海底のDNAから読み解く絶滅危惧種スナメリの100年史

―海棲哺乳類の個体数の推移を堆積物DNAから推定―

この研究の主な対象者
企業・研究者の方
公開日 2026年06月15日

概要

現在、海棲哺乳類の多くは、絶滅危惧種に指定され、化学物質による汚染の影響などが危惧されています。しかし、観測データの不足から、絶滅リスクの評価ができない状況が続いてきました。
　土居秀幸 情報学研究科教授、槻木玲美 松山大学教授、加三千宣 愛媛大学教授、国末達也 同教授、中根快氏（元・愛媛大学大学院生）、落合真理 麻布大学講師、磯部友彦 国立環境研究所主幹研究員らからなる研究チームは、絶滅危惧種スナメリの個体数の長期復元を目的に、本種に特異的なプライマー・プローブを開発し、瀬戸内海、別府湾の堆積物に残る環境DNAをリアルタイムPCR法によって検出・解析しました。
　その結果、過去100年に相当する堆積物からスナメリのDNAが検出され、その濃度は1950年代に急増した後、1960年代初頭に急減し、その後2000年代以降に回復傾向を示しました。この変動傾向は、瀬戸内海で断続的に行われてきた現地調査によるスナメリ生息数の変化と概ね一致していました。このことから、堆積物DNA（sedimentary DNA、sedDNA）解析は、海棲哺乳類の個体数推移を精度よく推定する有効な手法であることが示されました。
　さらに、1960年前後にみられたスナメリの急速な減少要因について検討した結果、PCB（ポリ塩化ビフェニル）濃度が高い時期ほどスナメリDNA濃度が低下する傾向が認められ、両者の間には負の関連が確認されました。日本国内におけるPCB生産量は1960年代に急増し、1970年前後にピークに達したことが知られており、この時期は本研究で確認されたスナメリDNA濃度の減少時期と概ね一致していました。加えて、1960〜1970年代に瀬戸内海で採取されたスナメリは、PCB濃度が鯨類において個体数減少や免疫毒性を引き起こすとされる基準値を大きく上回っていましたが、2000年代以降に採取された多くの個体のPCB濃度は低い値を示しました。これらの結果は、1960年代におけるスナメリ個体数の減少が化学物質による汚染と関係していた可能性を示すもので、当時の環境汚染がスナメリに深刻な影響を与えていたことが示唆されました。
　本研究成果は、2026年5月30日に、国際学術誌「Marine Pollution Bulletin」にオンライン掲載されました。

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詳しい研究内容について

海底のDNAから読み解く絶滅危惧種スナメリの100年史―海棲哺乳類の個体数の推移を堆積物DNAから推定―

研究者情報

研究者名 土居 秀幸
京都大学 教育研究活動データベース

関連部局

情報学研究科