メタゲノム由来ゲノムを収集・整理した統合データベース「Microbiome Datahub」を開発

―21万ゲノム以上のMAG配列と環境・機能情報を統合し、微生物研究を加速―

2026.03.30 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所
自然科学研究機構 基礎生物学研究所
東京科学大学
京都大学

概要

情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所の森宙史准教授、自然科学研究機構 基礎生物学研究所の内山郁夫准教授、東京科学大学 生命理工学院 山田拓司教授、京都大学 化学研究所 松井求助教を中心とする共同研究グループ（国立遺伝学研究所、基礎生物学研究所、東京科学大学、京都大学、東京大学）は、環境中の微生物を解析したメタゲノム由来のゲノム配列（MAG: Metagenome-Assembled Genomes）を公共の塩基配列リポジトリから網羅的に収集し、環境や系統・遺伝子機能等、様々な情報を付加した統合データベース「Microbiome Datahub」を開発・公開しました。本データベースは、公共の塩基配列リポジトリに蓄積された21万件以上のMAG配列に対し、統一された遺伝子予測、系統分類、遺伝子機能アノテーション、表現型予測および環境メタデータを付与したものであり、データ駆動型の微生物学や未知の有用タンパク質探索の基盤として貢献することが期待されます。本研究成果は、科学誌「Microbiome」に2026年3月16日に速報版が掲載されました。



図. Microbiome Datahubのユーザインターフェース。21万件以上のMAGデータについて、生息環境や系統名、MAGの品質等多様なメタデータを用いて絞り込み検索が可能です。 詳しいプレスリリースを見る