産業技術総合研究所 研究細菌と真菌が混在したマイクロバイオームの定量解析を可能に
－人工核酸標準物質の開発で次世代シーケンサーによる解析の標準化に貢献－
【産学連携対象 全学共通分野 Discovery Saga】
【Sagaキーワード】
並列処理/海洋/微生物群集/人工核酸/DNAポリメラーゼ/PCR法/クローン/リボソームRNA/遺伝情報/塩基配列/系統分類/生物群集/診断薬/マイクロ/rDNA/インフォマティクス/超並列/リボソーム/rRNA/土壌/微生物/クローン病/メタゲノム解析/同時測定/遺伝子解析/炎症性疾患/ゲノム解析/メタゲノム/次世代シーケンサー/PCR/RNA/自閉症/代謝物/アレルギー/ウイルス/ゲノム/マイクロバイオーム/遺伝子/細菌/真菌/神経疾患/糖尿病/標準化
発表・掲載日：2025/03/18
ポイント
次世代シーケンサーによるマイクロバイオーム解析のための12種類の人工核酸標準物質を開発標準物質を試料に添加することで、細菌など原核生物と真菌など真核微生物の比較、絶対定量が可能
これまで実現できていなかった真菌などを含めたより詳細なマイクロバイオーム研究に貢献
論文情報
掲載誌：ISME Communications論文タイトル：Synthetic DNA Spike-in Standards for Cross-Domain Absolute Quantification of Microbiomes by rRNA Gene Amplicon Sequencing
著者：Dieter M. Tourlousse & Yuji Sekiguchi
DOI：https://doi.org/10.1093/ismeco/ycaf028