発見/乳がん/臨床研究/老化
他の関係分野：生物学工学農学
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発表日：2025年6月18日
7
DNA液滴の流動性を光で制御
インテリジェントな微小流体型分子コンピュータの実現に期待
東京科学大学 情報理工学院 情報工学系の瀧ノ上正浩教授、鵜殿寛岳特任助教と東北大学 大学院工学研究科 ロボティクス専攻の野村M.慎一郎准教授らの研究チームは、照射した光の波長[用語1]...
キーワード：コンピューティング/AI/最適化/人工知能（AI）/分子ロボット/分子ロボティクス/検索システム/局所化/水分子/水溶液/相補性/対称性/非対称性/閉じ込め/相分離/数値シミュレーション/らせん構造/光応答性/高分子/自己集合/細胞内小器官/遺伝情報/塩基配列/光応答/マイクロ流体工学/ハイドロゲル/ナノ構造体/可視光/光スイッチ/光スイッチング/ベンゼン/光照射/反応速度/シミュレーション/ナノメートル/ナノ構造/マイクロ/マイクロ流体/モーター/モデル化/ロケット/ロボット/ロボティクス/遠隔操作/界面活性剤/拡散係数/周波数/相変化/電磁波/微細加工/表面張力/流体工学/流体力/流体力学/DNAコンピュータ/医工学/人工細胞/微細加工技術/生体内/生物物理学/TEMPO/トレーサ/分子モーター/光制御/酵素反応/筋肉/生物物理/カップリング/ナノテクノロジー/RNA/アゾベンゼン/イミン/ラット/凝集体/構造変化
他の関係分野：情報学複合領域数物系科学化学生物学総合理工工学総合生物農学
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発表日：2025年6月11日
8
難病「中大動脈症候群」の原因遺伝子を世界で初めて特定
RNF213の異常が全身性の血管狭窄の発症に関与：マウスモデルで病態を実証し、治療法開発に道
東京科学大学（Science Tokyo）大学院医歯学総合研究科 発生発達病態学分野の高木正稔教授および臨床医学教育開発学分野の鹿島田彩子助教らの研究チームは、全身の血管が狭窄する希少難病「中大動脈症候群」の原因遺伝子を、全エクソン解析[用語1]によって探索しました。その結果、RNF213遺伝子が原因候補として同定され、マウスモデルを用いた実験により、この遺伝子の異常が疾患の原因であることを明らかにしました。中大動脈症候群は、全身の大血管が狭窄することに...
キーワード：塩基配列/血流/分子細胞生物学/ゲノム編集技術/病原性/ノックイン/ノックインマウス/小児神経学/肺高血圧/RNF213/ヒトゲノム/マウスモデル/炎症反応/合併症/次世代シークエンサー/腫瘍学/大動脈/ゲノム編集/歯学/病態解明/NF-κB/ファージ/マウス/マクロファージ/細胞生物学/腎機能/腎機能障害/創薬/ゲノム/バイオマーカー/遺伝子/血圧/高血圧/小児/難病/脳卒中/肺高血圧症
他の関係分野：生物学総合生物農学
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発表日：2025年5月15日
9
細胞分裂の基点となるセントロメアの新規クロマチン構造を提唱
CENP-A-H4オクタソームの発見と構造解明
染色体の中央に位置するセントロメアは、細胞の有糸分裂[用語1]の際に、姉妹染色分体を分離する紡錘体微小管が結合する動原体[用語2]が形成される領域です。セントロメアでは、ヒストンH3がそのバリアントであるCE...
キーワード：検索システム/ゲノムDNA/タンパク質複合体/塩基配列/出芽酵母/紡錘体/電子線/ヒストン/アイデンティティ/モデリング/極低温/電子顕微鏡/分解能/ヌクレオソーム/構造変換/生体内/ゲノム機能/クロマチン構造/クライオ電子顕微鏡/アルギニン/セントロメア/高分解能/クロマチン/染色体/微小管/がん化/リモデリング/RNA/アミノ酸/ヒストン修飾/メチル化/高次構造/細胞分裂/創薬/立体構造/ゲノム/遺伝子
他の関係分野：複合領域化学生物学総合理工工学総合生物農学