新型コロナウイルス変異株におけるスパイクタンパク質の異常な変異を発見

概要

新型コロナウイルスについて公開ゲノムデータを解析した結果、感染性を高めたとされるスパイクタンパク質の614番目のアミノ酸のグリシンへの変異が、元のアスパラギン酸に戻ったゲノム配列が、デルタ株とオミクロン株に集中して多数見つかりました。また、その時期や検出場所にも偏りがありました。
　新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）にはスパイクタンパク質と呼ばれる特徴的な突起構造があり、これが感染を引き起こす鍵となることが知られています。この感染症の世界的流行の初期には、スパイクタンパク質の614番目のアミノ酸であるアスパラギン酸（D614）からグリシンへの変異（G614）が急速に起こり、感染性を高めたと考えられています。この変異はその後、ほぼすべての懸念される変異株に共通して固定され、D614はほぼ消失しています。
　本研究では、アメリカ国立生物工学情報センターの公開ゲノムデータベース（NCBI GenBank）に登録されている新型コロナウイルス変異株を網羅的に解析しました。その結果、スパイクタンパク質G614からD614への復帰変異が、デルタ株およびオミクロン株BA.2において集中して出現していることを明らかにしました。また、復帰変異の出現時期はそれぞれの株の流行のピークより遅れて生じており、さらに検出場所に地理的な偏りがあることも分かりました。このような出現パターンは市中感染の際に起きる自然な突然変異だけでは説明が難しく、この現象を発生させたメカニズムの解明が求められます。

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プレスリリース

研究代表者

筑波大学システム情報系
掛谷 英紀　准教授

掲載論文

【題名】

Anomalous Emergence of D614 Reverse Mutations in the Delta and Omicron BA.2 Variants
（デルタ株とオミクロン株BA.2におけるD614復帰変異の異常な出現）

【掲載誌】

Microbiology Research

【DOI】

10.3390/microbiolres17020044

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システム情報系